합성 및 두부 제조 폐수로부터 혐기 세균 복합체를 이용하여 수소를 생산하였다. 수소생산 혐기 세균 복합체는 하수처리장 농축 소화조에서 발생하는 슬러지를 $90^{\circ}C$에서 20분간 열처리하여 얻었다. 혐기 세균 복합체는 $37^{\circ}C$ 회분식 운전조건에서 1% (w/v) 포도당 함유 PYG (peptone-yeast extract-glucose) 배지로부터 1.15 L-$H_2$/g-균체건조량의 수소를 생산할 수 있었고, 이때 주요 유기산으로 15 mM acetate와 32 mM butyrate가 생성되었다. 같은 발효조건에서 1.4% 전분과 0.07% 환원당을 포함하는 두부 제조 폐수로부터 1.76 L $H_2$/L-두부제조폐수의 수소를 발생하였다. 이와 같은 결과로 부터 포도당과 두부 제조 폐수로부터 혐기세균 복합체에 의한 수소생산 효율은 각각 1.9과 0.9 mol $H_2$/mol 포도당을 나타내었다. 반연속운전(HRT, 12 시간)시 합성폐수를 이용하여 60일 이상 안정적으로 수소를 생산할 수 있었고, 이 때 혐기 세균 복합체는 1.3-2.0 L $H_2$/L-배양액을 발생하였다. PCR-DGGE(polymer chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis) 분석결과, 반응기 내 세균 복합체의 주요 미생물은 Clostridium 종이었다. 본 연구는 적절한 열처리를 통해 혐기 소화조 슬러지로부터 고활성 수소생산 세균 복합체를 얻을 수 있으며, 이들 세균 복합체를 이용하여 합성 및 두부제조 폐수로부터 효율적인 수소생산이 가능하다는 것을 나타내고 있다.
Carboxyl-terminal binding proteins (CtBPs) are transcription regulators that control gene expression in multiple cellular processes. Our recent findings indicated that overexpression of CtBP2 caused the repression of multiple bone development and differentiation genes, resulting in atrophic nonunion. Therefore, disrupting the CtBP2-associated transcriptional complex with small molecules may be an effective strategy to prevent nonunion. In the present study, we developed an in vitro screening system in yeast cells to identify small molecules capable of disrupting the CtBP2-p300 interaction. Herein, we focus our studies on revealing the in vitro and in vivo effects of a small molecule NSM00158, which showed the strongest inhibition of the CtBP2-p300 interaction in vitro. Our results indicated that NSM00158 could specifically disrupt CtBP2 function and cause the disassociation of the CtBP2-p300-Runx2 complex. The impairment of this complex led to failed binding of Runx2 to its downstream targets, causing their upregulation. Using a mouse fracture model, we evaluated the in vivo effect of NSM00158 on preventing nonunion. Consistent with the in vitro results, the NSM00158 treatment resulted in the upregulation of Runx2 downstream targets. Importantly, we found that the administration of NSM00158 could prevent the occurrence of nonunion. Our results suggest that NSM00158 represents a new potential compound to prevent the occurrence of nonunion by disrupting CtBP2 function and impairing the assembly of the CtBP2-p300-Runx2 transcriptional complex.
한국식물학회 1999년도 제13회 식물생명공학심포지움 New Approaches to Understand Gene Function in Plants and Application to Plant Biotechnology
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pp.63-67
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1999
We have isolated more than a dozen cDNA clones corresponding to genes that were expressed in Arabidopsis leaves when they were kept in the dark. The nucleotide sequence analysis showed that some of the clones encoded proteins with significant homology to $\beta$-glucosidase (din2), branched-chain $\alpha$-keto acid dehydrogenase subunit E1$\beta$(din3), and another subunit E2 (din4), yeast RAD23 (din5), asparagine synthetase (din6), pre-mRNA splicing factor SRp35 (din7), phosphomannose isomerase (din9), seed imbibition protein (din10), and 2-oxoacid-dependent oxidase (din11). Accumulation of transcripts from din3,4,6 and 10 occurred rapidly after the plants were transferred to darkness. Transcripts from din2,9, and 11 could be detected only after 24 h of dark treatment. Inhibition of photo-synthesis by DCMU strongly induced the accumulation of transcripts from those genes, and application of sucrose to detached leaves suppressed the accumulation both in the dark and by DCMU. These observations indicate that expression of the genes is caused by sugar starvation resulted from the cessation of photosynthesis. We further showed that din2-encoded protein also accumulated in senescing leaves. Given these results, possible roles of din genes in leaves in the dark and senescing leaves are discussed.
Discovery of $\alpha$-glucosidase inhibitors has been actively pursued with the aim to develop therapeutics for the treatment of diabetes and the other carbohydrate mediated diseases. As a method for the discovery of new novel inhibitors of $\alpha$-glucosidase, we have addressed the performance of the computer-aided drug design protocol involving the homology modeling of $\alpha$-glucosidase and the structure-based virtual screening with the two docking tools: FlexX and the automated and improved AutoDock implementing the effects of ligand solvation in the scoring function. The homology modeling of $\alpha$-glucosidase from baker’s yeast provides a high-quality 3-D structure enabling the structure-based inhibitor design. Of the two docking programs under consideration, AutoDock is found to be more accurate than FlexX in terms of scoring putative ligands to the extent of 5-fold enhancement of hit rate in database screening when 1% of database coverage is used as a cutoff. A detailed binding mode analysis of the known inhibitors shows that they can be stabilized in the active site of $\alpha$- glucosidase through the simultaneous establishment of the multiple hydrogen bond and hydrophobic interactions. The present study demonstrates the usefulness of the automated AutoDock program with the improved scoring function as a docking tool for virtual screening of new $\alpha$-glucosidase inhibitors as well as for binding mode analysis to elucidate the activities of known inhibitors.
Yenhwagamchotang has been widely used in treatment of inflammatory disease which is based on Oriental Medical literatures. These studies were attempted experimental effects of Yenhwagamchotang(sample A), Yenhwagamchotang plus Forsythia koreana NAKAI.(sample B), and Yenhwa-gamchotang plus Taraxacum mongolicum HAND- MAZZ(sample C),on the Anti-allergic reaction, the antipyretic action,the anti-inflammatory and the analgesic action,in rats. THe results of the studies were as follow: 1. Vascular permeability responses to intradermal serotonin in rats were showed significant effect at all sample groups. 2. The homologous passive cutaneous anaphylaxis in rats provoked by the IgE-like antibody aganist egg white albumin showed the decreasing effect. 3. The delayed type hypersensitivity responses to picryl chloride in mice were showed significant effect at all sample groups. 4. The delayed type hypersensitivity response to sheep red blood cell in mice were showed significant effect at all sample groups. 5. In anti-pyretic effect by yeast method were showed significant effect at all sample groups. 6. The anti-inflammatory effect by carrageenin method were showed significant effect at all sample groups. 7. The analgesic action by acetic acid method in mice were showed significant effect at all sample groups. According to the above result, Yenhwagamchotang(sample A), Yenhwagamchotang plus Forsythia koreana NAKAI(sample B), AND yenhwagamchotang plus Taraxacum mongolicum HNAN- MAZZ.(sample C ) were concluded to have the anti-allergic reaction, the antipyretic action, the anti-inflammatory, the analgesic action.
Degradation and glucose production from wood chips of white pine (Pinus strobus) and tulip tree (Liriodendron tulipifera) by several white rot fungi were investigated. The highest weight losses from 4 g of wood chips of P. strobus and L. tulipifera by the fungal degradation on yeast extract-malt extract-glucose agar medium were 38% of Irpex lacteus and 93.7% of Trametes versicolor MrP 1 after 90 days, respectively. When 4 g of wood chips of P. strobus and L. tulipifera biodegraded for 30 days were treated with cellulase, glucose was recovered at the highest values of 106 mg/g degraded wood by I. lacteus and 450 mg/g degraded wood by T. versicolor. The weight loss of 10 g of wood chip of L. tulipifera by T. versicolor on the nutrient non-added agar under the nonsterile conditions was 35% during 7 weeks of incubation, and the cumulative amount of glucose produced during this period was 239 mg without cellulase treatment. The activities of ligninolytic enzymes (lignin peroxidase, manganese peroxidase, and laccase) of fungi tested did not show a high correlation with degradation of the wood chips and subsequent glucose formation. These results suggest that the selection of proper wood species and fungal strain and optimization of glucose recovery are all necessary for the fungal pretreatment of woody biomass as a carbon substrate.
Lee, Hai Yen;Chai, Lay Ching;Pui, Chai Fung;Wong, Woan Chwen;Mustafa, Shuhaimi;Cheah, Yoke Kqueen;Issa, Zuraini Mat;Nishibuchi, Mitsuaki;Radu, Son
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제21권9호
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pp.954-959
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2011
There have been a number of studies conducted in order to compare the efficiencies of recovery rates, utilizing different protocols, for the isolation of L. monocytogenes. However, the severity of multiple cell injury has not been included in these studies. In the current study, L. monocytogenes ATCC 19112 was injured by exposure to extreme temperatures ($60^{\circ}C$ and $-20^{\circ}C$) for a one-step injury, and for a two-step injury the cells were transferred directly from a heat treatment to frozen state to induce a severe cell injury (up to 100% injury). The injured cells were then subjected to the US Food and Drug Administration (FDA), the ISO-11290, and the modified United States Department of Agriculture (mUSDA) protocols, and plated on TSAyeast (0.6% yeast), PALCAM agar, and CHROMAgar Listeria for 24 h or 48 h. The evaluation of the total recovery of injured cells was also calculated based on the costs involved in the preparation of media for each protocol. Results indicate that the mUSDA method is best able to aid the recovery of heat-injured, freeze-injured, and heat-freeze-injured cells and was shown to be the most cost effective for heat-freeze-injured cells.
Cavello, Ivana A.;Chesini, Mariana;Hours, Roque A.;Cavalitto, Sebastian F.
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제23권7호
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pp.1004-1014
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2013
Six nonpathogenic fungal strains isolated from alkaline soils of Buenos Aires Province, Argentina (Acremonium murorum, Aspergillus sidowii, Cladosporium cladosporoides, Neurospora tetrasperma, Purpureocillium lilacinum (formerly Paecilomyces lilacinus), and Westerdikella dispersa) were tested for their ability to produce keratinolytic enzymes. Strains were grown on feather meal agar as well as in solid-state and submerged cultures, using a basal mineral medium and "hair waste" as sole sources of carbon and nitrogen. All the tested fungi grew on feather meal agar, but only three of them were capable of hydrolyzing keratin, producing clear zones. Among these strains, P. lilacinum produced the highest proteolytic and keratinolytic activities, both in solid-state and submerged fermentations. The medium composition and culture conditions for the keratinases production by P. lilacinum were optimized. Addition of glucose (5 g/l) and yeast extract (2.23 g/l) to the basal hair medium increased keratinases production. The optimum temperature and initial pH for the enzyme production were $28^{\circ}C$ and 6.0, respectively. A beneficial effect was observed when the original concentration of four metal ions, present in the basal mineral medium, was reduced up to 1:10. The maximum yield of the enzyme was 15.96 $U_c/ml$ in the optimal hair medium; this value was about 6.5-fold higher than the yield in the basal hair medium. These results suggest that keratinases from P. lilacinum can be useful for biotechnological purposes such as biodegradation (or bioconversion) of hair waste, leading to a reduction of the environmental pollution caused by leather technology with the concomitant production of proteolytic enzymes and protein hydrolyzates.
마늘, 유자 추출물, 에탄올이 첨가된 고추장굴비를 제조하여 2$0^{\circ}C$와 4$0^{\circ}C$에 제품을 보관하면서 총세균수, 효모.곰팡이수 및 TBARS 값들의 변화를 살펴보았다. 30일간 2$0^{\circ}C$에서 제품을 보관하였을 때 5% 마늘추출물의 첨가는 대조구와 비교하여 숙성된 고추장의 효모.곰팡이수가 약 1.5 log 정도 낮게 나타났다 굴비의 체내 지방은 삼투압 작용에 의해 고추장으로 빠져 나옴으로 인하여 굴비의 TBARS 값은 오히려 상대적으로 조지방의 감소와 비례하여 줄어든 반면, 고추장에서의 TBARS 값은 증가하였다. 제품을 2$0^{\circ}C$에 저장하였을 때 미생물 성장억제 효과는 마늘추출액, 유자정유, 에탄올 순으로 나타났으며, TBARS값에 있어서는 저장중에는 유자정유 추출물이 다소 효과적으로 항산화효과를 보였지만 최종적으로 처리구들과 대조구간에는 큰 차이점은 없었다. 본 연구의 결과 마늘 추출액을 첨가한 고추장굴비 제품이 맛 뿐만 아니라 효모 및 곰팡이에 대해서는 좋은 성장 억제 효과를 보였다.
To improve the erythritol productivity of Penicillium sp. KJ81, mutants were obtained using UV irradiation and NTG treatment Among these mutants, Penicillium sp. KJ-UV29 revealed no morphological changes, yet was superior to the wild strain in the following three points: (1) Penicillium sp. KJ-UV29 produced more erythritol than the wild strain under the same conditions, (2) no foam was produced during cultivation, unlike the wild strain, and (3) the mutant produced a Significantly lower amount of glycerol. Penirillium sp. KJ-UV29 produced as much as 15.1 g/L of erythritol, whereas the wild-type Penirillium sp. KJ81 only produced 11.7 g/L. Penicillium sp. KJ-UV29 only generated 6.1 g/L of glycerol, compared to 19.4 g/L produced by the wild strain. When investigating the optimal culture conditions for erythritol production by the mutant strain Penicillium sp. KJ-UV89, sucrose was identified as the most effective carbon source, and the mutant was even able to produce erythritol in a 70% sucrose-containing medium, although a 30% sucrose medium exhibited the highest productivity. The production of erythritol by Penirillium sp. KJ-UV29 was also significantly increased by the addition of ammonium carbonate, potassium nitrate, and sodium nitrate. Accordingly, under optimal conditions, Penicillium sp. KJ-UV29 produced 45.2 g/L of erythritol in a medium containing 30% sucrose, 0.5% yeast extract, 0.5% (NH$_4$)$_2$C$_2$O$_4$, 0.1% KNO$_3$, 0.1% NaNO$_3$, and 0.01% FeSO$_4$ with 1 vvm aeration and 200 rpm agitation at 37$^{\circ}C$ for 7 days in a 5-L jar fermentor.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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