• 제목/요약/키워드: 세포 수

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겹친 세포 분리를 위한 타원 근사 기반 알고리즘 (An Ellipse Fitting based Algorithm for Separating Overlapping Cells)

  • 조미경;심재술
    • 한국정보통신학회:학술대회논문집
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    • 한국정보통신학회 2012년도 춘계학술대회
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    • pp.909-912
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    • 2012
  • 광학 현미경을 통해 일정한 시간 간격으로 얻은 세포 이미지들로부터 세포의 변화 과정을 관찰하여 어떻게 변화되어 가는지 자동적으로 추적하고 분석하는 것을 자동화된 세포 트래킹이라고 한다. 본 연구에서는 수 천 개 혹은 수 만개의 세포를 하나의 이미지에 포함함으로 크기가 매우 작아진 세포 클러스터를 분리하기 위한 타원 근사 기반의 알고리즘을 제안하고 개발하였다. 제안된 방법은 클러스터의 경계선을 추출하여 라인 세그먼트들로 분리한 다음 휴리스틱을 이용하여 라인 세그먼트들을 결합해 가며 근사 타원을 생성한다. 실험 결과 제안된 알고리즘은 두 개의 세포가 겹쳐진 클러스터의 경우 평균적으로 91%의 정확도로, 세개의 세포가 겹쳐진 클러스터의 경우 평균적으로 84%의 정확도를 가지도 클러스터를 분리해 주었다.

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돼지 태아섬유아세포 Clonal Lines의 배양에 관한 연구

  • 권대진;박춘근;양부근;김정익;정희태
    • 한국동물번식학회:학술대회논문집
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    • 한국동물번식학회 2003년도 학술발표대회 발표논문초록집
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    • pp.73-73
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    • 2003
  • 본 연구는 돼지 체세포의 clonal cell lines을 효율적으로 확립할 수 있는 배양방법을 제시하기 위하여 실시하였다. 50일령의 돼지태아로부터 섬유아세포를 회수하여 2회 계대배양 후 단일 세포를 96-well plate와 4-well dish에서 배양하여 배양액내의 FBS농도(10, 30, 50%), 첨가제(catalase, $\beta$-mercaptoethanol; BME), 세포의 크기(<16, 16~20, 20<) 및 형태(smooth, rough)에 따른 cell line 확립 효율을 검토하였다. FBS 농도에 따른 clonal line 확립 효율과 PD를 검토한 결과, 효율에 있어서 30% FBS 처리구(5.1%)가 10%(0.3%) 및 50%처리구(2.1%)보다 비교적 높게 나타났으나 유의적 차이는 없었으며, PD의 경우는 10, 30, 50%처리구에서 각각 36.7, 29.4, 26.3 시간으로 FBS 농도가 증가할수록 PD 시간이 유의적으로 짧아졌다(p<0.05). 배양액 첨가제에 있어서 BME 가시 무처리구나 catalase 첨가시보다 유의적으로 높은 효율을 보였으며(11.4%, 3.2%, 3.2%; p<0.05), PD 시간은 짧게 나타났다(23.6, 25.5, 28.1; p<0.05). 그러나 catalase는 cell line 확립 효율에 영향을 미치지 않는 것으로 나타났다. 세포의 크기에 따른 cell line 확립효율은 5.2~8.2%로 크기에 따른 차이는 보이지 않았으며, PD 또한 23.7~27.9 시간으로 세포 크기에 따른 차이는 없었다. 세포의 형태에 따른 세포의 부착율은 smooth(55.8%)구가 rough(73.0%)구보다 유의적으로 낮게 나타났으나(p<0.05), clonal line 확립 효율(7.7%n vs. 6.6%) 및 PD(23.5h vs. 24.0h)에서는 차이가 없었다. 본 연구의 결과, 세포의 형태에 따른 cell line 확립 효율은 큰 차이가 없었으나, 세포 배양액내에 30% FBS와 BME의 첨가로 clonal cell line 확립 효율을 향상시킬 수 있음을 확인할 수 있었다. 또한 cell line 확립 효율이 높아질수록 PD 시간이 짧아지는 경향을 볼 수 있었다.

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Retrovirus Vector를 이용한 동물 수정란에의 유전자 전이 (Retrovirus Vector-mediated Gene Transfer into the Fertilized Embryos of the Farm Animals)

  • 김태완
    • 한국가축번식학회지
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    • 제19권4호
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    • pp.293-305
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    • 1996
  • Retrovirus는 DNA가 아닌 RNA를 유전 물질로 갖고 있는 동물 virus인데 각 virus는 RNA와 함께 크게 gag, pol. 그리고 env 등의 3가지 단백질로 구성되어 있다. gag 단백질은 virus의 내부구조를 형성하는 단백질이고, pol단백질은 감염을 통해 표적 세포에 도입된 retrovirus의 RNA를 DNA로 역전사시키는 reverse transcriptase의 역할을 하며, env단백질은 virusdml 외부를 구성하는 단백질로써 이 단백질에 의해 각 retrovirus의 종류에 따른 감염이 가능한 표적세포의 종류가 결정된다(host cell specificity). 따라서 어떤 retrovirus의 envelope단백질과 표식세포에 있는 retrovirus의 envelope 단백질에 대한 특정 receptor와의 상호 작용에 의해 세포속으로 도입된 virus의 RNA는 reverse transcriptase에 의해 DNA로 역전사된 후 표적세포의 genomic DNA에 삽입되는 특징을 가진다. 이러한 특징을 가진 retrovirus vector system은 형질 전환 동물의 생산에 있어서 현재까지의 주된 방법인 수정란의 pronucleus에의 DNA microinjection방법 보다 여러 가지 면에서 우수함에도 불구하고 쥐 이외의 다른 동물에서는 거의 이용되고 있지 않는 실정이다. 주된 원인으로는 현재 사용되고 있는 대부분의 retrovirus vector system이 쥐의 백혈병 virus를 근간으로 하기 때문에 이 system에서 생산된 virus는 쥐 이외의 다른 동물, 특히 유제류의 세포에는감염성이 아주 약하기 때문이다. 이러한 결점을 해결하기 위하여 최근에 기존의 쥐 백혈병 virus의 envelope protein을 vesicular stomatitis virus의 G protein으로 대체한 hybrid retrovirus vector system이 개발되었다. 이러한 system에서 생산되는 virus는 조류를 포함한 거의 모든 종류의 동물세포를 감염시킬 수 있으며 몇몇 특정세포에 대해서는 기존의 retrovirus vector system에 비해 1,000배 이상의 높은 감염도를 나타내는데 그 특징이 있다. 따라서 이러한 새로운 virus vector system을 이용할 경우, 보다 다양한 종에 있어서 형질전환 동물을 효율적으로 생산할 수 있을 뿐만 아니라 형질전환 동물의 생산 방법 자체를 다양화 시킬 수 있다고 본다.

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암미세환경에서 종양관련대식세포의 역할 (Role of Tumor-associated Macrophage in Tumor Microenvironment)

  • 민도식
    • 생명과학회지
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    • 제28권8호
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    • pp.992-998
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    • 2018
  • 암세포는 종양의 성장을 지지하는 다양한 성분으로 구성되어 있는 환경에서 자란다. 암미세환경에 존재하는 주요 세포등은 섬유아세포, 내피세포, 면역세포들이며 이들세포들은 암세포들과 서로 소통을 하고 있다 종양조직에 유입된 면역세포중에서 대식세포가 종양미세환경의 주요성분으로서 다양한 면역현상들을 조절한다. 면역세포유입에 의한 암촉진과 항암효과 간의 복잡한 균형은 종양의 성장과 진행에 필요한 만성염증 환경을 생성시킬 수 있다. 대식세포는 M1과 M2 극성화로 규정된 미세환경 신호에 반응하여 기능적으로 다른 프로그램을 작동시킬 수 있다. 종양관련대식세포는 다양한 사이토카인, 케모카인, 단백질분해효소들을 분비함으로써 암 신생혈관형성, 증식, 전이 및 면역억제를 촉진시킨다. 최근에, 종양관련대식세포는 암줄기세포와 상호작용하여 종양의 진행, 전이 및 항암제 내성을 유도하는 것으로 알려져 있다. 종양관련대식세포는 암미세환경을 유지하기위해 면역억제 기능을 획득하며, 종양의 이질성과 가소성의 특성을 갖고 있어 암관련인자 및 감염등의 노출에 의해 서로 다른 극성형질로 리프로그래밍된다. 종양관련대식세포는 기질인자의 자극에 의해 암특이적인 케모카인들을 생성하기 때문에 케모카인은 질병의 활성을 반영하는 바이오마커로 작용할 수 있다. 종양조직에 종양관련대식세포가 많이 유입될수록 환자의 예후가 좋지 않으며 항암치료에 대한 저항성이 생긴다. 따라서 종양에서 대식세포를 표적화하는 항암치료는 유망한 치료전략이 될 수 있다.

AFM을 이용한 얼굴과 하박내측 각질세포 표면 특성 비교연구 (Study on the Surface Properties of Corneocyte between Face and Forearm Using Atomic Force microscopy (AFM))

  • 장민열
    • 대한화장품학회지
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    • 제45권4호
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    • pp.373-380
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    • 2019
  • 얼굴과 하박내측의 피부는 경피수분손실량(TEWL), 피부 수분량, 탄력 등에서 많은 차이를 보이고 있다. 특히, 이전 연구 결과에서 얼굴피부와 하박내측 피부는 수화(hydrating) 과정에 따른 탄력특성의 차이를 보여 주었다. 이에 본 연구에서는 신체부위에 따른 피부특성 차이는 각 신체부위를 구성하고 있는 각질세포 특성과 연관성이 있을 것이라는 가정하에 atomic force microscopy (AFM)을 이용하여 각질세포 표면 특성을 비교 연구하였다. 각질세포 표면의 거칠기(roughness)와 villus-like projections (VPs)을 이용하여 비교 평가 하였다. 더 나아가 얼굴피부, 하박내측, 입술 피부의 각질세포 표면을 정성적으로 비교해 보았다. 각질세포는 8명의 피험자의 얼굴과 하박내측 피부에서 tape-stripping을 이용하여 채취하여, AFM을 이용하여 40 ㎛ × 40 ㎛ 크기로 각질세포의 아랫면 표면 특성(bottom surface of corneocyte)을 측정하였다. 그 결과, 얼굴 각질세포 아랫면 표면 거칠기는 388.34 ± 86.189 nm이었고, 하박내측 각질세포 아랫면 표면 거칠기는 662.27 ± 224.257 nm로 하박내측 각질세포가 얼굴 각질세포보다 더 거친 표면 특성임을 확인하였다(p < 0.001). 관찰된 VPs의 양을 비교해보면, 입술 각질세포가 가장 많았고, 그 다음이 얼굴 각질세포이며, 하박내측 각질세포는 낮은 수준이었다. 이러한 결과를 통해 볼때, 각질세포 표면 특성이 얼굴과 하박내측 피부 사이에 보이는 특성 차이에 어느 정도 관여하고 있음을 확인할 수 있었으며, VPs는 부위별 피부 특성 연구에 유용한 parameter가 될 수 있는 가능성도 확인할 수 있었다. 그리고, AFM은 각질세포 표면의 미세한 구조적 차이를 비교 연구하는데 매우 유용한 기기임을 알 수 있었다. 향후 조금 더 많은 연구가 진행된다면 각질세포에 대한 새로운 화장품 효능 평가법이 개발될 것으로 사료된다.

다양한 기판 위에서 고분자 전해질 다층 막과 폴리에틸렌글리콜 미세 구조물을 이용한 세포 패터닝 방법 (Cell Patterning on Various Substrates Using Polyelectrolyte Multilayer and Microstructure of Poly(Ethylene Glycol))

  • 심현우;이지혜;최호석;이창수
    • Korean Chemical Engineering Research
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    • 제46권6호
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    • pp.1100-1106
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    • 2008
  • 본 연구는 표면에 세포를 부착하는데 있어서, 다양한 기판 표면에 보편적인 플랫폼으로써 적용될 수 있는 세포 부착을 위한 기능성 표면의 제작 기술 및 이를 이용한 세포의 선택적인 고정과 편리한 세포 패터닝의 방법을 보여주었다. 세포 부착에 적합한 기능성 표면의 제작은 산소 플라즈마 처리를 이용한 다양한 기판의(유리, PMMA, PS, PDMS) 표면 활성화 및 상반되는 고분자 전해질의(PAH, PDAC, PSS, PAA) 정전기적 인력을 통한 증착으로 이루어진 다층의 고분자 전해질 층을 통해 제작될 수 있었다. 또한, 고분자 전해질로 증착된 표면 위로 마이크로 몰딩 인 케필러리 방법을 사용하여 PEG 마이크로 구조물을 제작함으로써 세포의 선택적인 고정이 이루어질 수 있었다. 다층의 고분자 전해질로 증착된 표면은 세포와의 강한 정전기적 인력으로 세포 부착에 유리한 표면을 제공하였다. 반면에, 제작된 PEG 마이크로 구조물은 물리적, 생물학적인 장애물의 역할로써 세포의 비 특이적인 흡착을 방지하였다. 세포 부착을 위한 기능성 표면을 제작하는 동안 표면의 특성은 접촉각 측정을 통해 이루어 졌다. 다양한 기판 상에서 개질된 표면은 세포 부착을 위한 적합한 환경의 제공과 함께 세포의 마이크로 패터닝 기술에서 높은 수율의 세포 패터닝을 제공한다. 상기의 제안된 세포 부착을 위한 기능성 표면 제작 기술 방법은 제작 과정이 매우 간단하고, 편리하여 손쉽게 구현이 가능하며, 제작 공정에서 어떠한 해로운 용매도 사용하지 않기 때문에 친환경적이다. 또한, 이를 이용하여 세포를 이용하는 바이오 칩 및 바이오 센서, 세포를 기반으로 하는 시스템 등에서 기본이 되는 기술로 사용될 수 있는 넓은 응용 범위를 갖는다.

지르코니아/알루미나 복합 세라믹의 시험관내 생체적합성에 관한 연구 (In vitro biocompatibility study of zirconia/alumina composites)

  • 김규진;김현만;고재승;김대준;한중석
    • 구강회복응용과학지
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    • 제18권2호
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    • pp.73-80
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    • 2002
  • 치과용 임플란트의 세라믹 지대주를 위해 개발된 지르코니아 함유 세라믹 시편의 생체 적합성을 평가하기 위하여 시험관내 세포 독성을 검사를 시행하였다. L929 섬유모세포를 $37^{\circ}C$, 90% 습도, 5% CO2 및 95% 공기의 조건을 유지하는 세포 배양기에서 배양하여 실험에 사용하였다. 배양 2일, 4일, 6일 마다 시편을 넣은 배양 접시 내의 전체 세포 수와 생존 세포 수를 세어 세포 증식과 세포 생존율 검사를 시행하였다. millipore filter test를 이용하여 succinate dehydrogenase 효소 활성을 검사하였으며, 세포막 투과성의 변화를 관찰하기 위해 agar overlay test를 시행하였다. 음성 대조군은 시편을 사용하지 않았으며, 양성 대조군은 시편과 같은 크기의 구리를 사용하여, 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 세포 증식과 세포 생존율 검사에서는 지르코니아 함유 세라믹을 넣은 실험군과 음성 대조군 모두에서 시간이 경과함에 따라 세포가 증식하는 양상을 보였다. 세포 생존율 검사에서도 실험군과 음성 대조군이 유사한 결과를 나타내었다. 2. millipore filter test에서는 실험 시편 모두에서 염색 정도의 변화가 없이 음성 대조군과 동일한 결과를 나타냈다. 반면에 구리 시편을 넣은 양성 대조군에서는 중등도의 세포 독성을 나타냈다. 3. agar overlay test에서도 시편을 넣지 않은 음성 대조군에서는 세포 성장에 변화가 나타나지 않았으며, 실험군에서도 시편 주위로 탈색이 관찰되지 않아서 음성대조군과 같은 결과를 나타냈다. 양성 대조군에서는 심한 세포 독성을 나타내었다. 4. 실험결과, 치과용 임플란트의 세라믹 지대주를 위해 개발된 지르코니아 함유 세라믹 시편은 시험관내 세포 독성을 나타내지 않았다.

체외 생산된 소 수정란의 발달에 있어서 EGF 첨가제 효과와 EGF-R 발현에 관한 연구 (Study on the Additive Effect of Epidermal Growth Factor (EGF) and Expression of EGF-Receptor (EGF-R) on IVM/IVF Bovine Embryo Development)

  • 김은영;김묘경;엄상준;윤산현;박세필;정길생;임진호
    • 한국가축번식학회지
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    • 제20권3호
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    • pp.279-288
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    • 1996
  • 본 연구는 EGF가 체외성숙과 수정에 의해 생산된 소 수정란의 발달과 inner cell mass (ICM)와 trophectoderm (TE) 세포수에 미치는 영향 및 공동배양시의 첨가효가를 조사하고 그와 더불어 간적면역 형광법을 이용하여 EGF-R 단백의 발현 유무를 조사하기 위해 실시하였다. 그 결과를 요약하면 다음과 같다. EGF 1, 10, 100 ng/ml의 농도로 처리되었던 4-세포기와 8-세포기 배는 대조군에 비하여 유의차는 인정되지 않았으나 양호한 배반포기 배 발달과 ICM과 TE 세포수 증가 양상을 나타내었다. 특히, 발달단계에 따른 EGF (10ng/ml) 효과를 조사하였던 바, 8-세포기 이후 배에서 대조군에 비하여 배반포기까지 유의한 배 발달을 유도하는 것을 확인할 수 있었지만 (p<0.05), ICM과 TE 세포수 증가에는 유의한 영향을 미치지 못하는 것을 알 수 있었다. 또한, 간접 면역 형광에 의한 EGF-R의 발현 유무를 조사한 결과, EGF-R는 4-세포기 이후에 발현되며 그 강도는 발달단계가 진행되면서 다양하게 나타난다는 것을 알 수 있었다. 한편, 수정란과 난구세포 공동배양 군은 EGF의 첨가 유무에 상관없이 대조군에 비하여 유의한 배 발달과 총세포수의 증가를 나타내며, 공동배양군에 대한 EGF 첨가는 수정란과 난구세포와의 공동배양 효과를 증진시키는 것으로 나타났다. 따라서, EGF는 착상전 소 수정란의 4-세포기 이후에 발현디는 EGF-R에 반응하여 배 발달을 유기하고, 공동배양시의 배 발달에 유용한 물질형성을 촉진시키지만, 배반포기 배의 ICM과 TE 세포수 증가에는 유의한 영향을 나타내지 못한다는 것을 알 수 있었다.

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사람 치수 세포와 치주 인대 세포의 유전자 발현에 관한 비교 연구 (THE COMPARISON OF GENE EXPRESSION FROM HUMAN DENTAL PULP CELLS AND PERIODONTAL LIGAMENT CELLS)

  • 소현;박상혁;최기운
    • Restorative Dentistry and Endodontics
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    • 제34권5호
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    • pp.430-441
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    • 2009
  • 본 연구는 사람 치수세포 및 치주인대세포의 차이를 알아보고자 배양한 각각의 세포를 CDNA microarray assay를 통하여 유전자의 발현정도의 차이를 비교하였다. 그 결과를 바탕으로 각각의 세포에서 2배 이상의 유전자 발현의 차이를 보이는 유전자중 특징적인 3가지 유전자를 선택하여 RT-PCR로 검증한 결과 다음과 같은 결론을 얻었다; 1. Microarray assay 결과, 치주인대 세포에 비해 치수 세포에서 2배 이상 발현한 유전자 수는 총 51개가 나타났다. 2. RT-PCR의 결과, 치주인대세포에 비해 치수 세포에서 ITGA4, TGF-${\beta}2$ 등이 높게 나타났다. 3. Microarray assay결과, 치수 세포에서 비해 치주인대 세포에서 2배 이상 발현한 유전자 수는 총 19개가 나타났다. 4. RT-PCR의 결과, 치수 세포에 비해 치주인대세포에서 LUM, WISP1, MMP1 등이 높게 나타났다. 본 연구 결과로 치수세포에는 상아질 형성에 관여하는 특징적인 유전자가 치주인대세포에 비해 높게 발현되었으며, 치주인대세포에는 교원질 합성에 관여하는 특징적인 유전자가 치수세포에 비해 높게 발현되어, 치수세포와 치주인데 세포는 유전자 발현의 차이가 나타남을 알 수 있었다.