우유의 지방분해 효소인 리파제를 분리 연구하기 위하여 홀몬처리 되지 않은 정상유와 홀몬 처리된 비정상유에서 리파제를 Heparin-Sepharose-CL-6B를 이용하여 분리 정제하였다. Heparin-Sepharose에 친화력을 조사한 결과 두 개의 효소활성이 있는 성분이 구분되었으며 한 성분은 Heparin-Sepharose-CL-6B에 결합되었고 다른 한 성분은 결합되지 않은 채 분리되었다. 친화성 크로마토그램에 결합되어 분리 정제된 리파제의 최적 온도, 최적 pH, 기질 특이성, 분자량 및 BSA의 활성제로서의 작용등 여러 가지 효소특성은 모두 동일한 것으로 나타났다. 그러나 홀몬처리된 소에서 얻은 우유의 경우에는 또 다른 호소활성 성분이 나타나 있음을 알았다. 이 lipolytic activity가 있는 성분은 Heparin-Sepharose-CL-6B에 친화력을 보이지 않았으므로 정상적인 milk lipase와는 구별된다. 따라서 홀몬처리된 소에서 얻은 우유에 함유된 성분중 Heparin-Sepharose에 결합된 효소는 유지방 자동산화에 영향을 끼치지 않으며 Heparin-Sepharose에 결합되자 않은 활성이 있는 성분은 자동산패에 영향을 크게 미친다고 볼 수 있다. 그 이유는 hormone의 불균형 상태로 인하여 생유에 자동산패가 일어날 수 있으며 이것은 비정상적으로 분비된 리파제 출현 사이에 연관관계가 있음을 의미한다.
ras oncogene은 암조직이나 transformed human cell line에서 거의 공통적으로 발견되는 oncogene으로서 그 product인 p2l 단백질은 C-terminal 25개의 아미노산 외에는 거의 동일한 배열을 가지고 있는 매우 conservative한 단백질이며 C-terminal cysteine이 carboxy methylation되어 있고 또한 palmitic acid와 같은 long chain fatty acid도 결합되어 있다. 보고된 바에 의하면 p21 protein의 palmitation은 ras protein의 세포막에 대한 친화력을 유지시키며 이와 같은 친화력은 cell transforming activity의 기본요건으로 알려져 있다. 이와 같은 관점에서 볼때 p21 단백질의 C-terminal processing현상을 new drug target으로, 즉 p2l 단백질의 C-terminal processing을 억제하므로서 cell transforming activity를 저해 할 수 있을 것이므로 생체내에 존재하는 p21 단백질 C-terminal processing 억제제의 identification 및 purification은 항암제 연구와 밀접한 관계가 있다. 구체적으로 farnesyl-protein transferase inhibitor 혹은 carboxyl methyl inhibitor의 identification 및 purification은 이같은 목적을 달성 할 수 있는 가능성이 크다.
천연색소 Brazilin 및 Hematoxylin의 BSA에 대한 결합 특성을 fluorescence probe 법을 이용하여 측정하였다. Brazilin 및 Hematoxylin은 BSA에 대해 강한 결합 친화력을 보였으며 Hematoxylin은 Brazilin 보다 더 강한 결합력을 보였다. Brazilin 및 Hematoxylin의 농도 증가에 따라 결합상수는 감소하였으며, 이는 probe-단백 결합체와 양화합물간의 상호작용 또는 Probe와 양화합물간의 결합체 형성에 기인하는 것으로 추정되었다. 양화합물과 BSA의 결합은 pH 및 이온강도에 의존적이었으며, 이 결합에는 electrostatic force 및 hydrophobic force 가 관여하는 것으로 추정되었다.
PKR인산화효소의 억제인자로서 밝혀진 이중선RNA결합단백질 (RBF)의 RNA결합특이성을 정기영도에 의한 RNA 이동변화실험과 여과막결합도실험에 의해 측정하였다. RBF는 바이러스RNA나 stem/loop구조를 지니는 합성 RNA들에 대한 다양한 친화력을 지니는 것으로 나타났으며 충분한 GC가 포함된 11염기쌍으로 이루어진 RNA stem helix RBF가 결합하기 위한 최소한의 RNA구조로 제시되고 있다. 자연적 RNA구조에 대한 RBF의 결합은 poly(I) : poly(C)의 첨가에 의해 반전되었으며 E. coli 5S RNA경우는 효과를 거의 나타내지 않았다.
돼지 페르몬성 분자를 탐색하기 위하여 일련의 green odorant로서 기질 분자인 2-(Cyclohexyloxy)tetrahydrofurane 유도체들의 정량적인 구조와 수용체인 porcine odorant binding protein(pOBP) 사이의 결합 친화력 상수($p(Od)_{50}$)에 대한 비교 분자 유사성 지수 분석(CoMSIA)을 실행하였다. 가장 양호한 CoMSIA 모델(I-AI)은 기질 분자내 입체 중심의 절대 배열이 $I:\;C_{1'}(R),\;C_2(S)$인 분자를 atom based fit 정렬하였을 경우의 입체장 조건에서 유도되었으며 PLS 분석 결과, 예측성이 ${r^2}_{cv.}(q^2)=0.856)$ 그리고 적합성이 ${r^2}_{ncv.}=0.964)$ 이었다. 모델의 CoMSIA 등고도 상, pOBP와 냄새 분자 사이의 상호작용으로부터 가장 높은 결합 친화력을 나타내는 분자의 구조적 특정들을 이해할 수 있었다.
본 연구에서는 trypsin을 모델 단백질로 하여 단백질 본연의 환성을 유지할 수 있는 고정화 방법을 찾기 위하여 공유결합방법과 친화력 결합방법을 이용하여 trypsin을 고정화 하였다. Streptavidin-biotin system을 이용한 고정화 방법은 bioactivity 유지측면에서 공유결합 방법보다 우수함을 확인하였다. 하지만 streptavidin-biotin system을 이용하였을 때 고정화 수율이 낮은 것은 해결해야 할 과제이다. 분자량이 다른 기질들(BAPNA, insulin, BSA)을 대상으로 고정화 trypsin의 부위 특이적 절단 특성을 분석한 결과 streptavidin-biotin에 의해 고정화된 trypsin이 절단효율도 높고 sequence coverage도 높은 것으로 확인되었다. 또한 공유결합된 trypsin은 견고한 분자구조를 나타낸 반면 streptavidin-biotin system으로 고정화된 trypsin은 유연성이 높은 것을 QCM-D를 이용하여 관찰할 수 있었다. 따라서 streptavidin-biotin system에 의한 고정화 방법에서 streptavidin-biotin 결합이 일종의 spacer arm 역할을 하면서 고정화된 trypsin의 분자유연성을 향상시켜 절단반응의 부위특이성과 절단수율을 향상시키는 것으로 판단되었다.
유전에 의해 비만증을 타고나는 비만쥐 (ob/ob mouse)의 간으로 부터 유리된 세포막과 핵의 $L-triiodothyronine(T_3)$ 결합 능력이 그들과 한 배에서 태어난 정상 체중의 쥐들의 것들과 비교되었다. 세포막이 hypotonic 용액과 discontinuous sucrose density를 사용하여 원심분리기로 분리되었으며, 세포 각 부분의 marker enzyme들의 activity로 세포막의 순도가 측정되었다. 핵은 $Triton{\times}100$를 사용하여 윈심분리기로 얻어졌다. $T_3$ 수용체의 Bmax(최대결합용량)와 Kd(dissociation constant)가 세포막 혹은 핵을 여러 농도의 $^{125}I-T_3$와 함께 일정시간 incubation 시킨 후, 그 binding이 reverse Scatchard analysis에 의하여 계산하여 얻어졌다. 모든 실험과정은 비만쥐와 정상쥐에 대하여 평행으로 진행되었다. 간 핵의 $T_3$ 수용체의 최대결함용량은 비만쥐가 정상 체증의 쥐 보다 유의적으로 적었으나(p<0.001), $T_3$에 대한 친화력에는 차이가 없었다. 이는 이전의 보고들의 결과를 확인해 주는 것이다. 세포막에 있는 $T_3$ 수용체의 최대결합 능력과 친화력은 비만쥐와 정상쥐 간에 유의적인 차이가 없는 것으로 밝혀졌다. 이는 비만쥐의 세포막에 있는 $T_3$수용체의 기능에는 결함이 없음을 나타내며, 비만쥐의 말초조직에서 손상된 갑상선 홀몬의 작용은 세포막 수용체에 결합한 이후에 일어나는 과정에 원인이 있다는 것을 의미하고, 따라서 핵에 있는 $T_3$수용체의 결함이 비만쥐 (ob/ob mouse)의 비만증의 근본적인 원인일 수 있다는 제안을 뒷받침하여 주고 있다.
protein phosphatase 2A는 bovine brain homogenate의 세포질 fraction에서 얻어졌다. 기질로서 인산화된 histione H1을 이용하여 측정한 phosphatase 의 활성은 dipalmitoyIphophatidylcholine(DPPC) 혹은 phosphatidylserine/DPPC의 혼합물로 구성된 liposome의 존재하에서 저해되었다. Protein phosphatase 2A의 lipid membrane에의 결합은 다중층 지질막의 혼합물 계에서 liposome 의 양이 증가함에 따라서 상등액 중의 phosphatase의 활성이 감소하는 것으로 확인할 수 있었다. 또한 [$^{125}I$]protein phosphatase 2A가 liposome과 동시에 용출되는 것으로도 확인되었다. 그러나 liposome에 대한 protein phosphatase의 친화력은 높지 않았다. 한편, okadaic acid와 liposome은 협동으로 phosphatase의 활성을 감소시켰다. 이것은 okadaic acid가 lipid membrane이나 membrane에 결함한 phosphatase에는 결합하지 않는다는 것을 의미한다. 그러므로 lipid membrane에 의한 protein phosphatase 2A의 활성 저해 효과는 phosphatase 2A와 lipid membrane과의 결합에 의한 것이라고 설명될 수있다.
암의 성장과 신생혈관 억제인자로 알려진 thrombospondin-1의 생합성은 다양한 외부자극에 대해 전사단계에서 세포 특이적으로 조절된다. 이전의 연구에서 본 연구자들은 PMA가 정상 돼지 대동맥 내피세포(PAE)에서는 TSP-1의 발현을 감소시키는 반면 사람 간암 세포주인 Hep3B에서는 증가시키는 사실을 발견하였다. PMA 처치에 따른 정상 돼지 대동맥 내피세포에서의 TSP-1의 발현 감소현상은 tsp-1 유전자 조절부위의 염기서열 -767과 -723사이에 존재하는 염기서열이 억제 부위임을 밝혀 이러한 결과를 바탕으로 -767에서 -723 염기서열을 서로 부분 중복되도록 세 종류의 올리고 탐식자 (올리고 탐식자 a-1, -767∼-738; 올리고 탐식자 a-2, -759∼-730; 올리고 탐식자 a-3, -752∼723)를 제작하여 -767과 -723 부위의 특정 염기서열과 이에 결합하는 인자를 EMSA을 수행하여 분석하였다. 실험 결과, PMA 처치에 따른 정상 돼지 대동맥 내피세포에서의 TSP-1 감소는 -752에서 -730 사이의 염기서열이 저해 조절인자와 결합함과 더불어 -767에서 -760과 -752에서 -730 사이의 염기서열들에 촉진 조절인자들이 결합하지 못함으로서 기인된다는 실험적 사실을 관찰하였고. 특히, PMA 처치는 정상 돼지 대동맥 내피세포에서 저해 조절인자의 -752에서 -730 부위에 대한 친화력을 향상시켰으며 이러한 친화력은 c-Jun 항체에 의해 영향을 받지 않았다.
제5인자와 지질막 phosphatidylserine과의 상호작용은 prothrombinase 복합체의 활성을 조절하는데 중요하다. 본 연구에서 제5인자의 지질 결합부위에 위치한 Trp2063과 Trp2064를 동시에 돌연변이 시킨 재조합 제5인자를 과발현 시키고 정제하였다. 돌연변이된 제5인자는 1-10%의 phosphatidylserine을 포함하는 지질막에서 아주낮은 활성을 보였다. surface plasmon resonance에 의해서 지질막과의 결합을 측정한 결과 돌연변이된 제5인자가 본래의 제5인자보다 고정된 지질막에의 결합이 현저하게 떨어지는 것을 관찰하였다. 제5인자가 phosphatidylserine을 포함하는 지질막에 높은 친화력으로 결합하기 위해서는 Trp2063과 Trp2064가 필수적이고 이러한 상호작용은 생리적인 phosphatidylserine 농도를 포함하는 지질막 위에서 prothrombinase 복합체의 형성에 필요하다는 결론을 내렸다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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