• 제목/요약/키워드: 박테리오파지

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황색포도상구균 박테리오파지의 저감화를 위한 물리화학적 처리 효과 (Effects of Physical and Chemical Treatments for Reduction of Staphylococcal Phages)

  • 백다윤;박종현;조성래;이영덕
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제34권1호
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    • pp.106-114
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    • 2019
  • 본 연구는 황색포도상구균 박테리오파지를 물리화학적 방법을 통해서 제어하기 위해 황색포도상구균을 대상으로 하는 SAP 84 와 SAP 89를 신규 분리하였다. 그리고, 황색포도상구균 박테리오파지에 대해 물리적 방법으로 $55^{\circ}C$$60^{\circ}C$ 열처리와 pH 4, pH 7, pH 10 처리하였다. 그 결과 SAP 84는 $60^{\circ}C$에서 급격히 감소하였고 SAP 89는 $60^{\circ}C$에서 25 분 만에 모두 활성을 잃었다. SAP 84는 pH 4 ~ 10에서 매우 안정적이었고 SAP 89는 pH 10 이상에서 비교적 불안정해지는 것을 보였다. 화학적 방법으로는 에탄올과 차아염소산나트륨 및 FAS 처리를 하였다. SAP 84가 50%, 70% 에탄올에서 급격히 감소하였다. 살균력이 좋은 100 ppm의 차아염소산 나트륨에서도 SAP 84와 SAP 89는 상당히 안정적인 상태를 유지하고 있다. Virucidal agent로 사용되는 FAS를 10% 농도로 처리하였을 때 SAP 84와 SAP 89 모두 처리 직후부터 제거되는 것을 확인할 수 있었다. 따라서 본 연구를 통해 SAP 84와 SAP 89 모두 화학적 처리 방법인 FAS 처리를 통해서 제어 가능함을 보여주었다. 이외에도 SAP 84는 물리적 방법인 열처리의 저감화 효과가 좋았으며 SAP 89는 화학적 방법인 에탄올 처리의 저감화 효과가 비교적 좋았다. 이렇듯 물리화학적 처리방법으로 황색포도상구균 박테리오파지를 제어 가능할 것으로 사료된다.

M-13 박테리오파지 기반 신개념 고감도 고선택성 컬러센서

  • 김춘태;이소영;김원근;오진우
    • 한국진공학회:학술대회논문집
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    • 한국진공학회 2013년도 제45회 하계 정기학술대회 초록집
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    • pp.294-294
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    • 2013
  • 자연계의 많은 생물들은 의사소통이나 분위기 표현, 위장 등을 하기위해 자신의 색을 바꾸는 것으로 알려져 있으며, 현재 많은 연구자들이 이러한 자연 현상으로부터 영감을 받아 생체모방 구조와 메커니즘을 이용한 바이오센서를 개발하고 있다. 하지만 기존의 컬러센서는 수용체 개발에 있어 복잡한 디자인, 어려운 합성 방법 및 낮은 감도와 저선택성 등의 한계점을 가지고 있다. 이에 본 연구에서 우리는 바이러스(M13-박테리오파지)를 기반으로 한 신개념 고감도 고선택성 컬러센서를 개발하고자 한다. 우리가 개발하고자 하는 컬러센서는 자가 조립방법으로 만들어진 나노 구조체로 형성되어 있으며, 다양한 종류의 화학물질이나 오염물질을 감지할 수 있다. 이 컬러센서는 아주 낮은 농도의 휘발성 유기화합물(volatile organic compounds)을 감지해 색변화를 보였으며, 다양한 독성 물질이나 방향족을 가진 화학 물질을 감지할 수 있었다. 따라서 우리가 개발한 컬러 센서는 국가의 안보나 국민의 건강을 증진시키기에 아주 유용할 것으로 보인다.

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DNA 형태 적응을 거쳐 P2sir-관련 도움파지 비효율성을 극복하는 박테리오파지 P4 sid+ 유도체 정성 연구 (Characterization of the bacteriophage P4 sid+ derivative overcoming P2sir-associated helper inefficiency through DNA conformational adaptation)

  • 김경진
    • 미생물학회지
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    • 제52권1호
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    • pp.120-124
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    • 2016
  • P2-크기 머리에 packaging 될 특정 DAN 크기(28-29 kb long)와 박테리오파지 P4 유전자 sid의 변이가 "P2 sir-관련 도움파지 비효율성"을 극복할 수 있는 요소로 압축되었다. 유전자 sid의 변이 여부가 필수적인지를 확인하기 위해, 정상적인 sid 유전자를 가지며 $P2_{sir3}$-크기의 큰 머리에 packaging 될 DNA 크기가 28.5 kb되는 P4 delRI::kmr을 사용하여 실험하였다. P4 delRI::kmr이 P2 sir3 용원소에 대해 낮은 EOP를 보이므로, 이를 증가시키기 위해 P2 sir3 용원소를 숙주세포로 하여 파지 stock을 제조하였다. 이 과정에서 P4 delRI::kmr이 P2 sir3 용원소에 대해 적응하는 것을 관찰하고, CsCl 부양 균등밀도 편차실험과 분리된 DNA의 전기영동을 통해 그것이 packaging 될 머리 크기에 따른 DNA 형태 변화에 의한 적응이라는 것을 알아냈다. P2 sir3 용원소에 적응된 P4 delRI::kmr과 적응되지 않은 P4 delRI::kmr stock의 burst size 결정 실험은, sid 유전자 변이에 상관없이 packaging 될 DNA 크기에 의해 "P2 sir-관련 도움파지 비효율성"이 극복된다는 것을 보여주었다.

박테리오파지 E3의 Major Capsid Protein을 만드는 유전자의 Mapping 및 염기서열 분석 (Genetic Mapping and Sequence Analysis of the Gene Encoding the Major Capsid Protein of Bacteriophage E3)

  • 배수진;명희준
    • 미생물학회지
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    • 제35권4호
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    • pp.266-269
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    • 1999
  • 박테리오파지 E3가 만드는 plaque은 그 지름이 약 1㎝정도이고 대단히 빠르게 성장한다. 구조 단백질 중 가장 많은 copy를 가지는 major capsid 단백질을 발현하는 유전자를 조절하는 promoter가 가장 효율적일 것이라 생각되며, 이 promoter를 찾기 위하여 먼저 이 유전자를 mapping하였다. 정제한 파지 입자로부터 major capsid 단백질을 분리하여 그 N-terminal amino acid 서열을 확인하였고, 그에 해당하는 degenerate oligonucleotide probe를 이용하여 E3의 genomic library로부터 major capsid 단백질을 발현하는 유전자를 함유하는 clone을 찾았다. 이 clone의 DNA 서열 분석을 통하여 major capsid 단백질을 발현하는 유전자를 확인하였으며, 이는 E3 genome에서 약 72%에 mapping 되었다. 이 gene을 조절하는 promoter의 성질을 고찰하기 위하여 E3의 성장이 rifampicin에 의하여 영향을 받는지 확인한 결과 E3는 자기 고유의 RNA polymerase를 가지고 있음을 알 수 있었다.

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시가 독소 생성 대장균의 제어를 위한 박테리오파지의 분리와 특성 분석 (Isolation and characterization of bacteriophages for the control of Shiga Toxin-producing E. coli)

  • 임가연;박도원;이영덕;박종현
    • 한국식품과학회지
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    • 제50권6호
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    • pp.594-600
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    • 2018
  • 본 연구는 시가독소 생성 대장균(STEC)를 제어하기 위하여 하천수 시료로부터 넓은 숙주저해범위를 갖는 ECP33 파지와 NOECP91 파지를 분리, 선별하였다. 총 44주의 STEC균주에 대해 ECP33 파지는 약 45.5%와 NOECP91 파지는 약 65.9%로 숙주저해특성을 가지는 것으로 나타났다. 형태학적 특성을 확인한 결과 모두 Myoviridae family에 속하였다. 환경에 대한 안정성 분석을 진행한 결과, 두 파지 모두 50 ppm 농도의 차아염소산 및 pH 4-10의 pH환경에 대해서는 최소 30분까지 비교적 안정한 것으로 나타났다. 반면, $70^{\circ}C$의 고온에서는 NOECP91 파지는 15분 내에, ECP33 파지는 30분 처리 시에 대부분 사멸하고, 유기용매(EtOH) 환경에서 NOECP91 파지는 30% 에탄올 1시간 처리에 모두 사멸하였으나, ECP33파지의 경우 70% EtOH/에탄올 1시간 처리에도 2 log PFU/mL 미만의 감소율을 보여 온도와 유기용매(EtOH) 환경에 대해 ECP33 파지가 NOECP91 파지보다 안정적인 것으로 나타났다. 아울러 분리된 ECP33 파지와 NOECP91 파지를 MOI 0.1 조건에 따른 STEC 균주 생육억제 정도를 분석한 결과, 배양 10시간대까지 생육억제가 이루어지는 것을 확인하였다. 따라서 본 연구를 통해 분리된 ECP33 파지와 NOECP91 파지는 시가독소 생성 대장균의 생물학적 제어제로서 적용이 가능할 것으로 사료된다.

층상이중수산화물에 의한 인공지하수내의 박테리오파지 T7 제거 (Removal of Bacteriophage T7 from Artificial groundwater by Layered Double Hydroxide)

  • 박정안;이창구;강진규;김성배
    • 대한환경공학회지
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    • 제33권6호
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    • pp.426-431
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    • 2011
  • 본 연구의 목적은 마그네슘-철 층상이중수산화물(Mg-Fe LDH)을 이용하여 인공 지하수에서 바이러스를 제거하는 것이다. Mg-Fe LDH를 이용한 박테리오파지 T7의 제거를 관찰하기 위하여 다양한 실험조건에서 회분실험을 실시하였다. 실험 결과, Mg-Fe LDH에 의한 T7 제거는 빠른 반응으로써, 2~3시간 안에 평형에 도달하였다. Mg-Fe LDH의 T7 제거능은 $1.57{\times}10^8pfu/g$이었고, 제거율은 96%이었다. 또한, pH 6.2~9.1 범위에서 용액 pH가 T7 제거에 미치는 영향은 미미하였다. 음이온들($SO_4^{2-}$, $CO_3^{2-}$, $HPO_4^{2-}$)이 T7 제거에 미치는 영향은 중요하였는데, 이유는 이들 음이온들이 LDH상의 흡착지점에 T7과 경쟁하기 때문이다. 반면, 질산염($NO_3^-$)이 T7 제거에 미치는 영향은 미미하였다. 본 연구에 의하면, Mg-Fe LDH는 흡착제로써 수처리 과정에서 바이러스제거에 적용될 수 있을 것으로 판단된다.

박테리오파지 T4 tRNA의 프로세싱에 관여하는 몇가지 RNase들 (Some RNases Involved in the Processing of Bacteriophage T4 RNA)

  • 고동성
    • 대한화학회지
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    • 제26권6호
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    • pp.396-402
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    • 1982
  • RNase Ⅲ, RNase E, 및 RNase P가 각각 홀로 또는 복합적으로 결핍되는 E. coli 돌연변이 균주들 내에서의 박테리오파지 T4 tRNA의 전구 RNA로 부터의 합성을 연구하였다. RNase E$^-$균주에서는 9S RNA로 볼 수 있는 한 RNA 띠가 축적되었으며 RNase$ P^-$균주에서는 6S 이중띠의 하부띠가 축적되었다. RNase Ⅲ$^-$균주에서는 T4 tRNA 유전인자 떼(cluster)에 의하여 코드되는 (coded) tRNA$^{Gln}$의 생성이 심하게 억제되며 T4 DNA에 의하여는 코드되지만 T4 tRNA 유전인자 떼에 의하여 코드 되는 6S 이중 띠의 상부 띠는 RNase Ⅲ$^+$균주의 경우에 비하여 더 크게 축적된다. 그러나 6S 이중 띠의 상부 띠 RNA와 tRNA$^{Gln}$ 사이에는 precursor-product 관계가 없다고 판단되며 RNase Ⅲ이 precursor RNA을 가수분해 절단 한다고 생각하는 개념을 지지할만한 근거가 없음을 지적할 수 있다.

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