• Journal of Wellness
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• v.7 no.4
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• pp.177-186
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• 2012

The purpose of this study was to find out how Accumulation of Short Duration exercises influence on expression of apoptosis genes in a mouse skeletal muscle. The subjects, ICR-type mice, were divided into three cohorts, Accumulation of Short Duration exercise group, continuous aerobic exercise group, and control group. Accumulation of Short Duration exercise group performed wheel-running for fifteen minutes respectively in the morning and afternoon three times a week. Continuous exercise group performed wheel-running for thirty minutes three times a week. Both split and continuous groups completed the wheel-running trials for sixteen weeks. To identify the difference of apoptosis expression between groups, the data colleted from the skeletal muscle were analysed by one way ANOVA. Analyses of the data revealed that significant differences of apoptosis concentration in both continuous and Accumulation of Short Duration exercise groups, there was a notable differences were observed in control group.

• The Korean Journal of Applied Statistics
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• v.21 no.3
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• pp.523-535
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• 2008

Initial work of microarray data analysis focused on identification of differentially expressed genes, and recently, the focus has moved to discovering significant sets of functionally related genes. We describe some problems of GSEA and PAGE, and propose a modified method to identify significant gene sets. The results based on a simulated experiment and real data analysis using a set of publicly available data show the superiority of the newly proposed method, GSA-AT, in detecting significant pathways with the accurate prediction.

• Journal of the Korea Organic Resources Recycling Association
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• v.26 no.3
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• pp.39-46
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• 2018

Two domestic earthworm populations used in vermicomposting in different lacalities were collected. The one was from Hongcheon (Kangwon province) and the other was from Youngdong (Chungcheong province). Reproductive capacities and the degree of reproductive isolation of two population were investigated. CO I gene sequences were also compared. There was no difference in their reproductive capacities. And there was no reproductive isolation between two populations. Two populations were identified as Eisenia andrei or Eisenia fetida by CO I gene biomarkers. Phylogenetic tree formulated by CO I gene sequence strongly suggested that two populations were just the same species.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2003.04a
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• pp.40-42
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• 2003

본 논문에서는 유전자 알고리즘(Genetic Algorithm: GA)의 새로운 병렬화 방법을 제안 하고 있다. 기존의 병렬 유전자 알고리즘(Parallel Genetic Algorithm: PGA)은 전체 개체집단을 부개체집단 (Subpopulation)으로 나누어 해의 가능 영역을 동시에 탐색하는 것이 일반적인 방법인데 반해. 본 논문에서 제안하는 병렬화 방법은 전체 해의 영역을 나누어 각각의 영역에서 독립된 개체집단들이 서로 다른 영역을 탐색하게 하는 방법이다. 이 방법은 두 가지 단계의 병렬 유전자 알고리즘으로 구성된다. 먼저 적응교배 연산자(Adaptive Crossover Operator: ACO)를 이용한 PGA를 통해 지역해에 인접한 범위들로 해의 영역을 나누고, 이렇게 나누어진 각각의 영역들에서 다시 병렬로 GA를 적용시켜 자세하게 탐색하는 방법이다. 첫 번째 수행되는 PGA 단계에서는 탐색 시간을 줄이고 두 번째 PGA 단계에서는 보다 자세한 탐색을 하기 위해 정밀도(Precision)의 조정을 유전자 알고리즘의 병렬화에 적용하였으며. 이를 통해 빠르고 자세한 탐색이 가능한 유전자 알고리즘의 병렬화 방법을 제안하고 있다.

• Journal of Oral Medicine and Pain
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• v.22 no.2
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• pp.253-260
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• 1997

한국인 집단에서 개인식별의 기초자료로 활용하고자 한국인 201명을 대상으로 STR 유전좌위 중 하나인 LPL 유전좌위의 유전자 빈도 및 유전자형 분포를 구하였다. 혈액으로부터 추출한 핵 DNA를 중합효소연쇄반응으로 증폭시키고 폴리아크릴아마이드 겔 상에서 전기영동하여 은염색한 후 관찰하여 다음의 결과를 얻었다. 1. 한국인 집단 201명의 LPL 유전자에서 5개의 대립유전자, 7개의 유전자형을 검출하였으며, 이형접합도는 50.7%로 나타났고 대립 유전자다양성 (allelic diversity value)은 0.454, 개 인식 별력 (PD)은 0.674를 보였다. 2. 대립 유전자 및 유전자빈도는 9, 10, 11, 12, 13 대립 유전자에서 각각 0.020, 0.714, 0.100, 0.164, 0.002로 나타났으며, 대립유전자 7, 8, 14는 관찰되지 않았다. 이상의 결과를 볼 때 한국인 집단에서 STR LPL유전좌위의 유전자빈도는 친자감정 등 개인식별에 유용하게 사용할 수 있으나 감정실무에 응용시 다수의 STR유전좌위 및 VNTR유전좌위의 분석을 병행하여야 할 것으로 사료된다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2002.04b
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• pp.298-300
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• 2002

기존의 유전자 알고리즘은 우리가 원하는 최적해를 찾기 위해서 개체 집단의 크기를 가능한 크게 유지하여야 한다. 하지만 일반적인 문제들에 있어 개체의 적합도를 평가하는 젓은 어렵기 때문에 큰 집단의 로든 개체에 대하여 적합도를 평가하는 것은 커다란 시간과 비용을 소모한다. 이에 본 논문에서는 집단의 크기를 크게 유지하되 적합도 평가 과정을 줄이는 방안으로 클러스터링에 기반한 효율적인 유전자 알고리즘을 제시하고 체계적인 평가를 한다. 9개의 벤치마크 적합도 함수에 대하여 여러 클러스터링 방법을 적용하여 실험한 결과 제안한 방법의 유용성을 확인할 수 있었다.

• Journal of Life Science
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• v.13 no.3
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• pp.252-257
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• 2003

The genetic variabilities of second chromosomes of Drosophila melanogaster concealed in Busan natural and experimental populations have been analyzed by the Cy//Pm method. The experimental population was composed of D. melanogaster which had the lethal-free second chromosome, collected Sasang natural population in 1982. The frequencies of deleterious genes were estimated to be 14.3∼25.4% in Busan natural population and 26.5∼27.2% in experimental population. The allelism rates in lethal genes isolated from the natural and experimental populations were calculated to be about 0.76% and 9.76∼14.17%, respectively. The value of elimination by the frequencies of deleterious genes and allelism rate was 0.0106and the effective population size estimated to be about 430 flies at the 6570 days population.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2002.11b
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• pp.50-50
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• 2002

배추무사마귀병 저항성 유전 양식을 증명하기 위해서 CR계 F1에서 유래된 F2 세대를 포장시험과 유묘 검정을 실시하였다. F$_2$ 세대의 7 집단은 단인자우성으로 3:1의 분리비를 보였고, 5 집단은 중복 유전자가 관여하는 9:7의 유전 분리비를 보였다. 배추무사마귀병 저항성 유전자와 연관된 DNA 마커를 개발하기 위하여 CR-Saerona F$_2$ 집단을 배추무사마귀병 발병포장에서 재배하여 저항성 평가를 하였다. 220개의 임의의 프라이머를 이용하여 BSA-RAPD (Bulked segregant analysis-Randomly amplified polymorphic DNA)를 수행하였지만 CR-Saerona F2 집단에서 배추무사마귀병 저항성 유전자와 꼭 들어맞는 DNA 마커는 발견되지 않았다. 300개의 임의의 프라이머를 이용하여 CR-Saerona에서 유래된 F$_2$ 세대를 QTL 분석하였다. 저항성 정도는 발병지수에 따라 조사되었고 QTL 분석을 위해 one-way ANOVA 테스트를 하였다. 통계분석 결과 두 프라이머(K16-1, L2-2)가 저항성과의 상관관계를 보여 주었으나 유의성은 인정되지 않았다.

• Proceedings of the Korean Aquaculture Society Conference
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• 2003.10a
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• pp.33-33
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• 2003

Lipoprotein lipase (LPL)은 지방축적과 대사에 있어 중요한 효소로서 지방조직과 근육 내로의 지방산 유입을 조절하며, 여러 조직에서 합성되고, 조직 특이적인 방법으로 동물의 생리상태, 영양상태 및 발달단계에 따라 유전자 발현이 조절되는 것으로 알려져 있다. 본 연구는 어류의 체지방 축적과 대사과정을 이해하고 성장 및 경제형질 관련 DNA marker를 확보하기 위한 1차적인 연구로서, 한국산 선발계통 및 일본산 양식계통과 이들 두 계통간 잡종 참돔 집단을 이용하여 LPL 유전자 내의 다형성을 탐색하고 분석하였다. PCR-RFLP 분석을 실시하여 참돔 LPL 유전자 exon 2번을 포함하는 영역에서 3개의 (Msp I, Alu I 및 Hsp92II) 다형성을 확인하였고, 각 집단간 대립유전자의 빈도를 분석하였다. Exon 2번에서 관찰된 Msp I 다형성은 염기치환 (C$\longrightarrow$G)이 일어난 형태로서 아미노산 서열에는 변화가 없는 silent mutation 이었으며, 대립유전자의 빈도를 분석한 결과, 각 집단간 뚜렷한 차이는 없었다. Alu I 및 Hsp92II 다형성은 intron 영역에서 발견되었으며, Alu I 다형성으로 인한 4개의 대립유전자형 중 D 대립유전자는 한국산 선발 계통과 한국산 선발계통을 포함하는 교배집단에서만 검출되었다. 이 후의 연구에서는 참돔 LPL 유전자의 exon 영역에 존재하는 다형성을 탐색하고, 형질과의 연관성 및 지방축적 기능과의 관련성 등을 분석하고자 한다.

• Korean Journal of Plant Resources
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• v.28 no.2
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• pp.279-289
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• 2015

Genetic diversity and genetic differentiation of thirteen Pinus densiflora populations in South Korea were estimated using nine ESTP (Expressed Sequence Tag Polymorphism) markers. The numbers of allele and the effective allele were 2.2 and 1.8, respectively. The percentage of polymorphic loci (P) was 98.8%. The observed and the expected heterozygosity were 0.391 and 0.402, respectively, and the eleven populations except for Ahngang and Gangneung population were under Hardy-Weinberg equilibrium state. The level of genetic differentiation (Wright’s F_ST = 0.057) was higher than those of isozyme or nSSR markers. We could not find out any relationship between the genetic distance and geographic distribution among populations from cluster analysis. Also, the genetic differentiation between populations was not correlated with the geographic distance (r = 0.017 and P = 0.344 from Mantel test). From the result of F_ST-outlier analysis to identify a locus under selection, six loci were detected at confidence interval of 99% by the frequentist’s method. However, only three loci (sams2+AluⅠ, sams2+RsaⅠ, PtNCS_p14A9+HaeⅢ) were presumed as outliers by Bayesian method. The sams2+AluⅠ and sams2+RsaⅠlocus were originated from the sams2 gene and seemed to be the loci under balancing selection.