• Korean Journal of Microbiology
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• v.55 no.1
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• pp.83-85
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• 2019

Pseudomonas sp. PAMC 29040 was isolated from a maritime tundra soil in Antarctica for its ability to degrade lignin and subsequently confirmed to be able to depolymerize heterogeneous humic substance (HS), a main component of soil organic matter. The draft genome sequences of PAMC 29040 were analyzed to discover the putative genes for depolymerization of polymeric HS (e.g., dye-decolorizing peroxidase) and catabolic degradation of HS-derived small aromatics (e.g., vanillate O-demethylase). The information on degradative genes will be used to finally propose the HS degradation pathway(s) of soil bacteria inhabiting cold environments.

• Proceedings of the Korean Statistical Society Conference
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• 2002.11a
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• pp.203-207
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• 2002

Post-genome 시대를 맞이하여 인류는 전 유전체에서의 염기서열에 대한 정보를 가질 수 있게 되었다. 이러한 정보를 이용하여서 인간에게 나타나는 다양성을 설명하기 위해서 SNP(Single Nucleotide Polymorphism)의 연구가 활발히 되고 있다. 하지만 인간 체세포의 염색체는 2쌍으로 되어있기 때문에 이러한 정보가 어떠한 쌍의 조합(haplotype)으로 나타나는가를 고려하여야한다. 현재 실험적 방법으로 이를 고려하기에는 여러 가지 제약이 따르므로 통계적인 방법으로 이를 모형화하려는 노력(in silico haplotyping)이 시도되고 있다. 이 논문에서는 통계적으로 haplotype을 정하는 대표적인 알고리즘인 Clark's algorithm, E-M algorithm 등에 대한 고찰을 통하여 유전체통계학에 대한 소개를 하고자 한다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2002.11c
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• pp.2423-2426
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• 2002

간 소화기질환 환자정보 데이터베이스 시스템이란 간 및 소화기질환을 가지고 있는 환자들의 각종 검사결과 및 실험결과 데이터를 수집, 이용, 저장, 검색, 출력할 수 있는 시스템으로서 한국인에서 가장 많이 발생하고 있는 간 및 소화기질환의 발병원인 및 유전체 연구의 연구를 효율적으로 할 수 있도록 하는 시스템이다. 본 논문에서는 간 및 소화기질환 환자의 검사결과 및 실험결과를 효율적으로 관리 분석할 수 있는 간 및 소화기질환 환자정보 데이터베이스 시스템의 설계 및 구현에 관하여 논의하였다.

• Proceedings of the Korean Society Of Semiconductor Equipment Technology
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• 2006.05a
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• pp.168-171
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• 2006

플라스마 디스플레이는 패널내부에 진공상태를 요구하며 작동 중에 발생하는 불순가스에 의해 진공도가 떨어져 소자 수명, 휘도, 방전 개시 전압 등 많은 부분에 문제를 야기시킨다. 이에 불순가스 발생의 원인을 규명하기 위해 PDP에 상용적으로 사용되는 유연 유전체를 이용하여 열적 거동에 의해 불순가스 발생과 고 진공에서의 표면 조도를 분석하였다. $100^{\circ}$에서부터 $H_{2}O$의 가스가 발생되며 $300^{\circ}C$이상에서는 $CO_2$와 함께 가스가 발생하였다. 고 진공에서 표면조도는 상온에서부터 상승하다가 유리 전이점에서 감소하며, 다시 연화점 이상에서 상승하는 것으로 나타났다. 이와 같은 결과는 PDP에서 불순가스 발생의 원인을 규명하기 위한 기초적인 실험이라 할 수 있다.

• Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea TC
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• v.38 no.9
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• pp.29-39
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• 2001

Dielectric cover effect of rectangular microstrip patch antenna on uniaxial substrates with airgap are studied. First, we derive Dyadic Green function for selected anisotropic material by constitutive relation and then formulate integral equations of electric fields using Fourier transform in space region. Using Galerkin's moment method, we discretize the electric field integral equations into the matrix form and select sinusoidal functions as basis functions. We verify the validity of numerical results and compare the results with existing ones in showing a good agreement between them. When the dielectric cover thickness is varied, the resonant frequencies and input impedances in the variation of air gap, patch length and thickness and permittivity of superstrate are presented and analyzed.

• Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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• 2010.08a
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• pp.69-69
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• 2010

현대 건축물에서 건물에너지의 손실은 대부분은 창호를 통하여 유출되어지고 있으며 에너지 절감을 위해서는 창호의 단열성을 향상시켜야한다. 저방사(Low Emissivity) 코팅유리는 건축물의 냉난방비용을 절약할 수 있는 대표적인 건축재료로써 외부에서 유입되는 태양광의 가시광선 영역은 높은 투과율을 가지면서 적외선 영역과 겨울철 실내 난방열을 반사하는 특징을 지니는 박막코팅기술이다. 이 코팅유리는 일반적으로 유전체/금속/유전체 다층박막 구조로 되어있으며, 유전체층은 내구성 증진과 금속층의 반사를 낮추어 투과율이 향상된다. 금속층은 적외선영역의 복사에너지를 반사하는 역할을 하며 전도성이 우수한 Ag 또는 Au, Pt 등을 이용하고 있다. Ag의 경우 산화물기판 위에 증착하였을 경우 island 성장을 하고 이들의 합체는 전기적, 광학적 특성에 큰 영향을 미치게 된다. 본 연구에서는 DC-sputtering법으로 제조된 Ag/glass, Ag/Ta/glass 박막을 제조하고 Ta seeding이 Ag의 전기적, 광학적 성질에 미치는 영향을 관찰하였다. 박막의 표면 미세구조는 FE-SEM(Field Emission Scanning Electron Microscope)과 AFM(Atomic Force Microscope)으로, 표면저항은 4 point probe로 분석하였다. 광투과율은 UV-Vis spectroscopy와 FT-IR로 측정하였으며 측정파장범위는 각각 200~1100nm와 1400~2400nm 이다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2006.11a
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• pp.721-724
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• 2006

최근 인간 유전체 연구에 대한 관심이 증대되어 유전자원 정보에 대한 효율적 활용을 위한 정보 수집 및 관리 활동이 지속적으로 이루어지고 있다. 그러나 현재까지 연구된 보건의료분야 표준 코드체계들은 유전자원 정보 식별을 위한 적합한 표현방법을 고려하지 않아 유전자원 정보관리에 적용하기 어려운 문제점을 갖고 있으며, 현재 사용되는 식별체계 또한 기관에 따라 자체적으로 운영되고 있는 것이 현실이다. 따라서 이 논문에서는 보건의료 정보 관리에 적용되는 국내 외 표준 코드체계를 분석하고 유전자원 표준 코드체계 설계를 위한 정보 요구사항 및 기본방향을 제시하였다.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.55 no.3
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• pp.296-299
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• 2019

The genus of Bacteroides has been isolated from vertebrate animal feces. Bacteroides sp. KGMB 02408 was isolated from fecal samples obtained from a healthy Korean. The wholegenome sequence of Bacteroides sp. KGMB 02408 was analyzed using the PacBio Sequel platform. The genome comprises a 5,771,427 bp chromosome with a G + C content of 39.50%, 5,005 total genes, 18 rRNA genes, and 74 tRNA genes. Furthermore, we found that strain KGMB 02408 had some genes for oxidoreductases and menaquinone biosynthesis in its genome based on the result of genome analysis.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.54 no.4
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• pp.456-459
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• 2018

The genus of Olsenella has been isolated from vertebrate animal mouth, rumen, and feces. Olsenella sp. KGMB 04489 was isolated from fecal samples obtained from a healthy Korean. The whole-genome sequence of Olsenella sp. KGMB 04489 was analyzed using the PacBio Sequel platform. The genome comprises a 2,108,034 bp chromosome with a G + C content of 65.50%, 1,838 total genes, 13 rRNA genes, and 52 tRNA genes. Also, we found that strain KGMB 04489 had some genes for hydrolysis enzymes, and antibiotic biosynthesis and resistance in its genome based on the result of genome analysis.

• Journal of KIISE:Software and Applications
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• v.31 no.12
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• pp.1602-1610
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• 2004

As various genome projects have produced enormous amount of biosequence data, functional sequence analysis in terms of tile nucleic acid and protein becomes very significant. In functional genomics and proteomics, the functional analysis of each individual gene and protein remains a big challenge. Contrary to traditional studies, which regard proteins as not components of a whole protein interaction network but individual entities, recent studies have focused on examining functions and roles of each individual gene and protein in view of a whole life system. In this regard, it has been recognized as an appropriate method to analyze protein function on the basis of synthetic information of its interaction and domain modularity. In this context, this paper introduces the PIVS (Protein-protein interaction Inference & Visualization System), which predicts the interaction relationship of input proteins by taking advantage of information on homology degree, domain modules which input sequences contain, and protein interaction relationship. The information on domain modules can increase the accuracy of the function and interaction relationship analysis in terms of the specificity and sensitivity.