Peptide identification in tandem mass spectrometry is usually done by searching the spectra against target databases consisting of reference protein sequences. To control false discovery rates for high-confidence peptide identification, spectra are also searched against decoy databases constructed by permuting reference protein sequences. In this case, a peptide of the same sequence could be included in both the target and the decoy databases or multiple entries of a same peptide could exist in the decoy database. These phenomena make the protein identification problem complicated. Thus, it is important to minimize the number of such redundant peptides for accurate protein identification. In this regard, we examined two popular methods for decoy database generation: 'pseudo-shuffling' and 'pseudo-reversing'. We experimented with target databases of varying sizes and investigated the effect of the maximum number of missed cleavage sites allowed in a peptide (MC), which is one of the parameters for target and decoy database generation. In our experiments, the level of redundancy in decoy databases was proportional to the target database size and the value of MC, due to the increase in the number of short peptides (7 to 10 AA). Moreover, 'pseudo-reversing' always generated decoy databases with lower levels of redundancy compared to 'pseudo-shuffling'.
This paper presents an optimum mixture design method for proportioning a concrete. In the proposed method, the search space is constrained as the domain defined by the minimal convex region of a database, instead of the available range of each component and the ratio composed of several components. The model for defining the search space which is expressed by the effective region is proposed. The effective region model evaluates whether a mix-proportion is effective on processing for optimization, yielding highly reliable results. Three concepts are adopted to realize the proposed methodology: A genetic algorithm for the optimization; an artificial neural network for predicting material properties; and a convex hull for evaluating the effective region. And then, it was applied to an optimization problem wherein the minimum cost should be obtained under a given strength requirement. Experimental test results show that the mix-proportion obtained from the proposed methodology using convex hulls is found to be more accurate and feasible than that obtained from a general optimum technique that does not consider this aspect.
In load and resistance factor design (LRFD) method, resistance factors are typically calibrated using resistance bias factors obtained from either only the data within ${\pm}2{\sigma}$ or the data except the tail values of an assumed probability distribution to increase the reliability of the database. However, the data selection approach has a shortcoming that any low-quality data inadvertently included in the database may not be removed. In this study, a data quality evaluation method, developed based on the quality of static load test results, the engineering characteristics of in-situ soil, and the dimension of aggregate piers, is proposed for use in constructing database. For the evaluation of the method, a total 65 static load test results collected from various literatures, including static load test reports, were analyzed. Depending on the quality of the database, the comparison between bias factors, coefficients of variation, and resistance factors showed that uncertainty in estimating bias factors can be reduced by using the proposed data quality evaluation method when constructing database.
One of the mechanical system engineer's tasks of satellite design and development is to make the control plan, keep track and estimate the characteristics of system mass properties. As the design phases are going on, mass properties related activities also transit as like a data collection, system mass property estimation and measurement. Fidelity of mass properties database should be confirmed through measurement test. In this paper the control plan and estimation of system mass properties are explained by the actual data and experience of the development of satellite and the fidelity of mass properties database was confirmed through measurement test.
인터넷시대 가상 공간에서는 새로운 흐름들이 속속 등장하고 있다. 그 중에서 대표적인 것은 아마도 인터넷을 통한 상거래일 것이다. 이러한 사이버 상거래에 있어서 가장 중요한 것은 지불수단 즉 과금방식이다. 사이버 상거래가 완벽하게 정착되려면 공급자와 수요자간에 있어서 신뢰성의 중요성은 말할 나위가 없다. 공급자는 공급하는 제품의 품질과 고객이 정보보호를 수요자는 그러한 신뢰의 바탕위에서 사이버 거래를 발전시킬 것이다.
이러한 거래에 있어서 등장한 것이 바로 전자결제 수단이며 다양한 형태로 발전되어가고 있다. 아직도 해결과제가 많이 남아있지만 현재 진행되고 있는 전자지불 수단의 다양한 형태를 짚어봄으로써 가능성을 열어보고자 한다.
Proceedings of the Korea Inteligent Information System Society Conference
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2007.05a
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pp.321-328
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2007
데이터마이닝은 대용량의 데이터에 숨겨진 의미있고 유용한 패턴과 상관관계를 추출하여 의사결정에 활용하는 작업이다. 그 중에서도 고객 트랜잭션의 데이터베이스에서 아이템 사이에 존재하는 연관규칙을 찾는 것은 중요한 일이 되었다. Apriori 알고리즘 이후 연관규칙을 찾기 위해 대용량 데이터베이스로부터 압축된 의미있는 정보를 저장하기 위한 데이터 구조와 알고리즘들이 제안되어 왔다. 본 논문에서는 정점으로 아이템을 표현하고, 간선으로 두 아이템집합을 표현하는 빈발 패턴 네트워크(FPN)이라 불리는 새 자료 구조를 제안한다. 빈발 패턴 네트워크에서 아이템 사이의 연관 관계를 발견하기 위해 이 구조를 어떻게 효율적으로 사용 하느냐에 초점을 두고 있다. 구조의 효율적인 사용을 위하여 한 아이템이 클러스터 내의 아이템과는 유사도가 높고, 다른 클러스터의 아이템과는 유사도가 낮도록 네트워크의 정점을 클러스터링하는 방법을 사용한다. 실험은 신뢰도, 상관관계 그리고 간선 가중치 유사도를 이용하여 네트워크에서 아이템 클러스터링의 정확도를 보여준다. 본 논문의 실험 결과를 통해 신뢰도 유사도가 네트워크의 정점을 클러스터링할 때 클러스터의 정확성에 가장 많은 영향을 미친다는 것을 알 수 있었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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