• Journal of KIISE
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• v.43 no.10
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• pp.1073-1078
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• 2016

(${\delta}$, ${\gamma}$)-matching for strings over integer alphabets can be applied to such fields as musical melody and share prices on stock markets. In this paper, we define ${\delta}$-approximate periods and ${\gamma}$-approximate periods of strings over integer alphabets. We also present two $O(n^2)$-time algorithms, each of which finds minimum ${\delta}$-approximate periods and minimum ${\gamma}$-approximate periods, respectively. Then, we provide the experimental results of execution times of both algorithms.

• Journal of KIISE
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• v.44 no.8
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• pp.760-766
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• 2017

Repetitive strings have been studied in diverse fields such as data compression, bioinformatics and so on. Recently, two problems of approximate periods of strings over integer alphabets were introduced, finding minimum ${\delta}-approximate$ periods and finding minimum ${\gamma}-approximate$ periods. Both problems can be solved in $O(n^2)$ time when n is the length of the string. In this paper, we present two parallel algorithms for solving the above two problems in O(n) time using $O(n^2)$ threads, respectively. The experimental results show that our parallel algorithms for finding minimum ${\delta}-approximate$ (resp. ${\gamma}-approximate$) periods run approximately 19.7 (resp. 40.08) times faster than the sequential algorithms when n = 10,000.

• KIPS Transactions on Software and Data Engineering
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• v.2 no.2
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• pp.119-122
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• 2013

Repetitive strings such as periods have been studied vigorously in so diverse fields as data compression, computer-assisted music analysis, bioinformatics, and etc. In bioinformatics, periods are highly related to repetitive patterns in DNA sequences so called tandem repeats. In some cases, quite similar but not the same patterns are repeated and thus we need approximate string matching algorithms to study tandem repeats in DNA sequences. In this paper, we propose a new definition of approximate periods of strings based on distance sum. Given two strings $p({\mid}p{\mid}=m)$ and $x({\mid}x{\mid}=n)$, we propose an algorithm that computes the minimum approximate period distance based on distance sum. Our algorithm runs in $O(mn^2)$ time for the weighted edit distance, and runs in O(mn) time for the edit distance, and runs in O(n) time for the Hamming distance.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 1998.10b
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• pp.670-672
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• 1998

반복되는 형태의 문자열은 많은 분야에서 연구되고 있다. 반복적인 문자열 형태의 한 종류인 주기(period)는 주어진 문자열을 x라 할 때, x가 pn의 접두어(prefix)가 되는 p를 말한다. 본 논문에서는 근사주기(approximate period)의 개념을 제시하고, 길이가 각각 n, m인 두 문자열 x, p가 주어졌을 때, p가 x의 근사주기가 되는 최소의 오차를 O(m2n) 시간에 찾는 알고리즘을 제시한다.

• Journal of KIISE:Computing Practices and Letters
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• v.16 no.6
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• pp.742-746
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• 2010

In this paper, we propose new randomness testing methods based on approximate periods in order to improve the previous randomness testing method using exact pattern matching. Finding approximate periods of random sequences enables us to search similarly repeated parts, but it has disadvantages since it takes long time. In this paper we propose randomness testing methods whose time complexity is O($n^2$) by reducing the time complexity of computing approximate periods from O($n^3$) to O($n^2$). Moreover, we perform some experiments to compare pseudo random number generated by AES cryptographic algorithms and true random number.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2003.05a
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• pp.367-370
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• 2003

과학자나 공학자들은 빛이나 소리와 같이 주기적인 특성을 갖는 현상을 연구하는 경우가 많다. Fourier 변환은 이러한 주기함수의 근사 함수를 구할 때 유용하게 이용되고 있다. 본 논문에서는 극좌표 표현되는 함수의 근사 함수를 구하는 문제를 다룬다 일반적으로 컴퓨터 상에 구현하기 위해서는 이산형 Fourier 급수전개를 이용하는데 지금까지는 근사 함수를 컴퓨터 상에서 구할 때 이산화 표본수를 경험에 의해 임의로 결정하여 이용하였으나 본 연구에서는 Fourier 변환의 성질을 이용하여 주어진 함수에 따라 필요한 이산화 표본 수를 자동적으로 결정하는 알고리즘을 제안한다.

• Journal of Korean Society of Industrial and Systems Engineering
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• v.20 no.43
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• pp.119-126
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• 1997

본 논문에서는 제품을 생산하는 도중에 생산체계의 상태가 관리상태에서 이상상태로 전이될 수 있는 불완전한 생산체계에 있어서의 경제적 생산주기 결정모형을 다룬다. 생산체계가 관리 상태에 머무는 생산시간이 지수분포를 따른다는 가정하에서 전체 현금흐름의 현재가치를 생산 주기의 함수로 유도하고, 이 함수를 최대화하는 경제적 생산주기의 근사해를 구한다. 근사해에서 출발하여 최적해를 찾아 내는 간단한 알고리즘을 개발하고, 이를 적용한 수치예를 보인다.

• Proceedings of the Korean Society for Noise and Vibration Engineering Conference
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• 1994.04a
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• pp.134-147
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• 1994

고차근사가 혼돈응답에 미치는 영향을 조사하기 위하여 비선형문제의 전형인 탄성진자계를 집중적으로 조사하였다. 조화가진력을 가진 탄성진자계는 비자율계(원래계)로 나타나는데 다중시간법을 사용하여 이 계를 이차근사에 의한 자율계 (근사화계)로 변환하였다. 점근해의 초기조건에 대한 민감도의 척도인 Lyapunov 지수를 통하여 비교해 본 결과, 이차근사에 의한 근사화계가 일차근사에 의한 근사화계보다 원래계를 더 잘 반영하고 있음을 확인하였다. 이로써 고차근사가 정상상태 주기응답 뿐만 아니라 혼돈응답을 더 정확하게 예측하는 데도 유용함을 알 수 있었다.

• Journal of KIISE:Computer Systems and Theory
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• v.29 no.1
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• pp.16-21
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• 2002

Repetitive strings have been studied in such diverse fields as molecular biology data compression etc. Some important regularities that have been studied are perods, covers seeds and squares. A natural extension of the repetition problems is to allow errors. Among the four notions above aproximate squares and approximate periodes have been studied. In this paper, we introduce the notion of approximate covers which is an approximate version of covers. Given two strings P(｜P｜=m) and T(｜T｜=n) we propose and algorithm with finds the minimum distance t such that P is a t-approximate cover of T. The algorithm take O(m,n) time for the edit distance and $O(mn^2)$ time of finding a string which is an approximate cover of T is minimum distance is NP-complete.

• Proceeding of EDISON Challenge
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• 2014.03a
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• pp.211-224
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• 2014

금속을 포함한 분자에 대한 양자계산은 정확하고 일관된 결과를 얻기가 힘들 뿐만 아니라 상당한 컴퓨터 자원을 소비하며 많은 시간이 소요된다. 본 연구에서는 복잡한 양자계산의 근사를 위한 방법으로 본래 정성적인 구조 예측에 사용되는 닮은 궤도함수분석(Isolobal Analysis)을 정량적인 측면에서 접근해보고, 이를 통해 닮은 궤도(Isolobal) 구조를 가지고 있는 단위들(radical 등)에 대해서 계산을 근사할 수 있는 방법에 대해 논의한다. $CH_3$, $CH_2$와 닮은 궤도 구조를 가진 전형 원소를 중심으로 하는 분자들에 대해 가장 기초적인 근사계산인 Hartree-Fock 양자계산을 수행하였다. $(CUH_5){_2}^{2-}$를 표적으로 결합 구조를 예측하기 위한 경향성을 계산한 결합 성질로부터 파악한다. 분석 결과 동일한 주기에 대해서는 원자반지름(Atomic radii)에 대해 조화 형태의 결합에너지가 얻어졌으며, 동일한 족에 대해서는 좋은 근사가 되지 않았다. 파악된 경향성을 바탕으로 금속의 결합을 근사한 에너지에 대해서는 -1054.1875 kJ/mol로 비교적 큰 오차를 보였으나, 오차 항에 대한 분석이 가능해 추가적인 계들에 대한 계산으로 근사를 교정할 수 있을 것으로 보인다.