• Environmental Analysis Health and Toxicology
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• v.21 no.1 s.52
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• pp.21-26
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• 2006

본 연구는 DNA 상해유도기작을 규명하기 위하여 하등 진핵생물인 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe로부터 subtraction hybridization방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UV150과 UV200을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. 분리한 유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선 조사 1시간 후부터 발현이 증가되었다. 또한 알킬화제인 Methyl Methanesulfonate (MMS) 처리에 의해서도 발현이 증가되었다. 이 결과 다른 UV-inducible유전자와는 다르게 분리한 UV150유전자는 UV에 UV200유전자는 MMS에 의하여 발현이 증가됨을 알 수 있었다. 유전자의 기능을 알기 위하여 URA4 유전자를 이용하여 null-mutant 세포주를 제조하여 그 특성을 살펴본 결과 분리한 UV150 유전자는 세포의 성장에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2010.10a
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• pp.3-3
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• 2010

GM 들잔디의 환경위해성평가는 유전자변형생물체의 국가간이동등에 관한 법률 (2008년)에 안전관리 및 시험평가가 수행되었다. 일반적으로 GM 작물의 환경위해성평가는 도입 유전자의 안정적 발현여부, 일반적으로 사용되어온 식물과의 실질적 동등성, 화분비산에 의한 유전자이동성 검정, GM재배작물 주변 환경에 미치는 영향, GM작물 및 유전자의 인체 및 동물에 대한 안전성 평가, 위해성 관리 등이 있다. 본 발표에서는 제초제저항성 GM 들잔디를 실용화 하기위한 환경위해성평가의 내용을 소개하기 위하여 GM 들잔디의 안전성평가를 수행한 포장시험에 대해서 간략히 발표하고자 한다. GM 들잔디는 제초제저항성 유전자가 식물체내에 1개의 복제수를 갖으며, 후세대에서도 안정적으로 발현되었다. 또한 TAIL PCR을 통한 도입 유전자의 삽입 부위를 확인하였고, 주변염기서열을 이용한 JG21 들잔디 만의 특이적 염기서열을 얻었다. GM 들잔디의 실질적 동등성검정은 격리온실 수준과 격리포장 수준에 생물학적, 화학적 특성을 조사하였고, 일반 들잔디와 큰 차이가 없음을 확인하였다. GM 들잔디의 화분은 일광조건하에서 약 1시간 이내에 불활성 되었고, 실내의 실온조건에서는 3시간까지 활성이 유지되었다. GM 들잔디 재배포장 ($12m{\times}6m$ 크기)으로부터 화분비산 밀도는 3 m 이내에서 높게 나타났고, 9 m 이상의 거리에서는 낮은 빈도로 일정하게 나타났다. 화분비산에 의한 GM 들잔디 유전자이동성은 근접거리에서 약 15%가 관찰되었고, 반경 3 m 이내에서 거리에 따라서 2 ~ 0.12%의 유전자이동성이 관찰되었다. 각각의 시험모형에 따른 GM 들잔디와 일반들잔디 간의 교잡율을 조사한 결과 들잔디 교잡율은 GM 잔디의 면적과 거리에 의존적이었고, GM 들잔디 면적에 따라서 6-21%의 교잡율이 나타났다. GM들잔디의 인체위해성평가는 독성 및 알레르기 반응성을 검정하였고, 도입유전자 산물인 PAT 단백질은 독성 및 알레르기 반응성이 없음이 알려져 있다. 본 연구에서는 GM들잔디의 독성 및 알레르기 반응성을 검토한 결과 아플라톡신 등의 독성은 검출되지 않았으나, GM과 일반 들잔디 모두에서 화분 알레르기 반응성이 양성으로 나왔다. 그러나 GM들잔디에 도입된 유전자에 의한 알레르기 반응이 아닌 일반들잔디 화분에 가진 알레르겐에 의한 반응성이라 할 수 있다. GM들잔디의 비의도적 방출가능성을 조사하기위하여 시험포장외부의 자연환경에 대해서 환경모니터링을 수행한 결과 GM 들잔디의 유출 및 유전자이동 의한 제초제저항성 들잔디는 나타나지 않았다.

• Korean Journal of Environment and Ecology
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• v.30 no.5
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• pp.810-820
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• 2016

This study is focused on the investigation of the genes which are induced by various stresses of the halophyte Salicornia herbacea. One of the factors influencing in the germination of Salicornia herbacea is salt stress. The highest germination rate was found in the condition without NaCl, and the upper limit of the NaCl concentration for the germination of Salicornia herbacea was 7%. The optimal temperature of $20^{\circ}C$showed a germination rate of 98%. Among genes induced by stress the 2CysPrx gene was cloned and analyzed for this study. The 2CysPrx gene has two cysteine conserved residues and is composed of 275 amino acids with molecular weight of 30.1kDa. The 2CysPrx gene appeared to be one copy in the genome and consists of 6 introns and 7 exons. Quantitative real-time PCR revealed that the highest transcription rate induced by NaCl and $H_2O_2$ appeared to be at the concentration of 3.5% NaCl and 40mM $H_2O_2$, respectively. The amount of transcript induced by high temperature($40^{\circ}C$) and $75{\mu}M$ of ABA was respectively highest. The gene at low temperature ($4^{\circ}C$) appeared not to be expressed. We are conducting to clone other peroxyredoxin genes induced by various environmental stresses.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.31 no.4
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• pp.286-291
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• 1993

The $Km^{r}$ gene and plasmid of natural isolate and genetically modified microorganisms (GMM) rearranged by conjugation in water environments were comparatively analyzed by agarose gel electrophoresis and Southern analysis. The transfer rates of the $Km^{r}$ gene from GMM strains were generally 100 times higher than thosc of natural iso]ate(DKI) under laboratory cnvironments, but their transfer rate was not much different in Moosimcheon River water. The conjugants obtained in LB(Luria-Bertani broth) and FW(filtered river water) water under laboratory conditions showed same number of the plasmids. but the sizes of the plasmids were changed. The $Km^{r}$ gene in the conjugants was found in the same position as the pDKJO] $Km^{r}$ plasmid. In case of the GMM strains as donor. the large plasmids of 180 kb appeared in conjugants obtained in LB and FW water. Especially, the $Km^{r}$ gene in the donor of DKC600 was found to be inserted into chromosome of the conjugant obtained in FW water. However. in the conjugants obtained from DKl and DKB 701 in Moosimcheon River water, the plasmids were rearranged by 4 and 8. respectively, and all of them showed hybridization by the $Km^{r}$ probe. But the small plasmids of the recipient disappeared in the conjugant from DKC600 as donor, and the rearranged plasm ids and chromosome in the conjugants were observed to be hybridized with the $Km^{r}$ probe. Therefore, rearrangement of $Km^{r}$ gene and plasmids by conjugation was found to be afTected diversely by cellular characteristics as well as by environmental factors.

• Journal of Plant Biotechnology
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• v.35 no.4
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• pp.291-298
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• 2008

Methylmercury, an organic derivative, is the principal form of mercury that biomagnifies and causes neurodegenerative symptoms in animals. In recent years, living modified organism (LMO) resulting from biotechnology has played a highly visible and controversial role. Despite the potential benefits of this technology, public concerns have been raised about the environmental risk of LMO. The concern on the risk from LMO release has urged efforts to evaluate and manage the risks of the LMO. To build up the capacity building of risk assessment method for LMO used environmental remediation, we engineered Solanum nigrum L, expressing the modified bacterial gene, merB, encoding organomercurial lyase. Two independently isolated transgenic lines produced merB RNA. Transgenic Solanum nigrum leaf discs expressing merB gene showed organic mercury resistance, forming shoots well on growth medium containing $0.5{\mu}M$ methylmercury (II) chloride and $1{\mu}M$ phenylmercuric acetate while control plants breached. Transgenic merB seeds germinated and grew on growth medium containing $2{\mu}M$ methylmercury (II) chloride and phenylmercuric acetate. The merB transgenic plants will be used for risk assessment of natural environment.

• Environmental Analysis Health and Toxicology
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• v.23 no.3
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• pp.179-186
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• 2008

내분비계 장애물질 중 에스트로겐성 특성을 지닌 것으로 알려진 bisphenol A에 폭로되었을 때에 나타나는 이상 증상과 selenoprotein N 결핍 증상은 유사성이 있는 것으로 관찰되었다. 이에 본 연구에서는 bisphenol A에 폭로된 생물체의 selenoprotein N 유전자 발현에 영향을 미치는지에 관해 연구하였다. 실험동물은 zebrafish (Danio rerio, wild type)의 수정란을 사용하였다. Zebrafish의 수정란은 서로 다른 농도의 bisphenol A (0.1, 1, 10 ppm)에 노출하였다. 각각의 폭로 환경에서 부화된 치어를 시료로 selenoprotein N 유전자 발현을 RT-PCR방법에 의해 알아보았다. 그 결과, bisphenol A는 척추이상과 심장이상이 나타나 selenoprotein N 이상시 나타나는 현상과 유사성을 보였다. Selenoprotein N 유전자 발현은 bisphenol A 폭로 농도가 높아짐에 따라 유전자 발현 농도가 낮아지는 것으로 관찰되었다. 특히 1 ppm 농도에서는 대조군이나 0.1 ppm 농도보다 catalase의 활성이 높게 나타나 특정 농도에서 bisphenol A에 의한 영향이 나타나는 것을 알 수 있었다.

• Environmental Analysis Health and Toxicology
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• v.18 no.4
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• pp.243-247
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• 2003

고혈압은 다양한 유전적 요인과 환경적 요인들이 상호작용하여 발병하는 질환으로, 기존의 연구에서 dopamine D3 receptor(DRD3)와 고혈압과의 관련성에 관한 보고들이 있었다. 이에, 본 연구에서는 DRD3 유전자에 존재하는 Bail제한절편길이 다형성이 한국인 집단에서 고혈압과 어떠한 관련성이 있는 지를 조사하였다. 환자-대조군 연구를 수행한 결과 이 유전자에 존재하는 다형성은 한국인 집단에서 고혈압과 유의한 관련성을 나타내지 않았다. 그러나, 이 다형성을 구성하는 대립 유전자의 빈도를 여러 민족집단의 결과들과 비교했을 때, 흑인 집단과 유의한 차이를 나타내었다. 따라서, 이러한 결과는 DRD3유전자에 존재하는 다형성이 고혈압과의 관련성을 나타내는 지를 정확하게 이해하기 위해서는 혹인 집단을 비롯한 다른 민족집단들을 대상으로 하여 광범위한 연구를 수행할 필요가 있을 것으로 생각된다.

• The Korean Journal of Applied Statistics
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• v.28 no.5
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• pp.859-870
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• 2015

Economic-traits of livestock are affected by environmental and genetic factors. We are interested in genetic factors that influence the economic-traits of Korean cattle. It is necessary to adjust environmental factors in order to enhance the accuracy of the genetic effect analysis. In this paper, we propose a statistical model of Korean cattle that exclude environmental breeding farm and age factors. We formulated an adjusted economic-trait value, and applied multifactor dimensionality reduction (MDR) method to data of before-and-after adjustment to identify major FABP4 genes. We were able to increase the accuracy of the analysis after adjustment and identify superior FABP4 genes that influence grade and fatty acid.

• Environmental Analysis Health and Toxicology
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• v.20 no.4 s.51
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• pp.327-332
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• 2005

장기간 노출 시 발암 등 인체 유해성을 갖는 환경유래 내분비장애물질(endocrine disrupting chemicals, EDCs)에 대한 선택적이고 민감한 노출지표를 개발하기 위하여 본 연구에서는 DNA microarray를 이용하였다. 피험자는 아직 특별한 질환을 갖지 않는 18세 이상 연령, 성을 맞춘 EDCs고농도 노출군(N = 16)과 저농도군(N = 16)으로 구성되었다. 노출정도 구분은 10년 이상 거주지가 K산업폐기물 소각장과 2.5 km 반경 내, 외 인지에 따라 고노출군,저노출군으로 구분하였다. 피험자의 말초혈에서 total RNA를 분리, 각 군당 B인씩 pool로 cDNA를 합성하여 oligonucleotide DNA 칩에 적용하였다. 유전자발현의 차이를 GenePixPro 4.0 software를 이용하여 분석하였다. 총 3장의 칩을 이용하여 공통적으로 저노출군보다 고노출군에서 2배 이상 발현의 증가를 보인 유전자는 plasminogen activator(PLAT)등 12종이 관찰되었고, l/2이하로 발현의 감소를 보인 유전자는 kallikrein 3 (KLK3)등 29종이었다. 이 들 유전자는 PLAT등 면역계 반응에 관여하는 유전자 및 apoptosis, transport, G protein, chromatin, 암화, 발생 (development), 대사 등에 관여하는 유전자들이었다. 그러므로 KLK3등 본 연구에서 발굴한 유전자는 향후 확대된 인구에서 본 연구 결과의 확인을 통하여 EDCs특이적 노출지표로써, 나아가 암 등 EDCs관련 질병의 기전 및 병인학을 구명하는데 이용가치가 높다고 사료된다.

• Proceedings of the Korean Institute of Intelligent Systems Conference
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• 2004.10a
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• pp.173-176
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• 2004

유비쿼터스 컴퓨팅 환경에서는 각 클라이언트는 자신이 처한 환경에 따라서 여러 가지 장치를 사용할 수 있고, 각 장치는 각기 다른 클라이언트의 요구를 동시에 받을 수 있다. 본 논문에서는 클라이언트들이 보내는 프린트 요청을 받아 사용자에게 적절한 프린터로 출력하는 유비쿼터스 컴퓨팅 환경에서의 프린터 서버를 가정한다. 그러나 프린터 서버는 많은 클라이언트로부터 동시에 프린트 요청을 받을 수 있으므로, 가능한 모든 클라이언트의 요청을 만족시킬 수 있는 스케줄링을 해야 한다. 이러한 목적을 위한 유전자알고리즘을 이용한 유비쿼터스 환경에서의 실시간 프린터 스케줄링 방법을 제안한다.