• 제목/요약/키워드: 유전적 계통

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엽록체 유전정보를 이용한 두류 유전자원 형태적 형질의 유전력 분석 (An Analysis of the Heritability of Phenotypic Traits Using Chloroplast Genomic Information of Legume Germplasms)

  • 유동수;최유미;왕샤오한;강만정
    • 한국자원식물학회지
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    • 제36권4호
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    • pp.369-380
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    • 2023
  • 두류는 식량으로서 중요한 자원 중의 하나로 유용한 형질을 이용하여 장기적인 먹거리의 소재로 개발 및 활용하고 있다. 그런데 형질은 작물의 다양성과 관련하여 유전적 혹은 환경적 요인에 따라 형질 변이가 발생하기 때문에 유용한 형질의 장기적인 활용을 위해서는 유전적으로 장기적인 유지가 가능한 유전력이 높은 형질을 선발하는 것이 중요하다. 그러나 유전력의 추정은 복잡한 세대증식의 설계와 재배시간, 농업노동력 공급 등에 필요한 많은 시간과 비용이 소요되기 때문에 이를 해결할 수 있는 대안이 요구된다. 본 연구에서는 두류 6종에 대한 형태적 형질과 엽록체의 총455개 유전자의 계통 분류학적 차이를 통계적으로 상호 비교하여 형질에 대한 유전력을 추정하였다. 그 결과로 개화일수, 협당 립수, 조지방이 유의수준 0.05 이하(P-value≤0.05)에서 상관관계가 있는 유전자가 각각 62.86%, 69.45%, 57.14%로 높은 상관성을 보였고, 생육일수는 유의수준 0.1 이하에서 62.42%로 상관성을 보임으로써 환경적 영향보다 유전적 영향에 의한 변이가 더 크게 작용할 것으로 예상된다. 반면 성숙일수, 100립중, 조단백질, 조섬유, 식이섬유 함량에 대한 변이는 유의수준 0.05이하에서 상관성이 있는 유전자가 평균 11.82%로 환경적 변화영향이 더 클 것으로 추정되었다. 이 가운데 성숙일수와 100립중은 기존의 연구와는 다른 결과를 보였는데 이는 재배환경, 인간활동(농약, 비료 사용 등)과 같은 환경적 영향 뿐만아니라 유전력과 유전적 진전과의 관계에 따른 상위적, 상가적 유전자의 복잡한 영향으로 인하여 다른 연구결과가 나타났을 것으로 판단된다. 비록 엽록체 유전자 정보를 이용한 유전력 추정이 다소 미흡하지만 향 후에 단일염기다형성의 활용, 낮은 계통발생 신호의 보완을 위한 미토콘드리아 유전체 정보, 핵DNA 유전자 정보 등을 활용하고, 실제 조사결과와의 비교검정을 통한 보완이 이루어진다면 유전력 추정을 통한 신품종 개발 및 우수자원 선발과 육종기술 등과 같이 농업유전자원의 보존, 관리, 재배, 증식 등 광범위한 농업분야의 발전에 크게 기여할 수 있을 것이다.

규조류 Skeletonema pseudocostatum Medlin (Thalassiosirales, Bacillariohyta)의 형태적 특징과 분자계통학적 위치 (Morpho-molecular characterization of diatom Skeletonema pseudocostatum(Thalassiosirales, Bacillariophyta) from the Korean coast)

  • 한경하;이준;박준상;윤주연;김현정;곽경윤;오석진;신현호
    • 환경생물
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    • 제38권1호
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    • pp.21-29
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    • 2020
  • Skeletonema pseudocostatum의 세포는 규산질 성분의 돌기에 의한 사슬 형태로, 길이는 6~17.3 ㎛였고, 엽록체는 세포 당 1~2개를 포함하고 있었다. 주사전자현미경 관찰결과 Skeletonema 종을 구분할 수 있는 가장자리 받침돌기끝(terminal fultoportula process)은 끝이 갈라지거나, 갈고리 모양이었고, 길이가 1.67±0.5 ㎛이고, 개각의 가장자리에 위치해 있으며, 개수는 8.10±1.1개로 개각의 크기에 따라 다양하게 나타났다. 말단세포 입술돌기(terminal rimoportula process)는 두꺼운 원통형의 나팔관 모양으로, 개각의 중앙 근처에 위치하였고, 길이는 1.1±0.6 ㎛였으며, 개수는 1개였다. 연결세포 받침돌기(intercalary fultoportula process)는 대부분 1 : 1 결합으로 서로 맞물려 있는 형태였고, 1 : 2 결합도 종종 발견되었다. 계통분석 결과는 형태적 특징이 유사한 종 간의 유전학적 거리가 가깝다는 것을 나타냈고, 지리적 기원이 다른 동일 종의 경우, 유전적 차이를 보이지 않았다. 이는 S. pseudocostatum은 지리적 위치와 상관없이 유전적 차이가 나타나지 않는 단일계통(monophyly)이라는 것을 의미한다.

차세대 염기서열분석을 통한 밀 기능유전체 연구의 현황과 전망 (Current Status and Prospect of Wheat Functional Genomics using Next Generation Sequencing)

  • 최창현;윤영미;손재한;조성우;강천식
    • 한국육종학회지
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    • 제50권4호
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    • pp.364-377
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    • 2018
  • 차세대 염기 서열 분석 기술의 적용은 빠르게 식물 유전체학의 지식을 확장시킴으로 기능유전자 연구의 발전을 도모하고 있다. 특히, 밀의 기능유전체학의 발전은 기존의 염기서열 분석 기술로는 가능성이 없어 보였다. 하지만 NGS의 발전은 고품질 보통밀의 RefSeq를 완성뿐만 아니라 다양한 밀 계통들의 재염기서열분석을 가능하게 한다. 현재 이렇게 얻어진 고품질 유전정보와 유전적 다형성이 밝혀진 유전자원의 이용으로 밀 기능유전체 연구가 새로운 단계로 접어들고 있다. NGS 기술 및 reverse genetics의 발전은 앞으로 전세계에 펼쳐져 있는 야생형 밀과 재배종 밀 계통들의 유전적인 다양성 분석을 가능케 하고 밀의 유전과 진화 과정을 깊게 이해하는데 큰 도움이 될 것이다. NGS 기술의 사용과 생물정보학의 결합은 타 작물에 비해 뒤쳐진 밀의 기능유전체 연구 속도를 가속화할 것이다. 기능유전체 연구를 활용한 밀 육종의 시대가, 애기장대 및 벼 분야와 같이, 다가오고 있다.

배전계통에서 유전적 알고리즘을 이용한 접속변경순서결정방법 (A Re-Configuration Genetic Algorithm for Distribution Systems)

  • 최대섭
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 2005년도 춘계학술대회 논문집 전기설비전문위원
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    • pp.62-63
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    • 2005
  • Recently, sectionalizing switches have been coming to be operated by remote control through the distribution SCADA system. However, the problem of determining the optimal switching sequence is a combinatorial optimization problem, and is quite difficult to solve, Hence, it is imperative to develop practically applicable solution algorithms create a new arbitral distribution system configuration from an initial configuration, and some of these algorithms do not show a load transfer sequence to reach the objective system.

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배전계통에서 유전적 알고리즘을 이용한 접속변경순서 결정방법 (A Re-Configuration Genetic Algorithm for Distribution Systems)

  • 최대섭
    • 한국조명전기설비학회:학술대회논문집
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    • 한국조명전기설비학회 2004년도 학술대회 논문집
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    • pp.381-383
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    • 2004
  • Recently, sectionalizing switches have been coming to be operated by remote control through the distribution SCADA system. However, the problem of determining the optimal switching sequence is a combinatorial optimization problem, and is quite difficult to solve. Hence, it is imperative to develop practically applicable solution algorithms create a new arbitral distribution system configuration from an initial configuration, and some of these algorithms do not show a load transfer sequence to reach the objective system.

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배전계통에서 유전적 알고리즘을 이용한 접속변경순서결정방법 (A Re-Configuration Genetic Algorithm for Distribution Systems)

  • 최대섭
    • 한국조명전기설비학회:학술대회논문집
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    • 한국조명전기설비학회 2005년도 춘계학술대회논문집
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    • pp.418-420
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    • 2005
  • Recently, sectionalizing switches have been coming to be operated by remote control through the distribution SCADA system. However, the problem of determining the optimal switching sequence is a combinatorial optimization problem, and is quite difficult In solve. Hence, it is imperative to develop practically applicable solution algorithms create a new arbitral distribution system configuration from an initial configuration and some of these algorithms do not show a load transfer sequence to reach the objective system.

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넙치 우량혈통 선발육종을 위한 연구 III. 체세포분열 억제성 자성발생성 2배체 넙치의 유도

  • 이윤아;박상용;방인철
    • 한국어업기술학회:학술대회논문집
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    • 한국어업기술학회 2001년도 추계 수산관련학회 공동학술대회발표요지집
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    • pp.279-280
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    • 2001
  • 넙치(Paralichthys olivaceus)는 1980년대 초부터 일본으로부터 수정란을 도입하여 양식되기 시작하였으며, 현재 전 연안에서 종묘생산 또는 양식이 이루어지고 있다. 그러나 최근 연안어장의 오염과 질병의 발생으로 인해 넙치 양식 생산성이 크게 낮아지고 있다. 또한 장기간 동일계통의 넙치를 친어로 이용함으로서 유전적 열성화로 인한 많은 문제점이 나타나고 있는 실정이다. (중략)

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Mitochondrial Cytochrome b 유전자에 의한 올빼미과 (Family Strigidae)의 분자계통 (Molecular Phylogeny of the Family Strigidae (Aves) Based on Mitochondrial Cytochrome b Gene)

  • 류시현;박희천
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제19권2호
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    • pp.297-304
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    • 2003
  • Mitochondrial cytochrome b 유전자를 이용하여 한국에서 채집된 5종을 포함한 올빼미과(Strigidae)의 12속 31종의 계통분석을 하였다. Maximum likelihood 분석과, Kimura two-parameter와 p-distance를 이용하여 유전적 근연 관계를 측정하였다. 본 연구에 이용된 959개의 염기서열 가운데, 459개의 서열에서 변이를 확인하였고, 398개의 서열은 계통학적 정보를 가졌다. 올빼미과는 Clade I (Aegolius) , Clade II (Athene, Micrathene, Glaucidium, Surnia), 그리고 Clade III(Bubo, Nyctea, Pulsatrix, Strix, Otus, Ptilopsis, Ninox) 등 세 개의 그룹으로 나뉘어졌다. 또한 Otus속은 지리적으로 다른 두 개의 그룹으로 분리되는 것이 확인되었다.

RAPD를 이용한 용담의 유전적 유사도 분석 (Analysis Genetic Similarity of Gentiana scabra var. buergeri by Randomly Amplified Polymorphic DNA)

  • 이해경;이미경;문창식;방재욱
    • 한국약용작물학회지
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    • 제4권3호
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    • pp.224-230
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    • 1996
  • 서철재래종, 내장산 수집종, 대둔산 수집종, 거제도 수집종, 진부재래종 및 일본 도입종 등 계통의 용담을 대상으로 RAPD 분석을 통한 유사도 분석을 수행한 결과 적용한 20가지의 10-merprimer 중 8가지에서 54개의 증폭된 DNA 절편을 얻었다. 그 중 53.7%에 해당하는 29개의 band가 다형현상을 보였으며, 9.3%에 해당하는 5개의 band는 모든 계통에서 공통적으로 나타났고, 37%인 20개의 band가 특이성을 보였다. 특이성을 보이는 band들은 내장산 수집종에서 2개, 거제도 수집종에서 1개, 진부재래종에서 11개, 일본 도입종에서 6개가 관찰되었다. 유전적 유사도의 분석결과 서천재래종, 내장산 수집종, 대둔산 수집종 및 거제도 수집종이 0.76-0.87의 유사도를 보여 한 집단으로 구분되었으며, 이 집단과 진부재래종 및 일본 도입종 사이의 유사도는 0.23-0.34로 각 각 다른 집단으로 구별되었다. 또한 진부재래 종과 일본 도입 종 사이의 유사도는 0.41로 나타나 서로 구분되었다.

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ISSR을 이용한 음나무속 분류군의 유전적 다양성과 관련성 비교 (Comparison of Genetic Diversity and Relationships of Genus Kalopanax Using ISSR Markers)

  • 허만규
    • 생명과학회지
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    • 제16권5호
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    • pp.740-745
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    • 2006
  • ISSR 마크로 한국내 자생하는 음나무속 4분류군(음나무, 가시없는 음나무, 털음나무, 가는잎음나무)에 대해 유전적 다양성과 계통관계를 조사하였다. 64개의 재현성 높은 ISSR 밴드가 생성되었다. 음나무속의 각 개체별 분석에서 41개 밴드(64.1%)가 다형성을 나타내었다. 네 분류군을 통합하였을 때 그룹내 다양도는 0.115였고 그룹간 다양도는 0.467이였다. 종내 유전자 흐름(Nm)의 측정결과 음나무의 Nm값은 털음나무, 가는잎음나무에 비해 낮았다. 이는 지리적 거리에 따른 생식적 격리가 이 종의 집단구조를 형성하고 있다고 판단된다. 계통도 분석에서 ISSR 마크로 속수준의 네 분류군뿐만 아니라 집단까지도 잘 분리되어 본 연구에 사용한 마크가 분류에 효과적임이 규명되었다.