In order to increase protease stability of a novel Trp-rich model antimicrobial peptide, $K_6L_2W_3$ (KLWKKWKKWLK-$NH_2$)and investigate the effect of L-amino acid to peptoid residue conversion on biological functions, we synthesized its antimicrobial peptoid, $k_6l_2w_3$. Peptoid $k_6l_2w_3$ had similar bacterial selectivity compared to peptide $k_66L_2W_3$. The bactericidal rate of $k_6l_2w_3$ was somewhat slower than that of $K_6L_2W_3$. Peptoid $k_6l_2w_3$ exhibited very little dye leakage from bacterial outer-membrane mimicking PE/PG liposomes, as observed in $K_6L_2W_3$, indicating that the major target site of $K_6L_2W_3$ and $k_6l_2w_3$ may be not the cell membrane but the cytoplasm of bacteria. Trypsin treatment of $K_6L_2W_3$ completely abolished antimicrobial activities against Escherichia coli and Staphylococcus aureus. In contrast, the antimicrobial activity of $k_6l_2w_3$ was completely preserved after trypsin treatment. Taken together, our results suggested that antimicrobial peptoid $k_6l_2w_3$ can potentially serves as a promising therapeutic agent for the treatment of microbial infection.
An experiment was conducted to produce eggs enriched with vitamins $D_3$, K and iron in eggs. Six hundred 97-wk-old ISA Brown force molted hens were allocated to completely randomized block arrangement of six dietary treatments: T1; control (C), T2; C+4,000 IU vitamin $D_3$+2.5 mg vitamin K+100 ppm Fe, T3; C+8,000 IU vitamin $D_3$+5.0 mg vitamin K+100 ppm Fe, T4; C+12,000 IU vitamin $D_3$+7.5 mg vitamin K+100 ppm Fe, T5; C+16,000 IU vitamin $D_3$+10.0 mg vitamin K+100 ppm Fe, T6; C+20,000 IU vitamin $D_3$+12.5 mg vitamin K+100 ppm Fe. Fe was supplemented with Fe-methionine. Each treatment consisted of five replicates of ten cages with two birds per cage. Egg production and egg weight were highest in T2 and incidence of soft and broken egg was highest in T6. Haugh unit was not different among treatments although it tended to be increased as dietary vitamins $D_3$ and K increased. Eggshell strength was not different among treatment. Concentrations of vitamin $D_3$ and K in egg yolk increased and plateaued approximately 20 days after feeding supplemented diets. The level of these vitamins peaked at 12,000 IU/kg vitamin $D_3$ and 7.5 mg/kg vitamin K supplementation and then decreased at the higher than these supplementation levels. The peak concentrations of vitamin $D_3$ and vitamin K were 4.6 times and 4.8 times greater than the control, respectively. Supplementary Fe also increased Fe content in egg yolk. It is concluded that vitamin $D_3$ and K in eggs can be effectively enriched by proper supplementation time and level of these vitamins.
In order to investigate the thermoelectric properties of $Zn_{k}$$In_2$$O_{ 3+k}$ homologous compounds, the samples of $Zn_{k}$ /$In_2$$O_{3+k}$ / (k = integer between 1 and 9) were prepared by calcining the mixed powders of ZnO and $In_2$$O_3$fellowed by sintering at 1823 K for 2 hours in air, and their electrical conductivities and Seebeck coefficients were measured as a function of temperature in the range of 500 K to 1150 K. X-ray diffraction analysis of the sintered samples clarified that single-phase specimens were obtained for $Zn_{k} /$In_2$$O_{3+k}$ with k = 3, 4, 5, 7, 8, 9. Electrical conductivity of the $Zn_{k}$$In_2$$O_{3+k}$ / decreased with increasing temperature, and decreased with increasing k for k $\geq$ 3. The Seebeck coefficient was negative at all the temperatures for all compositions, confirming that $Zn_{k}$$In_2$$O_{3+k}$ / is an n-type semiconductor. Absolute values of the Seebeck coefficient increased linearly with increasing temperature and increased with increasing k for k $\geq$ 3. The temperature dependence of the Seebeck coefficient indicated that Z $n_{k}$I $n_2$$O_{3+k}$ could be treated as an extrinsic degenerate semiconductor. Figure-of-merits of Z $n_{k}$I $n_2$$O_{3+k}$ were evaluated from the measured electrical conductivity and Seebeck coefficient, and the reported thermal conductivity. Z $n_{7}$ I $n_2$$O_{10}$ has the largest figure-of-merit over all the temperatures, and its highest value was $1.5{\times}$10$^{-4}$$K^{-1}$ at 1145 K.5 K.
우리나라 자포니카 품종의 흰잎마름병 저항성 유전자와 연관된 마커를 탐색하기 위하여, 밀양121호, 밀양123호 및 HB10624-AC5 등을 교배친으로 한 두 조합의 약배양 계통을 재료로 흰잎마름병 저항성 유전자(Xa-1 and Xa-3)와 DNA 마커간의 연관분석을 통하여 유전자 지도를 작성하고자 수행하였던 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. $\textrm{K}_1$ 균주에 대한 흰잎마름병 저항성 검정결과, 밀양121호/HRl1650-1-4-2에서는 저항성과 감수성이 1:1로 분리하였으며, 밀양123호/HR10624-AC5 조합의 $\textrm{K}_1$ 및 $\textrm{K}_3$ 균주에 대한 검정결과는 각각 3:1과 1:1로 분리하여 이론치에 합당하였다. 2. 교배친에 대하여 DraI. HindIII, EcoRI, EcoRV, PstI등 5가지 제한효소에 대한 다형현상을 검정한 결과, RZ590, RG303, RZ536 등 3개의 마커가 다형현상을 나타내었다. 3. 흰잎마름병 포장저항성 검정결과와 RFLP 마커와의 연관분석 결과 Xa-1 유전자는 RZ590과 4번 염색체 상에서 3.1$\times$1.5 cM으로 연관되어 있었으며, Xa-3 유전자는 Rz536 및 RG303과 11번 염색체 상에서 각각 7.6$\times$2.3 및 16.0$\times$3.2 cM으로 연관되어 있었다. 4. 11번 염색체 상에서 Xa-3와 Rz536 및 RG303은 "Xa-3-RZ536-RG303" 순으로 위치하였다.순으로 위치하였다.
인간유방상피세포에서 H-ras가 침윤성과 세포 이동성을 유도한다는 것을 이 전연구에서 밝혔다. Phosphatidylinositol 3-kinase(PI3K)는 세포 이동성에서 중요한 역할을 하는 것으로 보고되고 있다. 본 연구에서 인간유방상피세포인 MCF10A에서 H-ras에 의해 유도된 침윤성에 PI3K가 어떠한 영향을 미치는지 살펴보고자 하였다. PI3K의 활성은 PI3K의 downstream molecule인 Akt의 인산화를 Western blot으로 확인하였다. Akt는 MCF10A, H-ras, N-ras MCF10A 세포에서 같은 정도로 발현되는 반면, 인산화된 Akt는 MCF10A 세포에 비해 H-ras MCF10A 세포와 N-ras MCF10A 세포에서 현저히 높게 나타났다. 이상의 결과로서 H-ras, N-ras 둘 다 PI3K를 활성화시키며, 침윤성과 세포이동성이 없는 N-ras MCF10A 세포에서도 PI3K가 활성화되었으므로, PI3K의 활성은 세포침윤성과 이동성을 유도하는데에 있어서 충분하지는 않음을 말해준다. PI3K의 저해제인 LY294002와 wortmannin을 세포에 처리하였을 때 세포침윤성과 이동성이 유의성 있게 감소되었다. 이상의 결과는 MCF10A 세포의 침윤성과 이동설에 있어서 PI3K의 활성이 충분하지는 않지만 반드시 필요하다는 것을 알 수 있었다.
현재 우리나라의 대표적인 저궤도실용위성 시리즈인 '다목적실용위성'은 K2, K3, K5, K3A(2호, 3호, 5호, 3A호) 이렇게 총 네 가지로 구성되어 있다. 본 논문에서는 한국항공우주연구원에서 운영하는 다목적실용위성 K3인 일상 임무계획(Mission Planning)의 모듈 자동화 시스템 개발에 대한 내용을 다뤘다. 그중에서도, 일상적으로 반복 수행되는 K3 임무계획 업무 중에서 수동 작업을 자동화하기 위해 객체지향 CBD 개발 방법론을 토대로 C#을 이용한 자동화 시스템을 구조화 시키는 방안에 대해 주력하였다. 그 결과로 자동화 개념 정립을 위한 Feasibility Study를 수행할 것이다. 이를 다목적실용위성 K3 임무계획 중 일상적인 임무계획에 한하여 제한적으로 적용할 수 있을 것으로 기대하며, 이는 나아가 본 선행연구 결과물을 이용하여 K3 임무계획 자동화시스템에 적용에 적극 활용될 수 있을 것이다.
Interaction of alkali oxides and SO3 and C3S formation and microstructure was studied using K2CO3 and Na2CO3 as alkali sources and (NH4)2SO4 for SO3. When SO3/K2O=1.43 as mole ratio, K2O and SO3 react to form K2SO4, this phase is immiscible with other oxide melt and thus could not affect C3S formation as well as its microstructure. In a condition of SO3/K2O 1, C3S crystals were round and grown in a much larger size. With addition of Na2O and SO3 by only 1wt% each, C3S formation was strongly hindered. Since C2S was stabilized by Na+ and SO4-2, it could not react to give C3S formation. However in the condition of SO3/Na2O=1.43, a little amount of C3S was formed. It is considered that small amount of Na2SO4 was formed, this phase was immiscible with clinker liquid, and the C3S crystals were formed locally in the liquid part of relatively low Na2O and SO3 compositions. These crystals had irregular and rough surfaces and contained more inclusions than those grown from K2O.SO3 system.
Chromatin structure and dynamics that are influenced by epigenetic marks, such as histone modification and DNA methylation, play a crucial role in modulating gene transcription. To understand the relationship between histone modifications and regulatory elements in breast cancer cells, we compared our chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-Seq) histone modification patterns for histone H3K4me1, H3K4me3, H3K9/16ac, and H3K27me3 in MCF-7 cells with publicly available formaldehyde-assisted isolation of regulatory elements (FAIRE)-chip signals in human chromosomes 8, 11, and 12, identified by a method called FAIRE. Active regulatory elements defined by FAIRE were highly associated with active histone modifications, like H3K4me3 and H3K9/16ac, especially near transcription start sites. The H3K9/16ac-enriched genes that overlapped with FAIRE signals (FAIRE-H3K9/14ac) were moderately correlated with gene expression levels. We also identified functional sequence motifs at H3K4me1-enriched FAIRE sites upstream of putative promoters, suggesting that regulatory elements could be associated with H3K4me1 to be regarded as distal regulatory elements. Our results might provide an insight into epigenetic regulatory mechanisms explaining the association of histone modifications with open chromatin structure in breast cancer cells.
Park, Hyoung-Min;Kim, HuiSu;Lee, Kang-Hoon;Cho, Je-Yoel
BMB Reports
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제53권5호
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pp.266-271
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2020
Breast cancer encompasses a major portion of human cancers and must be carefully monitored for appropriate diagnoses and treatments. Among the many types of breast cancers, triple negative breast cancer (TNBC) has the worst prognosis and the least cases reported. To gain a better understanding and a more decisive precursor for TNBC, two major histone modifications, an activating modification H3K4me3 and a repressive modification H3K27me3, were analyzed using data from normal breast cell lines against TNBC cell lines. The combination of these two histone markers on the gene promoter regions showed a great correlation with gene expression. A list of signature genes was defined as active (highly enriched H3K4me3), including NOVA1, NAT8L, and MMP16, and repressive genes (highly enriched H3K27me3), IRX2 and ADRB2, according to the distribution of these histone modifications on the promoter regions. To further enhance the investigation, potential candidates were also compared with other types of breast cancer to identify signs specific to TNBC. RNA-seq data was implemented to confirm and verify gene regulation governed by the histone modifications. Combinations of the biomarkers based on H3K4me3 and H3K27me3 showed the diagnostic value AUC 93.28% with P-value of 1.16e-226. The results of this study suggest that histone modification analysis of opposing histone modifications may be valuable toward developing biomarkers and targets for TNBC.
A 3% suspension of heat-stabilized defatted rice bran was treated with papain, followed by inactivating the enzyme by heat, and centrifuged. The supernatant was subjected to ultrafiltration, and fractions with various molecular sizes, F1 (>30 kDa), F2 (10-30 kDa), F3 (5-10 kDa), F4 (3-5 kDa), and F5 (3 kDa<), were freeze-dried, and evaluated for antimutagenicity by Ames test using Salmonella typhimurium TA 100 against phenazine methosulfate. The F3 fraction containing highest antimutagenicity from ultrafiltration was separated into 6 fractions by DEAE-Sephadex A-25 ion-exchange column chromatography (F3-1-F3-6). Each fractions having protein contents were pooled, dialyzed, freeze dried, and evaluated for antimutagenicity. Among the six fractions, the F3-1, F3-2, and F3-6 fractions showed antimutagenicity, which were 80.2, 53.4, and 58.6% at concentration of $100\;{\mu}g/plate$, respectively. These F3-1, F3-2, and F3-6 fractions were subjected to Sephadex G-50 gel filtration column chromatography for further purification. Among the purified fractions, the F3-1-1, F3-2-2, and F3-6-1 fractions showed antimutagenicity of 84.5, 58.6, and 69.8% at concentration of $100\;{\mu}g/plate$, respectively. It is thought that these peptides can find application for nutraceutical and pharmaceutical products.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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