펩타이드 중합체의 이차 구조는 화학적, 생물학적 기능을 갖는 단백질 삼차 구조를 결정하는 중요한 구성요소이다. 이러한 단백질의 이차구조에 대한 정보는 치매, 광우병과 같은 단백질 응집관련 질병에서 응집유발 단백질의 형성과정 및 안정도와 밀접한 연관이 있다. 본 연구는 폴리알라닌을 모델 펩타이드로 선택하여, 이들의 가능한 7가지 이차구조들에 대한 구조적, 열역학적 특성을 계산화학방법을 통해 비교 분석하였다. 우선 기체상에서 7가지 구조들의 구조최적화를 통해 상대적 안정도를 비교하였고, 나아가 EDISON의 용매화 자유 에너지의 열역학적 계산방법을 통해 수용액상에서의 상대적인 안정도와 그 원인을 비교, 분석하였다. 특히, 기체상에서와 수용액상애서 폴리알라닌 이차구조들의 상대적 안정도가 바뀌는 원인에 대해, 폴리알라닌의 구조적 특징과 수소결합과의 상관관계를 통해 규명하였다. 본 연구에서 밝힌 단백질 이차 구조의 상대적 안정도 및 물과의 상관관계에 미치는 구조적, 열역학적 원인은 응집 유발 단백질에서 제시된 특정 이차 구조의 선택적 안정성에 대한 근거를 제시하며, 그 기작을 이해하는 중요한 단서를 제공한다.
암을 억제시키는 기능을 하는 단백질로 잘 알려진 p53은, 주로 종양세포에서 과도하게 발현되는 단백질인 HDM2와 복합체를 형성하여 비활성화되고 항암기능을 상실하게 됩니다. 때문에 종양세포에서의 p53-HDM2의 상호작용을 억제하기 위해 현재까지 많은 연구가 진행되어왔으며, 다양한 p53-HDM2 억제제가 개발된 바 있습니다. 최근 연구들에 따르면, HDM2와 결합친화도를 높이고 소수성 작용(hydrophobic interaction)에 기여하여 보다 안정한 구조를 만드는 탄화수소체인(staple)을 연결시킨 펩타이드 설계에 대한 관심이 높아지고 있는 추세입니다. 이에, 본 연구에서는 분자동역학 모의실험을 통해서 얻은 탄화수소체인-p53과 비탄화수소체인-p53 및 각각의 HDM2와 결합한 복합체를 기반으로 EDISON의 용매화 자유에너지(Solvation Free Energy) 프로그램을 이용하여 탄화수소체인의 특징 및 역할을 구조적인 측면과 열역학적인 측면으로 분석하여 비교하고자 합니다. 우리 연구에서 비탄화수소체인-p53의 구조는 분자동역학 시뮬레이션을 수행하는 동안 나선구조형태로 풀려 HDM2와 결합 유도 시에 주요결합 아미노산 잔기가 올바른 결합부위와 상호작용하지 못한 결과를 확인한 반면, 탄화수소체인이 형성된 구조는 시뮬레이션 동안에도 펩타이드의 나선구조를 유지시켜 HDM2와 주요 결합을 형성하는 아미노산 잔기들을 올바른 방향으로 배치시켜 HDM2와의 결합친화도를 높였습니다. 이 연구 결과는 탄화수소체인이 펩타이드의 나선성을 유지시키고, HDM2와의 상호작용을 통한 구조적인 안정성 유도 및 용매화 자유에너지에 큰 기여를 통해 p53-HDM2상호작용 억제제에서 긍정적인 역할을 할 가능성을 보여줍니다.
Polymeric membranes consisting of poly(d,1-lactide) as a polymer matrix and crystallizable progesterone as a drug were prepared by coagulating polymeric solutions. The homogeneous casting solutions in dimethyformamide were solidified by using three different coagulating processes : solvent evaporation under vacuum, solvent extraction via immersion into the nonsolvent bath, or vapor exposure at high humidity condition. With solvent removal via evaporation under vacuum, the cast solution film was vitrified to form a homogeneous film containing progesterone of spherical shape distributed evenly in the film. Being prepared by solvent extraction via immersion into a water bath, the resulting membrane showed an asymmetric structure, with progesterone of big crystallites distributed unevenly in the structure. On the other hand, the coagulation under high humidity transformed the cast film into a sponge-like structure, where progesterone took a shape like flake.
Proceedings of the Korea Crystallographic Association Conference
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2002.11a
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pp.26-26
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2002
Cholesteryl 2,4-dichlorobenzoate의 결정은 두가지 서로 다른 결정구조로 결정화한다. Dichloromethane 용매에서 키운 결정(1)과 hexane 용매에서 키운 결정(2)이 서로 다른 구조를 나타낸다. Cholesterol O(3)에 결합한 dichloro- benzoate의 상대적인 배열도 이 두가지 구조에서 서로 다르다. 특히 이들 결정구조들은, 공간군(P2₁2₁2₁)과 격자상수들이 매우 비슷한 결정이다. 결정(1)은 뚜렷한 layer structure를 보여준다. 결정(1)은 예측한 대로 liquid crystalline state(cholesteric phase)가 130.8℃에서 나타내고 녹는점은 132.5℃이다. 결정(2)의 녹는점은 133.7℃이다.
The relative viscosities and the osmotic coefficients of alkaline metal iodides (NaI, KI, RbI, CsI) in methanol, ethanol, dimethylsulfoxide (DMSO), and sulfolane (TMS) have been measured by Ubbelohde viscometer and vapor pressure osmometry at 45 ∼ $120^{\circ}C.$ The order of A and B coefficients in viscosity for alkaline metal iodides are MeOH > EtOH > TMS > DMSO, and TMS > EtOH > DMSO > MeOH. dB/dT values for the alkaline metal iodides are in the order of NaI > KI > RbI > CsI in the protic solvents, while those for the aprotic solvents are in the reverse order. The order of the osmotic coefficients for the alkaline metal iodides is EtOH > DMSO > MeOH > TMS.
A series of new thorium nitrate complexes with crown ethers have been synthesized from the reaction of the hydrated thorium nitrate, with the appropriate crown ethers of different cavity sizes in various solvents such as methanol, ethanol, butanol, methylacetate, acetone, tetrahydrofuran and acetylacetone. CHN elemental analysis, ICPAS, thermal analysis and Karl-Fischer method have been used to characterize their compositions, and the spectroscopic methods of IR, UV, $^1H-NMR$, and X-ray diffraction have been employed to determine the structures and solvolysis phenomena of these complexes. and the electrical conductances were measured in DMSO, and water solvent. The solvolysis have been observed only in the complexes synthesized in acetylacetone solvent. In the solvated complexes of 15-crown-5 and 18-crown-6, the mole ratio of $Th^{4+}$: ligand : acetylacetone is found to be 1:1:1, but in the non-solvated complexes of 12-crown-4 and 15-crown-5, the mole ratios of Th:L are 1:2 and 2:3, respectively, and that in the complexes of both 18-crown-6 and dicyclohexano-18-crown-6 is 1:1. All complexes which were not solvated have shown $n{\to}{\sigma}^{\ast}$ electronic transitions of crown ether whereas complexes solvated have exhibited both $n{\to}{\sigma}^{\ast}$ of crown ether and $n{\to}{\pi}^{\ast}$ transitions of acac. The dissociation mole ratio of $Th^{4+}$ and nitrate ion is found to be 1:1 in aprotic solvent, and 1:4 in protic solvent like water.
Horseradish peroxidase(HRP) in organic solvent can be reactivated by evaporation. In order to measure the evaporation effect, the enzyme solutions were obtained by evaporation and dilution of organic solvent, respectively. Although two situations were thermodynamically identical, the activity from evaporation was higher than that from dilution. From the UV absorbance and the fluorescence intensity mesurements, it can be explained that reactivation of enzyme activity might be caused by reversible folding, and the enzyme obtained by evaporation was more refolded than that obtained by dilution.
Proceedings of the Membrane Society of Korea Conference
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1996.10a
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pp.75-76
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1996
다공성 고분자 분리막을 제조하는 방법으로 기존의 용매교환법을 대신하여 내용매성, 내약품성 및 내열성이 매우 뛰어난 고분자를 소재로하여 다공성 고분자막을 만드는 열유도 상분리법(Thermally Induced Phase Separation, TIPS)이 개발되었다. TIPS공정에서는 주로 고분자/희석제 system의 열역학적인 불안정성에 의하여 polymer-rich phase와 polymer-lean phase로 상이 분리되는 liquid-liquid phase separation과 결정성 고분자의 결정화에 의한 solid-liquid phase separation을 주로 상분리 mechanism으로 사용하고 있다. 따라서 위에 언급된 TIPS 이론에 근거한 melt spinning 공정에 의하여 PP 중공사막을 제조하였는데 wet spinning 공정에 의한 용매 교환법에 비해 비교적 공정이 단순하고 다공도를 조건하기가 용이하며 구조 및 성능면에서도 높은 재현성을 가지고 있다. 또한 우수한 소재임에도 불구하고 절절한 용매의 부재로 용매교환법에서 사용할 수 없었던 폴리올레핀계, 나일론계, 방향족출합계 고분자를 사용할 수 있게 되어 소재의 폭이 넓어졌다는데에 가장 큰 장점이 있다. 본 연구에서는 PP중공사막을 제조하기 위하여 먼저 용융 방사장치를 제작하였고 melt spinning 공정에 의해 막을 제조하는데 적합한 방사조건들을 확립한 후 결정된 방사조건에 의해 얻어진 PP 중공사막의 구조 및 성능에 영향을 미치는 인자들에 관하여 조사하였다.
Proceedings of the Korean Fiber Society Conference
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2002.04a
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pp.215-218
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2002
Poly(vinyl alcohol)(PVA)는 1924년 W. O. Herrmann과 W. Haehnel이 Poly(vinyl esters)를 caustic soda 용액에서 비누화하여 합성한 뒤 많은 연구 및 사용되어지고 있는 고분자이다. 환경친화적이고, 인체에 무해하여 인공관절, 콘택트 렌즈 등에 이용이 되고 있다. 특히 구조가 선형적이고 zig-zag구조를 가지기 때문에 고강도, 고탄성을 갖는 섬유의 제조가 가능한 소재이다[1]. PVA섬유의 제조는 용매를 이용한 습식방사 및 겔방사로 섬유를 제조한다. (중략)
Herein, novel porous structures were fabricated from monomer solutions of dimethylsiloxane and benzene by directional crystallization in twice. First, a honeycomb-like structure was fabricated by $1^{st}$ directional crystallization of solvent. By infiltration of the solution and subsequent $2^{nd}$ directional crystallization, novel structures of different pores in the honeycomb-like structure were fabricated. The porous materials prepared by the repeated directional crystallization have higher indentation modulus and hardness than those of the samples prepared by single directional crystallization. When a higher solution concentration was used in $2^{nd}$ directional crystallization, the maximum increase (indentation modulus: 2140% increase, indentation hardness: 2330% increase) was obtained. On the other hand, porosity and contact angle were lower in the samples from $2^{nd}$ directional crystallization than those from $1^{st}$ directional crystallization. A large decreases was observed, when a relatively high concentration was used in $2^{nd}$ directional crystallization (porosity: 21% decrease, contact angle: 36% decrease).
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[게시일 2004년 10월 1일]
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