• Transactions of the Korean Society of Mechanical Engineers A
• /
• v.28 no.10
• /
• pp.1598-1602
• /
• 2004

In this paper, we report a microthermostat using PDMS (poly-dimethylsiloxane) and glass. This PDMS/glass chip is able to maintain constant temperature that is necessary for restriction enzyme reaction. Since PDMS is the low-cost and the mass-producible material and has very good biochemical compatibility, PDMS chip has more benefit than general Si chip. Heater was made of Au wiring patterned on Pyrex glass. A reaction chamber has a capacity of about 3 ${mu}ell$. We performed a restriction enzyme reaction by using the fabricated microthermostat and conventional method. Then, with the electrophoresis, we made a comparison between the result from the micro reactor and the one from conventional method.

• Transactions of the Korean Society of Mechanical Engineers A
• /
• v.30 no.1 s.244
• /
• pp.26-31
• /
• 2006

This paper reports low-cost PDMS/glass based DNA microbiochip for the restriction enzyme reaction and its products detection using the capillary electrophoresis. The microbiochip ($25mm{\times}75mm$) has the heater integrated reactor ($5{\mu}{\ell}$) for DNA restriction enzyme reaction at $37^{\circ}C$ and the microchannel ($80\;{\mu}m{\times}100\;{\mu}m{\times}58mm$) for the capillary electrophoresis detection. It is experimentally confirmed that the digestion of the plasmid ($pGEM^{(R)}-4Z$) by the enzyme (Hind III and Sca I) is performed for less than 10 min and its electrophoresis detection is able to sequentially on the fabricated microbiochip.

• Korean Journal Plant Pathology
• /
• v.12 no.2
• /
• pp.169-175
• /
• 1996

콩 불마름병균 Xanthomonas campestris pv. glycines 8ra는 X. c. pv. vesicatoria에 길항력이 있는 bacteriocin인 glycinecin을 생성 분비한다. Bacteriocin 생성 분비 능력이 있는 콩 불마름병균을 효과적인 생물학적 방제원으로 활용하기 위해서는 좀더 체계적인 연구가 필요하여, bacteriocin 생성에 관계되는 유전자의 분리를 시도하였다. 약 2,000개의 Xanthomonas campestris pv. glycines 8ra cosmid library에서 bacteriocin의 생성 분비 능력을 조사하여 다섯 개의 clone을, pG011, pG0113, pG33과 pG35, 선발하였다. 그중 한 clone pG08을 임의로 선택하여 plasmid DNA를 분리하였다. Plasmid pG08에서 약 6.0 kb의 DNA를 떼어내어 다른 plasmid vector에 넣은 subclone pBL5는 bacteriocin의 생성 분비 능력이 있었다. Plasmid pG08을 제한효소 처리후 다시 접함시켜 만든 몇 개의 subclone과 pBL5의 제한효소 지도를 비교 분석한 결과 약 3.0 kb의 BamHI-HindIII 부분의 DNA가 bacteriocin의 생성에 관계함을 알았다.

• Microbiology and Biotechnology Letters
• /
• v.18 no.1
• /
• pp.94-97
• /
• 1990

The restriction cleavage map of multi-copy recombinant plasmid, pJY502 (5.5 kb), carrying the thiostrepton resistance gene (tsr) was determined. Comparison of the restriction pattern with that of Streptomyces plasmids previously demonstrated that pJY502 was novel. The plasmid pJY502 had a broad host range in Streptomyces and contained single BgtII site for cloning purpose. Transformation frequency of pJY502 was $2.2 \times 10^5$ in S. lividans. E. coti-Streptomyces bifunctional plasmid, pJY504, was also constructed.

• The Korean Journal of Malacology
• /
• v.13 no.1
• /
• pp.1-7
• /
• 1997

한국산 가리비, 큰가리비(Patinopecten yessoensis)와 주문진가리비(Chlamys swifti), 2종에 대한 28S ribosomal RNA 유전자의 PCR- 산물을 이용 RFLP 및 염기서열을 밝히고, 이미 보고된 2과 3종의 염기서열과 상동성을 비교 분석하였다. 그 결과 28S rRNA유전자를 이용하여 7가지 제한효소를 처리한 PCR-RFLP의 종간 차이에서 Taq I 제한효소에서만 차이를 볼 수 있었다. 한편 두종간에 28S rRNA유전자의 D1 부위의 염기서열에서 231개 부위 중 14군데에서 변이를 보였다.

• Bulletin of Food Technology
• /
• v.8 no.2
• /
• pp.3-19
• /
• 1995

효소는 생물이 만드는 단백질로서 화학반응을 촉진시키는 촉매이다. 현재까지 알려진 효소의 종류는 약 3,000종이 되며 그 숫자는 해마다 증가하는 경향을 보이고 있다. 이 가운데 산업적 응용 가능효소는 150여종이며 상업적으로 생산되고 있는 효소는 60여종이 된다. 효소의 산업적인 이용은 1894년 소화제인 takaamylase가 Aspergillus oryzae의 배양에 의하여 생산된 이래 $\alpha$-amylase와 동물에서 pancreatin, trypsin, chymotrypsin, 사람의 소변에서 urokinase와 식물체에서 protease등이 공업적으로 생산되고 있다. 효소는 화학촉매보다 많은 장점을 가지고 있는데 온건한 반응조건에서 촉매력과 기질특이성(specificity)이 높고 부산물(by-product)이 적다. 그러나 효소의 폭넓은 산업적인 이용은 아직 많이 제한되어 있는데 대체적으로 열, 화학물질, protease, 반응환경등에 의해 쉽게 불활성화되기 때문이다. 이러한 한계를 극복하기 위해 많은 노력을 기울여 왔고 산업적인 필요성에 부응하여 1993년말 이래 미국, New Zealand, Ireland 등지에서 별도의 학술적인 모임이 열렸다. 본 고에서는 현재 식품산업에서 사용되고 있는 효소와 그의 특성, 효소 개발기술 및 국내외 효소시장 현황을 중심으로 개술하고자 한다.

• The Microorganisms and Industry
• /
• v.13 no.3
• /
• pp.44-49
• /
• 1987

최근들어 미생물 이용에 관한 연구가 활잘해지면서 많은 진보가 있었다. 미생물반응을 촉매하는 효소는 각종 공업생산물, 식품공업및 의료에 응용되고 있는데 특히 특이성이 높기 때문에 특수성분의 생산, 계측및 성분의 분석수단에 다방면으로 이용되고 있다. 그러나 이용분야가 넓고 다양한 점에 비하여 현재까지 공업적으로 사용되고 있는 효소의 종류는 그리 많지 않다. 더구나 미생물이 생산하는 효소는 생산성및 안정성 때문에 이용이 제한되어 있으며 현재에는 20여종에 불과하다. 지금까지 산업적으로 이용되지 않고 있는 효소는 1) 효소를 생산하는 미생물의 안정성 문제 2) 미생물효소의 생산성이 낮거나 3) 효소의 특성이 구명되지 않아 용도의 개발이 늦어지고 있기 때문이다. 따라서 유전자 조작을 통한 생산성및 안정성 문제의 해겨, Bioreactor 기술 개발로 생산성의 증대등으로 효소의 산업적 응용을 가능하게 하리라 본다. 한편으로는 효소를 분리하여 여러가지 특성을 구명한다면 새로운 효소를 발견하고 또한 새로운 용도를 개발할 수 있을 것이다.

• Journal of The Korean Society of Inherited Metabolic disease
• /
• v.11 no.1
• /
• pp.27-32
• /
• 2011

최근 유전공학의 발달로 리소좀 축적 질환에서 효소 치료제가 개발되어 실제 치료에 사용되고 있다. 현재 효소 보충 치료가 가능한 리소좀 축적 질환에는 고셔병(Gaucher disease), 파브리병(Fabry disease), 폼페병(Pompe disease), 뮤코다당체침착병(Mucopolysaccharidosis, MPS) 1형, 2형, 6형이 있으며 비교적 안전하면서 증상 완화에도 효과적으로 보인다. 그러나 이미 진행이 된 증상에 대해서는 비가역적이므로 조기에 진단을 하여 치료를 시작하는 것이 중요하다. 효소 보충 치료의 장기간에 걸친 치료 효과에 대해서 지속적인 평가가 필요하며 무엇보다 뼈와 중추신경계에 대한 효과는 제한적이므로 이에 대한 새로운 치료법의 개발이 필요하다.

• Microbiology and Biotechnology Letters
• /
• v.14 no.2
• /
• pp.181-186
• /
• 1986

A defective lambda transducing phase carrying acetyl CoA carboxylase gene (fabE) from Escherichia coli chromosome (72 min on the current linkage map) has been isolated. A restriction map of the chromosomal region from defective transducing phage was established by digestion with combination of the restriction enzymes. No cleavage site for the enzyme EcoRI was found in this region. Restriction fragments were cloned from defective transducing phage into high copy number plasmid vector pACYC184 to generate hybrid plasmids which were capable of complementation of fabE temperature sensitive mutation. We show here that the fabE gene is located on a 3.4 megadalton Bam HI-SalI fragment with a HindIII site, which lies within the 7.4 megadalton BglIIfragment, by complementation analysis.

• Korean Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
• /
• v.27 no.5
• /
• pp.613-619
• /
• 1994

To investigate the population differences of small yellow croaker (Pseudosciaena polyactis BLEEKER) in the Yellow Sea, five catching sites (three from China; Zoushan, Shanghai and Qingdao, two from Korea; Inchon and Mokpo) were selected for sampling. The populations of small yellow croaker from all five catching sites were investigated to analyze their mtDNA's restriction fragment length polymorphism (RFLP) using 18 kinds of restriction enzymes. The average molecular size of the entire mtDNA was estimated at $16.9{\pm}0.6\;kb$. According to the results of RFLP analysis, a total of 40 restriction sites were identified in every population surveyed and the overall cleavage patterns of mtDNA, based on the RFLP, showed similar tendencies. However, the five restriction enzymes such as ApaI, EcoRI, PstI, SmaI and SstII showed slightly different cleavage patterns which could have resulted from individual variations between the populations of Korea and China.