• Title/Summary/Keyword: 해양 유전

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A Study on the Irregular Nesting Problem Using Genetic Algorithm and No Fit Polygon Methodology (유전 알고리즘과 No Fit Polygon법을 이용한 임의 형상 부재 최적배치 연구)

  • 유병항;김동준
    • Journal of Ocean Engineering and Technology
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    • v.18 no.2
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    • pp.77-82
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    • 2004
  • The purpose of this study is to develop a nesting algorithm, using a genetic algorithm to optimize nesting order, and modified No Fit Polygon(NFP) methodology to place parts with the order generated from the previous genetic algorithm. Various genetic algorithm techniques, which have thus far been applied to the Travelling Salesman Problem, were tested. The partially mapped crossover method, the inversion method for mutation, the elitist strategy, and the linear scaling method of fitness value were selected to optimize the nesting order. A modified NFP methodology, with improved searching capability for non-convex polygon, was applied repeatedly to the placement of parts according to the order generated from previous genetic algorithm. Modified NFP, combined with the genetic algorithms that have been proven in TSP, were applied to the nesting problem. For two example cases, the combined nesting algorithm, proposed in this study, shows better results than that from previous studies.

An Application of Surrogate and Resampling for the Optimization of Success Probability from Binary-Response Type Simulation (이항 반응 시뮬레이션의 성공확률 최적화를 위한 대체모델 및 리샘플링을 이용한 유전 알고리즘 응용)

  • Lee, Donghoon;Hwang, Kunchul;Lee, Sangil;Yun, Won-young
    • Journal of the Korea Institute of Military Science and Technology
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    • v.25 no.4
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    • pp.412-424
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    • 2022
  • Since traditional derivative-based optimization for noisy simulation shows bad performance, evolutionary algorithms are considered as substitutes. Especially in case when outputs are binary, more simulation trials are needed to get near-optimal solution since the outputs are discrete and have high and heterogeneous variance. In this paper, we propose a genetic algorithm called SARAGA which adopts dynamic resampling and fitness approximation using surrogate. SARAGA reduces unnecessary numbers of expensive simulations to estimate success probabilities estimated from binary simulation outputs. SARAGA allocates number of samples to each solution dynamically and sometimes approximates the fitness without additional expensive experiments. Experimental results show that this novel approach is effective and proper hyper parameter choice of surrogate and resampling can improve the performance of algorithm.

대하의 자연산과 인공종묘의 유전적 변이성 및 방류효과

  • 한현섭;장인권;임현정;박영제;김종화
    • Proceedings of the Korean Society of Fisheries Technology Conference
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    • 2003.05a
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    • pp.185-186
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    • 2003
  • 대하, Fenneropenaeus chinensis 는 주로 중국의 북부 및 발해와 우리나라의 남ㆍ서해에 서식하는 보리새우과의 고급 종으로, 우리나라에서는 매년 약 3,000톤 정도가 양식으로 생산되어 산업적으로 매우 중요한 위치를 차지하고 있다. 최근에는 서식지에서의 남획과 환경의 악화, 양식 새우에 대한 바이러스 질병 등으로 어획량 및 양식 생산량이 매년 감소되고 있어서, 이 종에 대한 효율적 관리와 자원 조성을 위한 생물학적 및 유전학적 연구가 필요하다. (중략)

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넙치(Paralichthys olivaceus) 정액의 냉동보존과 보존정자를 이용한 치어 생산

  • 장윤정;장영진;이정용
    • Proceedings of the Korean Society of Fisheries Technology Conference
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    • 2001.10a
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    • pp.283-284
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    • 2001
  • 넙치(Paralichthys olivaceus)는 1986년부터 본격적으로 양식되기 시작한 어종으로 현재 국내 어류 양식에서 차지하는 비율이 가장 높다. 그러나, 한정된 친어에서 생산된 수정란의 사용으로 유전적 다양성이 감소하고 있어, 우량한 형질의 유전자를 가진 친어를 이용하여 유전적 다양성을 유지하는 일이 필요하다. 또한, 일본에서 수입된 수정란으로 생산된 치어가 우리나라 연안에 방류됨으로써, 자연 상태에서 국산 넙치와의 잡종이 발생하고 있어 국산 넙치의 종보존이 시급한 실정이다. (중략)

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넙치에서 분리된 버나바이러스 strian들의 혈청학적, 유전학적 연구

  • 박상천;김영진;오명주;정성주
    • Proceedings of the Korean Society of Fisheries Technology Conference
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    • 2001.05a
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    • pp.513-514
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    • 2001
  • 지금까지의 연구에서 한국산 넙치 치어에서 분리된 버나바이러스인 NCI strian은 MABV(Marine Birnavirus) 와 혈청학적으로 유사하며 VP2/NS 경계영역의 염기배열에서도 MABV와 매우 높은 homology를 가지고 있음을 밝혔다. 본 연구에서는 남해안 일대의 넙치종묘배양장에서 1999년부터 2000년 사이에 분리된 5개 버나바이러스 strain들의 혈청중화시험과 VP2/NS경계영역의 염기배열을 검색하여 이들 strain들은 서로 유사한 혈청학적, 유전적 성상을 가지는 것을 밝혔다. (중략)

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Evidence of Intrusion of a Rare Species, Peristedion liorhynchus, into Korean Waters Based on High-throughput Sequencing of the Mixed Fish Eggs (희귀종 남방황성대(Peristedion liorhynchus)의 한국해 유입 증거 혼합 어란의 대용량 염기서열 분석법(high-throughput sequencing)으로 발견)

  • Choi, Hae-young;Chin, Byung-sun;Park, Gyung-soo;Kim, Sung
    • Korean Journal of Ichthyology
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    • v.34 no.1
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    • pp.8-15
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    • 2022
  • The appearance of larvae of a rare species, Peristedion liorhynchus, in Korean waters is suggestive of spawning or adult intrusion. We conducted high-throughput sequencing (HTS) on 31,776 pelagic fish eggs collected from 123 stations off the Korean Peninsula during May to August in 2013, 2014 and 2017. A total of 21,621,874 HTS reads were mapped onto the P. liorhynchus COX1 reference sequence. Three consensus sequences (313 bp) were constructed from the three samples, respectively, off Uljin and Goeje Islands in May and off Ulsan in July. These samples were formed a clade with P. liorhynchus in the maximum likelihood tree of Peristedion. The average genetic distance within the P. liorhynchus clade (0.0054±0.0046) was less than that among clades (0.1475±0.0396). The results indicate that the HTS analysis of mixed fish eggs is useful for monitoring the intrusion of rare species such as P. liorhynchus in Korean waters.

A Study on the Relation between Hull Geometric Characteristics and Performance in the Yacht Design (요트 설계시 선형의 기하학적 특성과 성능 사이의 관련성에 관한 연구)

  • 하득기;김수영;김용재
    • Journal of Ocean Engineering and Technology
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    • v.17 no.6
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    • pp.91-95
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    • 2003
  • Yacht design is significantly affected by the hull geometrical characteristics. Therefore, it is necessary to closely examine the relation between hull and performance, before considering characteristics of sea condition. In this study, Genetic Programming is used to derive a formula the relationship between hull geometric characteristics and performance. Using the formula, a new guideline is proposed to determine performance of a yacht.

홍합 Mytilus galloprovincialis에서 클로닝한 접착단백질 Mgfp-5의 유전학적 생산연구

  • 차형준;황동수
    • Proceedings of the Korean Society of Fisheries Technology Conference
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    • 2003.05a
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    • pp.27-29
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    • 2003
  • 해양생명체인 홍합(mussel)은 접착단백질(adhesive protein)을 생산, 분비함으로써 홍합 자신을 바다 속의 바위와 같은 젖은 고체표면에 단단히 부착할 수 있도록 하여 강한 파도의 충격이나 바닷속의 부력 효과에 대하여도 저항할 수 있다. 홍합접착단백질은 현재 알려진 어떠한 화학합성 접착제보다도 강력한 자연적인 접착제로 알려져 있으며 대부분의 에폭시 수지보다 두 배 정도의 커다란 인장강도를 지니고 있으면서도 휘어질 수 있는 유연성을 가지고 있는 혁신적인 물질이므로 접착제 산업계에서 매우 커다란 관심을 끌고 있다. (중략)

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