Proceedings of the Korean Society of Computer Information Conference
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2020.07a
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pp.269-270
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2020
코로나 사태 이후에도 세상은 수많은 바이러스가 유행하게 될 것이다. 수많은 질병에서 필요한 것은 정보이고 이러한 정보를 얻기 위해서 사람들은 많은 사이트를 찾아다니며 정보를 검색하는 데 시간을 소비하고 원하는 정보를 빠르게 찾을 수 없다. 이러한 문제를 해결하고자 현재 유행하고 있는 질병 현황 정보, 시도별 현황 정보, 마스크 판매처 위치 및 재고, 바이러스 감염자 방문 기록을 확인할 수 있는 등 바이러스 정보를 짧은 시간에 사용자가 원하는 정보를 한 눈에 확인할 수 있도록 각종 사이트에서 데이터를 크롤링하여 가공하여 필요한 정보를 제공하는 반응형웹 시스템을 개발하였다.
Major tomato viruses in Korea are Tomato chlorosis virus (ToCV), Tomato spotted wilt virus (TSWV), Cucumber mosaic virus (CMV), Pepper mottle virus (PepMoV), and Tomato mosaic virus (ToMV). RT-PCR conditions for the viruses were examined, especially in primer set and RT-PCR mixture. Total 46 primer sets from the unique sequence of the viruses were tested for nonspecific background products in a RT-PCR mixture without template. Among them 16 primer sets were applied to healthy tomato RNA, resulting the compatibility between RT-PCR mixture and primer set influenced RT-PCR to reduce nonspecific background products. Based on the combinations among cDNA synthesis parameters and RT-PCR mixtures, two reaction mixtures were finally selected for ToCV detection. The condition allowed to determine more specific primer sets; C029 (ToCV), C072 (TSWV), C070 (CMV), C048 (PepMoV), and C065 (ToMV). These primer sets are expected to be of use to specific detection of the major viruses in tomato plants.
[ $\lceil$ ]한국산 명나방과(Pyralidae)에 관하여는 이미 필자(1976)에 의하여 언급된바와 같이 1889년 영국인 곤충학자 J.H. Leech가 처음으로 9종의 신종을 발표한데 이어 현재까지 300여종이 기록되어 왔다. 그러나 이들의 기록이 여러종류의 발표문에 산재해 있는 상태로 체계적인 정리가 이루어진바 없으며 학명뿐아니라 우리말 이름조차 갖가지로 쓰여지고 있어 곤충명 사용에 혼란이 야기되고 있는 실정이다. 이에 필자는 현재까지 발표되었던 종들을 조사하여 최근의 분류체계에 따라 학명 및 그들의 동의어(Synonym)를 정리함과 아울러 우리말 이름도 먼저 명명된 이름이나 또는 현재 많이 사용되고 있는 이름을 택하여 통일화하고 ( )안에 그 이명을 표시하였다. Evergestiinae(새들명나방아과, 신칭)은 현재까지는 주로 Pyraustinae(들명나방아과)에 포함되는 족(Tribe)으로 취급되어 왔으나 최근의 분류체계에 따라 독립된 아과로 취급하였다. 이들에 대해서는 Leech에 이어 일본인 Shibuya(1927년에 의하여 13종, 박세욱등 (1958, 1969)에 의하여 27종이 새로 기록되는등 1968년에 출판된 한국 동물명집 곤충편에는 94종이 수록되었다. 최근 필자(1976)에 의하여 우리나라 미기록종으로 발표된 24종과 기타 국내외의 문헌을 통한 기록의 근거를 기초로 작성된 이 목록에는 Evergestiinae에 1속 3종, Pyraustinae에 53속 123종이 포함되었으며 학명이 불분명하거나 채집의 근거가 불확실한 4종은 후미에 별도로 기재하였다. 분포란의 괄호안에 명시된 채집지는 필자에 의하여 채집 확인된 종들로서 그들의 표본은 농업기술연구소 곤충연구담당관실 표본실에 소장되어 있다. 다른 아과에 관하여는 정리가 완료되는대로 추후 발표할 예정이다.nemella hengsungica, Aphelenchoides besseyi 등으로 2아목 7과 11종이었다.는 내연가공한 옷생산에 사용되지 않는 것이 타당하겠다. 주아의 즙액에 의해서도 C. amaranticolor에 기계적 전염이 되었다. 7. C. amaranticolor 상에 계통분리된 마늘 모자이크 바이러스의 내열성은 $65^{\circ}-70^{\circ}C$, 희석한계는 $10^{-}2-10^{-3}$, 그리고 보존한계는 2 일이었다. 8. 마늘 모자이크 바이러스의 순화는 2회의 분획원심과 Sephadex gel filtration에 의해서 가능했다. 9. 전자현미경하에서 관찰한 마늘 모자이크 바이러스는 길이 1200-1225mu 폭 10-12mu의 사상이었다. 10. 혈청학적 미량침강 반응법에 의해 마늘잎에서뿐만 아니라 인편과 주아에서도 마늘 모자이크 바이러스의 검정이 가능했다. 11. 우리나라 5개 지방에서 수집한 마늘 종구 150개와 주아 30개에 대해 혈청학적방법으로 마늘 모자이크 바이러스의 감염률을 조사한 결과 $100\%$의 감염률을 보였다. 12. 마늘 모자이크 바이러스와 크기가 근사한 Potato Virus X. Potato virus Y, Potato virus S, Potato virus M 등과의 혈청학적 유연관계를 조사한 바, 마늘 모자이크 바이러스는 이들과 구별되는 다른 바이러스라고 생각된다. 13. 마늘의 모자이크 감염주에서 단일계통으로 분리하여 본 실험에 사용한 바이러스는 마늘의 바이러스 무감염주를 얻을 수가 없기 때문에 직접 마늘잎에 접종해서 모자이크톤의 병원이라는 것을 확인할 수 없었지만, 검정식물상의 반응, 혈청학적반응, 전자현미경적 관찰등의 간접적인 조사 결과로 미루어 미인록의 마늘모자이크 바이러스라고 생각된다
Samples showing yellow mosaic symptom of Lilium spp. with necrotic fleck, stunting, malformation, and colour breaking were collected from lily-growing areas in the southern part of Korea. Two viruses were distinguished under a electron microscope and their host range, serological reaction, stability in sap, type of aphid transmission, and relations with cells and tissues were examined. Broad bean wilt virus (BBWV) was transmitted by sap-inoculation to 23 plant species in 8 families and by the aphid, Myzus persicae. This virus was inactivated after 10 min at 70C, at dilution of $10^{-3}$, and after 6 days at about 20C. Electron microscopic examination of purified preparation showed that the virus is spherical particle of 28nm in diameter. The virus reacted positively with BBWV-antiserum in agar gel diffusion test. In ultrathin sections of BBWV infected tissues, large aggregates or crystalline array of virus particles and vesicular body were found in the cytoplasm, vacuole, and nucleus of mesophyll cells. Cucumber mosaic virus (CMV) was transmitted by sap-inoculation. Electron microscopic examination of its purified preparation showed spherical particles of 30nm in diameter. The virus reacted positively with CMV-Y strain-antiserum in agar gel diffusion test. In ultrathin sections of CMV infected tissues, crystalline array of virus particles were found in the vacuole and a large number 0f virus particles were found in the cytoplasm and the plasmodesmata of mesophyll cells. When each of these viruses was retransmitted to Lilium tigrinum. L. concolor, and L. auratum, BBWV induced slight symtoms and colour breaking, but CMV induced yellowing mosaic or necrotic fleck.
Bovine viral diarrhea virus (BVDV) is an important worldwide disease in the livestock industry. To characterize BVDV circulating in Gyeongbuk province in the Republic of Korea which has the highest cattle population density, 365 rectal swabs from clinically BVDV Korean indigenous calves were collected. Fifty cases were identified as positive for BVDV. A phylogenetic analysis of 5'- untranslated regions (UTR) revealed that most of our cases belonged to BVDV-2a (n = 48), while only two cases were classified as BVDV-1a (n = 1) and 1b (n = 1), respectively. These results indicated that BVDV-2a is the most prevalent subgroup in Korean indigenous calves of Gyeongbuk province.
Cervical carcinoma is the second leading cause of cancer-related deaths in women around the world, and it is associated with the Human Papillomavirus (HPV) infection. HPV genotyping is important for vaccine policy, etiology, natural history, and epidemiology studies. The use of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues for HPV genotyping by reverse blot hybridization assays (REBA) has not been clearly confirmed in retrospective studies. The aim of this study was to evaluate the usefulness and efficiency of FFPE tissues from cervical cancers for HPV genotyping. HPV genotypes were detected in 52 FFPE tissues from cervical carcinoma specimens by REBA. HPV was detected in 32 (61.5%) of 52 specimens from FFPE, among which 27 (84.4%) harbored single infections and 5(15.6%) contained multiple infections. The HPV single infections (27) were analyzed by high-risk type 18(8), 58(6), 16(5), 33(1), 35(1), 39(1), 56(1) and low risk type 11(2), 6(1), 70(1). The HPV multiple infections (5) included 16/18(2), 18/52(1), 16/56(1), 16/18/33(1). Please consider being more specific here. Do you mean the analysis? Please clarify what you mean by "included."Through this study, it has been determined that the FFPE specimen is feasible and can be used in HPV genotyping, as well as in retrospective studies.
The prevalence of bovine viral diarrhea virus (BVDV) in Korean indigenous calves with diarrhea in Gyeongbuk province was investigated. Seventy-five cases were identified as BVDV positive in the diarrhea stools. Phylogenetic analysis revealed that all our cases were classified as BVDV-2a. Most of the present BVDV-2a cases were isolated from calves showing clinical signs of watery diarrhea. Our observations indicate that not all BVDV-2 infections cause clinically severe disease. This study shows the high incidence of BVDV-2 infection in Gyeongbuk province. Therefore, the results suggest that a vaccine development and immunization strategies are required for the effective control of BVDV infection in the Republic of Korea.
Kim, Chun-Ho;Shin, Cha-Gyun;Shin, Kye-Sook;Son, Tae-il
Applied Chemistry for Engineering
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v.10
no.4
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pp.599-602
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1999
Chitosan was depolymerized by using nitrous acid. In order to synthesize new fluorinated chitosan oligomer(FCO) derivative, free amine groups of resulting low molucular weight chitosan oligomers were reacted with trifluoroacetic anhydride. The structure changes in the samples were conformed by using FT-IR, $^{1}H\;NMR$, $^{13}C\;NMR$ and $^{19}F\{^{1}H\}NMR$. Antiviral activity of FCO was studied by measuring DAN amounts of the replication viruses at 36 hr after the cells were infected with the viral solution containing FCO of various concentrations. The viral replications in the cells infected with the viral solution containing FCO were proportionally decreased with the FCO does, compared to those of the control groups, indicating that FCO efficiently inhibits viral infection. In particular, viral replication was decreased to 40% in the 1% FCO-treated cells.
우백혈병 바이러스감염 B 세포주(BL2M3 및 BL312)의 배양상층액에 대한 자기세포들의 증식반응을 검토하였다. 그 결과 BL2M3 및 BL312세포의 배양상층액을 자기세포인 BL2M3세포에 첨가했을 때 농도에 비례하여 현저한 증식을 유도하였다. 이것은 배양 4-5일차, 배양상층액의 첨가농도는 50-60%,세포수는 5x$10^4$-5x$10^{5}$ /ml에서 최적의 증식반응을 보였다. 우태아혈청(FBS) 무첨가 BL2M3 및 BL312세포의 배양상층액에 대해서도 BL2M3세포는 동일한 증식반응을 보였다. 한편 BL2M3 및 BL312세포의 배양상층액을 BL312세포에 첨가했을 때는 BL2M3세포의 경우에 비해 현저하지 않았다. 또한 BL2M3 및 BL312세포의 배양상층액은 말초혈액 림프구에 대해서도 pokeweed mitogen(PWM)첨가 유무에 관계없이 증식을 유도하였다. 그러나 PWM자극 말초혈액 단핵세포의 배양상층액은 BL2M3 및 BL312세포에 대해서 전혀 증식을 유도하지 못했다. 이상의 결과로부터 우백혈병 바이러스감염 B세포주 특히 BL2M3세포는 세포자신이 증식인자를 분비하고 그것과 반응하여 증식하는 소위 autocrine growth 양상을 보이는 것으로 판명되었다.
Group A 로타바이러스 VP6에 특이적으로 반응하는 단크론 항체를 이용하여 로타바이러스 감염이 의심되는 돼지 분변으로부터 로타 바이러스를 검색할 수 있는 효소면역측정법을 개발하였다. 이 효소면역측정법에서는 capture antibody로서 protein A-sepharose를 이용하여 단크론 항체로부터 순수 분리한 immunoglobulin을 사용하였으며 detecting antibody는 토끼 면역혈청으로부터 순수 분리한 immunoglobulin에 biotin을 label하여 사용하였다. 개발된 효소면역측정법의 민감도와 특이성을 전자현미경법 및 형광항체법의 것과 비교하여 보았을 때 서로 유사하였으며 분변재료로부터 로타바이러스를 검색하는데 유용한 것으로 나타났다. 개발된 효소면역측정법은 야외로부터 로타바이러스 검색을 위하여 수집된 많은 양의 분변재료를 실험실내에서 screen하는데 유용하게 사용될 것으로 생각된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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