• 제목/요약/키워드: $^{13}C-NMR$ Analysis

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Myoglobin 시안 단백질에 포함된 Heme에 대한 전자 및 분자구조 규명을 위한 $^{13}C$ NMR분석 ($^{13}C$ NMR Analysis for the Characterization of Heme Electronic/Molecular Structure in Horse Myoglobin Cyanide)

  • 이강봉;권지혜;이호진;김영만;최영상
    • 분석과학
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    • 제11권1호
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    • pp.73-78
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    • 1998
  • 미오글로빈 시안착물(MbCN) 단백질에 대한 NMR의 HMQC 연구는 수소와 결합된 상자기성 heme 탄소 시그날의 완전한 지정을 가능토록 해준다. 이러한 상자기성 MbCN에 대한 HMQC 실험의 적용은 heme시그날뿐만 아니라 상자기성 아미노산에 대해 결합된 수소와 탄소간의 coherence를 지정하여주며 자연존재량 $^{13}C$시그날의 지정이 모든 low-spin 상자기성 heme단백질에서도 가능하다. 이러한 시그날 지정 전략은 정자기성 영역에서 공명하는 수소 시그날의 지정을 위해 사용되는 NOE에만 의존하는것 보다 훨씬 명확한 시그날지정이 가능하다. 2,4-비닐기의 ${\alpha}$-탄소들과 7-프로피온기의 ${\beta}$-탄소에서 특이한 anti-Curie형태를 보이는 것은 그들이 heme평면에 존재하고 있지 않다는 증거가 된다. Proximal His에 의해 유도된 heme의 전자 및 자성의 비대칭은 heme탄소 시그날공명이 $25^{\circ}C$에서 250 ppm의 범위에 이르도록 한다. 이러한 heme 탄소 시그날 공명은 미오그로빈 heme의 전자구조를 분석하는데 있어서 수소 시그날의 공명보다 더욱 민감한 증거로 작용할수 있다.

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Synthesis, Spectral Characterization, Electron Microscopic Study and Influence on the Thermal Stability of Phosphorus-containing Dendrimer with a 4,4'-Sulphonyldiphenol at the Core

  • Dadapeer, Echchukattula;Rasheed, Syed;Raju, Chamarthi Naga
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제32권2호
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    • pp.498-502
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    • 2011
  • The divergent synthesis of novel phosphorus-containing dendrimer with 4,4'-sulphonyldiphenol at the core has been accomplished involving simple condensation reactions using $P(O)Cl_3$, $P(S)Cl_3$, 3-amino-phenol, 3-hydroxy-benzaldehyde, and 2-butyn 1, 4-diol. The final compound was a Schiff's base macromolecule possessing 4 imine bonds, 8 acetylenic bonds and 8 OH groups at the periphery. The structures of intermediate compounds were confirmed by IR, NMR ($^1H$, $^{13}C$ and $^{31}P$), LC-Mass and C, H, N analysis. The structure of the final dendrimer (5) was confirmed by IR, NMR ($^1H$, $^{13}C$ and $^{31}P$), MALDI-TOF-MS, and C, H, N analysis. The surface morphological characteristics of the final dendrimer were understood by Scanning Electronic Microscopic study (SEM). The thermal stability of the final dendrimer was studied by TGA/DTA analysis.

Mass spectrometry와 NMR Spectroscopy를 이용한 1, 2-Octanediol Galactoside의 효소합성 확인 (Confirmation of Enzymatic Synthesis of 1, 2-Octanediol Galactoside using Mass Spectrometry and NMR Spectroscopy)

  • 이향렬;진홍종;안승혜;이혜원;정경환
    • 한국응용과학기술학회지
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    • 제38권3호
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    • pp.824-831
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    • 2021
  • 안전한 화장품용 방부제에 대한 연구를 위하여 1, 2-octanediol (OD)에 galactose 한 분자가 결합된 1, 2-octanediol galactoside (OD-gal)의 합성을 시도하였다. 이를 위하여, 재조합 대장균의 β-galactosidase (β-gal)를 이용하여 transgalactosylation 반응을 수행하였으며, OD-gal 합성을 확인하기 위하여 mass spectrometry 분석과 NMR (1H- and 13C-) spectroscopy 분석을 실시하였다. 합성반응물에서 m/z=331.1732의 sodium adduct ion 형태로 OD-gal 분자의 합성을 확인하였고, 정제된 OD-gal의 NMR 분석을 통하여 OD-gal의 1H NMR 스펙트럼에서 OD에 갈락토실화가 되었음을 보여주는 다양한 피크를 확인하였다. 1H NMR 스펙트럼의 다운필드인 δH 4.39 ppm과 δH 3.98~3.55 ppm에서 나타나는 다양한 피크들은 이들이 OD에 갈락토실화가 되었다는 것을 잘 암시하고 있으며, 또한 1H NMR 스펙트럼의 업필드에서 나타나는 δH 1.52~1.26 ppm과 0.89 ppm의 피크는 OD의 CH2 와 CH3 작용기로 부터 나타나는 피크로써 OD가 본 물질에 존재함을 알 수 있었다. 13C NMR 스펙트럼에서는 OD-gal의 알파-아노머와 베타-아노머의 구조에서 기인하는 총 24개의 탄소피크가 나타났고, 각 아노머 마다 14개의 탄소가 존재하는데 이중 δc 31.4, 29.0, 22.3 그리고 13.7 ppm에 보이는 OD 4개의 탄소는 지방족 사슬의 끝부분에 해당하며 화학적 구조의 유사성으로 인하여 탄소 피크가 겹쳐서 나타난 것으로 보인다. 따라서 총 28개의 탄소 피크 중 24개가 나타났다. 마지막으로, 합성된 OD-gal의 β-gal을 이용한 가수분해 반응을 통하여 OD-gal에 gal이 결합되어 있다는 것을 확인하였다. 이러한 결과를 바탕으로 세포독성이 감소된 첨가물 개발을 기대하고 있으며, 추가적인 후속연구를 진행할 예정이다.

Comparison of Metal Cleaning Effect on Pt Particles Supported on Carbon and Pt Black Observed by NMR, CV, and TEM

  • Han, Kee-Sung;Han, Oc-Hee
    • 한국자기공명학회논문지
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    • 제6권1호
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    • pp.38-44
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    • 2002
  • 60% Pt on Vulcan XC-72 with similar Pt sizes to fuel cell grade Pt black was investigated by $\^$13/C nuclear magnetic resonance spectroscopy (NMR), cyclic voltammery (CV), transmission electron microscopy (TEM). Experiments were carried out on electrochemically cleaned samples as well as as-received. The TEM and CV results showed that the average particle sizes were changed by cleaning. However, the chemical shift ($\delta$$\_$G/) of $\^$13/C of $\^$13/CO absorbed on Pt surfaces did not show any appreciable variation with particle size change as did in Pt black. These results indicate that a combination of different analytic techniques is essential to understand the properties of the metal particle catalysts and that the presence of carbon black support strongly influences the NMR data, probably through metal-support interaction.

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황금으로부터 항산화 활성 성분의 분리 (Isolation of Antioxidative Compound from Scutellaria baicalensis G.)

  • 김석창;안건석;박채규;전병선;이종태;박원종
    • 한국약용작물학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.212-216
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    • 2006
  • 황금 (Scutellaria baicalensis Gergi)에 함유된 항산화 억제활성 물질을 분리하고 항산화 효과에 대하여 조사한 결과는 다음과 같다. 1. 황금 500g을 100% MeOH로 추출하여 150g의 수율을 얻었으며, 다시 분획하여 Ethyl ether 13.2g과 n-BuOH 10.3g, Water 126.5g을 얻었다. 2. Ethyl ether 분획을 Column chromatography, TLC 및 HPLC를 이용하여 xanthine oxidase 억제활성을 가진 compound I을 분리하였다. 3. $^1H-NMR,\;^{13}C-NMR$, MS spectrometer 등 분광학적 방법을 이용하여 Compound I의 구조를 규명한 결과, flavonoid 물질로서 compound I은 구조식이 3,5,7-trihydroxy-2'-methoxy-flavanone로 확인되었다.

Complete $^1H$-NMR and $^{13}C$-NMR spectral analysis of the pairs of 20(S) and 20(R) ginsenosides

  • Yang, Heejung;Kim, Jeom Yong;Kim, Sun Ok;Yoo, Young Hyo;Sung, Sang Hyun
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제38권3호
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    • pp.194-202
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    • 2014
  • Background: Ginsenosides, the major ingredients of Panax ginseng, have been studied for many decades in Asian countries as a result of their wide range of pharmacological properties. The less polar ginsenosides, with one or two sugar residues, are not present in nature and are produced during manufacturing processes by methods such as heating, steaming, acid hydrolysis, and enzyme reactions. $^1H$-NMR and $^{13}C$-NMR spectroscopic data for the identification of the less polar ginsenosides are often unavailable or incomplete. Methods: We isolated 21 compounds, including 10 pairs of 20(S) and 20(R) less polar ginsenosides (1-20), and an oleanane-type triterpene (21) from a processed ginseng preparation and obtained complete $^1H$-NMR and $^{13}C$-NMR spectroscopic data for the following compounds, referred to as compounds 1-21 for rapid identification: 20(S)-ginsenosides Rh2 (1), 20(R)-Rh2 (2), 20(S)-Rg3 (3), 20(R)-Rg3 (4), 6'-O-acetyl-20(S)-Rh2 [20(S)-AcetylRh2] (5), 20(R)-AcetylRh2 (6), 25-hydroxy-20(S)-Rh2 (7), 25-hydroxy-20(S)-Rh2 (8), 20(S)-Rh1 (9), 20(R)-Rh1 (10), 20(S)-Rg2 (11), 20(R)-Rg2 (12), 25-hydroxy-20(S)-Rh1 (13), 25-hydroxy-20(R)-Rh1 (14), 20(S)-AcetylRg2 (15), 20(R)-AcetylRg2 (16), Rh4 (17), Rg5 (18), Rk1 (19), 25-hydroxy-Rh4 (20), and oleanolic acid 28-O-b-D-glucopyranoside (21).

Backbone assignment of the anticodon binding domain of human Glycyl-tRNA synthetase

  • Mushtaq, Ameeq Ul;Cho, Hye Young;Byun, Youngjoo;Jeon, Young Ho
    • 한국자기공명학회논문지
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    • 제20권2호
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    • pp.50-55
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    • 2016
  • Backbone $^1H$, $^{13}C$ and $^{15}N$ resonance assignments are presented for the anticodon binding domain (residues 557-674) of human glycyl-tRNA synthetase (GRS). Role of the anticodon binding domain (ABD) of GRS as an anticancer ligand has recently been reported and its role in other diseases like Charcot-Marie-Tooth (CMT) and polymyositis have increased its interest. NMR assignments were completed using the isotope [$^{13}C/^{15}N$]-enriched protein and chemical shifts based secondary structure analysis with TALOS+ demonstrate similar secondary structure as reported in X-ray structure PDB 2ZT8, except some C-terminal residues. NMR signals from the N-terminal residues 557 to 571 and 590 to 614 showed very weak or no signals exhibiting dynamics or conformational exchange in NMR timescale.

활성화된 비산회 촉매를 이용하여 간단히 수행된 1,2,4,5-Tetrazines의 One-pot 합성 (Easy-to-execute 'One-pot' Synthesis of 1,2,4,5-Tetrazines Catalyzed by Activated Fly Ash)

  • Gopalakrishnan, M.;Thanusu, J.;Kanagarajan, V.
    • 대한화학회지
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    • 제51권6호
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    • pp.520-525
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    • 2007
  • Thiourea/urea, 다양한 aromatic aldehydes, ammonium acetate의 세가지 요소를 가지고 마이크로파의 조 사하에서 무수조건의 활성화된 비산화재를 촉매로 사용하여 높은 수율의 6-aryl-1,2,4,5-tetrazinan-3-thiones/ones를 얻었 다. 6-aryl-1,2,4,5-tetrazinan-3-thiones/ones의 구조는 녹는점, MS, IR, 1H NMR, D2O 교환, 13C NMR, 이차원의 NMR 스펙트럼(HOMOCOR, HSQC)을 바탕으로 증명되었다.

대장균 베타-갈락토시데이즈를 이용하여 합성된 1, 2-Hexanediol Galactoside의 NMR Spectroscopy 및 Mass spectrometry (NMR Spectroscopy and Mass Spectrometry of 1, 2-Hexanediol Galactoside synthesized using Escherichia coli β-Galactosidase)

  • 김이옥;이향렬;정경환
    • 한국응용과학기술학회지
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    • 제33권2호
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    • pp.286-292
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    • 2016
  • 화장품용 방부제로 사용하고 있는 1, 2-hexanediol (HD)에 높은 농도의 lactose (300 g/l)를 넣고, 재조합 대장균 ${\beta}$-galactosidase (${\beta}$-gal)를 이용하여 galactose 한 분자를 결합시키는 transgalactosylation 반응을 시켜서, 1, 2-hexanediol galactoside (HD-gal)을 합성하였다. 그리고, 합성된 HD-gal 분자를 확인하기 위하여, HD-gal에 대한 NMR ($^1H$- and $^{13}C$-) 스펙트럼 분석과 mass 스펙트럼 분석을 실시하였다. HD-gal의 $^1H$ NMR 스펙트럼에서 HD에 갈락토실화가 되었음을 보여주는 다양한 피크를 확인하였다. $^1H$ NMR 스펙트럼의 다운필드인 ${\delta}_H$ 4.44 ppm과 ${\delta}_H$ 3.96~3.58 ppm에서 나타나는 다양한 피크들은 HD에 갈락토실화가 되었다는 것을 잘 암시하고 있으며, 또한 $^1H$ NMR 스펙트럼의 업필드에서 나타나는 ${\delta}_H$ 1.60~1.35 ppm과 0.92 ppm의 피크는 HD의 $CH_2$$CH_3$ 작용기로부터 나타나는 피크로써 HD가 본 물질에 존재한다는 것을 나타내고 있다. $^{13}C$ NMR 스펙트럼에서는 HD-gal의 알파-아노머와 베타-아노머의 구조에서 기인하는 총 21의 카본피크가 나타났고, 각 아노머마다 12개의 카본이 존재하는데 이중 ${\delta}_C$ 68.6, 60.9 and 13.2 ppm에 보이는 3개의 카본은 겹쳐서 나타나 총 24개의 피크 중 21개가 나타났다. 또한, 질량스펙트럼 분석에서는 protonated HD-gal인 281.1601 (m/z)의 peak를 확인할 수 있었다. 이를 종합하면, NMR ($^1H$- and $^{13}C$-) 스펙트럼 분석 결과와 질량분석 결과들은 우리가 기대했던 HD-gal의 구조와 매우 잘 일치하고 있다는 것을 알 수 있었다. 앞으로 추가적으로, 세균에 대한 minimum inhibitory concentrations (MICs) 조사와 human skin cell에 대한 독성연구를 추가적으로 진행할 예정이며, 이러한 결과를 근거로 항균력을 유지하면서 피부세포에 대한 독성이 감소된 화장품용 방부제의 연구/개발이 계속되기를 기대하고 있다.

고들빼기 생리활성물질의 검색 (Exploitation of the biologically active components in Youngia sonchifolia Max)

  • 신수철
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제36권2호
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    • pp.134-137
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    • 1993
  • 우리나라 전지역의 산과 들에 야생하고 있는 고들빼기(Youngia sonchifolia Max.)는 전통식품인 고들빼기 김치의 원료로 이용될 뿐만 아니라 오래전부터 민간에서 위장장애 치료재로 이용되어 왔다. 그래서 고들빼기의 생화학적 활성 및 항암 실험과 그 특수성분을 분석하였는데 hexane 추출물 중에서 silica gel column chromatography와 재결정으로 얻어낸 화합물은 무색판상 결정으로 융점이 $280{\sim}282^{\circ}C$ 이었으며 구조결정을 위해 $^{13}C-NMR$, $^1H-NMR$, MS로 분석한 결과 pentacyclic triterpene인 bauerenyl acetate인 것을 확인하였다.

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