• 수산해양교육연구
• /
• 제26권4호
• /
• pp.808-822
• /
• 2014

넙치 (Paralichthys olivaceus)로부터 elastase-like serine protease (PoElSp)를 암호화하는 cDNA를 클로닝하여 그 서열을 분석한 결과, PoElSp 유전자는 269 아미노산을 암호화하는 978염기쌍으로 구성되었다. PoElSp 유전자의 조직 특이적 발현 양상을 RT-PCR법으로 조사한 결과, 간, 비장 및 소장에서 그 발현이 크게 나타났다. lipopolysaccharide (LPS)로 인위적 세균감염을 유도한 후, 1시간째에 콩팥에서, 3시간째에는 근육에서, PoElSp 유전자의 발현이 크게 증가하였다. 또한, 이 유전자의 발현은 비장에서 LPS 주입 후 1-24시간동안 점차로 증가하였다. pro-mature PoElSp (proPoElSp)에 해당하는 cDNA를 pET32a 벡터 시스템을 이용하여 대장균에서 발현시켰다. 이 재조합 proPoElSp 단백질의 활성은 gelatin zymography 방법과 합성형광 Z-Phe-Arg-AMC의 분해법을 이용하여 측정하였다. 단백질 분해효소 활성을 위한 최적 pH는 7.5였다. 실험결과들을 종합하면, PoElSp 단백질은 면역 반응에서 중추적 역할을 하리라 판단된다.

• 미생물학회지
• /
• 제30권4호
• /
• pp.246-251
• /
• 1992

대두 (Glycine max) 뿌리혹의 질소고정 공생균주 Bradyrhizobium japonicum SNU001 의 nod 유전자를 클로닝하였다. Rhizobium meliloti 의 4.5 kb EcoRI/ HindIII 절편을 탐침으로 한 게놈 혼성화 반응을 분리균주의 게놈상에 nod 유전자가 존재함을 확인하고, lambda EMBL3-BamHI vector 를 이용하여 genomic library 를 작성하였다. 작성된 library 로부터 1, 2 차 선별과정을 통해 nod 유전자가 있는 클론 1-5 를 선별하고, 클론 2로부터 nod DABC 탐침과 lambda DNA 탐침을 사용한 혼성화반응을 수행하여 삽입된 genomic DNA 에 대한 부분적인 제한효소 지도를 작성하였다. nod DABC 탐침과 가장 강한 혼성화반응을 보인 phage 클론 lambda CNS-1 의 3.9 kb BamHI 절편을 pBS KS(+) vector 에 subcloning 하고 동일한 탐침을 이용한 혼성화반응을 통해 subclone pBjCNS-1 을 선별하였다. 이 subclone 에 대한 부분적인 제한효소 지도를 작성하여 nod DABC 가 1.8 KpnI/SacI 절편에 존재함을 확인하였다.

• 미생물학회지
• /
• 제35권3호
• /
• pp.226-230
• /
• 1999

무지개송어 등의 연어과 어류에서 발생하는 전염성 조혈기괴사증 바이러스의 국내분리주인 IHNV-PRT 의 특성을 규명하기 위하여 IHNV-PRT 의 당단백질인 G를 암호화하고 있는 유전자의 일부를 PCR로 증폭한 후 cDNA를 클로닝하여 이들의 염기서열을 분석하였다. 이 PCR product 는 442 bp의 크기이었다. IHNV-PRT 의 G의 염기서열을 IHNV 의 다른 strain 과 비교 분석한 결과 IHNV-RB-76, IHNV-RB, IHNV-LR-73, IHNV-K, IHNV-WRAC, IHNV-SRCV, IHNV-CoI-85들의 G와 각각 95,94,94,94,93,93%의 상동성을 보였다. 그러나 넙치로부터 분리된 fish rhabdovirus 인 hirame rhabdovirus 의 G와는 81%의 사동성을 보였다. 이 결과로부터 IHNV 의 G 유전자는 비록 HRV 의 G 유전자와 유사성은 높지 않지만, IHNV 의 strain 에 관계없이 유사하다는 것을 알 수 있다.

• 한국정보통신학회논문지
• /
• 제17권4호
• /
• pp.1005-1009
• /
• 2013

마산병원과 결핵연구원에서 rifampin 내성균주를 확보하여 기존의 전통방법으로 검사된 항결핵제 내성균의 rifampin 내성관련 유전자인 rpoB (RNA polymerase beta subunit)의 변이를 DNA 염기서열 분석방법에 의하여 분석하였다. 그 결과 국내에서 분리되는 결핵균에서는 기존에 보고된 rpoB 변이부위와는 다른 위치의 DNA 염기 변이가 확인되었고 국내에서 여러 내성 결핵균주에서 변이가 발견되고 있지만 이러한 변이가 리팜핀 내성을 실제로 유발하는지 실험적으로 검증된 바는 없었다. 따라서 이러한 특이 부위의 rpoB변이들이 실제로 리팜핀 내성을 유발하는가를 확인하기 위하여 내성 결핵균주들의 rpoB 변이유전자를 polymerase chain reaction(PCR)으로 증폭하고 이것을 리팜핀 감수성 결핵균주에 cloning(클로닝)하고 발현시켜 rpoB 변이가 리팜핀에 대한 내성을 발생시켰음을 실험적으로 확인하였다.

• 미생물학회지
• /
• 제46권2호
• /
• pp.207-212
• /
• 2010

전통 발효식품인 된장으로부터 mannanase의 생산균으로 분리된 WL-8 균주는 형태적 특성, 생화학적 성질 및 16S rRNA의 염기서열에 근거하여 Bacillus subtilis로 동정되었다. B. subtilis WL-8은 locust bean gum 보다는 밀기울이 첨가된 LB 배지에서 mannanase 생산성이 높았으며, 24시간 배양하였을 때 약 20 U/ml에 이르렀다. 분리균 WL-8의 mannanase 유전자를 클로닝하여 그 염기서열을 결정한 결과 mannanase 유전자는 362 아미노산으로 구성된 단백질을 코드하며 1,086 뉴클레오티드로 이루어졌다. 아미노산 잔기배열을 분석한 결과 WL-8의 mannanase는 GH family 26에 속하며 B. subtilis의 mannanases와 매우 상동성이 높았다. B. subtilis WL-8의 mannanase 유전자를 함유한 재조합 대장균의 배양상등액과 균체파쇄상등액을 사용하여 반응특성을 조사한 결과 pH 5.5와 $60^{\circ}C$에서 최대 반응활성을 보였으며, $60^{\circ}C$보다 높은 온도에서 배양상등액보다는 균체파쇄상등액에 존재하는 mannanase가 더 높은 활성을 보였다.

• 자연과학논문집
• /
• 제5권1호
• /
• pp.37-45
• /
• 1992

Neisseria lactamica 2118 의 $\beta$-galactosidase 유전자를 Southern Hybridization 과 colony hybridization을 통하여 Escherichia coli MC 1061에 클로닝 시켰다. $\beta$-Galactosidase 유전자를 함유하는 6.5 Kb EcoR I 단편과 7.2 Kb BamH I 단편들을 pMC 1871의 lac Z 유전자를 probe로 한 Southern hybridization으로 얻고 이들을 pBR 322에 삽입한후 Escherichia coli MC 1061에 형질전환 시키고 이들 형질전환체들을 동일 probe로 colony hybridization 시켜 최종적으로 3주의 $\beta$-galactosidase positive clone들을 얻었다. 이들의 재조합 plasmid에는 Neisseria lactomica 2118 염색체 DNA의 약 7.2Kb BamH I 단편이 삽입되어 있음을 확인 하였고 probe와 상동성이 가장 강한것으로 추정되는 pNL 24에 대한 제한효소지도를 작성 하였다.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제20권3호
• /
• pp.280-288
• /
• 1992

Serratia marcescens ATCC 21074 균주가 세포밖으로 분비하는 metalloprotease 유전자를 대장균으로 클로닝하고 그 발현을 살펴보았다 Serratia marcescens ATCC 21074 균주의 염색체 DNA를 제한효소 HindIII로 절단하고 아가로스 전기영동 후 32P로 표지된 합성 oligonucleotide를 사용하여 southern hybridization한 결과 4.0Kb의 DNA 절편에 metalloprotease가 존재함을 알 수 있었다. 4.0Kb 염색체 DNA 절ㅊ편을 분리하여 pUC19에 연결한 후 대장균으로 transformation하였다.

• 미생물학회지
• /
• 제32권1호
• /
• pp.28-33
• /
• 1994

정상적인 세포에서 tau 단백질은 신경세포의 축색돌기에 있는 미세소관(microtubule)과 결합하고 있지만, Alzheimer병 세포의 경우 그 단백질은 몇몇 신경세포의 체세포 수지상조직(somatodendrite) 부위에 고착되어서 이중나선 섬유(paired helical filament; PHF)의 주성분을 이루게 된다. 따라서 뇌에PHF가 축적되는 특성 파악과 그들을 야기시키는 요인분석의 일환으로 다량의 순수한 tau 단백질을 확보하기 위하여 본 연구에서는 인체 tau 유전자의 cDNA를 클로닝하고 Escherichia coli에서의 발현을 유도하였다.

• 미생물학회지
• /
• 제30권6호
• /
• pp.539-545
• /
• 1992

Lactobacillus casei SM-M1 의 플라스미드로부터 phospho-$\beta$-galactosidase gene 을 갖는 DNA 를 E. coli 에 클로닝한 pPLac15(13kb) 의 재조합 플라스미드를 제조하였다.(15). pPLac15 DNA 를 분리하여 제한효소로 처리하여 제한효소 지도를 작성하였다. Phospho-$\beta$-galactosidase 유전자의 발현을 높이기 위하여 lac promoter 를 가진 pUC18 의 PstI 위치에 클닝하여 pPLac18 을 제조하였으며, 이것을 다시 EcoRI 으로 절단하여 pUC 18 에 클로닝하여 얻은 pPLac23 (7.6 kb) 를 얻었다. Phospho-$\beta$-galactosidase 효소활성은 pPLac23 의 형질전환주인 E. coli SW-23 에서는 pPLac15 를 가진 형질전환주인 E. coli SW-15 보다 약 1.8 배의 효소의 활성을 나타내었으며 pPLac18 을 가진 E. coli SW-18 보다는 약간 높은 활성을 나타내었다.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제20권2호
• /
• pp.129-135
• /
• 1992

본 연구에서는 Serratia marcescens ATCC 27117 균주로부터 키나아제 유전자를 대장균으로 클로닝 하고 발현시켰다. pUC 19 플라스미드를 이용하여 S.marcescens의 genomic library를 만들고 팽화된 키틴이 포함된 한천배지에서 키티나아제 활성을 가지는 클론을 선별하였다. 약 1x10 transformant들 중에서 키티나아제 활성을 보이는 하나의 클론을 선발하였으며 이것은 pUC 19 플라스미드속에 8.9Kb 염색체 DNA 삽입단편을 가지고 있었다.