• Proceedings of the IEEK Conference
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• 2003.07d
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• pp.1569-1572
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• 2003

최근 생명공학 분야의 기술이 혁신적으로 발달함에 따라 게놈 프로젝트가 본래 계획보다 2년 앞당겨져 2003 년 4 월 인간 유전자의 완전한 서열을 밝히고 성공적으로 완료됨으로서 관련 연구자들은 인간의 유전자에 대한 대량의 서열 데이터를 얻게 되었다. 그래서 게놈 프로젝트의 다음 단계로서 엄청난 양의서열 정보 분석으로부터 유전자의 기능을 파악하고자 하는 연구들이 이미 세계적으로 활발히 진행되고 있다. 이러한 연구들의 최종적 목표는 질병 치료와 생명연장의 실현이라고 볼 수 있다. 유전자 연구를 위해선 우선 일차적으로 유전자 부위를 파악해야 한다. 유전자는 구조적으로 다시 여러 부분으로 나뉘는데 유전자 발현의 개시에 매우 중요한 요소 중 하나가 바로 프로모터 (Promoter) 이다. 프로모터 내에는 TATA box 가 있는데 이는 프로모터의 핵심 요소이다. 프로모터는 생명체의 종 그리고 RNA 중합효소의 종류에 따라 다르다. 이 논문에서는 다양한 신경망 알고리즘 중의 하나인 Backtpropagation 을 이용하여 밝혀지지 알은 서열에서 인간을 포함하는 원핵생물의 프로모터 서열을 예측할 수 있는 방법을 얻었기에 소개하고자 한다.

• Proceedings of the KSAR Conference
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• 2003.06a
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• pp.40-40
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• 2003

형질전환체 제작 시 발현벡터가 삽입되는 위치에 따라 발현 또는 억제되는 현상인 ‘position effect(위치효과)’를 극복하기 위해 Matrix Attachment Region(MAR)을 포함하는 발현벡터를 제작하였다 MAR는 핵 기질(nuclear matrix) 부착 부위로 발현조절에 관여하는 전사인자 등이 존재하는 핵 기질 부착부위로, 삽입된 발현벡터가 전사활성을 할 수 있는 게놈 환경을 제공해 주어 형질전환 유전자 발현을 향상시켜 준다고 보고되고 있다. 본 연구에서는 사람에서 이미 분리되어 염기서열이 밝혀진 MAR를 PCR로 증폭하였다. 증폭된 1,270 bp의 human alpha-1-antitrypsin MAR와 1,080 bp human corticosteroid binding globulin promoter MAR를 T vector에 클로닝하여 염기서열을 확인했으며 발현벡터 클로닝에 사용하였다. 유용 유전자와 세포 형질전환에 사용할 선별 유전자로 neo를 포함하며, 그 외 벡터골격은 pGL3 control vector를 사용하여 기본 발현벡터를 제작하였다. 이 벡터에 MAR를 5', 3' 양쪽 또는 한쪽만 포함하도록 클로닝하였다. 이는 MAR의 위치에 따른 게놈내 삽입 및 발현효과를 확인하여 형질전환동물 생산용 발현벡터로 활용하고자 한다.

• KOREAN POULTRY JOURNAL
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• v.33 no.3 s.377
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• pp.104-106
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• 2001

작년 6월에 인간 유전자 지도의 초안이 작성된 이후 지난 2월 11일에 신문과 방송은 사람이 게놈지도가 완성되었다고 주요뉴스로 보도하였다. 1990년 8월에 인간게놈 연구계획이 발표된지 11년여간의 연구 끝에 이룩한 연구결과이다. 최근, 학문의 급속한 발전으로 질병의 진단과 치료에 새로운 지평이 열리고 있다 수의분야에서도 예외는 아니다. 특히 질병예방에 있어 중요한 백신의 연구개발에 있어서도 괄목할 만한 발전이 있었다. 유전공학의 발전과 여러 병원체의 병원성 인자와 체내의 면역기능과의 관련성 연구결과로 여러질병이 백신으로 예방이 가능하게 되었으며 보다 안전하고 효과적인 새로운 개념의 백신도 개발되고 있다. 새로운 백신, 즉 신백신은 유전자 조작(재조합)에 의한 병원성이 약해진 백신에서부터 여러 질병을 동시에 예방하려고 공안된 벡터백신, 그리고 유전자를 접종하는 DNA 백신 등이 대표적이다. 이들 백신은 기존백신에 사용되고 있는 백신보다 안전하고 경제적이며 우수한 효능을 발휘하도록 고안되고 있다.

• Annual Conference of KIPS
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• 2002.04b
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• pp.1183-1186
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• 2002

DNA 의 염기서열 탐색을 위한 유전체학의 다음 세대인 구조유전체학은 유전체 사업으로 인한 인간 게놈지도의 완성과 축적된 생물정보를 이용한 생물정보학의 발달과 함께 급속한 성장을 계속하고 있다. 포스트 게놈 시대를 맞이하여 생명현상에 대한 궁극적인 이해를 위한 노력으로 단백질의 구조와 기능에 대한 연구가 주목을 받게 되었다. 다양한 구조 규명을 위한 도구들과 단백질 정보를 관리하기 위한 데이터베이스 구축에 따른 관련 기술의 발전은, 앞으로 다가올 생물정보의 방대함을 감안할 때, 가치 있는 지식정보를 얻기 위한 데이터 마이닝 기법들을 통해서만 가능하다. 본 논문은 데이터 마이닝의 근간 기술인 연관규칙 마이닝을 응용한 효율적인 서열 연관 규칙 알고리즘을 제안하며, 단백질 구조의 예측을 위한 단백질 서열 및 DNA 서열간의 패턴 비교 및 연관성을 목적으로 한다. 또한, 공간적 시간적 복잡성을 CMS-tree 라는 자료구조를 통해 알고리즘의 확장성 및 병렬화의 기본 알고리즘으로 사용하도록 개발하였다.

• The Korean Publising Journal, Monthly
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• s.205
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• pp.6-6
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• 1997

이데올로기로 양분됐던 동서구도가 무너지면서 과학기술이 새로운 국제질서로 부상하고 있다. 과학기술 개발의 변화는 한바탕 격동기임을 실감케 한다. 정보통신기술은 국가정책으로 두드러진 성장세를 보이고 인체게놈계획에 따른 생물기술의 관심이 활성화될 전망이다.

• Proceedings of the Korean Society of Plant Biotechnology Conference
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• 2004.10a
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• pp.143-143
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• 2004

• The Journal of the Korean dental association
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• v.39 no.11 s.390
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• pp.962-974
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• 2001

• Proceedings of the Botanical Society of Korea Conference
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• 2001.04a
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• pp.7-7
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• 2001

• Korean Journal of Microbiology
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• v.51 no.3
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• pp.194-198
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• 2015

Enterococcus faecalis is a Gram-positive and facultative anaerobic bacterium that causes many hospital-acquired infections. Novel E. faecalis specific bacteriophage (phage) ECP3 that had been isolated from thirty-four environmental samples and characterized phenotypically and genotypically. ECP3 phage belongs to the family Myoviridae with contractile tail and lysed E. faecalis specifically but other bacteria including Enterococcus faecium. The genome was double-stranded linear DNA and its size was 145,518 bp comprising of 220 open reading frames. The GC content was 35.9%. The genome sequence showed 97% identity in 90% coverage region with Myoviridae phage PhiEF24C. ECP3 is the first E. faecalis-specific Myoviridae phage isolated in Korea which can be a promising antimicrobial agent against E. faecalis infections.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.53 no.3
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• pp.227-229
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• 2017

Spirosoma rigui KCTC $12531^T$ was isolated from fresh water from the Woopo wetland, Korea. In this study, we report the complete genome sequence of a bacterium Spirosoma rigui KCTC $12531^T$, its complete genome sequence was obtained using the PacBio RS II platform. The genome comprised of 5,828,404 bp with the G + C content of 54.4%, the genome included 4,774 genes were predicted, among them, 4,647 genes are protein-coding genes.