한국콘텐츠학회:학술대회논문집 (Proceedings of the Korea Contents Association Conference)

한국콘텐츠학회 (The Korea Contents Association)
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Samblaster 병렬화를 위한 DNA 리드 분할 방법

DNA Reads Partitioning Method for Parallelizing Samblaster

  • 발행 : 2018.05.11
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초록

NGS 분석과정에서는 정확도를 높이기 위해서 중합 효소 연쇄반응 (PCR)을 통해 DNA 리드들을 증폭한다. PCR 증폭은 DNA 리드의 중복을 발생시키며 중복으로 인해 NGS 과정의 정확성이 저하되는 문제가 발생한다. 본 논문에서는 DNA 리드 중복을 제거하는 도구중 하나인 Samblaster 의 병렬화를 위한 DNA 리드 분할 방법을 제안한다. DNA 리드를 분할하여 Samblaster를 병렬 실행 하도록 하여 수행시간을 단축 할 수 있도록 한다.

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