Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

SeqWeB: Sequence Annotation System based on SOA

SeqWeB: SOA 기반의 서열 주해 시스템

  • 남성혁 (충북대학교 충북BIT연구중심대학육성사업단) ;
  • 정태성 (충북대학교 충북BIT연구중심대학육성사업단) ;
  • 김태경 (충북대학교 충북BIT연구중심대학육성사업단) ;
  • 유재수 (충북대학교 충북BIT연구중심대학육성사업단) ;
  • 조완섭 (충북대학교 충북BIT연구중심대학육성사업단)
  • Published : 2007.10.26
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Abstract

서열을 분석하고, 기능을 예측하는 서열 주해는 생명 현상 규명을 위한 필수 과정이다. 서열 주해는 다수 응용 프로그램간 상호 연계를 통한 복잡한 처리 과정을 거쳐 이루어진다. 현재 사용자는 다양한 응용 프로그램들 중 적합한 응용 프로그램을 선택한 후, 운영환경에 맞도록 설치하고, 사용법을 익혀야 한다. 또한 각 프로그램들의 연계를 위해 입출력 데이터 형식을 변환해야 하는 불편함이 있다. 이를 위해 자동화된 솔루션들이 개발되고 있지만, 각 단계별 프로그램들이 강결합(tightly coupled)되어 있어 유연성(flexibility)이 떨어지고, 기능의 확장 및 변경에 어려움이 있다. 본 논문에서는 기존 시스템들의 한계를 극복하기 위하여 SOA (Service Oriented Architecture) 기반의 서열 주해 시스템인 SeqWeB을 제안한다. SeqWeB은 서열 주해에 필요한 7개의 응용 프로그램(Phred, cross_match, RepeatMasker, ICAtools, Phrap, CAP3, Blast)들을 웹 서비스 기술을 통해 단위 서비스로 개발하고, BPM 기법을 이용하여 통합하였다. SeqWeB은 각 응용 프로그램간 상호 운용성을 높이기 위하여 XML 형식의 입/출력 데이터를 사용하며, SOA 기반의 시스템 통합으로 각 응용 프로그램들을 약결합(loosely coupled)하여 시스템의 확장 및 변경이 용이하다. 또한 웹을 기반으로 하는 다양한 조합의 서열 주해 솔루션 제공이 가능한 특징이 있다.

Keywords