• Title/Summary/Keyword: 환경유전자

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Regulation of Intracellular pH by SHC1 in Saccharomyces cerevisiae (효모에서 SHC1 유전자의 이온 농도 조절에 의한 세포내 pH 항상성 유지)

  • 하승길;전준철;최의열
    • Korean Journal of Microbiology
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    • v.38 no.3
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    • pp.168-172
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    • 2002
  • Budding yeasts maintain an effective system to regulate intracellular pH in response to environmental pH fluctuation. In a previous study we reported that SHC1 plays a role in cell growth at alkaline condition, not at acid pH. We constructed a null mutant deleted an entire open reading frame for SHC1. To test whether the retardation in cell growth was caused by the absence of intracellular pH buffering capacity, we measured intracellular pH with a pH-sensitive fluorescent dye, C.SNARE. The intracellular pH of the mutant cell was much higher than that of wild-type cells, indicating that the mutant cells lack some types of buffering capacity. We also investigated the level of $Na^+ and K^+$ content with atomic mass spectroscopy after alkali shock. Wild-type cell showed a higher level of intracellular K^+$ content, whereas there was no difference in $Na^+$ level. The result suggested that K^+$ is more important in the regulation of intracellular pH in yeasts.

Genetic Analysis of Taste of Korean Hot Pepper (한국 고추맛의 유전 분석)

  • Soh, Jae-Woo;Cho, Chi-Woong
    • Journal of agriculture & life science
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    • v.46 no.6
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    • pp.1-8
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    • 2012
  • This study was carried out to determine the genic values of taste of Korean hot pepper (Capsicum annuum L.) in practical genetic resources of using to breed them. The two breeding materials of pepper, '#1803' ($P_1$) of prefer tastes and '#1532' ($P_2$) of ordinary taste, and their $F_1$, $F_2$ generations were used in this study. By using partitioning method it was possible to estimate, from the $F_2$ generation, the number of effective factor pairs differentiating the two parents. There were found to be differentiated by two effective factor pairs. In practical genetic resource of using to breed the Korean hot pepper, the heritance of pepper tastes showed that the $F_1$ was better than excellent parent by reason of over dominant, but some $F_2$ was better than both parent by transgressive segregation. As the result, the magnitude of genic effects of A-a gene in pepper tastes was 0.36, and B-b gene was 0.64. The tastes of Korean hot pepper showed a complex inheritance by interaction effect on the two non-allelic factors of 0.94 and secondary effect of 2.86 at the most.

Association between Genetic Polymorphism of the Human Angiotensin I Converting Enzyme Gene ana Athletic Performance (한국인 운동선수군에서 안지오텐신 전환효소 유전자의 다형성과 심폐 지구력과의 관련성에 관한 연구)

  • Kang, Byung-Yong;Oh, Sang-Duk;Bae, Joon-Seol;Kim, Ki-Tae;Kim, Jae-Hyoun;Lee, Kang-Oh
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
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    • v.17 no.4
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    • pp.299-305
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    • 2002
  • 심폐 지구력은 유전인자에 의해 부분적으로 결정되며, 현재까지 이루어진 연구 결과에 의하면 안지오텐신 전환효소 유전자에 존재하는 다형성과 이 형질 사이에 유의한 관련성이 보고되고 있다. 그러나, 이러한 연구는 주로 서양인을 대상으로 수행되었기 때문에 유전적 배경이 다른 아시아 집단에 대해서는 아직까지 이렇다 할 연구 성과가 없는 실정이다. 이에, 본 연구에서는 아시아 집단중에서도 민족적으로 순수한 한국인 집단을 대상으로 안지오텐신 전환효소 유전자에 존재하는 다향성이 한국인 집단에서도 심폐 지구력과 유의한 관련성이 있는 지를 조사하였다. 그러나, 한국인 운동선수군을 대상으로 한 연구에서는 안지오텐신 전환효소 유전자의 다향성이 심폐 지구력을 비롯한 신체 계측치 및 생화학적인 측정치 들과 어떠한 관련성도 나타내지 않았다(P<0.05). 그러나, 본 연구 대상으로 다양한 종목에서 선발된 운동선수들을 표본으로 하였기 때문에, 단일 종목의 운동 선수군을 대상으로 한 추시가 요구된다.

Interleukin 4 Receptor (IL-4R) Gene Polymorphism in Korean Stroke Patients by Using Pyrosequencing (Pyrosequencing을 이용한 한국인 중풍 환자의 Interleukin 4 Receptor (IL-4R) 유전자 다형성)

  • Han, Sang-won;Lim, Seong-chul;Jung, Tae-young;Shin, Dong-hoon;Kim, Min-jung;Seo, Jung-chul
    • Journal of Acupuncture Research
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    • v.21 no.2
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    • pp.21-29
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    • 2004
  • 목적 : 본 연구는 Interleukin 4 Receptor (IL-4R) 유전자 다형성이 중풍의 발병과 관련이 있는지 알아보기 위해 수행되었다. 대상: 대구한의대학교부속 한방병원에 입원한 중풍환자 56명과 종합건진센터에 내원한 중풍 기왕력이 없는 건강인 83명을 대상으로 하였다. 방법 : 각 그룹에서 개개인마다 DNA를 분리 정제한 후 Taq polymerase로 증폭하여 한천 겔에서 전기영동을 하여 PCR 산물을 확인하였다. PCR 산물은 Pyrosequencing 과정을 통하여 IL4R의 유전형이 자동으로 판정되었다. 결과 : A/A, A/G, G/G의 세가지 유전자형이 검출되었으며 중풍군과 대조군 사이에 유의성 있는 차이가 발견되었다(p=0.005). 그러나 개별 allele 빈도에 있어서는 중풍군과 건강인 사이에 통계적인 유의성이 나타나지 않았다(p=0.995). 결론 : 이상의 결과를 통하여 IL4R 유전자 다형성은 중풍의 발병과는 관련성이 있는 것으로 사려되지만 더 많은 환자를 대상으로 다른 환경요인 또는 유전자와의 연관성에 대한 심도있는 연구가 필요하다고 하겠다.

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A Field Artillery Targeting Problem with Time Window by Genetic Algorithm (유전자 알고리즘을 이용한 시간제약 포병 표적처리문제)

  • Seo, Jae-Uk;Kim, Ki-Tae;Jeong, Geon-Wook
    • Journal of the military operations research society of Korea
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    • v.36 no.2
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    • pp.11-24
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    • 2010
  • Quick precision-strike capability of the artillery will be an important factor in modern and future war and it's represented by NCW and EBO. This study is based on artillery which has time limitation of firing, such as artillery which hides when not firing, and modeling various situations to decide firing order and who to shoot. The main purpose of this study is to suggest a mathematical programming model and a genetic algorithm which satisfies the limitation of firing time. The objective function is to minimize the total firing time to spend. The results of the suggested algorithm quickly gives a best solution for a large scale field artillery targeting problems.

Distributed Autonomous Robotic System based on Artificial Immune system and Distributed Genetic Algorithm (인공 면역 시스템과 분산 유전자 알고리즘에 기반한 자율 분산 로봇 시스템)

  • Sim, Kwee-Bo;Hwang, Chul-Min
    • Journal of the Korean Institute of Intelligent Systems
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    • v.14 no.2
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    • pp.164-170
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    • 2004
  • This paper proposes a Distributed Autonomous Robotic System(AIS) based on Artificial Immune System(AIS) and Distributed Genetic Algorithm(DGA). The behaviors of robots in the system are divided into global behaviors and local behaviors. The global behaviors are actions to search tasks in environment. These actions are composed of two types: dispersion and aggregation. AIS decides one among above two actions, which robot should select and act on in the global. The local behaviors are actions to execute searched tasks. The robots learn the cooperative actions in these behaviors by the DGA in the local. The proposed system is more adaptive than the existing system at the viewpoint that the robots learn and adapt the changing of tasks.

Proteomic Application in Cell Biology (세포생물학과 Proteomics 응용)

  • 김동욱
    • Korean Journal of Microbiology
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    • v.37 no.2
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    • pp.109-113
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    • 2001
  • As the complete genomic sequences accumulate, the use of global techniques became possible. DNA microarray is a powerful technology for measuring global mRNA levels. This method, however, does not provide information on post-translational modifications of proteins. In addition, mRNA levels do not strictly correlate with protein concentrations, especially for lower-abundance proteins. Therefore, studies at the level of transcription are not sufficient to understand cellular activity. Proteomic techniques to analyze protein expression and function at the large-scale have been developed and used. This review introduces a simple explanation for proteomic analysis and examples of how proteomics is applied in cell biology.

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Transformation of A Plant by Ascorbate Peroxidase Gene using Agrobacterium tumefaciens (Ascorbate Peroxidase 유전자의 도입에 의한 식물의 형질전환)

  • 이인애;이효신;배은경;김기용;이병현;손대영;조진기
    • Journal of The Korean Society of Grassland and Forage Science
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    • v.22 no.2
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    • pp.101-106
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    • 2002
  • This study was conducted to obtain the transformed tobacco (Nicotiana tubacum) plants with cytosolic ascorbate peroxidase gene(ApxSC7) using Agrobacterium tumefaciens LBA4404. A cDNA encoding the cytosolic ascorbate peroxidase of strawberry, ApxSC7, was introduced into tobacco plants via Agrobacterium-mediated gene transfer system. The expression vector, pIG-AP8, harboring ApxSC7 gene was used for production of transgenic tobacco plants. A large number of transgenic plants were regenerated on a medium containing hygromycin. Integration of ApxSC7 gene was confirmed by PCR and Southern blot analyses with genomic DNA. Northern blot analyses revealed that the pIGap8 gene was constitutively expressed.

Transformation of Orchardgrass (Dactylis glomerata L.) with Glutathione Reductase Gene (Glutathione Reductase 유전자의 도입에 의한 오차드그래스의 형질전환)

  • 이효신;배은경;김기용;원성혜;정민섭;조진기
    • Journal of The Korean Society of Grassland and Forage Science
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    • v.21 no.1
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    • pp.21-26
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    • 2001
  • To develop transgenic orchardgrass resistant to reactive oxygen species produced from environmental stresses, a vector with the cytosolic glutathione reductase cDNA (BcGRl) from Chinese cabbage was constructed under the control of the cauliflower mosaic virus 35S promoter and was introduced into orchardgrass using Agrobacterium tumefaciens EHA101. Transgenic plants from hygromycin-selected calli of orchardgrass did not show any morphological difference from wild-type plants. The results of PCR amplification and genomic Southern blot analysis confirmed the integration of foreign gene into the chromosome of transgenic orchardgrass. Northern blot analysis with total RNA from leaves also confirmed the constitutive expression of BcGR1 in transgenic orchardgrass.

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An Energy Awareness Congestion Control scheme based on Genetic Algorithms in Wireless Sensor Networks (유전자 알고리즘 기반의 에너지 인식 트래픽 분산 기법)

  • Kim, MiKyoung;Park, JunHo;Seong, DongOok;Yoo, JaeSoo
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2010.11a
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    • pp.979-982
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    • 2010
  • 최근 한정된 에너지를 기반으로 동작하는 센서 네트워크 환경에서 에너지를 효율적으로 사용하기 위한 많은 연구가 이루어지고 있다. 대표적인 연구로써 이벤트 발생 여부에 따른 노드의 가변 센싱 및 전송 기법의 경우, 특정 노드에서 네트워크 혼잡을 야기하여 전송 패킷의 손실 및 전송 모듈의 과다 사용으로 인한 네트워크의 수명이 감소하게 된다. 이를 해결하기 위해, 유전자 알고리즘을 기반으로 네트워크 패킷을 주변 노드로 분산시키는 TARP 가 제안되었다. 하지만 TARP 의 경우, 유전자 알고리즘의 핵심 단계인 적합도 평가에서 사용되는 적합도 함수에 인접 노드의 평균 데이터 전송량 및 데이터 분산만을 고려하여 트래픽을 분산하기 때문에, 전체 네트워크 수명에 대한 추가적인 고려가 필요하다. 이를 해결하기 위해 본 논문에서는 유전자 알고리즘 기반의 에너지 인식 트래픽 분산 기법을 제안한다. 제안하는 기법은 적합도 평가에서 잔여 에너지량 및 단일 노드의 데이터 전송량을 추가적으로 고려함으로써, 보다 효율적인 트래픽 분산을 수행하여 네트워크 수명을 증가시킨다. 제안하는 기법의 우수성을 보이기 위해 시뮬레이션을 통해 기존의 트래픽 분산 기법(TARP)과 제안하는 기법과의 성능을 비교하였다. 그 결과 기존 기법에 비해 평균 27% 이상의 네트워크 수명의 향상을 보였다.