• Title/Summary/Keyword: 유전체 분석

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Genetic comparison between Spirometra erinacei and S. mansonoides using PCR-RFLP analysis (만손열두조충과 북미열두조충의 중합효소연쇄반응-마디길이여러꼴 분석법을 이용한 유전 형질 비교)

  • LEE, Soo-Ung;HUH, Sun;PHARES, C. Kirk
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • v.35 no.4
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    • pp.277-282
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    • 1997
  • The only observed morphological difference between Spirometra erinqsei and S. mcnsonoides is the uterine shape of the mature proglottid. Two species of worms are thought to be evolutionarily closely related. Biomolecular colnparison of the ho worms by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analysis was conducted to observe the genetic distance. The 285 rDNA, mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (mCOI), and ribosomal internal transcribed spacer 1 (ITSI) fragments were obtained from the worms by PCR. The PCR products were cleaved by 5 four-base pair restriction enzyme combinations (Msp I, Hae III, Alu I, Cfo I, Rsa I) , electrophoresed and analyzed with PAUP 3.1.1. The fragment Patterns or 285 rDNA and Lni demonstrated that two worms were in identical systematic tree with bootstrap number 94 and 100, respectively As for mCOI, bootstrap number was 74 in a different tree. Above results are indicative of recent common ancestry between S. etinocei and S. mansonoides.

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Analysis of the association between bronchial hyperresponsiveness and genetic polymorphism of β2-adrenoceptor in adolescents with long-term asthma remission (장기간 천식 관해 청소년에서 지속되는 기관지 과민성과 β2-아드레날린 수용체 유전자 다형과의 연관성 분석)

  • Kang, Hee;Koh, Young Yull
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • v.50 no.6
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    • pp.556-564
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    • 2007
  • Purpose : We hypothesized that the persisting bronchial hyperresponsiveness (BHR) of adolescents with asthma remission may be controlled mainly by genetic factors, and the BHR of symptomatic asthma by airway inflammation. ${\beta}_2$-adrenoceptor gene is considered to be a candidate gene in the development of BHR. Thus, ${\beta}_2$-adrenoceptor gene polymorphism may be associated with the BHR of adolescents with asthma remission, but not with the BHR of symptomatic asthma. To evaluate this hypothesis, ${\beta}_2$-adrenoceptor gene polymorphism at 2 sites (Arg16-Gly, Gln27-Glu) were examined. Methods : Two hundred two adolescents with BHR ($PC_{20}<18\;mg/mL$) and long term remission (neither asthma-related symptoms nor medication during the previous 2 years) of their asthma (remission group), 182 adolescents with symptomatic asthma (symptomatic group), and 200 healthy adolescents (control group) were studied. Asthma phenotypes were determined using methacholine bronchial provocation test and skin prick test. Genotypes of ${\beta}_2$-adrenoceptor polymorphism were evaluated by PCR-based methods. Results : Gly/Gly allele and Gly16-Gln27 haplotype were more prevalent in the remission group than in the control group (P=0.01, P=0.02), although there was no difference between the symptomatic group and the control group. In the remission group, there was significant difference in geometric mean of $PC_{20}$ among the 3 groups subdivided by the number of Gly16-Gln27 haplotype, showing that the Gly16-Gln27 haplotype was positively associated with BHR. However, no association was found between Gly16-Gln27 haplotype and BHR in the symptomatic group. Conclusion : This study demonstrates that ${\beta}_2$-adrenoceptor polymorphism at amino acid 16 and 27 was associated with BHR persisting in adolescents with asthma remission.

에탄올을 첨가한 reflux법 나노 세리아 합성

  • Jo, Min-Yeong;Lee, Jae-Won;Park, Seon-Min;Choe, Heon-Jin
    • Proceedings of the Korean Institute of Electrical and Electronic Material Engineers Conference
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    • 2008.11a
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    • pp.162-162
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    • 2008
  • 세리아는 고체 산화물 연료전지(SOFC, solid oxide fuel cell)의 전해질 재료와CMP( chemical mechanical polishing) 슬러리 재료, 자동차의 3원 촉매, gas sensor, UV absorbent등 여러 분야에서 사용되고 있다. 본 연구에서는 세리아의 입자의 크기와 형상을 조절하여 성능 및 물성을 향상시켜 보다 넓은 분야의 활용을 하고자 실험을 실시하였다. 세리아 합성에 사용되는 전구체인 cerium carbonate의 특성이 세리아 분말의 물리화학적 특성에 직접적인 영향을 주기 때문에 전구체의 합성 단계에서 형상과 크기를 조절하고자 하였다. 세륨염으로 cerium nitrate hexahydrate, 균일침전반응을 할 수 있는 urea를 침전제로 사용하였다. 반응 용매의 유전상수를 조절하고 반응의 과포화도 변화를 이용하기 위하여 에탄올을 첨가하여 입자의 크기 및 형상을 조절, cubic형태의 $Ce_2O(CO_3)_2{\cdot}H_2O$ 결정상을 가지는 세리아 전구체를 합성하였다. 이렇게 생성된 전구체를 $1000^{\circ}C$에서 2시간동안 하소하여 세리아를 합성하고 반응시간, 농도, 에탄올의 함량 변화에 대해 XRD, FE-SEM, particle size analyzer, micropore physisorption analyzer 분석을 통하여 입자의 결정상과 형상, 입도 분포 및 기공분포 등을 반응인자의 변화에 따라 비교 및 해석하였다.

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A Case of Leber's Hereditary Optic Neuropathy Showing 11778 Point Mutation of Mitochondrial DNA (사렵체 DNA의 11778 점돌연변이가 확인된 Leber씨 유전성 시신경병증 1례)

  • Jung, Yun-Seok;Park, Seung-Kwon;Lee, Seung-Yeop;Hah, Jung-Sang;Park, Mee-Yeoung;Lee, Se-Jin;Lee, Jun
    • Journal of Yeungnam Medical Science
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    • v.16 no.1
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    • pp.114-118
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    • 1999
  • Leber's hereditary optic neuropathy(LHON) is an optic nerve disease that causes blindness and is associated with maternally inherited mitochondrial DNA(mt DNA) mutations. The most common mitochondrial DNA mutation among LHON patients is a point mutation at the nucleotide 11778 in the subunit 4 of complex I. In one 45-year old male LHON patient with bilateral optic neuropathy. we investigated the presence of a point mutation of mitochondrial DNA and identified a single guanine to adenine transition mutation in the mitochondrial DNA at nucleotide point 11778.

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Structural behavior of polyphenylcarbosilane through pyrolysis process

  • Lee, Yun-Ju;Kim, Yeong-Hui;Kim, Jong-Il;Kim, Su-Ryong;Gwon, U-Taek
    • Proceedings of the Materials Research Society of Korea Conference
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    • 2012.05a
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    • pp.94.1-94.1
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    • 2012
  • 폴리페닐카보실란은 페닐그룹을 포함하고 있는 카보실란계 고분자로서 열분해 후 과량의 탄소를 함유할 수 있는 세라믹 전구체이다. 카보실란계열의 고분자는 산화특성이 있어 SiOC 코팅 용도에도 사용되고 있는데, 폴리페닐카보실란은 free 탄소를 함유하는 SiOC:C 필름을 형성할 수 있다. SiOC 코팅 전구체로는 일반적으로 실리카졸, 실라잔 계열의 고분자, 실록산 계열의 고분자가 사용되고 있으나, 폴리페닐카보실란의 경우 상기 전구체에 비하여 보관 안정성 및 뛰어난 부착특성을 나타낸다. 기존 연구에서는 폴리페닐카보실란으로부터 형성된 SiOC:C 필름의 저유전막, 산화방지막, 분진방지막 등의 응용성에 대하여 고찰한 바 있다. 폴리페닐카보실란은 열처리 온도 영역에 따라 응용 분야가 달라질 수 있는데, 이에 본 연구에서는 각 열처리 온도 영역에 따라 형성되는 SiOC:C 필름의 구조적 변화를 고찰하였다. 필름 형성은 20 % 폴리카보실란 용액을 스핀코팅하고 대기상에서 경화를 실시하였으며, 질소 분위기에서 400 ~ 1200 도 범위에서 열처리하였다. 이렇게 얻어진 300 nm 두께의 필름은 XPS 표면분석과 FT-IR, Solid-NMR을 이용하여 C-Si-O 네트워크 형성의 거동을 확인하였으며, 800 도 이상에서 나타나는 특징적인 free 탄소는 Raman을 이용하여 확인하였다.

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Association of ABO Genetic Polymorphisms and Dyslipidemia in Korean Population (한국인 ABO 유전자 다형성과 이상지질혈증의 연관성)

  • Yoon-Joo SONG;Sung Won LEE;Hyun-Seok JIN;Sangwook PARK
    • Korean Journal of Clinical Laboratory Science
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    • v.56 no.1
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    • pp.66-72
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    • 2024
  • Lipid metabolic disorders are commonly encountered in clinical practice. Dyslipidemia and its prevalence rate are strongly associated with the morbidity and mortality of cardiovascular disease worldwide. We conducted a genetic analysis to determine the association between genetic polymorphisms of the ABO gene in adults middle-aged (40~69 years) with dyslipidemia in the Korean population. A total of 6,750 subjects from the Korea Association REsource (KARE) were selected for this study. Using the genetic and epidemiologic data of 4,403 dyslipidemia cases and 2,347 normal controls from the KARE, single nucleotide polymorphisms (SNPs) in ABO gene were analyzed for their genetic correlation. Eleven SNPs out of the ABO gene demonstrated a statistically significant association with dyslipidemia. Among them, rs8176707 in ABO gene statistically showed the most significant correlation with dyslipidemia (P-value=0.002, odds ratio=0.82, 95% confidence interval=0.78~0.86). The minor allele of T polymorphism within the ABO intron genetic region was associated with a decreased risk of dyslipidemia. This study uncovered a significant association between genetic polymorphism in the ABO gene and dyslipidemia. This finding suggest that ABO SNPs markers have a genetic correlation with the etiology of dyslipidemia.

Taxonomic position and genetic differentiation of Korean Astragalus mongholicus Bunge (한국산 황기의 분류학적 위치 및 유전적 분화)

  • Choi, In-Su;Kim, So-Young;Choi, Byoung-Hee
    • Korean Journal of Plant Taxonomy
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    • v.43 no.1
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    • pp.12-21
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    • 2013
  • To clarify the taxonomic position for Astragalus nakaianus and provide correct scientific name for A. mongholicus cultivar in South Korea, we examined external morphological characters and sequence variations from ITS and five cp non-coding DNA regions. Genetic structure was also analyzed for 61 individuals from three populations using nine microsatellite loci. We found no significant difference between the South Korean cultivar and A. mongholicus var. dahuricus when morphology and ITS sequences were considered. Morphologically, A. nakaianus specimens varied somewhat from A. mongholicus var. mongholicus and var. dahuricus in habit, plant height, and lengths of leaf axis and leaflet. Although sequence data from ITS and cp noncoding DNA regions could not distinguished A. nakaianus from A. mongholicus, microsatellite analysis revealed strong structuring between the cultivar and A. nakaianus. Therefore, we conclude that the South Korean A. mongholicus cultivar should be treated as A. mongholicus var. dahuricus and that A. nakaianus should be merged into A. mongholicus as a variety, i.e., A. mongholicus var. nakaianus.

Study on relationship between "cholestrol·cardiorenal connective tissue weakness type" and TNF-alpha gene polymorphism in iris constitution analysis (홍채체질 분석에서 콜레스테롤·심신이 약한 체질과 TNF-alpha 유전자 다형성과의 상관성 연구)

  • Yoo, Chun-sang;Hwang, Woo-jun;Kim, Kyung-sik;Choi, Sung-yong;Kim, Jong-uk
    • Journal of Acupuncture Research
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    • v.21 no.2
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    • pp.89-101
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    • 2004
  • 홍채학은 대체의학의 한 분야로서 홍채 침착의 불규칙성을 주시함으로써 의학적 상태를 진단한다. 홍채학적 분류에 의한 체질은 가족력을 보이고 있으며 이는 홍채체질의 유전성을 의미한다. 강력한 면역조절자이며 전 염증성 사이토카인인 종양괴사인자(tumor necrosis factor-a, TNF-${\alpha}$)는 많은 병리적 과정에서 중요한 역할을 한다. 따라서 본 연구자는 고혈압환자에서 홍채체질과 TNF-${\alpha}$ 유전자 다형성과의 관련성을 조사하였다. 87명의 고혈압 환자와 79명의 정상인을 홍채체질에 따라 분류하였으며 이들의 TNF-${\alpha}$ 유전자형을 분석하였다. 결과적으로 정상인에 비하여 TNF-${\alpha}$ GA 이형접합체의 빈도가 고혈압 환자군에서 감소하였다. 이 같은 결과는 TNF-${\alpha}$ 다형성이 고혈압에 대한 저항성과 관련 있음을 의미한다. 또한 고혈압환자에서 콜레스테롤 침착체질과 심신 결합조직 허약 체질은 42.5%로서 정상인 16.5%에 비하여 현저하게 증가하였다 (P<0.001). GG TNF-${\alpha}$ 유전자형을 갖고 있는 군에서 심신 결합조직 허약체질과 콜레스테롤 침착체질의 빈도는 정상인보다 환자에서 유의하게 높았다(P<0.001). 본 연구에서 저자는 홍채체질과 고혈압사이의 관련성을 발견함과 동시에 TNF-${\alpha}$ 유전자 다형성과 고혈압, 그리고 홍채 체질과의 관련성을 최초로 입증하였다.

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Heat treatment effect of high-k HfO2 for tunnel barrier memory application

  • Hwang, Yeong-Hyeon;Yu, Hui-Uk;Kim, Min-Su;Lee, Yeong-Hui;Jo, Won-Ju
    • Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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    • 2010.02a
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    • pp.218-218
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    • 2010
  • 기존의 비휘발성 메모리 소자는 터널 절연막으로 $SiO_2$ 단일 절연막을 이용하였다. 그러나 소자의 축소화와 함께 비휘발성 메모리 소자의 동작 전압을 낮추기 위해서 $SiO_2$ 단일 절연막의 두께도 감소 시켜야만 하였다. 하지만 $SiO_2$ 단일 절연막의 두께 감소에 따라, 메모리의 동작 횟수와 데이터 보존 시간의 감소등의 문제점들로 인해 기술적인 한계점에 이르렀다. 이러한 문제점들을 해결하기 위한 연구가 활발히 진행되고 있는 가운데, 최근 high-k 물질을 기반으로 하는 Tunnel Barrier Engineered (TEB) 기술이 주목 받고 있다. TBE 기술이란, 터널 절연막을 위해 서로 다른 유전율을 갖는 유전체를 적층함으로써 쓰기/지우기 속도의 향상과 함께, 물리적인 두께 증가로 인한 데이터 보존 시간을 향상 시킬 수 있는 기술이다. 따라서, 본 연구에서는 적층된 터널 절연막에 이용되는 $HfO_2$를 FGA (Forming Gas Annealing)와 RTA (Rapid Thermal Annealing) 공정에 의한 열처리 효과를 알아보기 위해, 온도에 따른 전기적인 특성을 MIS-Capacitor 제작을 통하여 분석하였다. 이를 위해 먼저 Si 기판 위에 $SiO_2$를 약 3 nm 성장시킨 후, $HfO_2$를 Atomic Layer Deposition (ALD) 방법으로 약 8 nm를 증착 하였고, Aluminum을 약 150 nm 증착 하여 게이트 전극으로 이용하였다. 이를 C-V와 I-V 특성을 이용하여 분석함으로 써, 열처리 공정을 통한 $HfO_2$의 터널 절연막 특성이 향상됨을 확인 하였다. 특히, $450^{\circ}C$ $H_2/N_2$(98%/2%) 분위기에서 진행한 FGA 공정은 $HfO_2$의 전하 트랩핑 현상을 줄일 뿐 만 아니라, 낮은 전계에서는 낮은 누설 전류를, 높은 전계에서는 높은 터널링 전류가 흐르는 것을 확인 하였다. 이와 같은 전압에 대한 터널링 전류의 민감도의 향상은 비휘발성 메모리 소자의 쓰기/지우기 특성을 개선할 수 있음을 의미한다. 반면 $N_2$ 분위기에서 실시한 RTA 공정에서는, 전하 트랩핑 현상은 감소 하였지만 FGA 공정 후 보다는 전하 트랩핑 현상이 더 크게 나타났다. 따라서, 적층된 터널 절연막은 적절한 열처리 공정을 통하여 비휘발성 메모리 소자의 성능을 향상 시킬 수 있음이 기대된다.

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Genetic Diversity and Structure of a Rare and Endemic, Spring Ephemeral Plant Corydalis filistipes Nakai of Ullung Island in Korea (울릉도 희귀.특산 식물 섬현호색의 유전적 다양성과 구조)

  • Kim, Jin-Seok;Yang, Byeong-Hoon;Chung, Jae-Min;Lee, Byeong-Cheon;Lee, Jae-Cheon
    • Journal of Ecology and Environment
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    • v.29 no.3
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    • pp.247-252
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    • 2006
  • For the spring ephemeral and myrmecochorous perennia, Corydalis filistipes Nakai (Fumariaceae), rare and narrow endemic to Ullung Island in Korea, genetic diversity and structure of 4 subpopulations of the species were investigated with allozyme markers. Levels of genetic diversity (A=1.73, $P_{95%}$=61..2%, Ho=0.201, He=0.167) were relatively lower than those of other endemic species with widespread distribution range, but considerably higher than other endemic species with similar life history traits isolated in island. The moderate level of genetic diversity within subpopulations in C. filistipes is characteristic of the species with predominantly outcrossing, myrmecochorous seed dispersal by dual function of the elaisome and mode of sexual and asexual reproduction by the cleistogamy. The analysis of fixation indices showed an overall excess of heterozygotes (mean $F_{IS}=-0.1889,\;F_{IT}=-0.1226$) relative to H-W expectations. About 5.6% of the total genetic variation was found among subpopulations ($F_{ST}$=0.0557). The strategies of reasonable conservation and management, and the maintenance mechanism of genetic diversity of Corydalis filistipes Nakai, endemic plant species in Korea were discussed.