• 한국생물공학회:학술대회논문집
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• 2000.11a
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• pp.463-466
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• 2000

In this study, it was observed to oxygen uptake rate(OUR) on microbes in activated sludge process. OUR was showed to 43, 55, and $64\;mgO_2/L/hr$ when inoculated microbes mass were 3, 5, and 10%(v/v%). In additon to oxygen was consumed to $4{\sim}42\;mgO_2/L/hr$ as changed substrate concentration. Also, we were measured kinetics coefficient in order to know growth tendency. It was concluded to maximum growth rate$(\;{\mu}\;_{max})$, $2.7\;day^{-1}$, yield coefficient, 0.655, and half-velocity coefficient, 36.11 mg/L.

• Current Research on Agriculture and Life Sciences
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• v.25
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• pp.7-12
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• 2007

In order to investigate the availability of insect resources for agrobiotechnological or medical purposes, we examined antioxidant (DPPH and FRAP assay) and cell viability by oxidant stress and NO inhibition assay by treatment of the extracts of Statilia maculata Thunberg, Tenodera angustipennis Saussure and Tenodera aridifolia Stoll. We found that Tenodera angustipennis Saussure and Tenodera aridifolia Stoll extract (DW, etanol, methanol) had high levels of anti-oxidant activity, whereas Tenodera aridifolia Stoll extract showed increased cell viability by hydrogen peroxide and inhibition of NO production. These findings suggest that Statilia maculata Thunberg, Tenodera angustipennis Saussure and Tenodera aridifolia Stoll, extract have potentials to be developed for agrobiotechnology or medicinal use, indicating that mechanistic study including inhibition against molecular inflammation will show a possibility for the development of useful insect resources.

• Proceedings of the KAIS Fall Conference
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• 2007.05a
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• pp.270-272
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• 2007

본 연구는 서산 6쪽 마늘로부터 완전장 유전자 은행의 제작과 이를 통해서 확보된 1,000여개 재조합 클론에 대한 염기서열 결과를 web-based database를 통한 상동성 분석으로 부터 서산 마늘의 발현 유전자에 대한 생물정보학적 분석에 관해 것이며 본 연구로 부터 마늘의 대표적 생리활성 물질인 allicin의 생성에 관여하는 효소인 allinase의 cDNA를 클로닝 및 완전 염기서열을 해석하였으며 allinase 유전자의 genomic structure 에 대한 일부의 결과를 확보하였다. 또한 다양한 생물종에서 연구 되어지고 있는 생리활성 단백질인 lectin 유전자 cDNA를 클로닝하여 완전 염기서멸을 분석하고, 6xHis Tag올 통한 재조합 단백질을 대장균에서 E.coli에서 발현시켰다.

• Microbiology and Biotechnology Letters
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• v.22 no.4
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• pp.347-352
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• 1994

Cytotoxic test was performed by SRB assay on human epidermoid carcinoma HEp-2 cell line for screening the soil microorganism, secreting anticancer agent. One microorganism was selected among two thousand microorganisms for its highest cytotoxicity. And this microorganism was identified with Streptomyces species after performing of diaminopimeric acid and reducing sugar analysis of cell wall and analysing the cultural characteristics and named Streptomyces sp. SM 1119. The effect of anticancer agent in SM 1119 culture extract on the cell cycle was studied by using GG$_{o}$ synchronized NIH 3T3 cells. The extract inhibited the serum stimulation of GG$_{o}$ NIH 3T3 cell only within 1 hour after serum stimulation but not after 6 hours. The extract also reduced the amount of c-myc mRNA in Colo 320 cell. These results suggest that the anticancer agent in the extract inhibits the progression of cell cycle very early stages, probably from G$_{0}$ to G$_{1}$.

• Proceedings of the Korean Environmental Sciences Society Conference
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• 2005.05a
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• pp.252-254
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• 2005

음용수 처리공법으로 BPA를 분해하는 TiO$_{2}$광분해과정의 생물학적 안전성을 zebrafish(Danio Rerio, wild type)의 발생과 성장기를 통해 알아보았다. TiO$_{2}$ 광분해는 BPA를 제거하는 효과가 있었으며, TiO$_{2}$ 광분해 환경에서 부화된 자어의 경우 배발생 초기와 성장기, 성체시기에 형태적인 이상을 보이지 않았다. 그러나 항산화효소인 catalase 의 활성도는 발생초기와 부화 1, 5주에는 대조군에 비해 별다른 차이가 나타나지 않았으나 28주의 성체기에는 활성도가 절반 이하로 떨어지는 자체방어계의 이상을 보였다.

• Bulletin of Food Technology
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• v.15 no.2
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• pp.3-24
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• 2002

펩타이드와 단백질은 전사, 번역, 후번역 단계에 걸친 모든 생물학적 반응을 조절한다. 그러나 분자수준에서 구조와 기능에 대한 우리의 이해는 초보적인 수준이다. 구조와 기능의 연관성에 대한 문제는 펩타이드와 단백질 자체에 대한 것과는 좀 다르다는 것을 명확히 할 필요가 있다. Multidomain을 갖는 단백질은 작고 통합적이며, 구조적으로 제한된 부분으로 쪼개는 것은 천연 단백질의 활성을 모방하여 저분자의 nonpeptide를 설계하는데 있어서 주요한 일이다. 결정적인 역할을 수행하는 domain을 모방하는 것은 특이성과 치료 효과에 있어서 자연적으로 얻어지는 단백질 물질과 비교하여 이로운 특성을 갖을 수 있고 분자 인지 분야에 관한 연구에 유용한 단서를 제공한다(Chen etal., 1992). 한편 펩타이드는 환경에 의해 구조가 심하게 영향을 받아 특성이 쉽게 변한다(Marshall et al., 1978). 수용액 내에서 이러한 구조적 유동성 때문에 그들이 결합할 수용체나 생리활성을 띄는 구조를 결정하는 것은 어렵고 복잡한 일이다(Fauchre,1987; Hruby, 1987). 구조를 한정하면 이러한 결정을 매우 쉽게 할 수 있다(Hrubyet al., 1987). 단백질 모방학은 분자지각 연구에 강력한 수단이며, 복잡한 단백질과 펩타이드의 구조-기능관계를 탐구하고 분석하는데 독특한 방법이다. 이 장에서는 매우넓고 빠르게 확장되고 있는 Peptidomimetic연구를 간략히 소개하고 있다. 단 본문은 기술 범위를 N-Methylated 아미노산과 스테로이드 등으로 제한하여 소개한다.

• Journal of the Korean Chemical Society
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• v.37 no.1
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• pp.68-75
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• 1993

Various biological activities (enzyme inhibitory potency, lipoxygenase inhibition, tadpole narcosis, vapor toxicity and heat of vaporization) of molecules are correlated with molecular descriptors. The molecular descriptors used in this works are molecular connectivity index, Wiener distance index and ad hoc descriptor, which can encode information about branching, size, cyclization, unsaturation, hetero atom content and polarizability. It is found that calculated values from multiple regression equations are in a good agreement with experimental data on five biological activities of alcohol, ester and ketone compounds.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2003.10a
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• pp.67-69
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• 2003

바이오네트웍 모델링은 유전자네트웍, 단백질네트웍, 대사회로, 신호전달회로네트웍등에 대하여 각 요소간의 관계를 그래프이론을 통하여 표현하는 작업을 말한다. 특히 조절네트웍의 모델링은 다양한 생물학적 실험 데이터로부터 단백질들간의 활성과 불활성 관계를 유추해내는 것을 말한다. 현재 조절네트웍 모델링을 위한 다양한 알고리즘들이 개발되어 있으나 응용적인 측면에서 유추된 네트웍은 활용성이 부족하다. 본 논문에서는 In Vitro상에서 DNA 컴퓨팅을 이용하여 간단한 연산을 수행함으로서 유전자 조절 기전을 모델링하고자 한다. 이러한 방법의 장점은 DNA컴퓨팅의 연산이 세포의 현재 또는 다음 상태를 In Vivo 상에서 구현되어 진단 등의 문제에 응용될 수 있다는 가능성을 제시해 준다는 것이다.

• Korean Journal of Food Science and Technology
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• v.20 no.3
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• pp.371-379
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• 1988

To investigate on the biochemical characteristics of myofibrillar proteins between cold(pollack, salmon) and warm current fish (yellow corbina, shark), myofibrils and actomyosin were prepared, and their biological activities, effect of temperature on the myofibrillar ATPase activities and SDS-polyacrylamide gel electrophoretic patterns of myofibrils were compared. SDS-polyacrylamide gel electrophoretic analysis showed that electrophoretic patterns of myofibril vary from fish to fish. Difference in KCl concentration dependency of myofibrillar ATPase activities and ATPase activity- pH curve were found among fish species. Myofibrillar proteins from cold current fish showed higher specific activity at low temperature $(5^{\circ}C-10^{\circ}C)$ than those from warm current fish.

• Journal of Life Science
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• v.23 no.10
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• pp.1273-1279
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• 2013

Aromatic hydrocarbons, such as phenol, have been detected frequently in wastewater, soil, and groundwater because of the extensive use of oil products. Bacterial strains (56 isolates) that degraded phenol were isolated from soil and industrial wastewater contaminated with hydrocarbons. GN13, which showed the best cell growth and phenol degradation, was selected for further analysis. The GN13 isolate was identified as Neisseria sp. based on the results of morphological, physiological, and biochemical taxonomic analyses and designated as Neisseria sp. GN13. The optimum temperature and pH for phenol removal of Neisseria sp. GN13 was $32^{\circ}C$ and 7.0, respectively. The highest cell growth occurred after cultivation for 30 hours in a jar fermentor using optimized medium containing 1,000 mg/l of phenol as the sole carbon source. Phenol was not detected after 27 hours of cultivation. Based on the analysis of catechol dioxygenase, it seemed that catechol was degraded through the meta- and ortho-cleavage pathway. Analysis of the biodegradation of phenol by Neisseria sp. GN13 in artificial wastewater containing phenol showed that the removal rate of phenol was 97% during incubation of 30 hours. The removal rate of total organic carbon (TOC) by Neisseria sp. GN13 and activated sludge was 83% and 78%, respectively. The COD removal rate by Neisseria sp. GN13 from petrochemical wastewater was about 1.3 times higher than that of a control containing only activated sludge.