• Microbiology and Biotechnology Letters
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• v.35 no.2
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• pp.112-117
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• 2007

Protein kinases play very important role for maintaining viability in prokaryote and eukaryote. The metabolism of prokaryotic cell is generally regulated by bacterial two-component regulatory systems that are composed of histidine and asparitic acid kinases, however, some eukaryotic signal transduction system such as, serine and threonine kinases, have been also found to be involved in the regulation of morphogenesis and physiological differentiation in Streptomyces. Streptomyces griseus, a streptomycin producer, was expected to have varlous types of eukaryotic-type serine/threonine protein kinases, controlling morphogenesis. Thus, many steps of chromatographies were applied to isolate serine and threonine kinases from S. griseus IFO13350. The immunoaffinity steps using anti-phosphoserine, anti-phosphothreonine, and anti-phosphotyrosine agarose column chramatographies were successfully introduced to identify eukaryotic protein kinases from S. griseus IFO13350. Eight proteins with the expected molecular weight of 14, 29, 31, 35, 40, 52, 56, and 60 kDa, were identified on SDS-PAGE, and the their kination activity was confirmed by nonradioactive protein kination assay using FITC-labeled peptide as the substrate.

• Environmental Analysis Health and Toxicology
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• v.21 no.1 s.52
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• pp.21-26
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• 2006

본 연구는 DNA 상해유도기작을 규명하기 위하여 하등 진핵생물인 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe로부터 subtraction hybridization방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UV150과 UV200을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. 분리한 유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선 조사 1시간 후부터 발현이 증가되었다. 또한 알킬화제인 Methyl Methanesulfonate (MMS) 처리에 의해서도 발현이 증가되었다. 이 결과 다른 UV-inducible유전자와는 다르게 분리한 UV150유전자는 UV에 UV200유전자는 MMS에 의하여 발현이 증가됨을 알 수 있었다. 유전자의 기능을 알기 위하여 URA4 유전자를 이용하여 null-mutant 세포주를 제조하여 그 특성을 살펴본 결과 분리한 UV150 유전자는 세포의 성장에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2007.11a
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• pp.262-263
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• 2007

유전체학 (genomics)의 가장 기초적인 기반이 되는 것은 염기서열을 정확하게 결정해 내는 것이다. 많은 진핵생물들 (eukaryotes)은 두개의 상동염색체를 가지며 두개의 염색체의 염기서열에는 차이가 존재한다. 현재의 유전체 염기서열 결정방법으로는 염기변이가 많이 존재할 경우 유전체의 염기서열을 결정하기 어렵다. 특정한 장소에 서식하는 무수히 많은 미생물들의 유전체의 염기서열을 동시에 결정하는 문제도 미생물학에서 중요성을 인정받는 문제이지만, 미생물들간의 염기변이의 정도는 단일개체의 경우보다 복잡하며 염기서열을 효과적으로 결정하기 힘들다. 따라서 염기변이가 많은 생물들과 미생물들 집합의 염기서열을 결정할 수 있는 방법론의 개발이 시급한 실정이다. 본 논문에서는 조립된 다염기변이 유전체및 메타유전체의 염기서열의 정확성을 평가하기 위한 유전체 서열과 시뮬레이션에 기반한 read 들을 생성하는 도구를 개발하는 것을 목표로 한다.

• The Korean Journal of Zoology
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• v.39 no.4
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• pp.378-386
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• 1996

We have developed a couple of new luciferase reporter plasmida with very low background reporter actlvltlea. One can be used to measure the promoter strength, after insertion of some promoter fragment into the reporter plasmid, and the other, with very low basal promoter actlvltlea, allis In studying eukaryotic transcriptional regulators. The latter reporter plasmid contains such cli elements as a 17 nucleotide long inftlator, Spl.blndIng sftes, GAL4 binding sltea, and bInding sitea for a certain Drosophila homeodomain proteins. In an attempt to construct an improved reporter plaimid by fadlltating transcriptional termination and minimizing any interference by cryptic promoters which may be preaent in the reporter pleamld DNA, we have inserted transsrlptional termination-related signals, a three tandem repeat of SV4O polyadenylatlon signal (AAA) and the putative transcrtptional termination signal (UMS) of the mouse c-mos gene, Into just upstream of the initIator, and the promoter actlvitiea were measured by a transIent expression assay employing the Drosophila Schneider line 2 cells. As expected, the basal promoter activitIes decreased maximally when both transcription termination related elements were inserted. Moreover, the reporter plasmld with the two elements allowed more sensitive measurement of transcriptional activation than the reporter piasmid without them. Theae reporter plasmids can be used for studying transcriptional regulators of higher organisms Including mammals as well as Droiophlla melanogaiter.

• Microbiology and Biotechnology Letters
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• v.30 no.3
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• pp.235-240
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• 2002

Streptomycetes is a group of Gram-positive soil bacteria that growas a branching vegetative mycelium leading to the formation of spores, and display a physiological differenti-ation related to the synthesis of many secondary metabolites including antibiotics. Their complex life cycle and multicellular differentiation require various levels of regulation and types of signal transduction systems including eukaryotic-type serine/threonine protein kinases and prokaryotic-type histidine/aspartic acid protein kinases. Akt kinase that was found in cells is a sorine/threonine kinase controlling signal pathway for multi-tude of important cellular events. The activation or inactivation of Akt kinase in the cell is one of the critical regulatory points to deliver cell proliferation, differentiation, survival or apoptosis signal. To find the regula-tory protein homologous to Akt in Streptomyces, the fluorescien-labeled synthetic peptide (FITC-TRRSR-TESIT) was designed from the consensus sequence of target proteins for Akt kinase. From the difference of the mobility between the nonphosphorylated and phosphorylated synthetic peptides on Agarose gel electro-phoresis, the Akt-phosphorylating activity was monitored. The cell-free extract prepared from Streptomyces griseus IFO 13350 and the Akt homologous protein was purified by ammonium sulfate fractionation and many steps of column chromatographies such as, DEAE-Sepharose, Mono Q, Resource Phenyl-Soporose and Gel permeation column chromatographies. As a result, the protein phosphorylating the fluorescien-labeled Akt substrate was identified and it's molecular weight was estimated as 39 kDa on SDS-PAGE.

• The Microorganisms and Industry
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• v.19 no.4
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• pp.55-61
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• 1993

이 논문에서는 S. pombe의 특징과 연구방법에 대하여 전반적인 검토를 하고, human 등 고등생물의 연구에 대한 model system으로의 S. pombe에 대한 연구를 살펴보고자 한다. 특히 많은 연구분야중 현재 가장 활발히 연구되고 있는 분야인 cell cycle에 대한 연구와 oncogene에 대한 연구, 그리고 이를 이용한 차원높은 진핵 세포에서의 연구에 대하여 논하고자 한다.

• Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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• 1995.10a
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• pp.23-27
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• 1995

세포내에서의 유전자 발현의 다양성은 여러 종류의 외부자극에 의해 항상 조절되어 지고 있다. 유전자 발현의 조절기전과정에서 여러 transcription factor들이 중심적 역할을 하는 것이 알려져 있다. Transcription factor의 활성도는 원핵 생물과 진핵 생물 공히 protein phosphorylation과정을 통하여 조절되어지는 공통의 경로를 거치게 된다. 이러한 protein 인산화과정은 상창에 따른 post-translational modification과정으로서 세포표면에 위치한 각각의 수용체(receptor)들이 신호를 인지하여 그 반응으로서 신속하게 transcription factor의 활성을 조절하기 위한 것이다.

• Journal of Industrial Technology
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• v.40 no.1
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• pp.1-6
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• 2020

In the process of protein transcription and translation, various protein complexes bind to DNA, and all processes are precisely controlled. Among the proteins constituting this complex, a peptide derived from eukaryotic initiation factor (eIF) 2 was synthesized. In addition, in order to increase the efficiency of transduction of this peptide into cells, peptides with polyarginine, one of the protein transduction domains (PTD), were synthesized. Cell growth inhibition was confirmed in HER2 positive breast cancer (SK-Br-3) and HER2 negative breast cancer (MDA-MB-231), and cardiomyocytes (H9c2). The peptide with polyarginine had high transduction efficiency in all cells, and had excellent cancer cell growth inhibitory effects. The peptide used in this study might be useful peptide therapeutics for the treatment of cancer through future research.

• Environmental Analysis Health and Toxicology
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• v.18 no.3
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• pp.225-230
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• 2003

본 연구는 DNA 상해유도기작을 규명하기 위하여 하등 진핵생물인 분열형 효모 Schizosaccharomyces Pombe로부터 subtraction hybridization방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UVI-180을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. UVI-180유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선(ultraviolet-light)조사 1시간 후에 최대의 발현 증가를 나타내었다. 반면 알킬화제인 MMS(methyl methanesulfonate)처리에 의해서는 전혀 발현이 증가되지 않았다. 이 결과 UVI-180유전자는 DNA상해에 따라 각기 다른 발현양상을 나타냄을 알 수 있었다. 유전자의 기능을 알기 위하여 null-mutant세포 주를 제조하여 그 특성을 살펴본 결과 이 유전자는 세포의 성장에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

• Proceedings of the Korean Society of Grassland Science Conference
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• 2005.06a
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• pp.172-173
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• 2005