To improve conventional yeast one-hybrid screening, we have developed an efficient mammalian one-hybrid system that allows rapid isolation of com-plementary DNAs which are able to induce human p14$^{ARF}$. tumor suppressor gene. A 1.5 kb promoter region of p14$^{ARF}$ was fused to EGFP to generate ARF promoter-EGFP reporter vector. This reporter plasmid was stably trans-fected into NIH3T3 cells for generation of reporter cell line. When the reporter cell line was infected with E2F-1 together with excess amounts of empty vector, the cells that received the positive modulator were readily identifiable by green fluorescence using FACS. The GFP-positive cells were cloned directly from the cultured cells and expanded in bulk culture. The genomic DNAs from GFP-positive cells were prepared and the CDNA insert in integrated retroviral genome was recovered by PCR using primers annealing to the retroviral vector sequences flanking the insert-cloning site. This system should be useful for efficient screening of expression CDNA libraries in mammalian cells to identify novel upstream regulators for spe-cific genes by one-hybrid interaction.ion.
본 연구는 출아효모 Saccharomyces cerevisiae을 이용해 이종 유전자(heterologous gene)를 효모염색체내에 도입하여 안정적으로 발현하기 위한 시스템의 비교에 대해서 연구하였다. 반복적으로 사용할 수 있는 Cre/loxP system의 이용을 위해 C. glabrata 유래 유전자를 선택마커로 사용하였고, universal pRS-CMT vector를 이용한 4종의 유전자(XYLP, XYLB, GRE3 및 XYL2 유전자)를 모델 유전자로 cloning하였다. 구축된 pRS-XylP, pRS-XylB, pRS-Gre3 및 pRS-Xyl2 plasmid를 이용한 4번의 sequential integration을 통해 효모염색체내에 도입된 4종의 유전자를 순차적으로 발현시킬 수 있었다. 또한 4종의 유전자 발현 cassette를 동시에 가지는 pRS-PBG2 plasmid에 의한 one-step integration을 통해서, 도입될 유전자들의 순서를 정할 수 있었으며 각 유전자들의 동시발현을 안정적으로 유지할 수 있었다. 결론적으로 본 연구에서 사용한 4종의 유전자들의 염색체내 동시 integration 및 발현을 위해서는 one-step integration이 효과적임을 확인하였으며, 적절한 유전자 도입방법을 통해 산업적으로 유용한 생물시스템의 손쉬운 육종이 가능하리라 기대한다.
Vesicular stomatitis virus G glycoprotein (VSV-G) has been widely used for pseudotyping retroviral, lentiviral, and artificial viral vectors. The objective of this study was to establish a potential approach for large-scale production of VSV-G. To this end, VSV-G was cloned with an N-terminal His-tag into Pichia pastoris expression vector pPIC3.5K. Three clones ($Mut^s$) containing the VSV-G expression cassette were identified by PCR. All clones proliferated normally in expansion medium, whereas the proliferation was reduced significantly under induction conditions. VSV-G protein was detected in cell lysates by western blot analysis, and the highest expression level was observed at 96 h post induction. VSV-G could also be obtained from the condition medium of yeast protoplasts. Furthermore, VSV-G could be incorporated into Ad293 cells and was able to induce cell fusion, leading to the transfer of cytoplasmic protein. Finally, VSV-G-mediated DNA transfection was assayed by flow cytometry and luciferase measurement. Incubation of VSV-G lysate with the pGL3-control DNA complex increased the luciferase activity in Ad293 and HeLa cells by about 3-fold. Likewise, incubation of VSV-G lysate with the pCMV-DsRed DNA complex improved the transfection efficiency into Ad293 by 10% and into HeLa cells by about 1-fold. In conclusion, these results demonstrate that VSV-G could be produced from P. pastoris with biofunctionalities, demonstrating that large-scale production of the viral glycoprotein is feasible.
본 연구에서는 Candida antarctica로부터 genomic DNA을 추출하여 lipase A(CalA) 유전자를 PCR 증폭하였고, 재조합 pColdIII/CalA, $pPICZ{\alpha}A$/CalA, $pPICZ{\alpha}A$/CalA$his{\times}6$을 구축하였다. 재조합 CalA 유전자의 기능적 발현을 위해 최적화된 시스템을 구축하고자 Escherichia coli와 Pichia pastoris 시스템에서 각각 수행하여 비교, 분석하였다. SDS PAGE gel을 통해 CalA의 발현의 여부 및 발현양을 확인하였고, pNPP를 기질로 한 가수분해 반응을 통해 활성을 측정하였다. E. coli 발현 시스템은 형질전환 방법이 간단하고, 미생물의 성장 속도가 빠르다는 장점을 갖지만 CalA의 활성이 0.02 Unit/ml으로 비교적 낮았으며 세포질 (cytoplasm)에서 발현되므로 비목적 단백질과의 분리 및 정제과정이 필요하다. 재조합 $pPICZ{\alpha}A$/CalA을 P. pastoris 시스템에서 발현한 경우 높은 발현양 뿐만 아니라 분비작용으로 인해 고순도 발현이 용이하였고, 활성 또한 약 0.7 Unit/ml으로 가장 높았다. 결론적으로 CalA의 기능적 발현을 위해 P. pastoris 시스템을 구축하는 것이 가장 적합함을 확인하였다.
미꾸라지의 간으로부터 핵을 분리하여, 저농도 염추출 및 제한효소 처리로 핵기질(nuclear matrix)을 분리하였다. 분리된 핵기질을 Proteinase K로 분해한 후, phenol-chloroform 추출로 크기가 약 0.3kb-15kb의 분포를 나타내는 핵기질 부착 DNA (nuclear matrix attachment regions : MARs)를 얻었다. 효모 URA 3 유전자를 가진 2.13 kb Eco47 III 단편을 제한효소 Ssp I 으로 절단된 pUC19 플라즈미드 벡타에 결합시켜, ARS (autonomously replication sequence) 클로닝을 위한 pURY19 플라즈미드 벡타를 만들었다. 이 pURY19 벡타는 Saccharomyces cerevisiae내에서 독립적으로 복제할 수 없기 때문에, 물고기의 효율적인 발현 벡타 개발을 위해, 이 system을 이용하여, S. cerevisiae내에서 독립적으로 복제 가능한 미꾸라지의 ARS를 클로닝하고자 하였다. 분리 된 MARs를 pURY19 벡타에 결합시 킨 다음, E. coli $DH5\alpha$에 형질전환시켜 $pURY19N_{l-62}$를 얻었다. MAR Libraries $(pURY19N_{1-62})$를 각각 $Ura^-\;S.\;cerevisiae$에 형질전환시켜, S. cerevisiae내에서 독립적으로 복제 가능한 M. mizolepis 유래의 복제원점들 (ARSs)을 분리하여, Sanger's dideoxy-chain termination method로 염기서열을 분석하였다. 염기서열 분석결과 모든 clones들은 AT-rich하였으며, 특히 $pURY19N_6$에는 ARS concensus sequence, Topoisomerase II consensus, near A-box, 그리고 T-box들이 존재하였다.
재조합 효모를 이용한 포도당산화효소의 대량생산 에 관한 기초연구를 실시하였다. 분비신호를 포함한 포도당산화효소 유전자는 Aspergillus niger로부터 polymerase chain reaction을 이용하여 클로닝한후 G GALl과 GALlO promoter를 이용하여 s. cerevi siae strain 2805에서 말현시킨 결과 GALl promoter를 사용한 형질전환체(yGOD1-l)에서 높은 효율 의 효소생성을 나타냈다. 플라스크 배양 결과 1% galactose를 포함한 YEP 배 지 에셔 최고 6 IU/mL 의 포도당산화효소를 생산하였으며 재조합 포도당산 화효소의 세포내 위치를 비교한 결과 A. niger와는 달리 발현된 효소가 80% 이상 배지로 분비됨을 확인하였다. 재조합 포도당산화효소의 열 안정성을 측정한 결과 표준품과 비교하여 $50^{\circ}C$까지 큰 차이를 보이지 않고 높은 활성을 유지하는 것으로 확인되었다.
Kim, Hong-Gyum;Lee, Jin-Joo;Park, Eun-Hee;Sa, Jae-Hoon;Ahn, Ki-Sup;Lim, Chang-Jin
BMB Reports
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제34권4호
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pp.379-384
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2001
The cDNA encoding ribosomal protein was identified from a cDNA library of Schizosaccharomyces pombe. The nucleotide sequence of the 548 by cDNA clone reveals an open reading frame, which encodes a putative protein of 166 amino acids with a molecular mass of 18.3 kDa. The amino acid sequence of the S. pombe L11 protein is highly homologous with those of rat and fruit, while it is clearly less similar to those of prokaryotic counterparts. The 1,044 by upstream sequence, and the region encoding N-terminal 7 amino acids of the genomic DNA were fused into the promoterless $\beta$-galactosidase gene of the shuttle vector YEp357 in order to generate the fusion plasmid pHY L11. Synthesis of $\beta$-galactosidase from the fusion plasmid varied according to the growth curve. It decreased significantly in the growth-arrested yeast cells that were treated with aluminum chloride and mercuric chloride. However, it was enhanced by treatments with cadmium chloride ($2.5\;{\mu}M$), zinc chloride ($2.5\;{\mu}M$), and hydrogen peroxide (0.5 mM). This indicates that the expression of the L,11 gene could be induced by oxidative stress.
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제37권1호
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pp.15-20
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2018
Most proteins produced in the endoplasmic reticulum (ER) of eukaryotic cells fold via disulfide formation (oxidative folding). Oxidative folding is catalyzed by protein disulfide isomerase (PDI) and PDI-related ER protein thiol disulfide oxidoreductases (ER oxidoreductases). In yeast and mammals, ER oxidoreductin-1s (ERO1s) supply oxidizing equivalent to the active centers of PDI. We previously identified and characterized the ERO1 of Bombyx mori (bERO1) as a thioredoxin-like protein that shares primary sequence homology with other ERO1s. Here we compare the reactivation of inactivated rRNase and sRNase by bERO1, and show that bERO1 and bPDI cooperatively refold denatured RNase A. This is the first result suggesting that bERO1 plays an essential role in ER quality control through the combined activities of bERO1 and bPDI as a catalyst of protein folding in the ER and sustaining cellular redox homeostasis.
In order to increase the production of glutathione by maximizing the expression of recombinant gsh plasmids, two genes responsible for the biosynthesis of glutathione were cloned. A gshI gene was cloned onto pBR322 plasmid as 3.6Kb PstI DNA fragment from E. coli K-12 chromosomal DNA. Also gshII gene was cloned onto pUC13 plasmid as 2.2Kb PstI-BamHI DNA fragment. In order to improve the glutathione producing activity more efficiently, various recombinant plasmids containing tandem repeated gshI genes or both genes in various copy number onto the same vector were constructed. E. coli cells harboring pGH501 plasmid (pUC8-gshI$\cdot$I$\cdot$II) showed the highest glutathione synthesizing activity. The conditions for glutathione production with an ATP-generating system such as acetate kinase reaction of E. coli cells or glycolytic pathway of yeast cells were examined using the E. coli cells harboring the pGH501 plasmid. When the acetate kinase reaction of E. coli cells was used as an ATP generating system, 20mM of L-csteine was converted into glutathione with a yield of $100\%$.
Starch로부터 ethanol을 직접적으로 발효 생산할 수 있는 새로운 효모 균주를 개발하고자 glucoamylase 생성균으로 알려진 Saceharomyces diastaticus의 glucoamylase gene을 cloning vector를 사용하지 않고 S, cerevisiae에 transformation시켰다. Li$_2$SO$_4$, 처리로써 competent화 한 S, cerevisiae의 Intact cells을 recipient로 하여 BamHI으로 partial digestion한 S, diastaticus의 chromosomal DNA를 transformation시키고 starch를 유일한 탄소원으로 함유한 최소 배지상에서 starch 자화능을 marker로 하여 transformant를 선별한 결과, 8.5$\times$$10^{-7}$ 빈도로 transformant를 얻었다. Transformant의 특성을 recipient 및 donor와 비교하기 위해 copper resistance와 당 발효능을 조사한 결과, donor인 S, diastaticus와 동일한 성질로서 표현된 maltose와 starch 발효능을 제외하고는 800ppm 농도까지 생육 가능한 copper resistance와 galactose 발효능 등에 있어서는 recipent와 동일하게 나타났다. 또한 transformant가 생성하는 glucoamylase의 그 작용에 있어서의 최적온도와 최적pH를 조사하여 본 바 각각 pH5.0, 50C로서 donor의 glucoamylase와 동일함을 알 수 있었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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