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Samblaster 병렬화를 위한 DNA 리드 분할 방법 (DNA Reads Partitioning Method for Parallelizing Samblaster)

  • 이현병;송석일
    • 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
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    • 한국콘텐츠학회 2018년도 춘계 종합학술대회 논문집
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    • pp.15-16
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    • 2018
  • NGS 분석과정에서는 정확도를 높이기 위해서 중합 효소 연쇄반응 (PCR)을 통해 DNA 리드들을 증폭한다. PCR 증폭은 DNA 리드의 중복을 발생시키며 중복으로 인해 NGS 과정의 정확성이 저하되는 문제가 발생한다. 본 논문에서는 DNA 리드 중복을 제거하는 도구중 하나인 Samblaster 의 병렬화를 위한 DNA 리드 분할 방법을 제안한다. DNA 리드를 분할하여 Samblaster를 병렬 실행 하도록 하여 수행시간을 단축 할 수 있도록 한다.

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참게, Eriocheir sinensis 유생의 중금속과 살충제의 잔유량과 급성독성

  • 이복규;김홍권
    • 한국어업기술학회:학술대회논문집
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    • 한국어업기술학회 2001년도 춘계 수산관련학회 공동학술대회발표요지집
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    • pp.463-464
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    • 2001
  • 산업사회의 발달에 따른 중금속 오염은 지역적으로 자연환경 중의 그 농도가 날로 증가되고 있어서 생태적으로 중요한 공해문제로 대두되고 있다. 자연환경에 방출되는 여러 가지 중금속은 직접적으로 또는 여러 가지 경로를 거치면서 생물체 내에 흡수된다. 따라서 유해 중금속들이 연안해역에 유입되면, 그 양이 미량일지라도 수서 생물에 축적되어 결국은 먹이연쇄로 이어져 다른 생물들에게 피해를 줄 수 있을 것이다. (중략)

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거머리말속 (Zostera Linne, 잘피) 식물의 중금속 함량 및 분포

  • 이상용;허승;최청일
    • 한국어업기술학회:학술대회논문집
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    • 한국어업기술학회 2001년도 춘계 수산관련학회 공동학술대회발표요지집
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    • pp.275-276
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    • 2001
  • 한반도에 자생하는 해산현화식물인 거머리말속 (Zostera, 잘피)의 거머리말 (Zostsra marina), 애기거머리말 (Z. japonica), 수거머리말(Z. caulescens)과 포기거머리말 (Z. caespitosa)들은 연안의 사질과 사니질에 생육하며 생태계에 중요한 역할을 담당한다. 이들 식물의 군집들은 조간대와 조하대에 침수 또는 노출되어 생육하면서 영양염과 중금속 순환에 중요한 역할을 수행한다. 식물체는 유기쇄설물을 먹이연쇄에 공급하는 기능을 하며, 중금속을 고등 영양단계로 수송하는 역할을 한다. (중략)

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아산만 연성저질에 서식하는 저서동물의 군집분석

  • 마채우;신현웅;오철웅;김종춘
    • 한국어업기술학회:학술대회논문집
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    • 한국어업기술학회 2001년도 춘계 수산관련학회 공동학술대회발표요지집
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    • pp.487-488
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    • 2001
  • 저서동물은 생태계 내에서 여러 가지 중요한 역할을 수행하고 있다. 저서생물은 유용저서어류나 유용 무척추동물의 먹이로서 매우 중요한 부분을 차지하고 있다. (Dean, 1973: McIntyre, 1978; McIntyre and Eleftherion,1968) 따라서 저서동물은 먹이생물로서 저서어류의 성장효율과 생산에 큰 영향을 미치는 요인이 될 수가 있다(Mills,1975). 또한 저서동물은 부식질 먹이 연쇄를 통하여 퇴적물내의 영양염을 변화 시킬 뿐만 아니라 최적물 내에서 수괴로의 영양염 재순환의 중요한 매개자 역할을 한다. (중략)

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열처리 조건에 따른 Pentacene 성장과 화학반응에 대한 연구

  • ;손재구;권학용;김홍배
    • 한국반도체및디스플레이장비학회:학술대회논문집
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    • 한국반도체및디스플레이장비학회 2005년도 추계 학술대회
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    • pp.63-67
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    • 2005
  • Pentacene channel OTFT(organic thin film transistor)을 SiOC 절연박막 위에서 film by thermal evaporation 방법을 이용하여 성장시켰다. CVD 방법으로 증착시킨 SiOC 절연막은 조성비에 따라 특성이 달라지므로 절연막 위에서의 펜타센의 화학적 반응을 조사하기 위해서 inorganic-type인 $O_2/(BTMSM\;+\;O_2)$ = 0.5의 비율을 갖는 SiOC 박막을 사용하였다. 팬타센 분자의 말단에서 SiOC 표면에서 Diels-Alder 반응에 의한 이중결합이 깨어지면서 안정된 성장을 하지만 온도가 높아감에 따라 표면에서의 $SN_2$(bimolecular nucleophilic substitution) 반응과 연쇄적인 화학반응에 의해 팬타센의 성장을 방해하는 것으로 나타났다.

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미국의 소프트웨어 공급망 보안 정책 동향: SBOM 사례를 중심으로

  • 최윤성
    • 정보보호학회지
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    • 제32권5호
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    • pp.7-14
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    • 2022
  • 2021년에 발생한 일련의 소프트웨어 공급망 공격으로 미국 연방 정부의 사이버보안 개선 정책이 가속됐다. 이중 소프트웨어 구성 정보를 유통하는 SBOM 정책은 SW 구성요소의 투명성을 강화하여, 이를 활용하는 공급자와 수요자의 보안 인식 개선에도 도움을 줄 것이 기대된다. 다만 SBOM으로 공급망 보안 위협을 완화하려면 해결해야 할 기술적 이슈가 있고, SBOM 수집자를 위한 구체적인 가이드도 마련되지 않아 제도 정착에는 시간이 걸린다. SW 공급망 문제는 SW 개발 관행에 대한 지속적인 개선이 요구되며, 글로벌 연쇄 위험으로 결코 혼자서는 해결할 수 없다. 따라서 우리는 실태조사, 실증사업 등을 시작으로 현실에 맞는 정책을 먼저 적용하고, 제도적 조화를 위한 국제협력에도 힘써야 한다.

韓國의 人口問題와 그 分析에 관한 硏究: 마아코프連鎖 人口移動模型에 의한 韓國都市人口流出入 分析 및 豫測

  • 구자흥
    • Journal of the Korean Statistical Society
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    • 제1권1호
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    • pp.38-64
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    • 1973
  • 본논문은 한국 주요도시의 인구 유출입현상을 통계적으로 구명하고 구명된 결과를 기초로 하여 앞으로의 인구를 예측하는 데에 목적이 있다. 이를 위하여서 간단한 마아코프 연쇄를 이용한 인구이동모형을 선정하고 센서스 자료를 적용하였다. 인구의 예측에는 흔희 단순 L-곡선(simple logistic curve)을 사용하는 것이 일반적인 방법이나 도시인구의 유출입과 같은 사회적 인구증가율을 내포하고 있는 경우에는 적당한 방법이라고 할 수 없겠다. 본논문은 5개의 장과 부록으로 구성되어 있으며 2장에서는 모형과 기초자료의 분석이 있고 3장에서는 모형의 적용, 4장에서는 도시 인구흡인력 등에 관련된 제반 통계량을 추정하였다. 마지막 장은 결과의 평가로 삼았다.

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미국 뉴욕 Reeves만에서 쌍편모조류인 Gyrodinium aureolum의 대발생에 영향을 미친 먹이연쇄내의 상호작용 (Multitrophic Interactions as a trigger of the Gyrodinium aureolum Bloom in Reeves Bay, New York)

  • 김웅서;장만;심재형
    • 한국해양학회지
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    • 제27권4호
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    • pp.268-276
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    • 1992
  • 해파리류의 동물플랑크톤에 대한 포식 파급효과가 식물플랑크톤의 대발생에 어떠 한 영향을 미치는 가를 연구하기 위해, 해파리류, 동물플랑크톤, 식물플랑크톤으로 이 어지는 먹이연쇄내에서 의 상호작용을 미국 뉴욕주에 있는 Reeves만에서 쌍편모 조류 인 Gyrodinium aureolum의 대발생이 있었던 기간을 전후한 1989년 3월 중순에서 7월 초순사이에 조사하였다. 동물플랑크톤의 최대 개체수는 해파리류의 개체수가 감소하기 시작한 4월 중순에서 5월 초사이에 관찰되었으며, 이때 식물플랑크톤의 생물량은 낮게 나타났다. 한편 해파리류의 개체수가 다시 증가하였던 5월 중순부터 동물플랑크톤은 개체수의 감소를 보인 보면, 식물플랑크톤은 대발생을 시작하였다. 이와 같은 결과는 2차 소비자인 해파리류의 포식이 1차 소비자인 돈물플랑크톤의 식물플랑크톤에 미치는 섭식압력의 감소 효과에서 비롯된 것으로 나타났다. 한편, 탄소동위원소를 사용하여 측정한 동물플랑크톤의 섭식률은 대발생 전후에 비해 대발생 중에 현저하게 낮아, 동 물플랑크톤들이 대발생을 일으킨 G. aureolum을 먹이로서 선호하지 않는 것으로 밝혀 졌다.

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HF 화학 레이저에 대한 Model Simulation과 그 작동 특성의 수치분석 (Model Simulation of a HF Chemical Laser and Numerical Analyses of It's Behaviors)

  • 김양미;김웅;조웅인
    • 대한화학회지
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    • 제33권2호
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    • pp.168-176
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    • 1989
  • 화학 레이저 모델의 이론적 연구를 화학 반응속도론, gain 과정과 유도 방출과정을 고려하여 수행하였다. 우선 F+$H_2$비 연쇄반응 HF 화학 레이저를 진동준위가 v = 3 까지 pumping되는 것으로 생각하고 관련된 rate equation을 풀어서 출력을 산출하였다. 여기서 조화진동자를 가정한 계산과 비조화성 보정을 해준 계산결과의 비교로부터 그 차이가 거의 없음을 확인하였다. 또한 여러가지 온도와 초기농도를 택하여 산출되는 laser 축력의 변화를 검토하였다. 그리고 $H_2$+$F_2$ 연쇄반응 HF 화학 레이저에 관한 비교적 단순한 model simulation을 수행하였다. 이 계산 결과는 이미 보고된 상당히 복잡한 계산결과와 비교하여 만족할 정도이었다.

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Sequence Alignment 기법을 활용한 화물 통행의 Trip Chain 분석 (An Analysis of Trip Chain of Freight Travel using Sequence Alignment Methods)

  • 조창현
    • 한국경제지리학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.540-552
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    • 2011
  • 화물차량의 통행패턴은 여객통행에 비해 연구 성과의 누적이 상대적으로 적은 분야이다. 그럼에도 불구하고 도시 내 통행에서 화물차가 차지하는 중요성에 대한 인식이 증가하고 있으며, 자가용 화물 차주들의 능동적 사업 비율이 증가하고 있어 이 분야에 대한 더 많은 연구의 필요성이 대두된다. 본 연구는, 여객통행에서의 활동기반 수요추정 이론의 발달에 부합하는 화물통행에서의 의사결정 원리에 대한 연구의 기초로서, 화물차량 통행실태 조사의 자료를 분석하여 화물차량 톤급별 평균 통행 특성, 운행효율성, 도착지-도착지유형-적재품목 통행연쇄의 특성을 확인하였다. 분석 결과 이들 화물차량 통행 특성들은 톤급별로 분명한 차이가 있음을 확인하였으며, 그 자체 화물차의 톤급별 특징을 잘 보여주었다. 연구 결과는 화물차량 통행 관련 교통정책 수단 개발에 긍정적 기여를 할 수 있을 것으로 기대된다.

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