Purpose: The association of mitochondrial DNA (mtDNA) mutations, deletions and copy number with progressive changes in patients with some glomerular disease and end-stage renal disease have been reported. In this study, we performed mtDNA mutation analysis in children with IgA nephropathy to investigate its role in progressive clinical course. Methods: Seven children with IgA nephropathy were involved in this study. MtDNA isolated from platelet was amplified by PCR and sequenced entirely. Results: The mean age at renal biopsy was $11.5{\pm}2.2$ year and the mean age at latest evaluation was $17.9{\pm}3.2$ year. The mean follow-up period were $7.8{\pm}3.1$ years. Patients was divided into 2 groups according to the amount of proteinuria at presenting manifestation. Group 2 patients were nephrotic syndrome. Renal function reveals within normal range in all patients. In group 2 patients, the mean serum albumin level was significantly lower than those of group 1 ($3.7{\pm}0.6g/dL$ vs. $4.7{\pm}0.2g/dL$, P=0.0241) and the mean total cholesterol level was significantly higher than those of group 1 ($222.7{\pm}35.7mg/dL$ vs. $148.3{\pm}29.1mg/dL$, P=0.0283). In Group 2 patients, total amount of protein of 24 hour collected urine also significantly higher than those of group 1 ($1,466.0{\pm}742.5mg$ vs. $122.5{\pm}48.1mg$, P=0.0135). Pr/Cr ratio in random urine sample was also higher in group 2 than those of group 1 but the statistical significance was not noted ($1.8{\pm}1.6$ vs. $0.2{\pm}0.2$, P=0.0961). Deletion of mtDNA nt 8272-8281 were observed in two patients, one patient in each groups, respectively. This is noncoding lesion. No patients demonstrated the mtDNA mutations. Conclusions: We have identified a deletion of mtDNA nt 8272-8281 in two children with IgA nephropathy. Further studies are needed to clarify the role of mitochondrial function in the progressive change of IgA nephropathy.
Journal of the Korean Institute of Intelligent Systems
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v.24
no.3
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pp.251-258
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2014
The purpose of the neural image analysis is to trace the velocities and the directions of moving mitochondria migrating through axons. This paper proposes an automated technique for detecting axon structure. Previously, the detection process has been carried out using a partially automated technique combined with some human intervention. In our algorithm, a consolidated image is built by taking the maximum intensity value on the all image frames at each pixel Axon detection is performed through vessel enhancement filtering followed by a peak detection procedure. In order to remove errors contained in ridge points, a filtering process is devised using a local reliability measure. Experiments have been performed using real neural image sequences and ground truth data extracted manually. It has been turned out that the proposed algorithm results in high detection rate and precision.
A polarograph with specially designed cell compartment usable in kinetic study of the mitochondrial respiration of a small sized sample was made, and its performance and experimental conditions were examined. An applied potential (ca-1.2V vs. SCE) which gives rise to the second step reduction of oxygen caused a considerable level of a residual current independent of oxygen, which is temporarily interpreted as the reduction current of the membrane-bound redox material(s) of mitochondria. A potential corresponding to the first slop reduction of oxygen (ca-0.4V vs SCE) did not produce the residual current. Thus, it is suggested that a measurement of oxygen concentration in a sample of mitochondria and submitochondrial particles by using dropping mercury electrode should be done with an applied potential of about -0.4V vs SCE. Consumption of oxygen by mitochondria was observed to follow practically zero order kinetics. Its rate constant exhibited the proportional relationship with the respiratory activity of mitochondria. Usefulness of tile instrument was properly demonstrated in the work on the temperature effect on the respiration of mitochondria isolated from several plant 4issues which were selected on the basis of chilling susceptivity.
Kim, Young-Ja;Kim, Il-Chan;Lee, Se-Young;Lee, Wan-Ok;Cho, Yong-Chul;Lee, Jae-Seong
Korean Journal of Ecology and Environment
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v.36
no.3
s.104
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pp.221-234
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2003
Phylogenetic studies would clarify the diversity of fishes if the morphological analysis based on plesimorphy characters combined with new genetic analysis on molecular level, inferring more accurate and objective phylogeny and the taxonomy. Current molecular phylogenetic approach using mitochondrial genome provides the framework for a new hypothesis not only inferring the relationships between ancestor descendants but raveling the intra-, interspecies variation.
Kim, Dong-Yeon;Yu, Kook-Hyun;Bom, Hee-Seung;Min, Jung-Joon
Nuclear Medicine and Molecular Imaging
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v.41
no.6
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pp.561-565
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2007
Purpose: Lipophilic cations including tetraphenylphosphonium (TPP) salts penetrate the hydrophobic barriers of the plasma and mitochondrial membranes, resulting in accumulation in mitochondria in response to the negative inner transmembrane potentials. The development of radiolabeled phosphonium cations as a noninvasive imaging agent may serve as a new molecular "voltage sensor" probe to investigate the role of mitochondria in the pathophysiology and diagnosis of cancer. Materials and Methods: We have synthesized a reference compound (4-fluorophenyl)triphenylphosphonium (TPP) and a labeled compound $[^{18}F]$TPP via two step nucleophilic substitution of no-carrier-added $[^{18}F]$fluoride with the precursor, 4-iodophenyltrimethylammonium iodide, in the presence of Kryptofix-2.2.2 and $K_2CO_3$. Result: The reference compound (4-fluorophenyl)triphenylphosphonium (TPP) was synthesized in 60% yield. The radiolabeled compound $[^{18}F]$TPP was synthesized in $10\sim15%$ yield. The radiochemical purity of the $[^{18}F]$TPP was $95.57{\pm}0.51%$ (n=11). Conclusion: $[^{18}F]$TPP was successfully synthesized that might have a potential to be utilized as a novel myocardial or cancer imaging agent for PET. However, it is required to improve the radiochemical yield to apply $[^{18}F]$TPP in preclinical or clinical researches.
Alternative initiation codon(AlC) has been reported in the mitochondrial genes in various mammalian species. We investigated the AlC of mitochondrial NADH dehydrogenase 2 gene(rntDNA ND2) in five pig breeds. Two kinds of initiation codons(ATA/ATf) showing different frequencies among tested pig breeds were used. While all Large White pigs had ATA as an initiator methionine codon, all Landrace pigs had ATf. The other breeds(Berkshire, Duroc and Hampshire) had both initiation codons with the ATA frequencies, 91.9, 21.3 and 60.00/0, respectively. In the previous reports, all Chinese indigenous pig breeds were identified to have unique initiation codon ATA. Although the effect of Ale on the translation of mtDNA ND2 has not been studied in this study, AlC patterns in mtDNA ND2 will contribute to the maternity test using molecular markers in pig breeding.
Ultrastructural changes of the pericarp in Citrus reticulata has been investigated during hesperidium abscission. The pericarp was composed of compactly arranged parenchyma cell layers during early stages of fruit development. The outermost exocarp was green and active in photosynthesis. However, cells in the exocarp soon changed into collenchyma cells by developing unevenly thickened walls within a short time frame. As the fruit approached maturation, the chlorophyll gradually disappeared and chloroplasts were transformed into carotenoid-rich chromoplasts. In the mature fruit the exocarp consisted of large, lobed collenchyma cells with primary pit fields and numerous plasmodesmata. The immature mesocarp was a relatively hard and thick layer, located directly under the exocarp. With development, the deeper layers of the exocarp merged into the white, spongy mesocarp. Before separation of the hesperidium from the plant, some unusual features were detected in the plasma membrane of the exocarp cells. The number of small vacuoles and dark, irregular osmiophilic lipid bodies also increased enormously in the exocarp collenchyma after the abscission. They occurred between the plasma membrane and the wall, and invaginated pockets of the plasma membrane containing double-membraned vesicles were also frequently noticed. The lipid bodies in the cytoplasm were often associated with other organelles, especially with plastids and mitochondria. The plastids, which were irregular or amoeboid in shape, contained numerous large lipid droplets, and occasional clusters of phytoferritin, as well as few loosely -oriented peripheral lamellae. Myelin-like configurations of membrane were frequently observed in the vacuoles, as was the association of lipid bodies with the vacuolar membrane. Most vacuoles had an irregular outline, and lipid bodies were often connected to the tonoplast of the vacuoles. The structural changes underlying developmental, particularly to senescence, processes in various hesperidium will be reported in the separate paper.
Journal of The Korean Society of Inherited Metabolic disease
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v.15
no.2
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pp.98-100
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2015
Short-chain acyl-CoA dehydrogenase (SCAD) deficiency is a rare mitochondrial fatty-acid oxidation disorder that is inherited as an autosomal recessive pattern. SCAD deficiency is caused by mutations in the ACADS gene (Acyl-CoA Dehydrogenase, Short-chain, OMIM #606885), which encodes SCAD, the mitochondrial enzyme that catalyzes the first reaction in the beta-oxidation of fatty acids four to six carbons in length. Here, we describe one Korean pediatric case of SCAD deficiency, which was diagnosed during newborn screening through tandem mass spectrometry. An increased concentration of butyrylcarnitine was detected on the newborn screening test, and the urine organic acid analysis showed increased urinary excretion of ethylmalonic acid. The patient has been asymptomatic and has shown normal growth and development by 8 months of age without any intervention during follow-up period.
Park, Sang-Joon;Ryu, Young-Hoon;Jeon, Tae-Joo;Kim, Jai-Keun;Nam, Ji-Eun;Yoon, Pyeong-Ho;Yoon, Choon-Sik;Lee, Jong-Doo
The Korean Journal of Nuclear Medicine
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v.32
no.6
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pp.490-496
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1998
Purpose: We evaluated brain perfusion SPECT findings of MELAS syndrome and mitochondrial myopathy in correlation with MR imaging in search of specific imaging features. Materials and Methods: Subjects were five patients (four females and one male; age range, 1 to 25 year) who presented with repeated stroke-like episodes, seizures or developmental delay or asymptomatic but had elevated lactic acid in CSF and serum. Conventional non-contrast MR imaging and Tc-99m-ethyl cysteinate dimer (ECD) brain perfusion SPECT were Performed and imaging features were analyzed. Results: MRI demonstrated increased T2 signal intensities in the affected areas of gray and white matters mainly in the parietal (4/5) and occipital lobes (4/5) and in the basal ganglia (1/5), which were not restricted to a specific vascular territory. SPECT demonstrated decreased perfusion in the corresponding regions of MRI lesions. In addition, there were perfusion defects in parietal (1 patient), temporal (2), and frontal (1) lobes and basal ganglia (1) and thalami (2). In a patient with mitochondrial myopathy who had normal MRI, decreased perfusion was noted in left parietal area and bilateral thalami. Conclusion: Tc-99m ECD SPECT imaging in patients with MELAS syndrome and mitochondrial myopathy showed hypoperfusion of parieto-occipital cortex, basal ganglia, thalamus and temporal cortex, which were not restricted to a specific vascular territory. There were no specific imaging features on SPECT. The significance of abnormal perfusion on SPECT without corresponding MR abnormalities needs to be evaluated further in larger number of patients.
Journal of The Korean Society of Inherited Metabolic disease
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v.15
no.1
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pp.35-39
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2015
Medium-chain acyl-CoA dehydrogenase (MCAD) deficiency is the most common mitochondrial fatty acid oxidation disorder which is inherited as an autosomal recessive pattern. MCAD deficiency is caused by mutations in the ACADM gene; medium-chain acyl-CoA dehydrogenase gene (ACADM; OMIM 607008) on chromosome 1p31 which encodes MCAD, the mitochondrial enzyme which catalyzes the first reaction in beta-oxidation of fatty acids with medium-chain length. Here, we describe one Korean pediatric case of MCAD deficiency, which was diagnosed during newborn screening by tandem mass spectrometry and confirmed by molecular analysis. The level of hexanoyl (C6), octanoyl (C8), decenoyl (C10:1) carnitine, and C8/C2 ratio was elevated. Homogenous c.1189T>A (p.Tyr397Asn) mutation of ACADM gene was identified by direct sequencing. He has been asymptomatic and has shown normal growth and development by 25 months of age without any intervention. There was no episode of metabolic acidosis during follow-up period.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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