• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
• /
• 2001.10a
• /
• pp.280-282
• /
• 2001

분자생물학의 급진적 발전은 현대 계통분류학에 큰 변혁을 가져왔다. 특히 유전의 근원물질인 DNA나 RNA를 분리.조작.분석하는 기술의 발전으로 이를 이용만 계통수 제작은 계통생물학의 중요한 실험방법으로 자리잡고 있다. 그 중 염기서열 비교 방법은 현재 유전자 계통수 제작에 가장 널리 이용되는 방법이다. 하지만 이러만 계통수는 각 객체간의 거리만을 표현하고, 객체군간의 차이는 설명하기 힘들다. 본 연구에서는 염기서열의 상대적인 특징(유사도)을 대신하는 염기서열의 총량과 염기 함량 등을 이용해 새로이 분류 기법 중 결정트리 방법에 적응하고, 종 분류의 유전적 모델을 설계한다. 또한 결정트리의 클래스인 종은 상위 클래스들을 포함하고 있어, 본 논문에서는 기존의 결정트리 분류자를 수정한 단계적 결정트기 분류자를 제안한다.

• Journal of the Korea Computer Graphics Society
• /
• v.11 no.3
• /
• pp.19-22
• /
• 2005

정보생물학 분야에 있어서 분자 구조를 3차원으로 렌더링하여 보여주는 것은 매우 중요한 작업이다. 특히 분자의 표면 렌더링은 분자의 3차원 구조 분석 등에 중요하게 사용된다. 그러나 분자 표면 렌더링을 수행하기 위해서는 많은 양의 폴리곤이 필요하게 된다. 특히 대장균 바이러스와 같은 분자량이 많은 거대 분자를 자연스럽게 렌더링 하기 위해서는 고가의 그래픽 전용 워크스테이션을 사용해야 한다. 본 논문에서는 저렴한 일반 PC 급 시스템에서도 거대 분자를 무리 없이 렌더링 할 수 있는 효율적인 알고리즘을 제안하였다. 제안하는 알고리즘은 높은 속도와 좋은 화질을 유지할 수 있는 Hybrid Point & Polygon 렌더링 기법이다. 이 알고리즘은 계층적인 자료구조인 옥트리(Octree)를 사용하였으며 최적의 성능을 내기 위하여 GPU가 작업을 처리한다. 제안된 알고리즘의 성능 평가는 일반 PC급에서 수행되었으며 특히 그래픽 카드 2개를 병렬로 연결하여 높은 성능을 낼 수 있는 SLI(Scalable Link Interface) 환경에서 평가를 수행하였다.

• The Microorganisms and Industry
• /
• v.14 no.2
• /
• pp.30-32
• /
• 1988

최근 새로운 효소들과 새로운 용도들이 개발되고 특히 분자 생물학의 발전으로 재조합 DNA 기술과 단백질공학이 효소공업에 이용되는 연구가 이루어졌다. 이러한 새로운 국면은 식품산업에도 커다란 영향을 줄 것으로 생각되어 지난 몇년 동안 식품공업에 관련된 효소의 연구와 개발의 예를 몇가지 들면서 그 경향을 가늠하려 한다.

• Agrochemical news magazine
• /
• v.22 no.8 s.171
• /
• pp.10-13
• /
• 2001

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
• /
• 2005.11b
• /
• pp.241-243
• /
• 2005

정보생물학 분야에 있어서 분자 구조를 3차원으로 렌더링하여 보여주는 것은 매우 중요한 작업이다. 특히 분자의 표면 렌더링은 분자 구조를 분석 하는데 필요한데, 렌더링을 하는데 있어서 폴리곤이 많이 필요하게 된다. 특히 분자량이 많은 거대 분자를 3차원으로 렌더링 하기 위해서는 고가의 그래픽 전용 워크스테이션을 사용하게 된다. 본 논문에서는 저렴한 일반 PC 급 시스템에서도 거대 분자를 렌더링 할 수 있는 알고리즘을 제안 하였다. 제안하는 알고리즘에는 옥트리(Octree)를 전처리로 사용한 Hybrid Point & Polygon 렌더링 기법을 적용 하였다. 각 렌더링 과정은 최적의 성능을 내기 위하여 GPU가 작업을 처리한다.

• Journal of Naturopathy
• /
• v.10 no.1
• /
• pp.42-47
• /
• 2021

Purpose: This study investigated the antioxidant activities of water extracts from Hibiscus petals, Moringa oleifera gymnosperm, and Nipa fruticans wurmb. Also, the possibility of their use as a functional cosmetic material and food were searched. Methods: We extracted Hibiscus petals, M. oleifera gymnosperm, and N. fruticans wurmb with water. And then, we measured the content of total polyphenols and flavonoids and the ability to scavenging free groups of ABTS and DPPH to study the antioxidant function. The toxicity of samples evaluated by measuring cell viability. Results: The polyphenol content of the water extract of N. fruticans wurmb was 109 ㎍/mg, which was significantly higher than that of Hibiscus petals (13 ㎍/mg) and M. oleifera gymnosperm (19 ㎍/mg). Radical scavenging ability was also excellent in N. fruticans wurmb, and the cytotoxicity test results of the samples were similar. Conclusions: The water extracts showed antioxidant activity to use for cosmetic materials or natural healing foodstuff.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
• /
• 2007.05a
• /
• pp.71-74
• /
• 2007

오늘날 생물학 데이터베이스 시스템은 끊임없이 증가하고 복잡하게 연결되는 데이터를 처리해야 할 필요성과 데이터양의 증가만큼이나 빨리 성장하는 사용자들의 요구에 부응해야 하는 필요성에 직면해 있다. 이 논문에서는 기존의 생물학 데이터베이스 시스템의 특징을 살펴본 후, 현재 당뇨 관련 데이터베이스가 존재하지 않으므로 당뇨 연구를 위한 포괄적인 정보 제공과 사용의 편의를 제공하기 위하여 생물학 관련 데이터베이스를 교차 참조한 당뇨 연구용 데이터베이스를 설계하였다. 본 논문에서 설계한 데이터베이스는 Genetic Information, Protein Information, In Silico digestion, 그리고 Chemical Information 4개의 메뉴로 구성하였다. Genetic Information과 Protein Information은 Cross-Reference를 통한 관련 데이터베이스와 연결시켰고, Protein Information에서 PDB 코드가 존재할 경우 3차원 분자 구조를 제공한다. 아울러 단백질 동정시에 활용할 수 있는 선택된 효소처리 후의 펩타이드의 이론적 질량값을 계산하도록 구현(In Silico Digestion)하였으며, 당뇨 관련 주요 단백질의 화합물들의 구조를 제공하였다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
• /
• 2010.11a
• /
• pp.189-192
• /
• 2010

분자 생물학을 통한 연구가 심화되면서, 생물학 정보는 기하급수적으로 늘어나고 있다. 그에 따라 바이오메디컬(생물학, 의학) 관련 논문들의 출판 및 등록 건수도 해마다 증가하고 있다. 그러나 바이오메디컬 문서들에서 유용한 정보를 추출하는 기술은 이러한 분야의 전문가 큐레이터(curator)에 의존한 경우가 많아서, 그 작업의 속도와 양적인 면에서 한계를 가지고 있다. 이러한 이유 때문에 바이오메디컬 문서를 기계학습을 통하여 분석하는 기법이 도입되기 시작하였다. 아직까지는 기계학습을 이용하여 구축된 데이터베이스가 소수에 불과하지만, 점차 증가하는 추세에 있다. 이러한 현 추이를 분석하고 향후의 추세를 예측하고자 텍스트마이닝 기술이 생물학과 의학 분야에서 어떻게 사용되며, 그 정보들이 어떻게 관리되는지 연구, 조사 하게 되었다. 현재 바이오메디컬 관련 데이터베이스들이 여러 기관 및 단체에 의해 구축 및 관리되고 있으며, 국가적인 프로젝트로서 이러한 데이터베이스들을 통합하는 과정을 진행하고 있다. 이처럼 국가기관의 주도하에 데이터베이스를 통합하여 관리하고자 하는 노력들이 계속되고 있어, 앞으로는 바이오메디컬 자료들을 검색하기가 보다 용이해질 것으로 생각된다. 텍스트마이닝을 이용하여 바이오메디컬 정보들을 추출하는 기술은 초기에는 공동 발생(co-occurence)과 같이 단순한 통계적 방법을 이용하였지만, 최근에는 다른 문서에서 추출된 정보와 기존의 정보들을 연계하여 새로운 정보를 추출해 내는 기법이 확산되고 있음을 알 수 있었다.

• Journal of Scientific & Technological Knowledge Infrastructure
• /
• s.10
• /
• pp.60-63
• /
• 2002

20세기초 시작된 실험동물분야는 다른 분야에 비해 뒤늦게 시작된 분야임에도 불구하고 생명해석과 의학의 발전과 더불어 급격히 발전한 분야라 할 수 있다. 특히, 1950년대 오염되지 않은 다양한 청정동물의 개발, 1970-80년대의 다양한 질환모델동물의 개발에 이어, 분자생물학의 발전과 더불어 1990년대를 거쳐 21세기의 다양한 유전자도입동물가 개발되고 있다. 이는 자연계에 존재하는 생물자원만이 아닌, 유전자조작으로 다양하게 개발되는 새로운 생물자원을 포함하므로, 그 다양성의 가치와 정보의 집대성은 대단히 중요한 일이며, 유전자연구의 한축이 되고있는 bioinformatic 분야에서도 많은 부분 할애되고 있다고 해도 과언이 아닐 것이다.

• Journal of Life Science
• /
• v.4 no.4
• /
• pp.170-175
• /
• 1994

The glucose transport across the mammalian plasma membranes is carried out by members of two distinct gene families, $Na^+$/glucose to transporter (SGLT) and glucose transporters (GLUTs). The energy requiring SGLT utilizes the sodium gradient to transport glucose and galactose against the concentration gradient. The energy independent transport (Facilitative transport) of glucose down the concentration gradient is mediated by the members of GLUTs. The facilitated transport of glucose is saturable, sterospecific and bidirectional across the membrane. To date, 6 kinds of isoforms of facilitative glucose transporters are found. These proteins are expressed in a tissue and cell specific manner, and shows distinct properties that reflect their specific functional roles.