• 제목/요약/키워드: (${\alpha}2$-3) linkage

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Conformation and Linkage Studies of Specific Oligosaccharides Related to H1N1, H5N1, and Human Flu for Developing the Second Tamiflu

  • Yoo, Eunsun
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제22권2호
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    • pp.93-99
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    • 2014
  • The interaction between viral HA (hemagglutinin) and oligosaccharide of the host plays an important role in the infection and transmission of avian and human flu viruses. Until now, this interaction has been classified by sialyl(${\alpha}2-3$) or sialyl(${\alpha}2-6$) linkage specificity of oligosaccharide moieties for avian or human virus, respectively. In the case of H5N1 and newly mutated flu viruses, classification based on the linkage type does not correlate with human infection and human-to-human transmission of these viruses. It is newly suggested that flu infection and transmission to humans require high affinity binding to the extended conformation with long length sialyl(${\alpha}2-6$)galactose containing oligosaccharides. On the other hand, the avian flu virus requires folded conformation with sialyl(${\alpha}2-3$) or short length sialyl(${\alpha}2-6$) containing trisaccharides. This suggests a potential future direction for the development of new species-specific antiviral drugs to prevent and treat pandemic flu.

D-알알 유도체의 1, 2-trans 글리코시드 형성 반응을 이용한 $\alpha$ -알트로피라노시드 결합을 갖는 이당류의 효과적 합성법의 개발 (A Facile Synthesis of Disacharides Containing $\alpha$ -Altropyranosidic Linkage by 1, 2-trans Glycosidation of D-allal Derivatives)

  • 최종락;윤신숙;전근호;남정이
    • 대한화학회지
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    • 제42권1호
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    • pp.78-83
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    • 1998
  • Campylobacter jejuni 그램 음성균의 O-antigen 부위를 구성하는 삼탄당의 반복 단위를 합성하기 위해서 먼저 이들에 포함된 알트로헵토오스의 합성과 ${\alpha}$-알트로피라노시드를 선택적으로 형성시키는 방법을 개발하여야 한다. 본 연구에서는 알알 유도체에 선택적으로 1, 2-trans glycosidation을 시킴으로서 ${\alpha}$-알트로피라노시드 결합을 갖는 이당류를 합성하고자 하였다. 4, 6-O-Benzylidene-D-allal을 DMDO(3, 3-dimethyl diox-irane)와 반응시켜 1, 2-무수당 중간체를 만들고 아릴 알코올과 글루칼 유도체들과 반응시킨 결과 아릴 ${\alpha}$-알트로피라노시드 유도체와 ${\alpha}$-알트로피라노시드 결합을 갖는 이당류를 효과적으로 합성할 수 있었으며 마노오스등에서 간접적으로 ${\alpha}$-알트로피라노시드를 만드는 기존의 방법을 대체할 새로운 방법임을 확인 할 수 있었다.

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Amylase분비효모와 alcohol발효효모의 세포융합에 의한 균주의 개발 - 제3보. S. diastaticus와 C. tropicalis 간의 세포융합 및 융합체의 성질- (A study on strain improvement by protoplast fusion between amylase secreting yeast and alcohol fermenting yeast - III. Isolation and characterization of fusant between S. diastaticus and C. tropicalis)

  • 서정훈;권택규;홍순덕
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제14권5호
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    • pp.359-363
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    • 1986
  • 본 실험의 목적은 starch의 alcohol발효에 있어서 전분의 $\alpha$-1.4 linkage을 분해하여 alcohol발효를 하는 S diastaticus와 전분 중의 $\alpha$-1.4, $\alpha$-1.6 linkage를 모두 분해할 수 있는 C. tropicalis 간의 이속간의 protoplast fusion을 시켰다. 이때 세포 융합의 빈도는 $10^{-5}$-$10^{-6}$이였으며, 이틀 융합체중 amylase 생성능과 유전적으로 안정한 융합체를 분리하였다. fusant의 성질을 조사하기 위하여 탄소원 자화능을 조사한바 parent와 달리 탄소원 자화능이 일부 보완됨을 보였고 또한 fusant는 원 parent보다 세포의 크기가 클 뿐만아니라, DNA함량도 많았다. spore형성능은 S. diastaticus A4는 spore를 형성하나 C. tropicalis는 형성할 수 없는 반면에 fusant는 형성하였고, Cu$^{++}$ 내성과 NaCl 내염성도 조사하였는데 fusant는 parent의 중간 성질을 가졌다. Fusant의 증식율을 조사하기 위하여 생육도를 조사한 결과 Parent보다 유도기가 길었음을 알았다.

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Synthesis of the 2'-Azidoethyl Trisaccharide, 6d-altroHepp-GlcNAc-Gal Hapten, an O-Antigenic Repeating Unit of Campylobacter jejuni Serotypes O:23 and O:36

  • Yun, Mi-Kyung;Shin, Jeong E. Nam
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제29권7호
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    • pp.1315-1319
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    • 2008
  • A trisaccharide, 6d-Altro-Hepp$\alpha$ (1$\rightarrow$3) GlcNAc$\beta$ (1$\rightarrow$3) Gal$\alpha$ (1$\rightarrow$$OCH_2CH_2N_3$, as an O-antigenic repeating unit of Campylobacter jejuni serotypes O:23 and O:36, was synthesized. Coupling of the 6d-altro-Hepp$\alpha$ (1$\rightarrow$3) GlcNAc$\beta$ (1$\rightarrow$SEt donor with Gal$\alpha$ (1${\rightarrow}OCH_2CH_2Cl$ acceptor in the presence of NIS-TfOH promoter afforded the trisaccharide having the $\beta$ (1$\rightarrow$3) Gal linkage. $\beta$ -Stereospecificity and the desired regioselectivity for the 3-OH Gal are obtained. Subsequent hydrogenation, acetylation, azide displacement, hydrazinolysis, Nacetylation, and finally deacetylation furnished the title trisaccharide hapten for further glycoconjugation.

Mammalian Sialyltransferase Superfamily : Structure and Function

  • Lee, Young-Choon
    • 한국생명과학회:학술대회논문집
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    • 한국생명과학회 2002년도 제38회 학술심포지움
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    • pp.13-19
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    • 2002
  • To elucidate the regulatory mechanism for expression of sialyl-glycoconjugates and their biological functions, ninetheen sialyltransferase cDNAs including eleven by our group or co-works have been cloned and characterized so far. The cloned sialyltransferases are classified into four families according to the carbohydrate linkages they synthesize: ${\alpha}2,3-sialyltransferase$ (ST3Gal I-VI), ${\alpha}$ 2,6-sialyltransferase (ST6Gal I), GalNAc ${\alpha}$ 2,6-sialyltransferase (ST6GalNAc I-VI), and ${\alpha}2,8-sialyltransferase$ (ST8Sia I-VI). Each of the sialyltransferase genes is differentially expressed in a tissue-, cell type-, and stage-specific manner. These enzymes differ in their substrate specificity and various biochemical parameters. However, enzymatic analysis conducted in vitro with recombinant enzyme revealed that one linkage can be synthesized by multiple enzymes. We present here an overview of structure and function of sialyltransferases performed by our group and co-works. Genomic structures and transcriptional regulation of two kinds of human sialyltransferase gene are also presented.

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식혜의 이소말토올리고당에 관한 연구(I) -정제 및 구조해석- (A Study on Sugars in Korean Sweet Rice Drink "Sikhye"(I) -Sugar Content and Its Composition-)

  • 안용근
    • 한국식품영양학회지
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    • 제10권1호
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    • pp.82-86
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    • 1997
  • 쌀 20%, 엿기름 4%를 가하여 7시간 동안 당화시켜 제조한 식혜는 말토오스 11.01%, 이소말토올리고당 5.31%, 말토트리오스 1.75%, 글루코오스 0.28%를 나타냈다. 알코올침전, Toyopearl HW-40S의 겔 크로마토그래피로 식혜의 이소말토올리고당, 말통스, 말토트리오스를 분리 정제하였다. NMR 분석 결과 말토오스와 말토트리오스는 $\alpha$-1, 4-글루코시드 결합만으로 이루어져Tr, 이소말토올리고당은 $\alpha$-1, 4-글루코시드 결합과 $\alpha$-1, 6-글루코시드 결합이 5:1로 이루어진 것으로 나타났다. 이소말토올리고당은 pullulanase 처리한 결과 말토오스와 말토헥사오스까지의 분포를 나타냈다.

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효모의 mating pheromone 신호전달과정에 관여하는 유전자의 돌연변이 분리 및 분석 (Isolation and Characterization of the Mutants in the Genes Involved in Mating Pheromone Signalling)

  • 김지혜;김환규;장광엽
    • 한국균학회지
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    • 제19권4호
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    • pp.266-275
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    • 1991
  • 효모의 mating pheromone에 의한 세포내 Slgnal을 전달하는 물질을 coding 하거나 조절할 수 있는 유전자에 대한 정보를 얻기 위해서 효모에서 G-protein의 ${\alpha}-subunit$를 coding 하는 유전자 CDC70에 돌연변이가 얼어난 균주 $A14-3(MAT{\alpha},\;cdc70-5)$에 UV를 조사하여 돌연변이 cdc70-5를 억제할수 있는 또 다른 돌연변이를 획득하였다 . 돌연변이 cdc70-5의 표현형은 온도 감수성 (temperature sensitivity)이며, $38^{\circ}C$에서 배양하면 세포주기가 G1에서 정지되고 shmoo모양을 보인다 . 균주 A14-3에서 UV를 조사하였을 때 $38^{\circ}C$에서 colony를 형성할 수 있고 세포분열이 정상적으로 진행되어 출아를 하고 있다는 것은 새로운 돌연변이가 cdc70-5 의 표현형을 억제 한다는 사실을 의미한다 . 이러한 억제돌연변이 중 signal transducer와 직접적으로 관련이 없는 유전자들인 $sir^-$$mat{\alpha}2^-$ 돌연변이를 배제한 다음 선택된 15개의 돌연변이들를 중심으로 분석을 행하였다 . 어느 유전자에서 유발 되었는지 그리고 유전자 종류는 몇 가지나 되는지를 암기 위하여 tetrad analysis를 통해 연관여부를 조사하여 분리된 15개의 돌연변이중 12개는 4개의 연관군(sga1, sga2, sga3, sga4)에 속함을 알았다.

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A Specific Pullulanase for ${\alpha}$-1,6-Glucosidic Linkage of Glucan from Thermus caldophilus

  • Moon-Jo Lee;June-Ki Kim;Kyung-Soo Nam;Jin-Woo Park;Cher-Won Hwang;Dong-Soo Kim;Cheorl-Ho Kim
    • Journal of Life Science
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    • 제9권1호
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    • pp.26-34
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    • 1999
  • A thermostable pullulanase has been isolated and purified from Thermus caldophilus GK-24 to a homogeneity by gel-filtration and ion-exchange chromatography. The specific activity of the purified enzyme was 431-fold increase from the crude culture broth with a recovery of 11.4%. The purified enzyme showed $M_{r}$ of 65 kDa on denaturated and natural conditions. The pI of the enzyme was 6.1 and Schiff staining was negative, suggesting that the enzyme is not a glycoprotein. The enzyme was most active at pH 5.5. The activity was maximal at $75^{\cire}C$ and stable up to $95^{\cire}C$ for 30 min at pH 5.5. The enzyme was stable to incubation from pH 3.5 to pH 8.0 at $4^{\cire}C$ for 24hr. The presence of pullulan protected the enzyme from heat inactivation, the extent depending upon the substrate concentration. The activity of the enzyme was simulated by $Mn^{2+}$ ion, }$Ni^{2+}$, $Ca^{2+}$, $Co^{2+}$ ions. The enzyme hydrolyzed the ${\alpha}$-1,6-linkages of amylopectin, glycogens, ${\alpha}$, ${\beta}$-limited dextrin, and pullulan. The enzyme caused the complete hydrolysis of pullulan to maltotriose and the activity was inhibited by $\alpha$, $\beta$, or $\gamma$-cyclodextrins. The $NH_{2}$-terminal amino acid sequence [(Ala-Pro-Gln-(Asp of Tyr)-Asn-Leu-Leu-Xaa-ILe-Gly-Ala(Ser)] was compared with known sequences of various sources and that was compared with known sequences of various sources and that was different from those of bacterial and plant enzymes, suggesting that the enzymes are structurally different.

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Enzymatic Synthesis of Novel $\alpha$-Amylase Inhibitors via Transglycosylation by Thermotoga maritima Glucosidase

  • Kim, Sung-Hee;Lee, Myoung-Hee;Yang, Sung-Jae;Kim, Jung-Woo;Cha, Hyun-Ju;Cha, Jae-Ho;Nguyen, Van Dao;Park, Kwan-Hwa
    • Food Science and Biotechnology
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    • 제17권2호
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    • pp.302-307
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    • 2008
  • Novel amylase inhibitors were synthesized via transglycosylation by Thermotoga maritima glucosidase (TMG). TMG hydrolyzes acarbose, acarviosine-glucose, and maltooligosaccharide by releasing $^{14}C$-labeled glucose from the reducing end of each molecule. When TMG was incubated with acarviosine-glucose (the donor) and glucose (the acceptor), two major transfer products, compounds 1 and 2, were formed via transglycosylation. The structures of the transfer products were determined using thin-layer chromatography (TLC), high-performance ion chromatography (HPIC), and $^{13}C$ nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy. The results indicate that acarviosine was transferred to glucose at either C-6, to give a $\alpha-(1{\rightarrow}6$) glycosidic linkage, or at C-3, to produce an $\alpha-(1{\rightarrow}3$) glycosidic linkage. The transfer products showed a mixed-type inhibition against porcine pancreatic $\alpha$-amylase; therefore, they may be useful not only as inhibitors but also as acarbose transition-state analogs to study the mechanism of amylase inhibition.

식혜의 이소말토올리고당에 관한 연구 -4보 찹쌀식혜- (A Study on Sugars in Korean Sweet Rice Drink "Sikhye" -4. Glutinous Rice Sikhye-)

  • 안용근
    • 한국식품영양학회지
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    • 제10권2호
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    • pp.180-185
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    • 1997
  • 찹쌀 20%, 엿기름 4%를 가하여 7시간 동안 당화시켜 제조한 식혜는 말통스 10.1%, 한계덱스트린 7.3%, 말토트링스 1.3%, 글루코오스 0.18%, 밥알 1.75%를 나타냈다. 알코올 침전, Biogel P-2의 겔 크로마토그래피로 식혜의 한계덱스트린을 정제하여 1H-NMR 분석한 결과 한계덱스트린은 $\alpha$-1,4-글루코시드 결합과 $\alpha$-1,6-글루코시드 결합이 5:1로 이루어졌고, pullulanase 처리한 결과 말토오스와 말토헥사오스까지의 분포를 나타내어 멥쌀식혜에서 얻은 한계덱스트린가 구조가 같은 결과이다. 밥알의 당함량은 26.4%, 단백질 함량은 41.6%를 나타냈다. 참쌀식혜의 한계덱스트린과 밥알에 30unit/ml의 $\alpha$-아밀라아제, 글\ulcorner아밀라아제, $\alpha$-글루코시다아제, $\beta$-아밀라아제를 작용시킨 결과 글루코아밀라아제 외에는 일부밖에 가수분해하지 at하였다. 인체의 효소인 $\alpha$-아밀라아제와 $\alpha$-글루코시다아제를 함께 작용시킨 결과 한계덱스트린의 가수분해율은 18%, 밥알의 가수분해율은 26%를 나타냈다.

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