• Polymer Science and Technology
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• v.15 no.4
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• pp.430-437
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• 2004

인간 게놈 프로젝트 완성 및 간세포 (Stem cell) 발견으로 미래에는 현재 의학적 치료의 한계를 극복하는 의학적 혁명이 예상되고 있다. 간세포를 이용한 치료기술 개발을 위하여서는 균일한 간세포의 대량배양, 원하는 세포로의 균일한 분화, 면역학적 안전성 등이 매우 중요한 이슈가 되고 있으며 이의 해결을 위하여서는 생체적합성이 우수한 지지체의 개발이 기본이 되고 있다. (중략)

• Applied Biological Chemistry
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• v.40 no.3
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• pp.262-265
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• 1997

• The Science & Technology
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• v.29 no.6 s.325
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• pp.14-15
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• 1996

21세기의 가장 중요한 분야는 과학과 기술이다. 폭주하듯 발전하는 과학기술은 평범한 사람들은 뒤쫓기가 어렵다. 앞으로'디지털 나르시스'와 같은 첨단과학의 하나인 인간게놈 프로젝트를 둘러싼 논의는 계속될 것이다. 이런 문제들을 단순히 청치가나 사회학자들에게 맡겨서도 안된다. 과학기술계에 종사하는 사람들이 주체가 되어 공론화 과정을 통해 실마리를 풀어가야 하겠다.

• Journal of Plant Biology
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• v.36 no.4
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• pp.415-423
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• 1993

대두의 uricase II cDNA를 탐침으로 plaque 혼성화 방법에 의해 해녀콩의 뿌리를 cDNA library로부터의 두 개의 phage 클론(λCINUO-01, λCINUO-02)을 선별하였다. 두 phage 클론은 약 1.6 kb와 1.0 kb의 insert를 갖고 있었으며 이들의 염기서열을 결정하기 위하여 pUC19과 pBSKS vector에 subcloing(pcCLNUO-01, pcCLNUO-02)하였다. Sanger법에 의해 염기서열을 결정한 결과, 두 클론은 각각 1,611 bp와 1,024 bp로 이루어져 있었으며 pcCINUO-01은 308개의 아미노산, pcCINUO-02는 301개의 아미노산을 암호화하는 open reading frame(ORF)을 갖고 있었다. 두 클론의 ORF의 염기서열은 대두의 uricase II와 각각 88.9%, 89.3%의 상동성을 보여주었으며, 아미노산 서열은 84.1%, 85.4%의 상동성을 보여주었다. pcCINUO-01의 경우, 종결코돈으로부터 313 NT 하류쪽에 진핵생물의 poly(A) 첨가신호인 AATAAA 서열이 존재하였으며 이로부터 21 NT 하류쪽에 17 잔기의 poly(A)가 존재하였다. 두 클론의 염기서열에서 추정된 아미노산 서열의 카르복시 말단에는 세포질에서 합성된 몇몇 단백질들이 peroxisome으로 수송되는데 필요한 신호서열인 Ser-Lys-Leu-COOH 서열이 존재하고 있었다. 두 클론의 염기서열을 토대로 아미노산 조성을 살펴본 결과, 염기성 아미노산(Arg, His, Lys)과 산성 아미노산(Asp, Glu)이 각각 46 대 35, 47 대 35의 비를 보여주었는데 이는 uricase II 단백질의 염기성 성질을 보여주는 결과로 추정된다. Northern 혼성화 결과 해녀콩에서 uricase II는 뿌리혹에서만 특이적으로 발현됨을 알 수 있었고 게놈 혼성화 반응 결과는 uricase II 유전자가 해녀콩 게놈상에 유전자 가족으로는 존재할 수 있음을 보여주었다.

• Journal of Life Science
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• v.11 no.5
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• pp.400-404
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• 2001

A new human endogenous retroviral family (HERV-S) has recently been identified from human X chromosome. It is 6.7 kb in length and has a typical retroviral structure with LTR-gag-pol-env-LTR. Using the PCR and sequencing approach, we investigated LTR elements of the HERV-S family from a human genomic DNA. Four LTR elements (HSL-1, HSL-5, HSL-10, HSL-11) were identified and have a high degree of sequence similarity(96-99%) with that of the HERV-S. Phylogenetic analysis from the HERV-S family indicated that the LTR elements were mainly divided into 2- groups through evolutionary divergence in the primate evolution. Further investigation of the HERV-S LTR elements in primates may cast light on the integration timing into the primate genome and understanding of human evolution.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.53 no.1
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• pp.61-63
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• 2017

A Gram-negative, yellow-pigmented, long-rod shaped bacterium Spirosoma montaniterrae $DY10^T$ was isolated from a soil sample collected at Mt. Deogyusan, Jeonbuk Province, Republic of Korea. Cells showed extreme gamma radiation resistance with the $D_{10}$ value of 12 KGy. The complete genome sequence of strain $DY10^T$ is consist of a circular chromosome (5,797,678 bp) encoding 5,116 genes, 9 rRNA genes and 39 tRNA genes. The genomic features contain the key enzymes for gamma and UVC radiation.

• Proceedings of the Korean Society for Agricultural Machinery Conference
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• 2002.02a
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• pp.407-412
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• 2002

세계는 지금 post-genome 시대에 접어들고 있고, 하루에도 수백개 이상 밝혀지는 새로운 유전정보들이나 모든 유전암호가 밝혀진 생물들을 기존의 방법들로 연구한다는 것은 너무나 많은 시간을 요구한다. 즉, 인간 게놈 프로젝트 뿐만 아니라, 식물 게놈 프로젝트 등 다양한 분야에서 DNA chip의 필요성이 인식되고 있다. 그러나 우리나라는 DNA chip의 생산에 있어서 chip 제작에 필수적인 DNA chip 제작용 microarrayer를 고가를 들여 수입에 의존하고 있는 실정이다. 이는 DNA chip 생산비를 높이고, 더 나아가 우리나라 생명공학분야 연구의 발전에 악영향을 미치는 결과를 초래할 수 있다. 몇몇 국내 생산 업체가 있지만, 아직 그 실요성을 입증하지 못하였고, 대부분의 chip 공급업체는 아직 수입품을 사용하고 있는 상태이다. 이에 본 연구에서는 microarrayer의 국산화를 통해 안정적 DNA chip 및 microarrayer의 공급을 위해 microarrayer의 개발에 관해 수행하는 연구이며, 앞으로의 연구방향을 다음과 같이 설정하였다. 1) 유전자 검색을 위한 DNA chip 제작용 로봇 시스템 (microarrayer)을 pin 타입으로 설정한다. 2) 정밀도 향상을 위하여 로봇 시스템의 구동은 XYZ 직교좌표형으로 설정한다. 3) 1$cm^2$당 5,000개 정도의 DNA를 붙일 수 있도록 한다.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.53 no.4
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• pp.340-341
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• 2017

Acidovorax citrulli is a causal agent for bacterial fruit blotch on watermelon. Here, we report the complete genome sequence of A. citrulli strain KACC17005. The genome contains 5,349,924 bp with G + C contents of 68.54%, including 4,520 protein coding genes in a circular chromosome. It also possesses at least 15 genes encoding putative type III effector proteins, which may contribute to promoting virulence in susceptible hosts or triggering immune responses in resistant hosts.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• v.33 no.4
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• pp.341-348
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• 1995

Genetic status of Acnnthamoebc sap. were tested on the basis of random amplified polymorphic DNA (RAPD) marker analysis. Four previously established Accnthcmoebn species, 4 Korean isolates of Acnnthamoeba sp., and one American isolate of Acanthcmoebc sp. were analyzed by RAPD-PCR using an arbitrary decamer primers. Amplification products were fractionated by agarose gel electrophoresis and slainrd by ethidium bromide . Eighteen primers produced DNA amplification profiles revealing clear differences among 4 species. Nine of them also produced DNA amplification profiles which included some isolate-specific amplification products. On the basis of amplified fragments by 18 primers, the pairwise similarity indices between A. culbensoni and other species (i.e. A. hntchetti, A. trinngularis, A. polyphaga) were 0.300, 0.308, and 0.313, respectively. Similarity index between A. hctchetti and A. triansulcris was 0.833. The mean similarity index among the 3 Korean isolates (YM-2, -3, -4) was 0.959 and 0.832 among them and 2 other species (A. hatchetti and A. triongulnris). The mean similarity index among YM-5 and other Korean isolates (YM-2, -3, -4) was 0.237. However, the similarity index between YM-5 and A. culbeksoni was 0.857, which suggests that YM-5 is genetically more similar to A. culbertsoni than other Korean isolates. Phonogram reconstructed by UPGMA method revealed that there are two groups: one group consists of A. hctchetti, A. tlonsulcns, and 3 Korean isolates (YM-2, -3, -4) , and the other group consists of A. cuLbensoni. A. polwphosc, HOV, and YM-5.

• Journal of Life Science
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• v.30 no.3
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• pp.304-312
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• 2020

Agarase can be used in the field of basic science, as well as for production of agar-derived high-functional oligosaccharides and bioenergy production using algae. In 2012, we summarized the classification, origin, production, and applications of agar. In this paper, we briefly review the literature on the recombinant expression of agarases from 2012 to the present. Agarase genes originated from 19 genera, including Agarivorans, Flammeovirga, Pseudoalteromonas, Gayadomonas, Catenovulum, Microbulbifer, Cellulophaga, Saccharophagus, Simiduia, and Vibrio. Of the 47 recombinant agarases, there were only two α-agarases, while the rest were β-agarases. All α-agarases produced agarotetraose, while β-agarases yielded many neoagarooligosaccharides ranging from neoagarobiose to neoagarododecaose. The optimum temperature ranged between 25 and 60℃, and the optimum pH ranged from 3.0 to 8.5. There were 14 agarases with an optimum temperature of 50℃ or higher, where agar is in sol state after melting. Artificial mutations, including manipulation of carbohydrate-binding modules (CBM), increased thermostability and simultaneously raised the optimum temperature and activity. Many hosts and secretion signals or riboswitches have been used for recombinant expression. In addition to gene recombination based on the amino acid sequence after agarase purification, recombinant expression of the putative agarase genes after genome sequencing and metagenome-derived agarases have been studied. This study is expected to be actively used in the application fields of agarase and agarase itself.