• BMB Reports
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• 제41권11호
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• pp.778-783
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• 2008

Turnip yellow mosaic virus (TYMV) RNA has two hairpins in its 5' untranslated region (5'-UTR). To investigate the role of the hairpins in replication of TYMV, mutants lacking one or both of the two hairpins were constructed. The TYMV constructs were introduced into Chinese cabbage by an Agrobacterium-mediated T-DNA transfer method, called agroinfiltration. Analysis of total RNA from agroinfiltrated leaves showed that replication of the mutant TYMV RNA lacking both hairpins was about 1/100 of wild type. This mutant was also impaired in systemic spread. Deletion analysis of each hairpin revealed that both hairpins were needed for maximal replication. The deletion analysis along with sequence modification of the hairpin structure indicates that the second hairpin plays a role in efficient long-distance systemic movement of TYMV.

• 식물병연구
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• 제29권1호
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• pp.88-93
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• 2023

충북지역 수박과 멜론재배지에서 2020년부터 2021년까지 시료를 채집하여 reverse transcription polymerase chain reaction으로 유전자 진단을 실시해 바이러스 발생현황을 조사하였다. 2020년 수박에서는 정식 전 접목묘에 대해 바이러스를 검정했을 때 음성군과 진천군 두 곳에서 cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV)만이 각각 8%의 감염률을 보였다. 6월에는 진천군과 음성군 모두에서 watermelon mosaic virus (WMV), CGMMV, cucurbit aphid-borne yellows virus (CABYV)가 공통적으로 검출되었으며, 감염률은 진천군이 WMV 3.7%, CGMMV 11.1%, CABYV 3.7%이었고 음성군은 WMV 15.8%, CGMMV 33.3%, CABYV 3.5%로 음성군이 진천군에 비해 WMV와 CGMMV 감염률이 높았다. 2021년 3월부터 5월까지 월별로 수박재배지에서 바이러스를 검정했을 때 3월에는 음성군과 진천군 모두에서 바이러스가 검출되지 않았으며, 4월에는 진천군에서 CGMMV 1.6%, 음성군에서는 WMV 0.4%, CGMMV 38.5% 발생하였다. 5월에는 진천군에서 cucumber mosaic virus (CMV) 35%, CGMMV 10%, 음성군에서는 CMV 20.9%, CGMMV 29% 발생하였다. 충북지역에서 수박 바이러스 조사기간 동안 zucchini yellow mosaic virus (ZYMV)와 cucurbit chlorotic yellows virus (CCYV)는 검출되지 않았으며, 2020년에는 발생되지 않았던 CMV가 2021년도에 발생하였다. 2020년부터 2021년까지 멜론재배지에서 최근 문제가 되고 있는 CABYV와 CCYV 발생을 조사했을 때 CABYV는 조사기간 동안 음성군과 진천군 모두에서 발생되었고 감염률은 53.9-92.2%였다. CCYV는 2020년에 음성군에서만 20.8% 2021년에는 진천군에서만 2.7% 발생하였다.

• 한국작물학회지
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• 제48권6호
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• pp.501-505
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• 2003

보리호위축병 피해지역에 대한 수량감소의 예측을 위하여, 보리호위축병(BaYMV)에 대한 저항성 품종과 이병성 품종간 수량구성요소, 수량 및 증질 변이를 건전구와 이병구에서 비교 조사하였다. 1. 보리호위축병의 이병주는 BaYMV에 감염된 것으로 나타났으며, 이병정도는 감수성 품종인 백동에서 9, 저항성 품종인 내한쌀보리에서 1정도 발병하였다. 2. 감수성 품종인 백동은 천립중을 제외한 간장, 수당립수, $\textrm{m}^2$당 수수 등의 수량구성요소가 유의하게 감소하였으며, 수량은 대조구의 20%수준으로 현저히 감소하였다. 3. 보리호위축병 감염구에서 종자의 발아율은 감수성 품종과 저항성 품종간에 차이가 없었으나, 정립률은 감수성 품종인 백동에서 설립중이 유의하게 증가하였으며, 대조구에 비하여 정립률과 조단백질 함량 모두 유의한 차이를 보였다. 4. 보리호위축병은 간장, 수량, 정립률, 수수, 천립중, 1수립수 등의 피해와 부의 상관을, 조단백질 함량과는 정의 상관을 보여 보리호위축병에 이병이 되면 수량 및 품질에 크게 피해를 주는 것으로 나타났다.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제63권3호
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• pp.189-195
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• 2020

The soybean (Glycine max L.), also known as the soya bean, is an economically important legume species. Pathogens are always major threats for soybean cultivation. Several pathogens negatively affect soybean production. The soybean is also known as a susceptible host to many viruses. Recently, we carried out systematic analyses to identify viruses infecting soybeans using soybean transcriptome data. Our screening results showed that only few soybean transcriptomes contained virus-associated sequences. In this study, we further carried out bioinformatics analyses using a soybean flower bud transcriptome for virus identification, genome assembly, and single nucleotide variations (SNVs). We assembled the genome of Soybean yellow common mosaic virus (SYCMV) isolate China and revealed two SNVs. Phylogenetic analyses using three viral proteins suggested that SYCMV isolate China is closely related to SYCMV isolates from South Korea. Furthermore, we found that replication and mutation of SYCMV is relatively low, which might be associated with flower bud tissue. The most interesting finding was that SYCMV was not detected in the cytoplasmic male sterility (CMS) line derived from the non-CMS line that was severely infected by SYCMV. In summary, in silico analyses identified SYCMV from the soybean flower bud transcriptome, and a nearly complete genome of SYCMV was successfully assembled. Our results suggest that the low level of virus replication and mutation for SYCMV might be associated with plant tissues. Moreover, we provide the first evidence that male sterility might be used to eliminate viruses in crop plants.

• 식물병연구
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• 제23권4호
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• pp.363-366
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• 2017

최근 국내 맥류 재배지에서는 대부분 BaMMV, BaYMV, BYDV의 발생이 확인되고 있다. 본 연구에서는 multiplex reverse transcription polymerse chain reaction (mRT-PCR) 방법에 의해 이들 3종류의 바이러스를 동시에 진단하는 방법을 확립하였다. 이들 3종 바이러스의 외피단백질 유전자 정보를 활용하여 각 바이러스에 대한 primer를 제작하였다. mRT-PCR에 사용한 primer는 RT-PCR 반응의 민감도와 특이성에 의해 선발하여 primer 농도와 mRT-PCR의 조건을 설정하였다. 각 바이러스에 대하여 선발된 primer 사용에 의한 mRT-PCR 결과 BaMMV 594 bp, BaYMV 461 bp, BYDV 290 bp의 PCR 산물을 얻을 수 있었다. 본 연구에서 확립된 맥류 바이러스 동시진단방법은 신속하고 특이적인 진단 뿐 아니라 맥류 바이러스병의 전염 등 역학 연구에도 활용 될 것으로 기대된다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제22권1호
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• pp.46-50
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• 2006

A virus causing chlorotic ringspot, yellow mosaic and vein clearing symptoms was prevalent on mungbean plants around Taean, Korea. The isolate caused mosaic on Chenopodium quinoa, Nicotiana benthamiana, Phaseolus vulgaris and Vida laba but no symptoms on peanut plants. Inclusion bodies such as scroll, pinwheel and laminated aggregates induced by the virus in the host cells were similar to those produced by members of the Potyvirus subdivision III. Multiple alignment as well as cluster dendrograms of the 709 nucleotide region comprising part of the coat protein gene and 3'untranslated region (UTR) showed that the isolate belongs to the BCMV-PSt subgroup. Altogether, these results support the identification of the causal virus as peanut stripe strain of Bean common mosaic virus (BCMV-PSt).

• 한국응용곤충학회지
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• 제17권1호
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• pp.33-35
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• 1978

모자익병징을 나타내는 이병시금치를 채집하여 순무모자익 바이러스를 분류 동정하였다. 분리된 순무모자익바이러스를 지표식물에 접종한 결과 담배(B.Y)와 명아주에는 국부병반이 형성되었고 쑥갓, 시금치, 무우에는 모자익 병징이 나타났다. 이병시금치 잎을 착즙하여 순무모자익바이러스의 항혈청과의 혈청반응 시험 결과 양성 반응이 나타났다. 이병엽을 Dip법으로 시료를 제작하여 전자현미경에서 검경한 결과 대부분이 750nm의 사상 입자가 관찰되었다. 시금치에서 순무모자익바이러스의 발생분포는 수원, 안양, 대구, 진주 등 거의 전국적으로 발생하였다

• 식물병연구
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• 제14권2호
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• pp.138-141
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• 2008

경상북도 오이 주산단지인 상주와 군위지역의 바이러스 병 발생을 조사한 결과 포장 발생율은 $55.0{\sim}88.6%$였으며, 상주지역이 군위보다 약간 높게 나타났다. 바이러스 발병 포장의 이병주율은 2006년 상주 지역에서 평균 25.6%로 매우 높게 나타났으며, 발생범위는 최소 1.5%에서 최대 90%로 농가별로 편차가 매우 심하였다. 포장에서 바이러스 증상으로 관찰되는 시료 217점을 RT-PCR을 이용하여 바이러스 종류를 분석한 결과 ZYMV가 85% 이상으로 가장 많이 검출되어 오이에 피해를 주는 주요 바이러스로 나타났다. ZYMV에 감염된 오이는 잎에 황화 및 심한 모자이크 증상이 나타났으며 일부 과일은 곡과 증상과 함께 표면이 울퉁불퉁하게 나타났다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제23권4호
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• pp.260-265
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• 2007

Testing a large number of samples from field monitoring and routine indexing is cumbersome and the available virus detection tools were labor intensive and expensive. To circumvent these problems we established tissue blot immunoassay (TBIA) method an alternative detection tool to detect Barley mild mosaic virus (BaMMV) and Barley yellow mosaic virus (BaYMV) infection in the field and greenhouse inoculated plants for monitoring and routine indexing applications, respectively. Initially, leaf and stem were tested to determine suitable plant tissue for direct blotting on nitrocellulose membrane. The dilutions of antibodies were optimized for more efficient and economical purposes. Results showed that stem tissue was more suitable for direct blotting for it had no background that interferes in the reaction. Therefore, this technique was referred as direct stem blot immunoassay or DSBIA, in this study. Re-used diluted (1:1000) antiserum and conjugate up to 3 times with the addition of half strength amount of concentrated antibodies was more effective in detecting the virus. The virus blotted on the nitrocellulose membrane from stem tissues kept at room temperature for 3 days were still detectable. The efficiency of DSBIA and RT-PCR in detecting BaMMV and BaYMV were relatively comparable. Results further proved that DSBIA is a rapid, reliable and economical detection method suitable for monitoring BaMMV and BaYMV infection in the field and practical method in indexing large scale of barley materials for virus resistance screening.

• 한국육종학회지
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• 제41권4호
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• pp.612-615
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• 2009

Lipoxygenase and Kunitz trypsin inhibitor protein are the main antinutritional factor in mature soybean seed. A new soybean cultivar, "Gaechuck#2" with yellow seed coat, lipoxygenase2,3-free and Kunitz trypsin inhibitor protein-free was developed. It was selected from the population derived from the cross between "Jinpumkong2ho" and C242. Plants of "Gaechuck#2" have determinate growth habit with purple flowers, tawny pubescence, yellow seed coat, yellow hilum, oval leaflet shape and brown pods at maturity. Seed protein and oil content on a dry weight basis were 40.7% and 18.7%, respectively. It has shown a resistant reaction to soybean necrosis, soybean mosaic virus, Cercospora leaf spot and blight, black root rot, pod and stem blight, and soybean pod borer. Gaechuck#2 matured in 4 October with plant height of 54cm and a 100-seed weight of 24.4g. Average Yield of Gaechuck#2 was 230 - 250 kg/10a in 2005 - 2007.