• 제목/요약/키워드: ${\beta}$-tubulin

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The First Report of Penicillium georgiense in Malaysia

  • Yee, Teh Li;Zakaria, Latiffah
    • Mycobiology
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    • 제42권3호
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    • pp.274-278
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    • 2014
  • Penicillium georgiense was isolated from sandy beach soil from Batu Ferringhi beach, Penang Island, Malaysia. The identification was based on morphological characteristics and phylogenetic analysis of internal transcribed spacer regions and ${\beta}$-tubulin sequences. To the best of our knowledge, this is the first report of P. georgiense in Malaysia.

A New Record of Penicillium pimiteouiense from Beach Soil in Malaysia

  • Teh, Li Yee;Latiffah, Zakaria
    • Mycobiology
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    • 제41권4호
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    • pp.256-259
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    • 2013
  • Three isolates of Penicillium pimiteouiense were recovered from sandy beach soil samples in Penang Island, Peninsular Malaysia. All the isolates were identified based on morphological characteristics and phylogenetic analysis of internal transcribed spacer regions and ${\beta}$-tubulin gene. This is a first record of P. pimiteouiense in Malaysia.

Evaluation of ${\alpha}$-Tubulin as an Antigenic and Molecular Probe to Detect Giardia lamblia

  • Kim, Ju-Ri;Shin, Myeong-Heon;Song, Kyoung-Ju;Park, Soon-Jung
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제47권3호
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    • pp.287-291
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    • 2009
  • The ${\alpha}/{\beta}$-tubulin heterodimer is the basic subunit of microtubules in eukaryotes. Polyclonal antibodies specific to recombinant ${\alpha}$-tubulin of Giardia lamblia were made, and found effective as a probe to specifically detect G. lamblia by immunofluorescence assays. Nucleotide sequences of ${\alpha}$-tubulin genes were compared between G. lamblia WB and GS strains, prototypes of assemblage A and assemblage B, respectively. A set of primers was designed and used to amplify a portion of the ${\alpha}$-tubulin gene from G. lamblia. PCR-RFLP analysis of this ${\alpha}$-tubulin PCR product successfully differentiated G. lamblia into 2 distinct groups, assemblages A and B.Theresults indicate that ${\alpha}$-tubulin can be used as a molecular probe to detect G.lamblia.

Benzimidazole계 살균제에 대한 배 검은별무늬병균 Venturia nashicola 의 저항성과 β-Tubulin 유전자 돌연변이와의 관계 (Relationship of Resistance to Benzimidazole Fungicides with Mutation of β-Tubulin Gene in Venturia nashicola)

  • 곽연수;민지영;송장훈;김명수;이한찬;김흥태
    • 식물병연구
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    • 제23권2호
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    • pp.150-158
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    • 2017
  • Benzimidazole계 살균제 저항성을 모니터링하면서, 저항성과 ${\beta}$-tubulin 유전자의 198번째 코돈의 돌연변이와의 관계를 조사하였다. Venturia nashicola의 benzimidazole계 살균제에 대한 반응은 $0.16{\mu}g/ml$ carbendazim 배지에서 전혀 생장하지 못하는 감수성과 $4.0{\mu}g/ml$ 배지에서 생장이 안 되는 저저항성, $100{\mu}g/ml$에서조차 생장이 가능한 고저항성으로 구분할 수 있었다. 국내 3개 지역의 과원에서 채집한 30균주의 V. nashicola는 carbendazim에 대해서 모두 고저항성이었다. V. nashicola의 ${\beta}$-tubulin 유전자의 염기서열을 분석한 결과 저저항성 균주에서는 감수성 균주와 염기서열에 차이가 없었지만, 고저항성 균주는 GAG인 glutamic acid가 GCG인 alanine으로 치환되어 있었다. 옥천의 과원에서 분리한 10균주 중에서 5균주는 GGG인 glycine으로 치환되어 있었다. 특히 glycine으로 치환될 경우 carbendazim에 대해서 저항성이 되면서 carbendazim과 diethofencarb 혼합제에 대해서는 감수성이 더 커졌다. 결국 ${\beta}$-tubulin의 198번째 코돈의 돌연변이 E198A와 E198G는 V. nashicola가 benzimidazole계 살균제에 대해서 저항성이 되는 중요한 기작임을 알 수 있었다.

pBRG-4를 이용한 Metarhizium anisopliae의 형질전환 (Transformation of Metarhizium anisopliae by using pBRG-4)

  • 이동규;예완해;황철원;권석태;강선철
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제41권3호
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    • pp.219-223
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    • 1998
  • 작물 병해충에 대한 무공해 미생물 농약 개발의 일환으로 곤충 병원성 곰팡이 Metarhizium anisopliae의 분자생물학적 육종을 위해 이 균주의 형질전환계를 확립하였다. M. anisopliae의 원형질체를 제작하여 benomyl 약제에 대하여 저항성을 나타내는 Aspergillus flavus 유래의 ${\beta}-tubulin$ 유전자를 갖는 pBRG-4 plasmid DNA를 polyethylene glycol 방법으로 형질 전환하였다. 이 형질전환은 pBRG-4 DNA $50\;{\mu}g$당 10개의 효율로 이루어졌으며, 그 결과 야생형 균주들의 $2.5\;{\mu}g/ml$ 농도의 benomyl 존재 하에서도 성장이 억제되는데 반하여 선발된 형질전환체들은 $5.0\;{\mu}g/ml$ 농도의 benomyl 함유 배지에서도 잘 성장하였다. 또한 이 형질전환체들의 chromosomal DNA를 분리하여 Southern 분석한 결과 ${\beta}-tubulin$ 유전자가 homologous recombination에 의하여 M. anisopliae의 genome속에 삽입 되었음을 확인하였다.

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Fenbendazole에 저항성과 감수성을 지닌 염전위충의 분비배설물에서의 DNase 활성 비료 (Comparison of DNase activities from excretory/secretory productsof Haemonchus contortus fenbendazole-resistantand -susceptible isolates)

  • 곽동미
    • 대한수의학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.455-462
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    • 2004
  • Change in ${\beta}$-tubulin nucleic acid and protein sequences was the only known difference between Haemonchus contortus fenbendazole (FBZ)-resistant and -susceptible isolates. This change was sufficient to determine the pathologic effect induced by FBZ treatment. This research was initiated to investigate further differences from these two isolates. Since ${\beta}$-tubulin is involved in formation of microtubule, which has functions in secretory vesicle transport, DNase activities from excretory/secretory products (ESP) of the two isolates were compared, based on pH, sensitivity to DNase inhibitors, molecular masses and production of 3'-OH. The most significant difference detected was that a 38.5 kDa DNase activity was identified from ESP of H. contortus FBZ-susceptible isolates but not from those of H. contortus FBZ-resistant isolates. However, it was shown that the 38.5 kDa DNase is expressed with similar level of activity in intestine and whole worm of H. contortus FBZ-resistant and -susceptible isolates. This result demonstrated that the secretory transport pathway of the 38.5 kDa DNase was inhibited by unknown mechanisms, which may be related with ${\beta}$-tubulin sequence change in FBZ-resistant isolates. Other DNases of 34, 36 and 37 kDa were detected from ESP of both H. contortus FBZ-resistant and -susceptible isolates. Overall DNase activities found from ESP of these two isolates were not inhibited by 10 mM EDTA at pH 5.0, but largely inhibited by pH 7.0. In addition, DNase activities in two isolates produced DNA fragments with mixtures of 3'- hydroxyls (OH) and 3'-phosphates (P) at each pH although the 3'-end labeling ratios at pH 5.0 and 7.0 were shown different. Identification of inhibition of the 38.5 kDa DNase secretion in FBZ-resistant isolates suggests existence of further differences, in addition to ${\beta}$-tubulin sequence change, in two isolates. This shows complex effect of FBZ on H. contortus biological mechanisms.

국내 해송에서 분리한 변색균 Ophiostoma quercus의 균학적 특성 (Mycological Characteristics of Ophiostoma quercus, a Sap-staining Fungus Isolated from Japanese Black Pine in Korea)

  • 현민우;서동연;윤여홍;김성환
    • 한국균학회지
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    • 제36권2호
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    • pp.123-129
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    • 2008
  • 한국에서 해송의 줄기변색 부위에서 분리된 변색균류중 한 종에 대하여 그 특성을 조사하였다. Cycloheximide에 저항성인 Ophiostoma piceae complex 그룹에서 보여지는 무성세대 Petosum의 분생포자경과 또 다른 무성세대 Sporothrix의 형태를 지니고 있었다. 그러나 완전세대의 모습인 자낭각을 형성하지 못하였다. 이 균류는 배양적특성, 형태적특성 그리고 $\beta$-tubulin 유전자 염기서열 분석을 통하여 Ophiostoma quercus로 동정되었다. 본 연구에서는 한국에서 분리된 O. quercus의 균학적 특성을 처음으로 보고하고자 한다.

Heterotrimeric Kinesin 2 모터 단백질의 Carboxyl-말단과 β2-tubulin의 결합 (The Carboxyl-terminal Tail of a Heterotrimeric Kinesin 2 Motor Subunit Directly Binds to β2-tubulin)

  • 정영주;박성우;김상진;이원희;김무성;엄상화;석대현
    • 생명과학회지
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    • 제29권3호
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    • pp.369-375
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    • 2019
  • 미세소관은 알파- 와 베타-tubulin의 이량체가 종합되어 형성되며, 또한 세포내에서 tubulin 수송은 섬모나 편모와 같은 세포 부착 기관의 성장에 중요한 역할을 한다. Kinesin 2는 kinesin superfamily (KIF)의 분자 모터 단백질의 한 종류로 미세소관를 따라 다양한 운반체를 운반하며, 2종류의 다른 모터 단백질(KIF3A, KIF3B)과 kinesin-associated protein 3 (KAP3)로 구성되어 있다. Kinesin 2는 KIF3A의 cargo binding domain을 통하여 다양한 단백질과의 결합이 알려져 있지만, 아직 결합단백질의 다수는 아직 밝혀지지 않았다. 본 연구에서 KIF3A와 결합하는 단백질을 분리하기 위하여 효모 two-hybrid system을 사용하여 탐색한 결과 미세소관의 단위체의 한 종류인 ${\beta}2-tubulin$ type (Tubb2)을 분리하였다. Tubb2는 KIF3A와 결합하지만, KIF3B, KIF5B와 kinesin light chain 1 (KLC1)과는 결합하지 않았다. Tubb2의 C-말단은 KIF3A와의 결합에 필요하며, 다른 KIF3A는 Tubb의 isoforms인 Tubb1, Tubb2, Tubb3, Tubb4, Tubb5와도 결합하였다. 그러나 Tuba1은 KIF3A와 결합하지 않았다. 생쥐의 뇌 파쇄액을 KIF3A 항체로 면역침강한 결과 Tubb2는 heterotrimeric kinesin 2의 구성단백질들과 같이 침강하였다. 이러한 결과들은 heterotrimeric kinesin 2는 tubulin과 결합하여 세포 내에서 tubulins을 운반하는 것을 시사한다.

사람 지방 유래 중간엽 줄기세포의 도파민성 및 콜린성 신경세포분화 (Differentiation of Dopaminergic and Cholinergic Neurons from Mesenchymal-like Stem Cells Derived from the Adipose Tissue)

  • 홍인경;정나희;김주란;도병록;김해권;강성구
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제12권1호
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    • pp.31-39
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    • 2008
  • 손상된 뇌신경조직내에서 신경줄기세포로부터 새로운 신경세포로의 분화가 상당히 제한되어 있어 이것이 손상된 뇌신경조직의 복구가 잘 이루어지지 않는 원인이라 여겨지고 있다. 본 연구에서는 세포배양을 통해 지방조직 중간엽 줄기세포를 도파민성 신경세포와 콜린성 신경세포로 분화를 유도하였다. 중간엽 줄기세포를 신경세포로 분화시키기 위해 N2배양액에 bFGF, EGF, dimethyl sulphoxide (DMSO)와 butylated hydroxyanisole (BHA)를 첨가하여 유도하였다. DMSO와 BHA에 처리된 중간엽 줄기세포가 빠르게 신경세포 모양으로 분화하는 것을 관찰하였으며, 이것은 면역조직학적 염색에서 신경세포 특이 표지인 $\beta$-tubulin III, 별아교세포에 대한 특이 표지인 GFAP, 흰돌기아교세포에 대한 특이 표지인 Gal-C에 대해 양성반응을 나타내었다. RT-PCR 분석에서 배양 단계에 따라 신경세포에 특이적인 표지 인자인 neuro D1, $\beta$-tubulin III, GFAP, nestin 등의 발현을 통해, 중간엽 줄기세포가 신경세포로 분화됨을 확인하였다. 그러나 중간엽줄기세포가 신경세포로 분화된 이후에는 줄기세포 표지인 SCF, C-kit와 stat-3 등은 발현되지 않았다. 또한, 중간엽줄기세포에 bFGF, SHH와 FGF8 등을 처리하면 도파민 신경세포로 분화하였다. 중간엽 줄기세포에 bFGF, RA, Shh를 처리하여 콜린성 신경세포로 분화시켰을 때, 신경세포 특이 표지인 $\beta$-tubulin III와 콜린성 신경 특이 표지인 ChAT에 양성반응를 보였다. 결론적으로 사람 지방조직의 중간엽 줄기세포가 도파민성과 콜린성 신경세포로 분화가 가능하고 이러한 잠재성을 가진 지방 유래 중간엽 줄기세포는 퇴행성 신경질환에 대한 세포 치료제로서 가능성을 제시한다.

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Viriditoxin Induces G2/M Cell Cycle Arrest and Apoptosis in A549 Human Lung Cancer Cells

  • Park, Ju Hee;Noh, Tae Hwan;Wang, Haibo;Kim, Nam Deuk;Jung, Jee H.
    • Natural Product Sciences
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    • 제21권4호
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    • pp.282-288
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    • 2015
  • Viriditoxin is a fungal metabolite isolated from Paecilomyces variotii, which was derived from the giant jellyfish Nemopilema nomurai. Viriditoxin was reported to inhibit polymerization of FtsZ, which is a key protein for bacterial cell division and a structural homologue of eukaryotic tubulin. Both tubulin and FtsZ contain a GTP-binding domain, have GTPase activity, assemble into protofilaments, two-dimensional sheets, and protofilament rings, and share substantial structural identities. Accordingly, we hypothesized that viriditoxin may inhibit eukaryotic cell division by inhibiting tubulin polymerization as in the case of bacterial FtsZ inhibition. Docking simulation of viriditoxin to ${\beta}-tubulin$ indicated that it binds to the paclitaxel-binding domain and makes hydrogen bonds with Thr276 and Gly370 in the same manner as paclitaxel. Viriditoxin suppressed growth of A549 human lung cancer cells, and inhibited cell division with G2/M cell cycle arrest, leading to apoptotic cell death.