The importance of spatio-temporal trajectories for contact tracing has increased due to the recent COVID-19 pandemic. Spatio-temporal trajectories store time and spatial data of moving objects. In this paper, I propose query processing for spatio-temporal trajectories of moving objects. The spatio-temporal trajectory model of moving objects has point type spatial data for storing locations and timestamp type temporal data for time. A trajectory query is a query to search for pairs of users who have been in close contact by boarding the same bus. To process the trajectory query, I use the Geolife dataset provided by Microsoft. The proposed trajectory query processing method divides trajectory data by date and checks whether users' trajectories were nearby for each date to generate information about contacts as the result.
Validation of viral safety is essential in ensuring the safety of mammalian cell culture-derived biopharmaceuticals, because numerous adventitious viruses have been contaminated during the manufacture of the products. Mammalian cells are highly susceptible to minute virus of mice(MVM), and there are several reports of MVM contamination during the manufacture of biopharmaceuticals. In order to establish the validation system for the MVM safety, a real-time PCR method was developed for quantitative detection of MVM in cell lines, raw materials, manufacturing processes, and final products as well as MVM clearance validation. Specific primers for amplification of MVM DNA was selected, and MVM DNA was quantified by use of SYBR Green I. The sensitivity of the assay was calculated to be $6{\times}10^{-2}TCID_{50}/mL$. The real-time PCR method was proven to be reproducible and very specific to MVM. The established real-time PCR assay was successfully applied to the validation of Chinese hamster ovary (CHO) cell artificially infected with MVM. MVM DNA could be Quantified in CHO cell as well as culture supernatant. When the real-time PCR assay was applied to the validation of virus removal during a virus filtration process, the result was similar to that of virus infectivity assay. Therefore, it was concluded that this rapid, specific, sensitive, and robust assay could replace infectivity assay for detection and clearance validation of MVM.
Lee, Doseung;Boo, Kyung Hwan;Kim, Young Cheon;Lee, Jin-Man;Kim, Seong Cheol;Lee, Wang Shik;Riu, Key Zung;Lee, Dong-Sun
Journal of Applied Biological Chemistry
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v.57
no.2
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pp.179-182
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2014
In the present study, we investigated the effects of methanol extracts from Alpinia katsumadai Hayata against antiviral potential underlying mechanism in glucosidase inhibition. Syncytium formation in Newcastle disease virus (NDV)-infected baby hamster kidney (BHK) cell originates from the trafficking of viral glycoprotein into cell-surface. Methanol extracts inhibited not only syncytium formation, but also trafficking of glycoprotein, hemagglutinin-neuraminidase (HN), onto cell-surface. A. katsumadai extracts showed the inhibitory activities ($IC_{50}$$25{\mu}g/mL$) against ${\alpha}$-glucosidase. These results suggested that blue chanterelle extracts inhibited the cell-surface expression of NDV-HN glycoprotein without significantly affecting HN glycoprotein synthesis in NDV-infected BHK cells.
This study aims to explain the process of providing important medical images for the diagnosis of pneumonia caused by coronavirus disease 2019 (COVID-19) through the only mobile hospital computed tomography (CT) in Korea. Since January 28, 2020, medical imaging examinations have been provided to confirmed and suspected COVID-19 patients, and the quality of images was evaluated based on the objective and subjective indicators. In order to prevent the transmission in the hospital that may occur due to exposure to medical staff and general patients, personal protective equipment was worn and the separate route was used blocking human infection factors. For 11 weeks, a total of 185 tests were performed for 98 confirmed patients and 72 suspected patients. The average time to complete the test was 33 minutes. In the course of the test, no cross-infection cases were examined. During the outbreak of the COVID-19, the only mobile hospital CT room of Korea provided medical imaging examinations without infection among medical staff and patients and also provided adequate medical images without significant difference (p >0.05) in determining the degree of pneumonia progression compared to a stationary in-hospital CT.
Genomic RNA sequence of a tobamovirus infecting Eutrema wasabi plant(TMV-W) was determined. The RNA is composed 6,298 nucleotide and contains four OREs encoding the protein of 180KD(OREI), 130KD(ORE2),30KD(ORF3) and 18KD(coat protein, ORF4). ORE4, ORF 3, ORF 2 and ORF 1 are overlaped by 130, 20 and 40 nucleotides, and the overapping region can be folded into a stable hairpin styucture. This includes the 3'non-coding region of 238 nucleotides, coat protein gene(537 nucleotides,179 amino acid), 30KD movement protein gene(825 nucleotides, 275 amino acid), 13(IKD protein gene(1,896 nucleotides, 632 amino acid) and 180KD protein gene(2,958 nucleotides, 986 amino acid). The genomic RNA sequence was compared with homologous regions of eleven other tobamoviruses. TMV-WTE was similar to TMV-WSF(98.6%) in nucleotide sequence.
Kim, Wi-Sik;Jang, Min-Seok;Kim, Jong-Oh;Jeon, Young-Ho;Oh, Myung-Joo
Korean Journal of Ichthyology
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v.27
no.3
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pp.183-188
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2015
Recently, mariculture of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) has been initiated in the coast areas of Korea. In the present study, we investigated the effect of fish viruses on mariculture of rainbow trout. The pathogenicity of infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV) and infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) isolated from freshwater rainbow trout was tested against major cultured marine fish species, including olive flounder (Paralichtys olivaceus), rock fish (Sebastes schlegeli), rock bream (Oplegnathus fasciatus), red seabream (Pagrus major) and sevenband grouper (Epinephelus septemfasciatus). The pathogenicity of marine birnavirus (MABV), hirame rhabdovirus (HIRRV) and nervous necrosis virus (NNV) isolated from marine fish species was also tested against rainbow trout. No mortality was observed in marine fish species challenged with IHNV or IPNV. However, olive flounder and rock bream were infected by IHNV and IPNV. A mortality of 8.3% was observed in rainbow trout challenged with HIRRV. The fish was infected by both MABV and NNV. These results suggest that the mariculture of rainbow trout might be affected by fish viruses.
Kim, Ji Hyun;Lee, Jung Ju;Yun, Sin Weon;Chae, Soo Ahn;Lim, In Seok;Lee, Dong Keun;Choi, Eung Sang;Yoo, Byoung Hoon
Clinical and Experimental Pediatrics
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v.51
no.12
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pp.1368-1371
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2008
Herpes zoster in infancy is very rare but can be developed following intrauterine or postnatal exposure to varicella zoster virus. We report a case of herpes zoster in a 4-month-old male infant. He had no prior history of primary varicella or varicella vaccination. His mother had no history of varicella infection and no contact history with varicella during pregnancy. He had a history of exposure to his father with herpes zoster 3 months ago, and to his cousin with convalescent chickenpox 2 months ago. Multinucleated, giant cells were shown on a Tzanck smear. He was treated with acyclovir and first generation cephalosporin for herpes zoster with Staphylococcal skin infection, with complete resolution without sequelae.
Journal of the Korea Institute of Information Security & Cryptology
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v.20
no.6
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pp.237-249
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2010
If one analyzes recent cyber incidents including personal information infringement cases, it seems like actual attack is targeting Internet service providers but actually they are targeting Internet service users. For many users, all the services were not provided to them as they have signed for in the contract or personal informations, which users have provided to service providers when signing contracts, were disclosed to public without users' consent causing aftereffect. As a result, importance of S-SLA indexes, which is to be included in the SLA to be signed between a user and a service provider, is ever more increasing. Especially, if there is a S-SLA indexes for anti-virus services, service providers have to provide a high quality of service as they have signed in the SLA. However, there wasn't any researches in the S-SLA area domestically and there are only limited SLA indexes related to system or service maintenances at the moment. Therefore, this paper analyses security functions in anti-virus services and proposes S-SLA indexes for different security level.
Lee, So Young;Kim, Hyun Ji;Kim, Mi Young;Kim, Won Duck;Lee, Dong Seok;Kim, Doo Kwun;Choi, Sung Min
Clinical and Experimental Pediatrics
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v.46
no.5
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pp.454-458
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2003
Purpose : Rotavirus is the main cause of infantile diarrheal disease worldwide. The purpose of this study is to assess the difference between clinical manifestations and feeding or delivery methods in healthy full-term neonates and those with nosocomially-acquired rotaviral infection. Methods : The study was conducted on 348 babies who were delivered in Dongguk University Kyongju Hospital from Jan 1 to June 30 in 2001. Stool specimens were collected from clinically symptomatic neonates. We studied the rate of positive stool rotazyme ELISA tests and positive symptoms. We compared the frequency of clinical manifestations according to the feeding methods [breast feeding(BF) or formula feeding(FF)] and the delivery methods[normal vaginal delivery(NVD) or Cesarean section(C/sec)]. Results : Rotavirus was detected in 152 of 348 babies. The rate of positive rotazyme ELISA test was 43.7% in healthy full-term symptomatic neonates. The most common symptom of rotaviral enteritis was mild fever; the others were watery diarrhea, abdominal distension, vomiting, delayed weight gain, irritability, poor oral intake and dehydration. Compared with FF neonates, BF neonates have lower frequency of symptoms, especially watery diarrhea, delayed weight gain and poor oral intake. The symptomatic frequency was higher in FF and NVD neonates than BF and C/sec. Conclusion : The symptoms of rotaviral enteritis were less frequent in BF or C/sec delivered neonates. BF appeared to alleviate the rotaviral enteritis but further studies are needed. The cause of the lower frequency of symptoms in C/sec delivered neonates was unknown.
This survey was carried out in order to find out population density of aphid at the alpine area. Thetraps were set from May 1 to October 31 in 1973. The summarized results are as follows; 1. About 37 species of aphids were trapped, including 4 species of potatao virus vectors. 2. Of these, dominant species are Aphis gossypii Koch, Aphis lerodendri Matsumura, and Lipahis erysimi Kaltenbaeh. The $67\%$ of 3, dominant species consisted of the trapped total aphids. 3. The potato virus vectors are Myzus persicae Sulzer, Aulacorhum solani Kaltenbach, Lipaphis erysimi Kaltenbaeh and Aphis gossypii Glover. 4. Tile number of aphids and vectors at the alpine area is considerably lower than that at the level land. 5. The peak of the flying aphid occurrence is shown in the latter part of September.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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