• 제목/요약/키워드: 2D-gel

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Proteomic identification of the bovine pregnancy associated proteins by peptide mass fingerprinting

  • Kang, Sun-Chul;Kim, Eun-Jung;Pyo, Jae-Hoon;Lim, Jin-Kyu
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2002년도 생물공학의 동향 (X)
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    • pp.558-561
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    • 2002
  • In this study, a method for the localization of pregnancy-specific proteins from cow urine on 2-D gel have been established. The proteins were digested with trypsin in gel and then analyzed with MALDI- TOF or transferred to a membrane and microsequenced. To examine the pregnancy associated protein spot 2 as a diagnosis marker in bovine urine 2-D western blotting was performed. This antibody was reacted specifically in the protein of pregnant cow’s urine. Consequently spot 2 was identified and found to be good candidates for developing cow pregnancy detection assay kit.

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Purification and Properties of Cyclodextrin Glucanotrnsferase Synthesizing $2-O-{\alpha}-D-Glucopyranosyl{\;}_{L}-Ascorbic$ Acid from Paenibacillus sp. JB-13

  • Bae, Kyung-Mi;Kim, Sung-Koo;Kong, In-Soo;Jun, Hong-Ki
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제11권2호
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    • pp.242-250
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    • 2001
  • A Gram-positive bacterium (strain JB-13) that was isolated from soil as a producer of cyclodextrin glucanotransferase (CGTase) [EC 2.4.1.19] was identified as Panibacillus sp. JB-13. This CGTase could catalyze the transglucosylation reaction from soluble starch to L-ascorbic acid (AA). A main product formed by this enzyme with ${\alpha}-glucosidase$ was identified as $2-O-{\alpha}-D-glucopyranosyl{\;}_{L}-ascorbic$ acid (AA-2G) by the HPLC profile and the elemental analysis. CGTase was purified to homogeneity using ammonium sulfate fractionation, ion-exchange chromatography on DEAE-Seohadex A-50, and gel chromatography on Sephacryl S-200HR. The molecular weight was determined to be 66,000 by both gel chromatography and SDS-PAGE. The isoelectric point of the purified enzyme was 5.3. The optimum pH and temperature was PH 7.0 and $45^{\circ}C$ respectively. The enzyme was stable in the range of pH 6-9 and at temperatures of $75{\circ}C$ or less in the presence of 15 mM ${CaCl_2}.\;{Hg^2+},\;{Mn^+2},{Ag^+},\;and\;{Cu^2+}$ all strongly inhibited the enzyme's activity.

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정상산소 중합체 겔 선량계를 이용한 3차원 방사선량 평가에 관한 연구 (A Study on the Evaluation of 3D Dose Distribution using Normoxic Polymer Gel)

  • 정세영;김영범;권영호;이석
    • 대한방사선치료학회지
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    • 제19권1호
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    • pp.7-17
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    • 2007
  • 목 적: 최신 방사선 치료에서는 환자 치료계획 시 종양체적에 분포한 3차원 공간적 선량분포의 검증이 중요시 되고 있는 추세이다. 기존의 선량계로는 공간상의 선량분포를 알 수 없어 이러한 문제점을 극복하고자 조직등가 겔 내에서 방사선에 의해 변화된 화학적 변화를 자기공명영상을 이용하여 3차원적 선량 분석을 시행하는 겔 선량계를 개발하고자 하였다. 대상 및 방법: 겔 합성 시료의 조성비에 따른 정상산소 중합체 겔의 특성 연구를 위해 다섯 개 조합의 중합체 겔을 합성하였다. 이후 방사선량과 자기공명영상의 횡이완 시간과의 상관관계를 구하기 위해 겔로 채워진 후 밀봉된 선량측정용 바이알을 제작하였고, 방사선을 조사하였다. 그리고 방사선 조사 후 선량측정용 바이알의 자기공명영상을 획득하였다. 선량특성 평가 항목으로는 자기공명영상과 R2 지도, 조성비 별 선량-R2 반응곡선 및 선량분포 등의 인자를 분석, 평가하였다. 결 과: 각 조성비 별 정상산소 중합체 겔의 선량-R2 반응 곡선에서 set 1, 3, 4, 5 의 기울기는 각각 0.60, 0.775, 0.683, 0.954이며 절편은 각각 0.322, 0.473, 0.611, 1.032이었다. Set 3의 경우 선형성도 다른 조합보다 비교적 우수한 0.9491이며 선량 반응이 일어나는 문턱 값 또한 0.473으로 0.5 Gy 정도에서 반응이 일어나는 것을 확인할 수 있었다. 결 론: 본 연구에서는 임상에서 실용적으로 사용할 수 있는 정상산소 중합체 겔(normoxic gel)을 항산화제를 사용하여 정상산소 조건에서 합성하였고, 이상적인 조성비를 얻을 수 있었다.

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산겨릅나무 줄기에서 페놀성 글루코사이드의 분리 (Isolation of Phenolic Glucosides from the Stems of Acer tegmentosum Max)

  • 허종문;양은주;최선하;송경식
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제49권2호
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    • pp.149-152
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    • 2006
  • 산겨릅나무(A. tegmentosum)의 성분 연구를 위하여 줄기를 MeOH로 추출하여 $CH_2Cl_2$, n-BuOH 및 $H_2O$ 순으로 분획하였다. n-BuOH fraction에 대하여 silica gel과 RP-18 column chromatography를 행하여 2종의 화합물을 분리하였다. 이들 화합물의 구조는 spectral data를 문헌치와 비교하여 methyl gallate $4-O-{\beta}-D-glucoside(1)$와 salidroside(2)로 동정하였다. 이들 화합물은 산겨릅나무에서 처음으로 분리되었다.

Microwave Sol-Gel Preparation of NaLa(MoO4)2:Eu3+/Yb3+ Particles and Their Upconversion Photoluminescence Properties

  • Lim, Chang Sung
    • 한국재료학회지
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    • 제24권11호
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    • pp.599-603
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    • 2014
  • $NaLa_{1-x}(MoO_4)_2:Eu^{3+}/Yb^3$ phosphors with doping concentrations of $Eu^{3+}$ and $Yb^{3+}$ ($x= Eu^{3+}+Yb^{3+}$, $Eu^{3+}=0.05$, 0.1, 0.2 and $Yb^{3+}= 0.2$, 0.45) were successfully synthesized by the microwave-modified sol-gel method, and the upconversion and spectroscopic properties were investigated. Well-crystallized particles showed a fine and homogeneous morphology with particle sizes of $2-5{\mu}m$. Under excitation at 980 nm, $NaLa_{0.5}(MoO_4)_2:Eu_{0.05}Yb_{0.45}$ particles exhibited a strong 525-nm emission band and a weak 550-nm emission band in the green region, and a very weak 665-nm emission band in the red region. The strong 525-nm emission in the green region corresponds to the $^7F_1{\rightarrow}^5D_1$ transition and the weak 550-nm emission in the green region corresponds to the $^7F_0{\rightarrow}^5D_2$ transition, while the very weak emission 665-nm band in the red region corresponds to the $^5D_0{\rightarrow}^7F_3$ transition. The Raman spectra of the doped particles indicated the domination of strong peaks at higher frequencies of 762, 890, 1358 and $1430cm^{-1}$ and weak peaks at lower frequencies of 323, 388 and $450cm^{-1}$ induced by the disorder of the $[MoO4]^{2-}$ groups with the incorporation of the $Eu^{3+}$ and $Yb^{3+}$ elements into the crystal lattice or by a new phase formation.

Temperature-dependent photoluminescence study on aluminum-doped nanocrystalline ZnO thin films by sol-gel dip-coating method

  • Nam, Giwoong;Park, Hyunggil;Yoon, Hyunsik;Kim, Soaram;Leem, Jae-Young
    • 한국표면공학회:학술대회논문집
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    • 한국표면공학회 2012년도 추계총회 및 학술대회 논문집
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    • pp.131-133
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    • 2012
  • The photoluminescence (PT) properties of Al-doped ZnO thin films grown by the sol-gel dip-coating method have been investigated. At 12 K, nine distinct PL peaks were observed at 2.037, 2.592, 2.832, 3.027, 3.177, 3.216, 3.260, 3.303, and 3.354 eV. The deep-level emissions (2.037, 2.592, 2.832, and 3.027 eV) were attributed to native defects. The near-band-edge (NBE) emission peaks at 3.354, 3.303, 3.260, 3.216, and 3.177 eV were attributed to the emission of the neutral-donor-bound excitons (D0X), two-electron satellite (TES), free-to-neutral-acceptors (e,A0), donor-acceptor pairs (DAP), and second-order longitudinal optical (2LO) phonon replicas of the TES (TES-2LO), respectively. According to Haynes' empirical rule, we calculated the energy of a free exciton (FX) to be 3.374 eV. The thermal activation energy for D0X in the nanocrystalline ZnO thin film was found to be ~25 meV, corresponding to the thermal dissociation energy required for D0X transitions.

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Effect of Sinter Additives on Sol-Gel Derived Alumina Fibres

  • Lakshmi, N.S.;Gnanam, F.D.
    • The Korean Journal of Ceramics
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    • 제6권2호
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    • pp.159-163
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    • 2000
  • Alumina fibre has been synthesized successfully by sol-gel technique. Boehmite sol was prepared by hydrolyzing aluminium iso-propoxide and peptizing it with nitric acid. The stable sol thus obtained was used for fibre drawing when their viscosity reached the required value as a result of progress of the hydrolyzation and polycondensation reaction. The fibres dried at 11$0^{\circ}C$ for 12 hours were sintered at 1$600^{\circ}C$ for 5 hours. A reasonable sintered density with better microstructure and strength have been attained using 2 wt% of urea, magnesia and silica as sinter additives. Thermal analysis with sintering additives of 2 wt% and phase determination of the heat treated fibres using XRD and FT IR spectra confirms the phase transitions. The observation of surface and cross-section of the fibres were made using SEM. Fibres of uniform circular cross-section is obtained by fixing the shape in a setting solution.

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프로테오믹스 연구를 위한 정량분석 데이터의 해석 (Data analysis for quantitative proteomics research)

  • 권경훈
    • 유전체소식지
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    • 제6권1호
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    • pp.24-28
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    • 2006
  • 프로테오믹스는 생물체 안에 포함되어 있는 단백질을 통합적으로 연구한다. 단백질을 동정(Protein identification)하고, 단백질의 상태를 분석(Protein characterization)하며, 단백질의 양적 변화를 관찰(Protein quantitation)한다. 단백질에 대한 분석, 특히 질량분석기에 의해 초고속으로 대량의 단백질 데이터를 생산하는 프테테오믹스의 연구는 정량적인 단백질 발현양상분석의 정확도를 높이고 분석시간을 단축하기 위해 다양한 실험기법과 데이터 분석기법을 동원하고 있다. 1) 단백질의 양적 차이나 양적 변화의 관찰은 바이오마커를 발굴하고 생명현상의 메카니즘을 규명하여 그 결과를 신약개발에 활용하기 위한 기초 연구이다. 이 글에서는 프로테오믹스 연구의 초창기부터 사용되어온 2차원 전기영동법에 의해 생성되는 2D-gel image에서의 스팟(spot)분석법과 함께, 탄뎀 질량분석기를 사용하는 ICAT, SILAC 등의 동위 원소를 사용한 라벨링(labeling) 방법, 라벨링을 하지 않는 label-free 방법 등 프로테오믹스에서의 정량분석법에 대한 기본 개념을 살펴보고, 이들에서의 데이터 분석 기술의 적용에 대해 간략히 소개하였다.

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Cloned Placenta of Korean Native Calves Died Suddenly at Two Months after Birth Displays Differential Protein Expression

  • Kim Hong Rye;Kang Jae Ku;Lee Hye Ran;Yoon Jong Taek;Seong Hwan Hoo;Jung Jin Kwan;Park Chang Sik;Jin Dong Il
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제29권2호
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    • pp.63-68
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    • 2005
  • Cloned calves derived from somatic cell nuclear transfer (SCNT) have been frequently lost by sudden death at 1 to 3 month following healthy birth. To address whether placental anomalies are responsible for the sudden death of cloned calves, we compared protein patterns of 2 placentae derived from SCNT of Korean Native calves died suddenly at two months after birth and those of 2 normal placentae obtained from AI fetuses. Placental proteins were separated using 2-Dimensional gel electrophoresis. Approximately 800 spots were detected in placental 2-D gel stained with coomassie-blue. Then, image analysis of Malanie III (Swiss Institute for Bioinformatics) was performed to detect variations in protein spots between normal and SCNT placentae. In the comparison of normal and SCNT samples, 8 spots were identified to be up-regulated proteins and 24 spots to be down-regulated proteins in SCNT placentae, among which proteins were high mobility group protein HMG1, apolipoprotein A-1 precursor, bactenecin 1, tropomyosin beta chain, $H^+-transporting$ ATPase, carbonic anhydrase II, peroxiredoxin 2, tyrosine-rich acidic matrix protein, serum albumin precursor and cathepsin D. These results suggested that the sudden death of cloned calves might be related to abnormal protein expression in placenta.

디커플링 조건 및 폴리머 겔 적용에 따른 발파공 발파위력 영향에 관한 수치해석 연구 (Study on Blast Effects of Decoupling Condition and Polymer Gel Coupling in Single Blast Hole by Numerical Analysis)

  • 고영훈;정승원;양형식
    • 화약ㆍ발파
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    • 제36권2호
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    • pp.1-9
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    • 2018
  • 폴리머 겔의 발파 효과를 평가하기 위해 AUTODYN을 이용한 단일 발파공 모델 시뮬레이션을 수행하였다. 발파공 내부 에멀젼 폭약과 공벽간의 채움재는 공기와 폴리머 겔을 적용하여 서로 결과를 비교하였으며, 디커플링 지수 1.0인 밀장전과 디커플링 지수 1.25, 1.56에 대해 각각 해석하였다. 폴리머 겔의 발파 효과 평가를 위한 기준은 밀장전 case를 기준으로 하였다. 해석 결과로서 석회석 모델의 파쇄 및 균열 발생에서 공기보다 폴리머 겔 적용의 경우가 높은 파쇄 정도를 나타냈고, 지정 게이지에서의 최고압력 또한 공기의 경우보다 폴리머 겔 적용이 높은 수치를 보였다.