• Title/Summary/Keyword: 시간적 연관성

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Estimating Amino Acid Composition of Protein Sequences Using Position-Dependent Similarity Spectrum (위치 종속 유사도 스펙트럼을 이용한 단백질 서열의 아미노산 조성 추정)

  • Chi, Sang-Mun
    • Journal of KIISE:Software and Applications
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    • v.37 no.1
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    • pp.74-79
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    • 2010
  • The amino acid composition of a protein provides basic information for solving many problems in bioinformatics. We propose a new method that uses biologically relevant similarity between amino acids to determine the amino acid composition, where the BOLOSUM matrix is exploited to define a similarity measure between amino acids. Futhermore, to extract more information from a protein sequence than conventional methods for determining amino acid composition, we exploit the concepts of spectral analysis of signals such as radar and speech signals-the concepts of time-dependent analysis, time resolution, and frequency resolution. The proposed method was applied to predict subcellular localization of proteins, and showed significantly improved performance over previous methods for amino acid composition estimation.

Data Cache System based on the Selective Bank Algorithm for Embedded System (내장형 시스템을 위한 선택적 뱅크 알고리즘을 이용한 데이터 캐쉬 시스템)

  • Jung, Bo-Sung;Lee, Jung-Hoon
    • The KIPS Transactions:PartA
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    • v.16A no.2
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    • pp.69-78
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    • 2009
  • One of the most effective way to improve cache performance is to exploit both temporal and spatial locality given by any program executive characteristics. In this paper we present a high performance and low power cache structure with a bank selection mechanism that enhances exploitation of spatial and temporal locality. The proposed cache system consists of two parts, i.e., a main direct-mapped cache with a small block size and a fully associative buffer with a large block size as a multiple of the small block size. Especially, the main direct-mapped cache is constructed as two banks for low power consumption and stores a small block which is selected from fully associative buffer by the proposed bank selection algorithm. By using the bank selection algorithm and three state bits, We selectively extend the lifetime of those small blocks with high temporal locality by storing them in the main direct-mapped caches. This approach effectively reduces conflict misses and cache pollution at the same time. According to the simulation results, the average miss ratio, compared with the Victim and STAS caches with the same size, is improved by about 23% and 32% for Mibench applications respectively. The average memory access time is reduced by about 14% and 18% compared with the he victim and STAS caches respectively. It is also shown that energy consumption of the proposed cache is around 10% lower than other cache systems that we examine.

태양 활동과 대서양 지역에서 발생하는 equatorial plasma bubble 사이의 상호 관계

  • 이재진;민경욱
    • Bulletin of the Korean Space Science Society
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    • 2003.10a
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    • pp.31-31
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    • 2003
  • Equatorial Plasma Bubble(EPB)은 적도 지역에서 Rayleigh-Taylor Instability에 의해 발생하는 이온층 플라즈마의 불안정성 현상으로, 주변의 플라즈마 밀도에 비해 좁은 영역에서 플라즈마 밀도가 급격하게 떨어지는 현상을 말한다. 지역적으로 보면, 겨울철에는 대서양 지역에서 집중적으로 발생하고 여름철에서는 태평양 지역에서 많이 관측된다. 이러한 불안정 현상은 단파 통신 장애를 유발할 수 있기 때문에 많은 연구 대상이 되어왔지만, 아직까지 태양 활동이나 지자기 변화에 의한 상호 연관성이 규명되지 못 하고 있다. 이것은 Rayleigh-Taylor Instability를 발생시키는 여러 인자들이 매우 복잡하게 관련되어 있기 때문인데, 본 연구에서는 특정 지역에서 발생하는 EPB에 한정하여 태양 활동과의 상호 연관성에 대해 분석하고자 하였다. 또한 단순한 발생 빈도에 대한 통계적인 처리가 아닌, EPB하나 하나에 대한 특성을 분석함으로써 EPB의 발생과 관련한 보다 명확한 분석이 가능하게 되었다. 분석에 필요한 data는 KOMPSAT-1의 Langmuir Probe(LP)에 의해 2000년에서 2001년 사이에 얻은 이온층의 전자 밀도를 사용하였는데, KOMPSAT-1의 LP는 같은 기간 활동한 다른 위성에 비해 좋은 시간 분해능을 가지고 있기 때문에 EPB의 통계 처리에 적당한 것으로 생각되었다.

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Table Clustering Using Inter-schema Association (스키마간 연관성을 이용한 테이블 군집화 기법)

  • 조순이;이도헌
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2001.04b
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    • pp.85-87
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    • 2001
  • 업무 데이터 분석을 통한 종합적인 의사결정을 지원할 수 있도록 데이터웨어하우스, OLAP, 데이터마이닝을 적용하려는 기업의 요구가 많아졌다. 그래서 기초 데이터의 이해, 선별, 수집, 가공, 정제가 매우 중요한 과정이나 테이블명 및 속성명이 표준화되어있지 않고 코드나 시스템 카탈로그와 같은 기본 데이터는 부정확하고 부족하다. 본 논문에서는 거의 스키마 정보에만 의존하여 테이블의 의미적 연관성에 근거한 유사한 특성을 가진 집단끼리 분류하는 대략적인 군집분석 방법을 제안한다. 질의 수행시 사용자가 설정한 임계 거리에 ㄸ라 관련된 군집만 검색함으로써 신속한 응답시간을 보장하고, 분석시점에서 다양한 질의에 유연하게 대처할 수 있다는 장점이 있다. 또한 실제 데이터에 본 연구를 적용하여 산출한 군집결과와 사람이 매뉴얼하게 그룹핑한 군집결과와 비교한다.

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Efficient variable selection method using conditional mutual information (조건부 상호정보를 이용한 분류분석에서의 변수선택)

  • Ahn, Chi Kyung;Kim, Donguk
    • Journal of the Korean Data and Information Science Society
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    • v.25 no.5
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    • pp.1079-1094
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    • 2014
  • In this paper, we study efficient gene selection methods by using conditional mutual information. We suggest gene selection methods using conditional mutual information based on semiparametric methods utilizing multivariate normal distribution and Edgeworth approximation. We compare our suggested methods with other methods such as mutual information filter, SVM-RFE, Cai et al. (2009)'s gene selection (MIGS-original) in SVM classification. By these experiments, we show that gene selection methods using conditional mutual information based on semiparametric methods have better performance than mutual information filter. Furthermore, we show that they take far less computing time than Cai et al. (2009)'s gene selection but have similar performance.

A Study on the Relationship between Sleep Duration and Suicidal Idea in an Urban Area of South Korea (일 도시지역 주민들의 수면시간과 자살사고의 연관성에 관한 연구)

  • Lee, Yu-Jin;Kim, Seog-Ju;Cho, In-Hee;Kim, Jong-Hoon;Bae, Seung-Min;Koh, Seung-Hee;Cho, Seong-Jin
    • Sleep Medicine and Psychophysiology
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    • v.16 no.2
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    • pp.85-90
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    • 2009
  • Introduction: There has been an increasing interest in the relationship between sleep and suicidality. In addition, suicidal patients habitually report their sleep problems. Although sleep-related complaints and electroencephalographic changes are generally encountered in psychiatric disorders, sleep complaints such as insomnia, hypersomnia and nightmares are more common in suicidal patients. In current study, we aimed at investigating the relationship between self-reported sleep duration and suicidality in general population. Methods: One thousand general population (male:female=500:500, mean age=$39.6{\pm}11.6$ years, ranged age=20-77 years) completed Center for Epidemiologic Study-Depression (CES-D), Beck Suicide Intent scale (BSI), Spielberger State-Trait Anger Expression Inventory (STAXI), Barratt Impulsiveness Scale (BIS), Morningness-Eveningness Scale (MES) and brief questionnaire of sleep habits. Results: After controlling for age and sex, score of BSI was correlated positively with the score of CES-D, STAXI and BIS on partial correlation analysis ($r_p$=0.251; p<0.001, $r_p$=0.352; p<0.001, and $r_p$=0.175; p<0.001, respectively). In addition, score of BSI was inversely correlated with the score of MES (rp=-0.066; p=0.037). However, score of BSI showed no significant correlation with sleep duration. However, regression analysis revealed that short (<6 hrs) or long (>10 hrs) sleep duration, the family history of psychiatric illness, the score of CES-D, and the score of STAXI predicted higher score of BSI significantly in total subjects (F=17.837, adjusted $R^2$=0.166; p=0.003, p=0.003, p<0.001, and p=0.003, respectively). This model was explained better in depressed subjects with 16 or higher score of CES-D (F=9.920, adjusted $R^2$=0.298). Conclusion: Current result suggested that not only short sleep duration (<6 hrs) but also long sleep duration (>10 hrs) might be related to suicidality.

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Spatio-Temporal Variability Analysis of Precipitation Data Through Circular Statistics (순환통계에 의한 강수량의 시공간적 변동성 분석)

  • Lee, Jeong-Ju;Kwon, Hyun-Han;Hwang, Kyu-Nam
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2010.05a
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    • pp.1420-1424
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    • 2010
  • 강수량의 계절성은 수자원관리에 있어 매우 중요한 수문요소로서 계절성의 변동을 정량적으로 평가하는 것은 미래 수자원관리 및 정책 수립에 필수적이다. 이러한 점에서 본 연구의 목적은 강수량의 계절성을 평가하는데 유리한 방법론을 제시하고, 이를 통한 계절 변동성의 정량적인 해석을 목적으로 한다. 본 연구에서 적용한 순환통계치 분석은 시간을 각도로 변환하여 이용함으로써 미세한 시간적인 변화양상의 정량적인 해석이 가능한 방법이다. 강수량의 주기특성과 과거로부터 현재까지의 변화 양상을 평가하기 위해서, 우선 전국의 58개 강우관측소를 선별하고 각 관측소의 일강우자료를 이용하여 관측소별 연최대치계열(Annual maxima series)과 발생일자, 월최대강수계열(Monthly maxima series)과 발생일자를 추출하였다. 각 자료의 발생일자는 순환통계분석을 위해 해당 time scale을 한 주기로 하는 방향각 데이터로 변환하였으며, 변환된 시간속성 데이터의 통계특성치를 산정하여 발생시기에 대한 경향성을 분석하였다. 월최대강수량의 발생 시기는 자료 계열 연주기의 변동성을 평가하기 위해 사용되었고, 분석결과 남해안지역이 6월말에서 7월초이고, 북쪽으로 올라감에 따라 조금씩 발생시기가 늦어지는 것으로 분석되었다. 극치강수량의 발생 경향을 평가하기 위해 사용된 일최대강수량의 시공간적 변동성은 월최대강수량보다 크게 분석되었으며, 이는 일최대강수량의 경우 지형학적인 영향에 크게 좌우되며, 우리나라의 여름철 극치강수량이 태풍 발생빈도 및 경로와 연관성을 갖는다는 일반적인 사실을 반영한 결과라고 판단된다. 월최대강수량 및 일최대강수량 발생시기의 이동평균을 통해 발생시기의 변동을 분석한 결과, 서울과 강릉지방은 최대강수량의 발생시점이 늦어지고 있으며 반대로 목포와 부산지방은 최대강수량의 발생시점이 앞당겨지고 있었다. 이는 몬순시스템의 거동에 영향을 받는 것으로 사료된다.

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Adaptive ROI Separation Method for Effective FRUC Techniques (효과적인 프레임율 증가기법을 위한 적응적인 관심영역 분리 방법)

  • Lee, Beom-Yong;Kim, Jin-soo
    • Proceedings of the Korean Society of Broadcast Engineers Conference
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    • 2015.07a
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    • pp.522-523
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    • 2015
  • 본 논문에서는 FRUC(Frame Rate Up-Conversion)을 위한 효과적인 관심영역 분리 방법을 제안한다. 기존의 알고리듬은 움직임 벡터를 이용하여 관심영역을 지정하고 이를 기반으로 추가적인 재탐색이 요구되며 경우에 따라 잘못 예측된 움직임 벡터가 사용됨으로 인해 관심영역에 대한 신뢰성이 낮다. 본 논문에서는 이전과 다음 영상과의 시간적 연관성을 이용하여 이 두 영상간의 상관관계에 따라 효과적으로 신뢰영역 및 관심영역을 분리한다. 본 논문에서는 기존에 제안되었던 알고리듬으로 생성된 보조 영상과 원본 영상과의 차이에 대해 제안한 관심영역 분리 방법을 적용하여 그 결과를 비교하고, 성능 척도로서 객관적 화질을 비교한다. 실험 결과를 통해 기존에 제시된 다수의 알고리듬 보다 비교적 간단한 방법을 통해 효과적으로 관심 영역을 분리하고 또한, 성능이 크게 향상될 수 있음을 보인다.

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Manage the Software Defects using Opportunity Tree Framework (Opportunity Tree 프레임워크를 이용한 소프트웨어 결함관리)

  • Lim keun
    • Journal of the Korea Society of Computer and Information
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    • v.9 no.4 s.32
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    • pp.1-4
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    • 2004
  • This paper identifies defects to produce a reliable software and analyzes the relationship between defects. Also, this paper is intended to develop the relationship between defects and their causes to introduce. For the doing, first, to meet to customer satisfaction and make flexibility and productivity and second. to maximize market extension and financial outcome by controlling of quality and delivery.

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Workload-Driven Adaptive Log Block Allocation for Efficient Flash Memory Management (효율적 플래시 메모리 관리를 위한 워크로드 기반의 적응적 로그 블록 할당 기법)

  • Koo, Duck-Hoi;Shin, Dong-Kun
    • Journal of KIISE:Computer Systems and Theory
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    • v.37 no.2
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    • pp.90-102
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    • 2010
  • Flash memory has been widely used as an important storage device for consumer electronics. For the flash memory-based storage systems, FTL (Flash Translation Layer) is used to handle the mapping between a logical page address and a physical page address. Especially, log buffer-based FTLs provide a good performance with small-sized mapping information. In designing the log buffer-based FTL, one important factor is to determine the mapping structure between data blocks and log blocks, called associativity. While previous works use static associativity fixed at the design time, we propose a new log block mapping scheme which adjusts associativity based on the run-time workload. Our proposed scheme improves the I/O performance about 5~16% compared to the static scheme by adjusting the associativity to provide the best performance.