TNT 분해 세균 Stenotrophomonas sp. OK-5는 세 개의 다른 NAD(P)H-nitroreductase의 활성 fractions (NTR fractions I, II, III)을 갖고 있는 것으로 확인된 바 있다. 본 연구에서는 NTR fractions I, II, III에 대한 생리학적 특성과 분자생물학적 특성을 규명하고자 하였다. TNT에 대한 균주 OK-5의 NTR fractions I, II, 그리고 III의 활성은 억제 물질인 $\beta$-mercaptoethanol의 첨가 시에 효소의 활성 이 모두 억제되는 것으로 확인되었다. TNT와 그 유사 기질을 이용하여 균주 OK-5에서 분리된 NTR의 기질 특이성을 조사한 결과, nitrobenzene, 그리고 RDX에 대 해서는 비교적 활성 이 높게 나타났으나 2,6-DNT와 2,4-DNT에서는 낮은 활성을 나타내는 것으로 확인되었다. 균주 OK-5에서 정제된 NTR fraction I의 N-말단 아미노산 서 열은 $^1MSDLLNADAVVQLFRTARDS^20$로 분석되었고, Xanthomonas campestris의 NTR과 X. axonopodis의 NTR에서 각각 70%와 65%로 비교적 높은 유사성을 가지는 것으로 나타났다. 균주 OK-5의 NTR fraction I의 효소를 암호화하는 SmOK5nrI 유전자의 염기서열을 확인하고 분석된 유전자로부터 유추되는 아미노산 서열을 각각 비교한 결과 X. campestris의 NTR과 81%, X. axonopodis의 NTR과 75%,그리고 Streptomyces avermitilis의 NTR과 30%의 유사성이 있는 것으로 조사되었으나, Pseudomonas putida KT2440의 NTR (pnrB)과는 16%로 낮은 유사성이 있는 것으로 확인되었다.
네가지 쌀단백군의 양적 관계는 주로 추출조건에 의하여 좌우되며 albumin 및 globulin의 추출양은 교반방법보다 추출온도에 의하여, glutelin은 사용용매의 종류와 pH에 의하여 추출양이 크게 좌우되었다. 적합한 쌀단백질의 추출로는 albumin 및 globulin은 0.5M-NaCl용액으로 $0{\sim}5^{\circ}C$에서, prolamin은 70%(v/v) ethanol용액으로 상온에서, glutelin은 0.1N acetic acid보다는 0.5% SDS-borate buffer (pH 8.3) 과 0.6% ${\beta}-mercaptoethanol$을 포함한 동일용액을 사용하는 것이 효과적이었다. 상기방법으로 추출한 각 단백군 구성성분의 분자량 분포는 albumin은 29,000, $18,000{\sim}15,000$ 및 12,000의 세가지이며 globulin은 27,000, 21,000 17,000 및 12,000의 4가지 이외에 고분자량의 단백질($10^5$이상)로 되어 있고 prolamin은 16,000, 0.5% SDS-borate buffer에 가용성인 glutelin은 35,000, 21,000, 17,000 및 15,000의 4가지와 이외에 globulin의 경우와 같이 고분자 단백질로 구성되어 있었다. Prolamin을 제외한 세 단백군은 각각 disulfide bond로 연결된 subunit를 가지고 있는 구성성분을 포함하고 있음을 알 수 있었다. SDS-glutelin은 Sephadex G-150 column chromatography에 의하여 세가지 fraction으로 분리할 수 있었다. Albumin과 globulin은 starch gel 전기영동상 산성 (pH 3.1)에서는 총 13개 및 21개의 band를 각각 나타내었고 염기성 (pH 8.95)에서는 총 4개 및 6개의 band를 확인할 수 있었다. 쌀품종들은 albumin과 globulin의 starch gel전기영동 pattern에 의하여 구별할 수 있었다. 산성조건에서는 특수 band의 존재 또는 band의 조합양상에 의하여 각 품종의 구별이 가능하였고 염기성조건에서는 각 품종별 구별은 할 수 없었으나 Japonica종을 Indica 또는 Japonica와 Indica교배종과 분리 식별할 수 있었다.
A $C_{1}$ enriched cellulase fraction was separated from culture filtrate of anaerobic Clostridium thermocellum by hydroxyapatite column chromatography. The separated fraction showed strong synergistic action with $C_{x}$ component (endo-$\beta$-1, 4-glucanase) in digestion of crystalline cellulose, similar to the other aerobic cellulolytic microorganisms. Unlike the $C_{x}$ component the $C_{1}$ enriched fraction was rapidly inactivated by oxidation at the atmospheric condition. The enzyme activity was significantly enhanced by the addition of reducing agents, especially $\beta$-mercaptoethanol, which indicates that a $C_{1}$ component has a lot of sulfhydryl groups essential for the enzyme activity. The effect of metal ions on $C_{1}$ activity was also investigated. The $C_{1}$ fraction was found to be thermally stable compare to endo-$\beta$-1,4-glucanase. Optimal temperature and pH were found to be 60.deg.C and 6.0, respectively.
Km값 및 분광학적성질(分光學的性質)를 조사하고 아울러 이 효소(酵素)의 결정화법(結晶化法)을 검토하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 효소(酵素)의 정제(精製)과정에서 유안분별침전(硫安分別沈澱)을 한 조효소(粗酵素)를 pH6.0 및 7.0의 인산염(燐酸鹽)완충액으로 48시간 이상의 충분한 투석(透析)을 시키고 DEAE-Sephadex column chromatography에서는 11mg protein/ml DEAE-Sephadex 정도의 DEAE-Sephadex를 사용하는 것이 효과적이였다. 2. 효소(酵素)의 정제과정(精製過程)에서 이미 알려진 protamin 황산(黃酸) 처리와 Sephadex G-150의 gel여과는 생략하여도 무방하였다. 3. 효소(酵素)의 결정화(結晶化)에서는 단백질을 20mg/ml의 농도가 되게끔 2-mercaptoethanol를 함유하는 0.01M 인산(燐酸)카리 완충액에 녹여 고체유안(固體硫安) 첨가(添加)법으로 결정(結晶)시키는 것이 가장 큰 육각봉상(六角棒狀)의 결정(結晶)이 얻어졌다. 4. Pyridoxal phosphate와 결합(結合)한 holo형 ${\beta}-tyrosinase$는 340nm와 430nm의 파장(波長)에서 각각 최대흡수(最大吸收)를 나타내었다. 5. ${\beta}-tyrosinase$의 L-tyrosine에 대한 Km값은 $2.31{\times}10^{-4}M$이였으며 SDS-polyacrylamide 전기영동법(電氣泳動法)에 의한 이 효소(酵素)의 subunit의 분자량(分子量)은 약 5,000이였다.
다수확계(통일벼) 및 일반계 각각 3가지 품종의 각 출수후 6시기의 쌀종자에서 2% sodium dodecyl sulfate/5% ${\beta}-mercaptoethanol$로 단백질을 추출하여 1차원에서 등전점에 따라 분리한 후 2차원에서 분자량에 따라 분리하는 2차원 전기영동으로 각각의 단백질 지도를 작성하였다. 종합단백질 지도를 작성하였고 pH $5.2{\sim}8.3$, 분자량 $20,000{\sim}100,000$의 범위에서 300개 이상의 spots이 관찰되었다. 품종 및 출수시기에 따라 단백질 지도가 많은 차이를 보였다.
Rahnella aquatilis AY2000 균주는 항효모성 물질(AYS)을 생산하지만, AYS가 저장 중에 활성이 감소되는 경향이 있었다. 따라서 본 연구에서는 AYS활성이 저하되는 원인을 알아보기 위하여 AYS에 다양한 이화학적인 처리를 행하였다. 그 결과 열처리가 AYS의 활성을 감소시키는 하나의 인자이며, AYS를 침전시키는 유기용매인 methanol의 사용 또한 AYS의 활성을 감소시키는 원인이었다. 또한 $\beta$-mercaptoethanol 과 dithiothreitol 등 thiol화합물 역시 AYS의 활성을 감소시키는 인자로 작용하였으나, pH, EDTA나 NaCl은 AYS의 활성저하를 가져오지 않았다. 한편, 정제과정에서 AYS의 조성분 중 다당류와 미지의 물질(230 nm)을 DEAE-cellulose 이온교환수지로 분리시키면 AYS의 활성이 완전히 소실되지만, AYS를 Sephacryl S-400 gel 여과를 행하여 이들 성분이 분리되지 않은 상태에서는 그 활성이 잘 유지되었다. 본 실험에 사용된 AYS의 MIC는 S. cerevisiae 대해 $7.8-15.6{\mu}g/mL$ 범위로 측정된다.
본 연구는 돼지 체세포의 clonal cell lines을 효율적으로 확립할 수 있는 배양방법을 제시하기 위하여 실시하였다. 50일령의 돼지태아로부터 섬유아세포를 회수하여 2회 계대배양 후 단일 세포를 96-well plate와 4-well dish에서 배양하여 배양액내의 FBS농도(10, 30, 50%), 첨가제(catalase, $\beta$-mercaptoethanol; BME), 세포의 크기(<16, 16~20, 20<) 및 형태(smooth, rough)에 따른 cell line 확립 효율을 검토하였다. FBS 농도에 따른 clonal line 확립 효율과 PD를 검토한 결과, 효율에 있어서 30% FBS 처리구(5.1%)가 10%(0.3%) 및 50%처리구(2.1%)보다 비교적 높게 나타났으나 유의적 차이는 없었으며, PD의 경우는 10, 30, 50%처리구에서 각각 36.7, 29.4, 26.3 시간으로 FBS 농도가 증가할수록 PD 시간이 유의적으로 짧아졌다(p<0.05). 배양액 첨가제에 있어서 BME 가시 무처리구나 catalase 첨가시보다 유의적으로 높은 효율을 보였으며(11.4%, 3.2%, 3.2%; p<0.05), PD 시간은 짧게 나타났다(23.6, 25.5, 28.1; p<0.05). 그러나 catalase는 cell line 확립 효율에 영향을 미치지 않는 것으로 나타났다. 세포의 크기에 따른 cell line 확립효율은 5.2~8.2%로 크기에 따른 차이는 보이지 않았으며, PD 또한 23.7~27.9 시간으로 세포 크기에 따른 차이는 없었다. 세포의 형태에 따른 세포의 부착율은 smooth(55.8%)구가 rough(73.0%)구보다 유의적으로 낮게 나타났으나(p<0.05), clonal line 확립 효율(7.7%n vs. 6.6%) 및 PD(23.5h vs. 24.0h)에서는 차이가 없었다. 본 연구의 결과, 세포의 형태에 따른 cell line 확립 효율은 큰 차이가 없었으나, 세포 배양액내에 30% FBS와 BME의 첨가로 clonal cell line 확립 효율을 향상시킬 수 있음을 확인할 수 있었다. 또한 cell line 확립 효율이 높아질수록 PD 시간이 짧아지는 경향을 볼 수 있었다.
할미송이버섯으로부터 혈전용해효소 (FE-2)를 DEAE-cellulose, Mono-S column으로 분리 정제하였다. 이 효소는 분자량이 18.2 kDa 이었으며, ICP-MS (inductively coupled plasma mass spectrometer) 분석 결과 $Zn^{2+}$을 포함하고 있었다. 15번째까지의 N-terminal amino acid 서열은 A-L-Y-V-G-X-S-P-X-Q-Q-S-L-L-V이고, pH 7.5에서 활성이 가장 큰 염기성 단백질 분해효소로, EDTA와 1,10-phenanthroline에 의해 활성이 감소되는 metalloprotease였다. $Mg^{2+}$, $Zn^{2+}$, Fe$^{2+}$, Co$^{2+}$의 첨가 시 활성이 증가하였으나 Hg$^{2+}$의 경우 활성이 완전히 소멸되었다. 이 효소 (FE-2)는 단백질 분해효소 저해제인 E-64 (trans-epoxysuccinyl-L-leucylamido-(4-guanidino)-butane), PMSF (phenylmethylsulfonyl fluoride), pepstatin 과 2-mercaptoethanol의 영향을 받지 않으며, 섬유소원 (fibrinogen)과 반응 시 $A\alpha$ chain과 B$\beta$ chain은 분해시키지만 $\gamma$ chain과는 반응하지 않았다.
Tyrosinase는 식물의 갈변현상에 관계가 있으며, 이의 방지를 위한 방법의 개발은 과학적인 관심사가 되고 있다. 솔잎으로부터 3개의 tyrosinase isozyme을 정제하여 그들의 활성에 영향을 주는 인자들을 분석하였다. L-ascorbic acid와 ${\beta}$-mercaptoethanol은 효소의 활성을 크게 저해하였다. 또한 sodium diethyldithio-carbamate도 효소활성에 대한 경쟁적 저해제였으며, $K_i$ 값은 $P_1$(0.030 mM), $P_2$(0.015 mM), $P_3$(0.019 mM)이였다. 반면 대부분의 금속이온들은 효소활성을 증가시켰다. L-DOPA를 기질로 사용했을 때 효소의 최적 pH는 9.0~9.5이며, 최적 온도는 $55{\sim}60^{\circ}C$를 나타내었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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