Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference (한국정보처리학회:학술대회논문집)

  • 2007.05a
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  • Pages.71-74
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  • 2007
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  • 2005-0011(pISSN)
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  • 2671-7298(eISSN)
Korea Information Processing Society (한국정보처리학회)
권호 표지

Web-Based Integrated Database system Implementation for Diabetes Research

당뇨 연구를 위한 웹기반 통합 데이터베이스 시스템 구현

  • Kim, Jae-Hee (Database / Bioinformatics Laboratory, Chung-buk University) ;
  • Ryu, Keun-Ho (Database / Bioinformatics Laboratory, Chung-buk University)
  • 김재희 (충북대학교 전자계산학과) ;
  • 류근호 (충북대학교 전자계산학과)
  • Published : 2007.05.11
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Abstract

오늘날 생물학 데이터베이스 시스템은 끊임없이 증가하고 복잡하게 연결되는 데이터를 처리해야 할 필요성과 데이터양의 증가만큼이나 빨리 성장하는 사용자들의 요구에 부응해야 하는 필요성에 직면해 있다. 이 논문에서는 기존의 생물학 데이터베이스 시스템의 특징을 살펴본 후, 현재 당뇨 관련 데이터베이스가 존재하지 않으므로 당뇨 연구를 위한 포괄적인 정보 제공과 사용의 편의를 제공하기 위하여 생물학 관련 데이터베이스를 교차 참조한 당뇨 연구용 데이터베이스를 설계하였다. 본 논문에서 설계한 데이터베이스는 Genetic Information, Protein Information, In Silico digestion, 그리고 Chemical Information 4개의 메뉴로 구성하였다. Genetic Information과 Protein Information은 Cross-Reference를 통한 관련 데이터베이스와 연결시켰고, Protein Information에서 PDB 코드가 존재할 경우 3차원 분자 구조를 제공한다. 아울러 단백질 동정시에 활용할 수 있는 선택된 효소처리 후의 펩타이드의 이론적 질량값을 계산하도록 구현(In Silico Digestion)하였으며, 당뇨 관련 주요 단백질의 화합물들의 구조를 제공하였다.

Keywords