• Title/Summary/Keyword: 인자연구

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In silico Analysis of Downstream Target Genes of Transcription Factors (생명정보학을 이용한 전사인자의 하위표적유전자 분석에 관한 연구)

  • Hwang, Sang-Joon;Chun, Sang-Young;Lee, Kyung-Ah
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • v.33 no.2
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    • pp.125-132
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    • 2006
  • Objective: In the previous study, we complied the differentially expressed genes during early folliculogenesis. Objective of the present study was to identify downstream target genes of transcription factors (TFs) using bioinformatics for selecting the target TFs among the gene lists for further functional analysis. Materials & Methods: By using bioinformatics tools, constituent domains were identified from database searches using Gene Ontology, MGI, and Entrez Gene. Downstream target proteins/genes of each TF were identified from database searches using TF database ($TRANSFAC^{(R)}$ 6.0) and eukaryotic promoter database (EPD). Results: DNA binding and trans-activation domains of all TFs listed previously were identified, and the list of downstream target proteins/genes was obtained from searches of TF database and promoter database. Based on the known function of identified downstream genes and the domains, 3 (HNF4, PPARg, and TBX2) out of 26 TFs were selected for further functional analysis. The genes of wee1-like protein kinase and p21WAF1 (cdk inhibitor) were identified as potential downstream target genes of HNF4 and TBX2, respectively. PPARg, through protein-protein interaction with other protein partners, acts as a transcription regulator of genes of EGFR, p21WAF1, cycD1, p53, and VEGF. Among the selected 3 TFs, further study is in progress for HNF4 and TBX2, since wee1-like protein kinase and cdk inhibitor may involved in regulating maturation promoting factor (MPF) activity during early folliculogenesis. Conclusions: Approach used in the present study, in silico analysis of downstream target genes, was useful for analyzing list of TFs obtained from high-throughput cDNA microarray study. To verify its binding and functions of the selected TFs in early folliculogenesis, EMSA and further relevant characterizations are under investigation.

Is There Any Spousal Concordance of Cerebrovascular Risk Factors in Stroke Patients? : A Preliminary Study (뇌졸중 환자에서 배우자 사이에 뇌혈관 질환의 위험요인 일치성이 있는가? : 예비 연구)

  • Lee, Hyung-Suk;Ko, Young-Chai;Baek, Shin-Hye;Shin, Kyeong-Seob;Kim, Ji-Sun;Han, Hyun-Jeong;Shin, Dong-Ick
    • The Journal of the Korea Contents Association
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    • v.11 no.5
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    • pp.308-316
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    • 2011
  • Familial concordance of vascular risk factors is well understood and there are many studies about inter-spouse concordance of the risk factors for coronary heart disease. However, there are no studies for inter-spousal relation of the risk factors in cerebrovascular disease patients. We analysed inter-spouse correlation of cerebrovascular risk factors in patients admitted our hospital due to stroke and their spouses. There was statistically significant inter-spouse concordance in the presence of hypertension(p=0.025) and carotid IMT(r=0.479, p=0.001). However, the further age-adjusted analysis revealed no significant result. Differently from the results of previous studie,, the present study shows no significant spousal concordance. Althought there are tendencies of spousal concordance in some risk factors, the age is major determinant.

Identifying Compound Risk Factors of Disease by Evolutionary Learning of SNP Combinatorial Features (SNP 조합 인자들의 진화적 학습 방법 기반 질병 관련 복합적 위험 요인 추출)

  • Rhee, Je-Keun;Ha, Jung-Woo;Bae, Seol-Hui;Kim, Soo-Jin;Lee, Min-Su;Park, Keun-Joon;Zhang, Byoung-Tak
    • Journal of KIISE:Computing Practices and Letters
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    • v.15 no.12
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    • pp.928-932
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    • 2009
  • Most diseases are caused by complex processes of various factors. Although previous researches have tried to identify the causes of the disease, there are still lots of limitations to clarify the complex factors. Here, we present a disease classification model based on an evolutionary learning approach of combinatorial features using the data sets from the genetics and cohort studies. We implemented a system for finding the combinatorial risk factors and visualizing the results. Our results show that the proposed method not only improves classification accuracy but also identifies biologically meaningful sets of risk factors.

화상 분석을 이용한 직물 구성 인자의 객관적 측정

  • 최수현;강태진;이승구
    • Proceedings of the Korean Fiber Society Conference
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    • 1998.10a
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    • pp.373-376
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    • 1998
  • 직물에 있어서 경ㆍ위사의 밀도, crimp, cover factor, 직물의 두께, 무게 둥은 경ㆍ위사의 섬도, 직물의 패턴 등과 더불어 직물의 특성을 나타내는 기본적인 인자들이며 이러한 직물 구성 인자간의 관계에 대하여 Peirce의 연구[1] 이래 많은 연구가 이루어져 왔다. 그러나 이러한 인자들을 실제로 측정하기 위해서는 직물을 자르거나 분해하여야 하며, 측정에 많은 시간이 소요되고, 측정 방법이나 기기 또는 측정자에 따라 측정치에 차이가 나는 등의 단점이 있다. (중략)

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Estimation of Hydrometeorologic Parameters using DHSVM (DHSVM을 이용한 수문기상인자 산정)

  • Cho, Hyungon;Kim, Gwangseob
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2016.05a
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    • pp.222-222
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    • 2016
  • 기후변화에 의한 자연재해의 규모와 빈도가 증가함에 따라 수자원 영향 평가 및 대응전략 수립을 위한 연구가 활발히 이루어지고 있다. 본 연구에서는 물리기반의 분포형 수문기상모형인 DHSVM을 이용하여 2012년-2014년 동안의 한반도 유역의 기상인자 자료를 수집하여 증발산, 토양수분, 현열, 잠열, 지열, 순복사량 등의 수문기상인자를 산정하였다(Fig. 1). 모형의 적합성 평가를 위해서 안동댐 유역에 대하여 검정통계량으로 NSE(Nash-Sutucliffe model efficiency coefficient), RMSE, $R^2$, MAPE(mean absolute percentage error example)위한 계산하였다.

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An Empirical Validation of Complexity Metrics for Java Programs (Java 프로그램에 대한 복잡도 척도들의 실험적 검증)

  • Kim, Jae-Woong;Yu, Cheol-Jung;Jang, Ok-Bae
    • Journal of KIISE:Software and Applications
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    • v.27 no.12
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    • pp.1141-1154
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    • 2000
  • 본 논문에서는 Java 프로그램의 복잡도를 측정하기 위해 필요한 인자들을 제안하였다. 이러한 인자들을 추출하기 위해 Java 프로그램을 분석하여 객체지향 설계 척도 값들을 계산하고 통계적 분석을 수행하였다. 그 결과 기존의 연구에서 발견되었던 클래스의 크기 인자 외에도 메소드 호출 빈도, 응집도, 자식 클래스의 수, 내부 클래스 및 상속 계층의 깊이가 주요 인자임이 파악되었다. 클래스의 크기 척도로 분류되었던 자식 클래스의 수는 다른 크기 척도들과 다른 성질을 가진다는 것을 발견하였다. 또한 프로그램의 크기가 커지고 결합도가 높아질수록 응집도가 떨어진다는 것을 입증하였다. 그리고 인자 분석을 바탕으로 인간의 인지 능력과 인자의 상관관계를 고려한 가중치를 적용하기 위해 인자별로 회귀분석을 수행하였다. 보다 적은 척도를 가지고 인자를 설명할 수 있는 회귀식을 도출하였다. 두 그룹에 대한 교차 검증 결과 회귀식이 높은 신뢰도를 가지는 것으로 나타났다. 따라서 본 논문에서 제안한 인자들을 이용하는 경우 Java 프로그램의 복잡도를 측정할 수 있는 새로운 척도로 사용할 수 있다.

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Selection of Hydrologic Factors of NASA LIS for Water Hazrd Information Platform (수재해 정보 플랫폼에 활용 가능한 NASA LIS의 수문인자 선정)

  • PARK, Gwang-Ha;BAECK, Seung Hyub;CHAE, Hyo-Sok;HWANG, Eui-Ho
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2017.05a
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    • pp.471-471
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    • 2017
  • 최근 기상 이변으로 인해 홍수, 가뭄 등과 같은 수재해가 빈번히 발생되고 있다. 이에 수재해예방 등의 안전 기술과 관련된 관심이 증가되고 있다. 수재해 예방을 위해서는 먼저 홍수, 가뭄 등과 같은 수재해 감시가 필요하며, 이를 위해 위성, 레이더 등으로 관측된 자료를 활용한 수문인자 정보는 매우 중요하다. 미국 NASA의 LIS(Land Information System)는 위성 및 지상관측 자료를 활용하여 홍수, 가뭄, 기상, 산사태, 농업 등의 정보를 생산할 수 있는 프레임워크이다. LIS는 크게 지표면 모델 및 자료동화를 위한 변수들의 전처리 과정(LDT), 지표면 모델을 활용한 분석 및 자료동화 과정(LDAS) 및 분석된 자료의 검보정(LVT) 과정으로 구성되어 있다. LIS에서 산출 가능한 인자는 Energy Balance, Water Balance, Surface/Subsurface State, Evaporation, Hydrologic, Cold Season Processes, Compared Data, Carbon 등 9개로 분류되며 약 78개의 인자를 산출한다. 홍수, 가뭄 등과 같은 수재해 감시를 위한 수문인자는 강수량, 증발산량, 토양수분, 지표면 온도 등을 비롯한 여러 가지 인자들이 필요하다. LIS는 주로 미국, 캐나다 등 평활한 지역에 활용되어 공간해상도는 약 10km(0.1deg) 이하로 자료를 산출한다. 산악 지형이 대부분인 한국 지형에 적용하기에는 자료의 정확성이 낮아 10km 이상의 공간해상도 자료가 필요하며, 한국형 수재해정보 플랫폼에서 홍수, 가뭄 등의 기초자료로 사용하기 위한 수문인자의 선정이 필요하다. 이에 본 연구에서 NASA LIS를 통해 산출 가능한 인자를 정리하고 한국형 수재해 정보플랫폼에 활용 가능한 수문인자의 항목을 조사하였다. 홍수, 가뭄 등 수재해 분석에 필요한 기초자료는 강우량, 유출량, 잠재적 증발산량, 식생의 증산량, 토양수분, 표면온도, 알베도 등의 수문인자이며, NASA LIS에서 이와 같은 수문인자 산출이 가능하다. NASA와 국제공동 연구중인 한국형 물순환분석 프레임워크(K-LIS(안)) 개발을 통해 한국 지형에 적합한 홍수 및 가뭄 등의 수재해 감시 평가 예측이 가능할 것이며, K-LIS에서 산출되는 고해상도의 수문인자들을 수재해 정보 웹 포털의 정보 제공 서비스를 통하여 손쉽게 접근 가능할 것으로 사료된다.

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Estimation of Optimal Water Surface Width/River Width Ratio and Investigation of Visual Preference for the River Scenery (하천경관을 고려한 적정 수면폭/하폭 비의 산정 및 시각적 선호도 조사)

  • Lee, Joo-Heon;Yoo, Sang-Wan;Jeong, Sang-Man;Kim, Do-Hee;Lee, Yong-Su
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2006.05a
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    • pp.57-65
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    • 2006
  • 본 연구는 유량에 의한 수면폭의 변화로 인한 하천경관의 시각적 선호도에 미치는 선호요인 파악하였다. 등간척도의 점수부가체계를 적용하여 이용자에 의한 금강경관의 시각적 선호를 평가한 후 시각적 선호와 이에 영향을 미치는 선호요인들과의 관계를 다중회귀분석방법으로 검정하였다. 수면폭 변화에 따른 금강경관의 시각적 선호요인 변수는 심미성 인자, 물리적 특성 인자, 복잡성 인자로서 3개 변수 모두 유의성이 있는 것으로 판명되었다. 모든 선호요인의 값이 증가함에 따라 시각적 선호의 값도 증가를 가져오고 그 반대의 경우도 마찬가지였다.다중회귀모형에서 다른 조건이 불변일 경우, 심미성 인자의 값이 증가할 때 전체적인 시각적 선호에 가장 크게 영향을 미치고, 다음으로 물리적 특성 인자가 두 번째로 영향을 미치는 것으로 판명되었다. 선호요인이 시각적 선호에 기여하는 상대적 중요도는 심미성 인자, 물리적 특성 인자, 복잡성 인자 순으로 나타났다. 심미성 인자는 복잡성 인자에 비해 3.2배 만큼 중요도가 크며 물리적 특성 인자는 복잡성 인자에 비해 3배의 중요도를 가지고 있는 것으로 나타났다. 따라서 심미성인자는 가장 중요한 선호요인으로 판명되었다. 수면폭 변화에 따른 금강경관의 시각적 평가에 의한 선호 요인 분석 결과는 하천의 수면폭 및 수량에 큰 영향을 미칠 것이다. 수위 변화로 인한 하천 경관의 선호 요인을 파악함으로서 금강 유지유량의 결정에 지침을 마련하고, 시각적 선호도에 따른 최적의 수면폭/하폭비 산정하였으며 본 연구 결과는 수량에 의한 수면폭/하폭 비의 변화로 인한 하천경관의 수량결정에 중요한 정보를 제공하고 이용자의 만족을 극대화할 수 있는 경관조성에 기여할 것으로 판단된다. 통하여 유기농업의 실현을 도모하여 소비자의 욕구에 맞는 작물 생산 및 농촌관광단지 조성을 통해 부가가치증대 및 소득증대를 꾀함으로 농촌문제 해결에 도움이 될 것으로 기대된다. 본 연구를 통해 GIS 와 RS의 기술이 농촌분야에 더 효율적으로 적용될 것으로 기대되며, 농업기술센터를 통한 정보제공을 함으로써 대농민 서비스 및 농업기관의 위상이 제고 될 것으로 기대된다.여 전자파의 공간적인 가시화를 수행할 수 있었다. 본 전자파 시뮬레이션 기법이 실무에 이용될 경우, 일반인이 전자파의 분포에 대한 전문지식을 습득할 필요 없이, 검색하고자 하는 지역과 송전선, 전철 등 각종 전자파의 발생 공간 객체를 선택하여 실생활과 관련된 전자파 정보에 예측할 수 있어, 대민 환경정보 서비스 질의 개선측면에서 획기적인 계기를 마련할 것으로 사료된다.acid$(C_{18:3})$가 대부분을 차지하였다. 야생 돌복숭아 과육 중의 지방산 조성은 포화지방산이 16.74%, 단불포화지방산 17.51% 및 다불포화지방산이 65.73%의 함유 비율을 보였는데, 이 중 다불포화지방산인 n-6계 linoleic acid$(C_{18:2})$와 n-3계 linolenic acid$(C_{18:3})$가 지질 구성 총 지방산의 대부분을 차지하는 함유 비율을 나타내었다.했다. 하강하는 약 4일간의 기상변화가 자발성 기흉 발생에 영향을 미친다고 추론할 수 있었다. 향후 본 연구에서 추론된 기상변화와 기흉 발생과의 인과관계를 확인하고 좀 더 구체화하기 위한 연구가 필요할 것이다.게 이루어질 수 있을 것으로 기대된다.는 초과수익률이 상승하지만, 이후로는 감소하므로, 반전

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Analysis of A Watershed Terrain Factors using Digital Elevation Model (수치표고모형에 의한 유역에서의 지형인자 분석)

  • 양인태;천기선;박재훈
    • Journal of the Korean Society of Surveying, Geodesy, Photogrammetry and Cartography
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    • v.17 no.1
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    • pp.61-67
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    • 1999
  • A watershed terrain factor is known to the very important in studies of a stream and a watershed. We have obtained the terrain factor in map directly or we have generated it in a digitalized map. In this study, DTED (Digital Terrain Elevation Data) offering in DMA(Defense Mapping Agency) was used to create a stream and a watershed and to extract the terrain factor. As comparison of the terrain factors gererated in digitalized map with the terrain factors extracted in DTED, DTED could be used to extract a terrain factor for a watershed management.

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Development of Module of Hydrological Terrain Analysis from DEM (DEM으로 부터 지형수문인자 추출을 위한 모듈 개발)

  • Cho, Ki Won;Lee, Do Hoon;Lee, Byung Ju
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2015.05a
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    • pp.464-464
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    • 2015
  • 수문해석을 수행할 때 유역의 지형으로 부터의 얻어진 수문인자를 사용한다. 유역의 경사나 흐름방향과 같은 지형적인 수문인자는 DEM 자료를 이용하여 여러 수치계산과정을 통해 얻을 수 있다. 이는 특히 유역 수문해석에 있어 유역 특성치 및 수문 인자들의 공간적으로 분포시켜 접근하는 분포형 모형에서 지형적인 입력요소 로 중요하게 사용된다. 본 연구에서는 아래와 같은 지형 수문인자 추출 모듈을 개발하고 사용하고자 한다. * Pit Remove : DEM에서 갱격자 제거 * Flat Remove : DEM에서 평격자 제거 * Flow Direction : 흐름방향 결정 * Flow Accumulation : 흐름 누적계수 결정 * Stream Definition : 하천영역 결정 * Watershed Delineation : 유역 생성 위의 모듈은 Java 오픈소스 프로그램으로서 분포형 수문해석 모형의 한 부분으로서 사용 가능하며, GIS 프로그램에 의존하지 않고 사용할 수 있다. 이 모듈은 이후 분포형 수문해석 프로그램 개발에 사용할 계획이며 연구에 사용되는 컴퓨팅 도구와 환경에 독립적으로 사용이 가능하다.

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