• 생명과학회지
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• 제13권4호
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• pp.541-550
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• 2003

본 실험에서는 C형 간염바이러스 (HCV)의 외피 단백질인 E2 당단백질에 결합하는 세포단백질들을 클로닝하기 위해 간세포 cDNA를 phage 표면에 발현시킨 phage library를 제작하였고, 12-mer peptide library와 함께 E2 단백질에 대해 panning을 실시하였다. 검색결과 세포내 신호전달과 cytoskeleton 구성에 관여하는 tensin, membrane protein band 4.1 등 세포질내 단백질과 CCR7, CKR-L2, insulin-like growth factor-1 receptor 등 세포막 단백질 등이 확인되었다. 이들 단백질들을 발현하는 phage들은 수용성 E2단백질을 이용한 결합중화반응 결과 E2 단백질에 특이적으로 결합함이 확인되었다. 사람 T 세포에서 주로 발현되는 CCR7 유전자를 PHA로 활성화된 사람 T 세포의 total RNA를 이용하여 증폭하고 클로닝하였다. 293T 세포에 transfection시켜 단백질 발현양상을 flow cytometer로 분석하여 70% 이상의 세포들이 CCR7을 발현하고 있음을 관찰하였다. 수용성 E2 단백질을 CCR7이 transfection된 세포와 mock transfection된 대조군 세포에 각각 반응시킨 결과 dose-dependent 양상으로 CCR7에 결합하였다.

• KSBB Journal
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• 제26권6호
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• pp.517-522
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• 2011

In our previous study, we isolated and characterized a 1-deoxynojirimycin (DNJ)-producing bacterium, Bacillus subtilis MORI, from chungkookjang, a Korean traditional food. B. subtilis MORI was subjected to ${\gamma}$-irradiation and the resulting bacteria were screened for increased DNJ production. A mutant was identified that produced 7.6 times more DNJ and named B. subtilis MORI 3K-85. In this study, the protein profiles of both strains were compared by one-dimensional and two-dimensional gel electrophoresis (1-DE and 2-DE, respectively) under both native and denaturing conditions. The 1-DE native-PAGE and 1-DE SDS-PAGE analyses identified 5 and 7 bands, respectively, that were found at higher concentrations in B. subtilis MORI 3K-85 than in B. subtilis MORI. Similarly, 2-DE analyses identified 20 protein spots which were found at higher concentrations in B. subtilis MORI 3K-85. The peptide mass profiles of these 20 proteins were analyzed by MALDI-TOF and compared with peptide sequences of B. subtilis and B. amyloliquefaciens in the MASCOT database. This screening suggested that three dehydrogenases, an aldolase, a synthetase, an isomerase, a reductase, and a peroxidase are elevated in B. subtilis MORI 3K-85. Based on this data, one or more of the elevated 8 enzymes might be related to the DNJ biosynthetic pathway.

• BMB Reports
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• 제29권1호
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• pp.58-62
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• 1996

The structural changes in the electron donor side of the PSII reaction center have been monitored since heat treatment ($45^{\circ}C$ for 5 min) of thylakoids is known to decrease the oxygen evolving activity. In heat-treated spinach chloroplast thylakoids, the inhibitory effect of 3-(3,4-dichlorophenyl)-1,1-dimethylurea (DCMU) on the electron transport activity of the PSII reaction center from diphenyl carbazide to dichlorophenolindophenol became reduced approximately 3.8 times and [$^{14}C$]-labeled DCMU binding on the D1 polypeptide decreased to 25~30% that of intact thylakoid membranes, implying that the conformational changes of the DCMU binding pocket, residing on the D1 polypeptide, occur by heat treatment. The accessibility of trypsin to the $NH_2$-terminus of the cytochrome b-559 ${\alpha}$-subunit, assayed with Western blot using an antibody generated against the synthetic peptide (Arg-68 to Arg-80) of the COOH-terminal domain, was also increased, indicating that heat-treatment caused changes in the structural environments near the stromal side of the cytochrome b-559 ${\alpha}$-subunit, allowing trypsin more easily to cleave the $NH_2$-terminal domain. Therefore, the structural changes in the electron donor side of the PSII reaction center complexes could be one of the reasons why the oxygen evolving activity of the heat-treated thylakoid membranes decreased.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제20권6호
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• pp.699-703
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• 1992

본 연구에서는 간염치료제로 효과가 있는 민간제제(NS-P)의 성분 분석 및 항균 활성과 항산화 활성을 연구하였다. 이 NP-S는 그람 양성균인 Staphylococcus aureus와 그람 음성균인 Salmonella typhimurium 그리고 진균인 Candida albcans에 항균 활성을 보여 주었을 뿐만 아니라, 지질의 과산화를 억제하는 항산화 활성을 나타냈다. 이러한 NP-S는 C/H/N/S의 원소비가 15.5/4.8/11/10으로 황(S)이 상당히 많이 존재하고 있으며, 휘발성 물질인 암모니아를 2.11M 함유하고 있었다. 이 외에도 6.7의 펩타이드, 0.3의 유리 아미노산, 0.1의 무기 인산염을 함유하고 있으며, 미량 원소로서 Cl, Si, Mg, Zn도 함유하고 있다.

• IMMUNE NETWORK
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• 제6권2호
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• pp.102-110
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• 2006

Background: Dendritic cells (DC) are professional antigen-presenting cells in the immune system and can induce T cell response against virus infections, microbial pathogens, and tumors. Therefore, immunization using DC loaded with tumor-associated antigens (TAAs) is a powerful method of inducing anti-tumor immunity. For induction of effective anti-tumor immunity, antigens should be efficiently introduced into DC and presented on MHC class I molecules at high levels to activate antigen-specific $CD8^+$ T cells. We have been exploring methods for loading exogenous antigens into APC with high efficiency of Ag presentation. In this study, we tested the effect of the cationic liposome (Lipofectin) for transferring and loading exogenous model antigen (OVA protein) into BM-DC. Methods: Bone marrow-derived DC (EM-DC) were incubated with OVA-Lipofectin complexes and then co-cultured with B3Z cells. B3Z activation, which is expressed as the amount of ${\beta}$-galactosidase induced by TCR stimulation, was determined by an enzymatic assay using ${\beta}$-gal assay system. C57BL/6 mice were immunized with OVA-pulsed DC to monitor the in vivo vaccination effect. After vaccination, mice were inoculated with EG7-OVA tumor cells. Results: BM-DC pulsed with OVA-Lipofectin complexes showed more efficient presentation of OVA-peptide on MHC class I molecules than soluble OVA-pulsed DC. OVA-Lipofectin complexes-pulsed DC pretreated with an inhibitor of MHC class I-mediated antigen presentation, brefeldin A, showed reduced ability in presenting OVA peptide on their surface MHC class I molecules. Finally, immunization of OVA-Lipofectin complexes-pulsed DC protected mice against subsequent tumor challenge. Conclusion: Our data provide evidence that antigen-loading into DC using Lipofectin can promote MHC class I- restricted antigen presentation. Therefore, antigen-loading into DC using Lipofectin can be one of several useful tools for achieving efficient induction of antigen-specific immunity in DC-based immunotherapy.

• 한국식품과학회지
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• 제28권4호
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• pp.684-688
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• 1996

전통식품인 된장으로부터 혈소판 응집 저해활성을 갖는 항혈전 펩타이드를 탐색하고자 하였다. 증류수로 추출한 된장액을 한외 여과하여 얻은 분자량 3,000 dalton 이하의 여액에 대하여, SD흰쥐의 세척혈소판 (washed platelet)을 이용하여 ADP 자극으로 유도되는 혈소판응집의 저해정도를 aggregometer에서의 탁도로 측정하였을 때, $96\;{\mu}g/ml$로 처리시 90% 가량의 응집 저해효과가 확인되었다. 추출물을 Dowex 50W X-2 강양이온 교환칼럼을 이용하여 pyridine-formic acid 완충액의 pH (2.8-5.0) 및 몰농도(0.1-3.0M)를 단계별로 증가시키면서 용출시켜 19개의 획분(No.B-18)으로 분리하였다. 이들 획분의 활성을 microplate를 이용한 방법으로 측정하였을 때, 전체적으로 앞의 방법보다는 감도가 낮게 나타났으나 모든 분획에서 응집억제 효과가 확인되었다. 이때 용량반응 곡선으로부터 구한 각 획분의 $IC_{50}$은 $10-1,000\;{\mu}g/ml)$의 범위를 보였으며, 대부분의 획분들은 양성대조구인 RGDS $(IC_{50},\;205\;{\mu}g/ml)$보다 높은 활성을 나타내었다. 또한, 후반부의 염기성 획분$(IC_{50},\;10-20\;{\mu}g/ml)$에서 된장추출물$(IC_{50},\;30\;{\mu}g/ml)$보다 활성이 높게 나타났다. 이들 중 활성이 가장 높은 16번 획분을 아미노산 분석한 결과, 펩타이드 부분에 histidine, arginine, alanine 등이 높은 비율로 존재하였다.

• IMMUNE NETWORK
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• 제7권2호
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• pp.80-86
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• 2007

Background: CD40-activated B (CD40-B) cells might be an attractive source of autologous antigen-presenting cells (APCs) for immunotherapy due to the convenience to obtain from peripheral blood and expand in vitro. Moreover, CD40-B cells were found to be comparable with DCs in their capacity to raise antigen-specific CD8+ T cells. Here, we have established K562 cells expressing CD40L to expand CD40-activated B cells used for APCs. Methods: After activation of B cell by K562/CD40L, CD40-B cells were examined by counting B cell numbers. Surface expression of CD54, CD80, CD86 and HLA class II was measured by flow cytometry. The CD40-B cells were tested for its function as APC by mixed lymphocyte reactions (MLR) and by induction of T cell responses specific for pp65 peptide in vitro. Results: The expansion of B cells by K562/CD40L increased about 6-folds compared with anti-CD40 or K562. Furthermore, the expression of CD54, CD80, CD86 and HLA class II was up-regulated by K562/CD40L. B cells by K562/CD40L showed comparable antigen presentation activity with mature DCs as shown in MLR, INF-${\gamma}$ ELISPOT assay. Conclusion: These results suggest that K562/CD40L could be used to generate activated B cells as potent APCs which could be useful for cellular vaccination and adoptive immunotherapy.

• 대한한의학회지
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• 제42권4호
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• pp.150-163
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• 2021

Objectives: The purpose of this study was to confirm the effects of Liriope platyphylla extract on relieving Gastroesophageal reflux disease (GERD) through regulation of acid secretion. Methods: 8-week-old ICR mice were divided into untreated control group (Ctrl), GERD elecitation group (GERDE), Omeprazole administrate group before GERD elicitation (OMA), and Liriope platyphylla extract administrate group before GERD elicitation (LPA). After inducing GERD, gross observation and histological examination were performed and ATP6V1B1 (ATPase H+ Transporting V1 Subunit B1), GRPR (Gastrin-releasing peptide receptor), COX-1 (Cyclooxygenase 1), 8-OHdG (8-hydroxy-2'-deoxyguanosine), Cathelicidin, p-JNK (phospho c-Jun N-terminal kinase) were observed to confirm the damage defense effect of the esophageal mucosa, acid secretion regulation, antioxidant, anti-inflammatory, mucosal protection, and apoptosis regulation Results: OMA and LPA showed lower levels of damage compared to GERDE in gross observation and histological examination. ATP6V1B1, GRPR, and 8-OHdG showed lower positive reactions in OMA and LPA than in GERDE. COX-1 were less positive in GERDE and OMA than in Ctrl, but showed higher secretion in LPA than in Ctrl. Cathelicidin showed a decreased positive reaction in GERDE, OMA and LPA compared to Ctrl, but the decrease in positive reaction was smaller in OMA and LPA compared to GERDE. p-JNK showed increased positive reaction in GERDE, OMA and LPA than in Ctrl, but the increase in the positive reaction was smaller in the OMA and LPA compared to GERDE. Conclusions: The effects of Liriope platyphylla extract on esophageal mucosal damage protection, acid secretion regulation, antioxidant, anti-inflammatory, mucosal protection and apoptosis regulation were confirmed.

• 한국식품영양학회지
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• 제15권2호
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• pp.104-111
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• 2002

호열균 B. stearotheymophilus으로부터 단백질 고차구조 형성을 촉진하는 내열성 PPIase를 정제하기 위해, 이 균체를 대량으로 배양 집균, 파쇄하여 효소활성을 측정하였다. 효소의 활성측정은 N-succinyl-Ala-Ala-Pro-Phe-p-nitroanilide(pAN)를 기질로 사용하였다. chymotrypsin은 기질 이성체(cis-trans 형)의 한쪽(trans)만을 특이적으로 분해하는 반응을 이용하여 PPIase 활성을 측정하였다. 호열균 추출시료로 부터 효소활성을 확인한 후, DEAE-sepharose CL-6B, Sephadex G-75로 정제 후, 최종적으로 Superose TM-12 (FPLC) gel-필트레이션으로 분자량 18kDa의 본 효소를 정제하였다. 정제한 효소의 화학적 특징을 조사한 결과 pH 7.5~8.0사이에 안정하였으며, 최적 pH는 8.0으로 나타났다. 그리고 $65^{\circ}C$에 30분간 열처리 후, 효소활성을 측정한 결과 50%이상의 잔존 활성을 갖는 내열성 효소임을 확인하였다. 정제 단백질의 N-말단 아미노산 분석은 Edman 분해법으로 39 아미노산 잔기를 결정하였다. 그리고 PPIase의 재구성(refolding) 반응은, 요소로 변성시킨 기질 RNase 1을 이용하여 이 단백질의 재구성 (refolding) 실험을 조사한 결과, PPIase는 변성 기질 RNase 1의 재구성(refolding)을 촉진하는데 높은 효과를 가지고 있었다. 호열균 유전자 라이브러리로부터 PPIase 유전자 약 3kb을 클로닝하였다. 재조합 플라스미드 cPI-40에서 프라이머(A-1, B-2)를 이용하여 PPIase N-말단을 코드하는 유전자를 PCR법으로 증폭하여, 염기배열을 결정한 결과 증폭된 단편은 165염기로 형성된 55 아미노산 잔기를 코드하는 open reading frame(ORF)가 연속되고 있었다. 그리고 Edman법으로 결정한 PPIase의 39아미노산 잔기가 이 배열내에 완전히 보존되어 있었다. 이 결과로부터 이 ORF는PPIase구조 유전자의 1/3에 해당하는 단편임을 확인하였다.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
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• 한국생물공학회 2000년도 추계학술발표대회 및 bio-venture fair
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• pp.655-659
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• 2000

토양에서 분리한 endo-inulinase 생산 균주인 Xanthomonas oryzae #5로 부터 11.5kb의 endo-inulinase 유전자를 포함하는 재조합 plasmid를 함유한 형질 전환주를 분리하였다. 11.5kb의 단편으로부터 8.6kb, 4.1kb의 단편을 포함한 pDI 2, pDI4 재조합 plasmid를 제작하여 활성을 확인한 결과 endo-inuliase 활성을 나타내었으며, 재조합 plasmid pDI 2를 이용하여 DNA sequence를 한 결과 endo-inulinase 유전자는 1,333개의 아미노산으로 구성된 ORF를 가지고 있었다. 또한 B. circulans MCI-2554의 CFTase와 아미노산 배열에 있어은 약 72%의 높은 homology를 나타냈었으며, 다른 fructan hydrolases, inulinase, levanase와의 아미노산 비교로부터 ${\beta}-fructouranosidase$ motif를 포함한 6개의 유사부위를 확인하였다.