In this study, a Korean native cattle strain (Hanwoo) evidencing high performance in terms of both meat quality and quantity was employed in the generation of 150,000 BAC clones with an average insert size of 140 kb, and corresponding to about a 6X coverage of bovine chromosomal DNA. The BAC clones were pooled in a mini-scale via three rounds of a pooling protocol, and the efficiency of this pooling protocol was evaluated by testing the accuracy of accessibility to the positive clones, via a PCR-based screening method. Two sets of primers designed from each of two known genes were tested, and each yielded 2 or 3 positive clones for each gene, thereby indicating that the BAC library pooling system was appropriate with regard to the accession of the target BAC clones. Analyses of $3.3{\times}10^6$ base pairs obtained from the 7,090 BAC end sequence (BES) showed that 34.88% of the DNA sequence harbored the repetition sequence. Analysis of the 7,090 BES to the $1^{st}$ and $2^{nd}$ generation radiation hybrid map of the cattle genome, using the COMPASS program designed for the construction of a cattle-human comparative mapping, resulted in the localization of a total of 1,374 clones proximal to 339 $1^{st}$ generation markers, and 1,721 clones proximal to 664 $2^{nd}$ generation markers. Collectively, the BAC library and pooling system of the BAC clones from the Korean cattle, coupled with the chromosome-localized BAC clones, will provide us with novel tools for the excavation of desired clones for genome mapping and sequencing, and will also furnish us with additional information regarding breed differences in cattle.
Surface energy balance components were evaluated by Landsat TM data and GIS with meteorological data. Calibration and validation for the applicability of this methodology were made through the estimating of the large-scale evapotranspiration (ET). In addition, sensitivity and error analysis was conducted to see the effects of the surface energy balance components on ET and the accuracy of each components. Bochong-chon located on the upper part of Guem River basin was selected as the case study area. Spatial distribution map of ET were produced for five dates: Jan. 1, Apr. 3, May. 10, and Nov. 27, 1995. The study results showed tat ET was greatly varied with the aspect and theland use type on the surface. In the case of having northeast and southeast in the aspect, ET was linearly increased depending on growing net radiation. While surface temperature has a high value, NDVI(Normalized Difference Vegetation Index) has a low value in the vegetated area. Therefore, ground heat flux was increased but ET was relatively decreased. The results of sensitivity and error analysis showed that net radiation is most sensitive and effective, ranging from 12.5% to 23.6% of sensitivity. Furthermore, the surface temperature, air temperature, and wind speed have the significant effects on ET estimation using remotely sensed data.
Korean Journal of Agricultural and Forest Meteorology
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v.19
no.1
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pp.10-18
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2017
Korean Red Pine (Pinus densiflora) has been protected and used as the most ecologically and socio-culturally important tree species in Korea. However, as dieback of Korean red pines has occurred in the protected area of the forest genetic resources. The aims of this study is to identify causes for dieback of pine tree by investigating topographical characteristics of pine tree dieback and its correlation to meteorological factors. We extracted the dead trees from the time series aerial images and analyzed geomorphological characteristics of dead tree concentration area. As a result, 1,956 dead pine trees were extracted in the study region of 2,600 ha. Dieback of pine trees was found mostly in the areas with high altitude, high solar radiation, low topographic wetness index, south and south-west slopes, ridgelines, and high wind exposure compared to other living pine forest area. These areas are classified as high temperature and high drought stress regions due to micro-climatic characteristics affected by topographic factors. As high temperature and drought stress are generally increasing with climate change, we can evaluated that a risk of pine tree dieback is also increasing. Based on these geomorphological characteristics, we developed a pine tree dieback risk map using Maximum Entropy Model (MaxEnt), and it can be useful for establishing Korean red pine protection and management strategies.
Journal of the Korean Society of Marine Environment & Safety
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v.27
no.2
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pp.363-368
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2021
Ship engine rooms have improved automation systems owing to the advancement of technology. However, there are many variables at sea, such as wind, waves, vibration, and equipment aging, which cause loosening, cutting, and leakage, which are not measured by automated systems. There are cases in which only one engineer is available for patrolling. This entails many risk factors in the engine room, where rotating equipment is operating at high temperature and high pressure. When the engineer patrols, he uses his five senses, with particular high dependence on vision. We hereby present a preliminary study to implement an engine-room patrol robot that detects and informs the machine room while a robot patrols the engine room. Images of ship engine-room equipment were classified using a convolutional neural network (CNN). After constructing the image dataset of the ship engine room, the network was trained with a pre-trained CNN model. Classification performance of the trained model showed high reproducibility. Images were visualized with a class activation map. Although it cannot be generalized because the amount of data was limited, it is thought that if the data of each ship were learned through transfer learning, a model suitable for the characteristics of each ship could be constructed with little time and cost expenditure.
Gyujin Jang;Jaeyoung Kim;Dongwook Kim;Yong Suk Chung;Hak-Jin Kim
KOREAN JOURNAL OF CROP SCIENCE
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v.67
no.4
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pp.274-284
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2022
To use kenaf (Hibiscus cannabinus L.) as a fiber and livestock feed, a high-yielding variety needs to be identified. For this, accurate phenotyping of plant height is required for this breeding purpose due to the strong relationship between plant height and yield. Plant height can be estimated using RGB images from unmanned aerial vehicles (UAV-RGB) and photogrammetry based on Structure from Motion (SfM) algorithms. In kenaf, accurate measurement of height is limited because kenaf stems have high flexibility and its height is easily affected by wind, growing up to 3 ~ 4 m. Therefore, we aimed to identify a method suitable for the accurate estimation of plant height of kenaf and investigate the feasibility of using the UAV-RGB-derived plant height map. Height estimation derived from UAV-RGB was improved using multi-point calibration against the five different wooden structures with known heights (30, 60, 90, 120, and 150 cm). Using the proposed method, we analyzed the variation in temporal height of 23 kenaf cultivars. Our results demontrated that the actual and estimated heights were reliably comparable with the coefficient of determination (R2) of 0.80 and a slope of 0.94. This method enabled the effective identification of cultivars with significantly different heights at each growth stages.
Journal of Korean Society of Coastal and Ocean Engineers
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v.19
no.5
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pp.492-501
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2007
Coastal disasters have become one of the most important issues in every coastal country. In Korea, coastal disasters such as storm surge, sea level rise and extreme weather have placed many coastal regions in danger of being exposed or damaged during subsequent storms and gradual shoreline retreat. A storm surge is an onshore gush of water associated with a tow pressure weather system, typically in typhoon season. However, it is very difficult to predict storm surge height and inundation due to the irregularity of the course and intensity of a typhoon. To provide a new scheme of typhoon damage prediction model, the scenario which changes the central pressure, the maximum wind radius, the track and the proceeding speed by corresponding previous typhoon database, was composed. The virtual typhoon scenario database was constructed with individual scenario simulation and evaluation, in which it extracted the result from the scenario database of information of the hereafter typhoon and information due to climate change. This virtual typhoon scenario database will apply damage prediction information about a typhoon. This study performed construction and analysis of the simulation system with the storm surge/coastal inundation model at Masan coastal areas, and applied method for predicting using the scenario of the storm surge.
The objective of this study was to analyze the changes in the hydrological environment in Soyanggang-dam watershed due to climate change results (in yews 2050 and 2100) which were simulated using CCCma CGCM2 based on SRES A2 and B2. The SRES A2 and B2 were used to estimate NDVI values for selected land use using the relation of NDVI-Temperature using linear regression of observed data (in years 1998$\sim$2002). Land use change based on SRES A2 and B2 was estimated every 5- and 10-year period using the CA-Markov technique based on the 1985, 1990, 1995 and 2000 land cover map classified by Landsat TM satellite images. As a result, the trend in land use change in each land class was reflected. When land use changes in years 2050 and 2100 were simulated using the CA-Markov method, the forest class area declined while the urban, bareground and grassland classes increased. When simulation was done further for future scenarios, the transition change converged and no increasing trend was reflected. The impact assessment of evapotranspiration was conducted by comparing the observed data with the computed results based on three cases supposition scenarios of meteorological data (temperature, global radiation and wind speed) using the FAO Penman-Monteith method. The results showed that the runoff was reduced by about 50% compared with the present hydrologic condition when each SRES and periods were compared. If there was no land use change, the runoff would decline further to about 3$\sim$5%.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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