• Title/Summary/Keyword: 제한효소 반응

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식품산업과 효소

  • Park, Jong-Hyeon
    • Bulletin of Food Technology
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    • v.8 no.2
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    • pp.3-19
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    • 1995
  • 효소는 생물이 만드는 단백질로서 화학반응을 촉진시키는 촉매이다. 현재까지 알려진 효소의 종류는 약 3,000종이 되며 그 숫자는 해마다 증가하는 경향을 보이고 있다. 이 가운데 산업적 응용 가능효소는 150여종이며 상업적으로 생산되고 있는 효소는 60여종이 된다. 효소의 산업적인 이용은 1894년 소화제인 takaamylase가 Aspergillus oryzae의 배양에 의하여 생산된 이래 $\alpha$-amylase와 동물에서 pancreatin, trypsin, chymotrypsin, 사람의 소변에서 urokinase와 식물체에서 protease등이 공업적으로 생산되고 있다. 효소는 화학촉매보다 많은 장점을 가지고 있는데 온건한 반응조건에서 촉매력과 기질특이성(specificity)이 높고 부산물(by-product)이 적다. 그러나 효소의 폭넓은 산업적인 이용은 아직 많이 제한되어 있는데 대체적으로 열, 화학물질, protease, 반응환경등에 의해 쉽게 불활성화되기 때문이다. 이러한 한계를 극복하기 위해 많은 노력을 기울여 왔고 산업적인 필요성에 부응하여 1993년말 이래 미국, New Zealand, Ireland 등지에서 별도의 학술적인 모임이 열렸다. 본 고에서는 현재 식품산업에서 사용되고 있는 효소와 그의 특성, 효소 개발기술 및 국내외 효소시장 현황을 중심으로 개술하고자 한다.

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Improved PCR Amplification of Human DRD4 Polymorphic 48-bp Repeats : PCR of Digested Template for GC-rich Targets (수용체의 다형성 48-hp반복배열의 PCR을 위한 효과적 방법 : 제한효소로 절단된 GC-rich목표배열의 중합효소연쇄반응)

  • Sheen, Joon-Ho;Kim, Young-Tae;Lee, Min-Soo
    • Korean Journal of Biological Psychiatry
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    • v.2 no.2
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    • pp.248-251
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    • 1995
  • 정신분열병의 약물치료에서 중요한 역할을 하는 도파민의 기전은 지금까지 5종류의 수용체들이 발견되고 클론되면서, 새롭고 보다 근본적인 유전학적 접근을 통해 규명될 수 있게 되었다. 특히, 도파민 수용체 D4 (DRD4)는 막단백질의 세포질쪽 세번째굴곡에 48-bp반복 다형성배열을 가지고있다. 이러한 다형성 반복배열이 신호전달에 참여할 가능성이 높은 막단백질의 세포질쪽 굴곡에 있다는것은, 각 개인의 항정신병약물에 대한 민감성의 차이를 포함하여 정신분열병에 대한 개개인의 유전적 차이를 진단할 수 있는 가능성을 제시한다. 이러한 가능성을 검증하기 위하여 주로 손쉽고 빠른 중합효소연쇄반응(PCR)을 사용하여 DRD4의 아형들을 분류하게 되는데, DRD4의 PCR은 그 반복배열과 그 주변배열의 높은 GC함량(78% G+C) 때문에 일반적인 PCR 방법을 변형시켜 사용해야한다. DRD4의 아형을 분류하기 위해 변형된 PCR은 통상적으로 7-deaza dGTP와 10% DMSO를 사용하게된다. 이러한 DRD4 PCR은 대부분의 경우 성공하지만, 항상 모든 시료에서 PCR이 성공되는것은 아니었으며 반복적으로 시도하여 증폭시킬 수 있었다. 이러한 어려움은 대부분이 template DNA에 문제가 있을것으로 의심되며 DNA정제 또는 template DNA를 제한효소로 적절하게 무작위절단하여 성공율을 높일 수 있었다.

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Differentiation of Korean isolates of Entamoeba histolytica from Entamoeba dispar (우리 나라에서 분리한 이질아메바(Entamoeba histoItica)와 동형아메바(Entamoebn dispar)의 감별)

  • 최성준;이미정
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • v.34 no.1
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    • pp.15-20
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    • 1996
  • Cysts of Entamoebn histoIMtica are still found from humans in Korea, but notall of the cysts are known as pathogenic. The non-pathogenic strain is regarded as a differenL species, E. nispnr. In this study, Korean isolates of conventional E. histolvticn were subjected for the differentiation by polymerase chain reaction (PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. Human stools were screened by routine microscopic examination, and cyst or trophozoite positive stools were inoculated into Robinson media. The cultivated trophozoites were prepared for DNA extraction, and the DNAs were used for PCR with common primers of Pl gene. The PCR products were divested with 3 restriction enzymes and RFLP was observed. Also anti-sense primers containing the cleavage site of each restriction eWe were designed for differentiation only by PCR. The PCR products of Korean isolates 59,512, YS-6, and YS-27 were spliced by Taq I and Xmnl but not byAccl, and the isolates S1, S3, S11, S15, S16, S17, S20, YS- l7, and YS-44 were spliced by Acc I but not by Taq I and Xmn I. These RFLP pattern correlated well with PCR products by the species specific primers. The findings confirm that the Korean isolates 59,512, YS-6, and YS-27 are E. histolwtico and others are E. dispar. In Korea, most of the asymptomatic cyst carriers are infected by E. dispar, not by E. histolytica. Key words: Entcmoebc histolytica, Entcmoebn dispar Korean isolates, polymerase chain reaction (PCR), restriction fragment length polymorphism (RFLP)

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Study on PDMS/Class Microthermostat Fabrication and Evaluation for Restriction Enzyme Reaction (제한효소 반응용 PDMS/유리 마이크로 항온조 제작 및 특성평가)

  • Jin Seok-Ho;Cho Yong-Jin;Ahn Yoomin
    • Transactions of the Korean Society of Mechanical Engineers A
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    • v.28 no.10
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    • pp.1598-1602
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    • 2004
  • In this paper, we report a microthermostat using PDMS (poly-dimethylsiloxane) and glass. This PDMS/glass chip is able to maintain constant temperature that is necessary for restriction enzyme reaction. Since PDMS is the low-cost and the mass-producible material and has very good biochemical compatibility, PDMS chip has more benefit than general Si chip. Heater was made of Au wiring patterned on Pyrex glass. A reaction chamber has a capacity of about 3 ${mu}ell$. We performed a restriction enzyme reaction by using the fabricated microthermostat and conventional method. Then, with the electrophoresis, we made a comparison between the result from the micro reactor and the one from conventional method.

Recent Developments and Prospects in the Enzymatic Acylations (효소를 이용한 아실화 반응의 최근 동향과 전망)

  • Park, Oh-Jin
    • Korean Chemical Engineering Research
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    • v.51 no.6
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    • pp.716-726
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    • 2013
  • Enzymatic acylations catalyzed by hydrolytic enzymes, along with enzymatic hydrolysis, are established reactions in the synthesis of fine chemicals such as chiral intermediates and polymerizations in the industry. Those reactions have been carried out mostly in organic media due to the thermodynamic limitations. Recently, there have been reports on enzymatic acylations in aqueous media. They have dealt with the elucidation of reaction mechanisms of hydrolases and acyl transferases based on their X-ray structures, homology comparison of the two kinds of enzymes, substrate engineering of acyl donors and computational design of acyl transferases for enzymatic acylations in aqueous media. Enzymatic acylations play an important role in the combinatorial synthesis of natural products such as polyketides and nonribosomal peptides. In this review, the historic developments of enzymatic acylations and industrial examples are described briefly. In addition, recent developments of enzymatic acylations in the modification of natural products and their prospects will be discussed.

PCR-RFLP 분석기법을 이용한 가금육의 종(닭, 칠면조, 오리) 판별 기술 개발

  • Sin, Seong-Cheol;Choe, Eun-Ju;Lee, Jun-Je;Kim, Hui-Seon;Jo, Ha-Na;Jeon, Sang-Hui;Jeong, Gu-Yong;Jeong, Ui-Ryong
    • Proceedings of the Korean Society for Food Science of Animal Resources Conference
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    • 2005.05a
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    • pp.199-202
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    • 2005
  • 본 연구는 cytochrome B 유전자의 PCR-RFLP 분석기법을 이용하여 다양한 가금류 식육자원 및 각종 가공 육제품의 원료육에 대한 정확하고 재현성 높은 축종 및 육종 감별기술을 개발하기 위하여 수행되었다. 국내에서 유통되고 있는 종간 근연관계가 높은 3종의 가금육(닭, 칠면조 및 오리)의 육류에서 분리한 DNA 시료를 대상으로 cytochrome B 유전자의 특정 염기서열을 포함하는 primer를 설계 제작하여 PCR-RFLP 분석을 실시하였다. 각 축종의 근육조직으로부터 genomic DNA를 추출하고 PCR 증폭 반응을 수행한 후 얻어진 PCR 증폭산물(359 bp)을 두 종류의 제한효소(HaeШ 및 Hinf I)로 각각 절단한 결과 특히, HaeШ 제한효소에서 가금류의 축종 간 그리고 제한효소 간에 명확한 차이를 보이는 종 특이적인 PCR-RFLP marker를 검출하였다. 따라서, 본 연구에서 개발한 cytochrome B 유전자의 가금류 종 특이적 PCR-RFLP marker는 가금류의 식육 및 가공 육제품의 육종 및 축종 판별에 매우 유용한 DNA marker로 이용될 수 있을 것이다.

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간 대사효소의 유전자 발현조절에 관한연구

  • 신윤용
    • Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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    • 1994.04a
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    • pp.192-192
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    • 1994
  • 본 논문에서는 cytochrome P450 LA1 유전자의 5'-upsteam 조절부위의 클로닝을 실시하였다. pUC19 vector에 연결시킨 3.4 Kb 크기의 Pstl DNA조각을 Sst1, Nco1 제한 효소로 자른 뒤, Exonuclease III 를 처리하여 약 200bp 씩의 차이를 갖는 여러 크기의 plasmid들을 얻었다. 이 plasmid 의 핵산서열을 알아보기 위해 dideoxy nucletide를 이용한 sequencing방법으로 그 핵산서열의 결정 실험을 시도하였다. 또한, 다환상 방향족 탄화수소 화합물에 반응성을 갖는 C57BL/6N 생쥐와 반응성을 갖지않는 DBA/2N 생쥐에 있어 phase II 대사 효소인UDP-glucuronosyltransferase 효소활성에 대한 3-methylcholanthrene의 영향을 알아보기 위해 C57BL/6N 생쥐와 DBA/2N 생쥐에 각각 다른 농도의 3-methylcholanthrene을 처리하거나 각기 다른 시간에 3-methylcholanthrene를 처리하였다. 그 결과 UDP-glucuronosyl-transferase의 mRNA가 3-methylcholanthrene양의 증가에 따라, 처치시간이 길어짐에 따라 증가되어지며 그 mRNA위 크기는 약 2.2Kb 정도임을 알았다. 이로부터 UDP-ghucuronosyltransferase 또한 cytochrome P45O와 함께 다환상 방향족 탄화수소 화합물 조절인자를 통한 조절을 받을 것이며 phase I phase II 약물 대사 효소가 조절상 밀접한 관련을 가짐을 예측할 수 있었다.

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PCR-based Determination of the Correct Orientation of Sub cloned DNA Fragments, and its Application in the Rapid Cloning and Recombinant Expression of Rat Urocortin in Eukaryotic Cells (중합효소 연쇄반응에 근거한 벡터 클로닝된 DNA조각의 방향성 결정 및 이를 이용한 랫트 Urocortin의 진핵 세포주상에서의 발현과 클로닝의 수행)

  • Jung-Hyun Park;Yun-Jung Lee;Shin-Young Na;Kil Lyong Kim
    • Biomedical Science Letters
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    • v.6 no.1
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    • pp.73-82
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    • 2000
  • Blunt-end DNA fragments can be inserted in two different orientations. Conventionally, their directions are determined by restriction enzyme digestion or by DNA sequencing, however, these methods are often limited in their use due to the lack of appropriate enzyme sites or large sample numbers, respectively. In the present study, a novel strategy and the corresponding protocol for the simple determination of insert orientation is introduced. Using conventional sequencing primers and PCR primers that have been used for amplification of the insert, single clones, which have inserted the fragment in the desired orientation, were easily identified by this PCR-based method. The fidelity of this system was confirmed by cloning of a tar urocortin cDNA, which is a recently discovered neuropeptide. Recombinant clones identified by this method were further shown to be fully functional, and using these, for the first time, urocortin was recombinantly expressed in eukaryotic cells.

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PDMS/Glass Based DNA Microbiochip for Restriction Enzyme Reaction and Electrophoresis Detection (DNA의 제한효소 반응 및 전기영동 검출용 PDMS/유리 마이크로바이오칩)

  • Choi Joon-Young;Ahn Yoo Min;Hwang Seung-Yong
    • Transactions of the Korean Society of Mechanical Engineers A
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    • v.30 no.1 s.244
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    • pp.26-31
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    • 2006
  • This paper reports low-cost PDMS/glass based DNA microbiochip for the restriction enzyme reaction and its products detection using the capillary electrophoresis. The microbiochip ($25mm{\times}75mm$) has the heater integrated reactor ($5{\mu}{\ell}$) for DNA restriction enzyme reaction at $37^{\circ}C$ and the microchannel ($80\;{\mu}m{\times}100\;{\mu}m{\times}58mm$) for the capillary electrophoresis detection. It is experimentally confirmed that the digestion of the plasmid ($pGEM^{(R)}-4Z$) by the enzyme (Hind III and Sca I) is performed for less than 10 min and its electrophoresis detection is able to sequentially on the fabricated microbiochip.

효소의 새로운 이용분야와 그 전망

  • 박관화
    • The Microorganisms and Industry
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    • v.13 no.3
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    • pp.44-49
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    • 1987
  • 최근들어 미생물 이용에 관한 연구가 활잘해지면서 많은 진보가 있었다. 미생물반응을 촉매하는 효소는 각종 공업생산물, 식품공업및 의료에 응용되고 있는데 특히 특이성이 높기 때문에 특수성분의 생산, 계측및 성분의 분석수단에 다방면으로 이용되고 있다. 그러나 이용분야가 넓고 다양한 점에 비하여 현재까지 공업적으로 사용되고 있는 효소의 종류는 그리 많지 않다. 더구나 미생물이 생산하는 효소는 생산성및 안정성 때문에 이용이 제한되어 있으며 현재에는 20여종에 불과하다. 지금까지 산업적으로 이용되지 않고 있는 효소는 1) 효소를 생산하는 미생물의 안정성 문제 2) 미생물효소의 생산성이 낮거나 3) 효소의 특성이 구명되지 않아 용도의 개발이 늦어지고 있기 때문이다. 따라서 유전자 조작을 통한 생산성및 안정성 문제의 해겨, Bioreactor 기술 개발로 생산성의 증대등으로 효소의 산업적 응용을 가능하게 하리라 본다. 한편으로는 효소를 분리하여 여러가지 특성을 구명한다면 새로운 효소를 발견하고 또한 새로운 용도를 개발할 수 있을 것이다.

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