• The Plant Pathology Journal
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• 제32권1호
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• pp.65-69
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• 2016

In plant virus ecology, weeds are regarded as wild reservoirs of viruses and as potential sources for insect-mediated transmission of viruses. During field surveys in 2013-2014, three Leonurus sibiricus plants showing virus-like symptoms were collected from pepper fields in Daegu, Seosan, and Danyang in Korea. Molecular diagnosis assays showed that the collected L. sibiricus samples were infected with either Tomato spotted wilt virus (TSWV), Pepper mild mottle virus (PMMoV), or Beet western yellow virus (BWYV), respectively. Since this is the first identification of TSWV, PMMoV, and BWYV from L. sibiricus, complete genome sequences of three virus isolates were determined to examine their phylogenetic relationships with the previously reported strains and isolates. Phylogenetic analyses performed using full genome sequences of the viruses showed the isolates of TSWV and PMMoV obtained from L. sibiricus are closely related to the pepper isolates of the corresponding viruses. Our results suggest that L. sibiricus could act an alternative host and reservoir of viruses that cause damages in pepper fields.

• The Plant Pathology Journal
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• 제36권1호
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• pp.67-75
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• 2020

Tomato spotted wilt virus (TSWV) is one of the plant viruses transmitted by thrips and causes severe economic damage to various crops. From 2008 to 2011, to identify natural host species of TSWV in South Korea, weeds and crops were collected from 5 regions (Seosan, Yesan, Yeonggwang, Naju, and Suncheon) where TSWV occurred and were identified as 1,104 samples that belong to 144 species from 40 families. According to reverse transcription-polymerase chain reaction, TSWV was detected from 73 samples from 23 crop species, 5 of which belonged to family Solanaceae. Additionally, 42 weed species were confirmed as natural hosts of TSWV with three different life cycles, indicating that these weed species could play an important role as virus reservoirs during no cultivation periods of crops. This study provides up-to-date comprehensive information for TSWV natural hosts in South Korea.

• Weed & Turfgrass Science
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• 제7권1호
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• pp.54-61
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• 2018

Zoysiagrass (Zoysia spp.) exists spotly in Indonesia and it has potential to be used in parks, golf courses, and football fields. Many football fields and golf course fairways use sand as top soil over native soil. This study aims to analyze growth and quality of two native zoysiagrasses Zis and Zim. Zis is a native zoysiagrass collected in sea-side and Zim is a native zoysiagrass collected in mountain area. Both types of zoysiagrasses were planted at field with altitude of 300 m with various growing media mixes of sand and reservoir's sediment. Thickness of the growing medium was 10 cm over an alfisol clay soil. Experimental plots were constructed using factorial completely randomized design with two native zoysiagrasses and 5 types of growing media. Two ecotypes of native zoysiagrasses showed different in growth habits combined with mixtures of growth media. Zim showed higher growing speed including more vigor with uniformity and texture than Zis. There were not significanthly differences on leaf color and root length between two ecotypes of native zoysiagrasses collected in Indonesia.

• Weed & Turfgrass Science
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• 제4권2호
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• pp.118-123
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• 2015

메타게놈(metagenome)은 연구실에서 배양이 불가능한 미생물을 포함한 자연계에 존재하는 미생물의 유전자를 직접 연구하는 학문분야이다. 지구상 거의 모든 자연, 인공 환경에서 살고 있는 미생물 DNA를 분리 정제하는 것이 가능하며, 재조합 DNA 기술 등을 이용하여 배양 가능한 숙주미생물에 메타지놈을 클로닝함으로서 메타지놈 라이브러리를 제작할 수 있다. 최근 메타게노믹스를 통하여 자연계에 존재하고 있는 대다수의 미생물들이 실험실에서 배양되지 않았던 이유를 구명할 수 있게 되었고, 그들이 가지고 있는 생태학적인 의미와 역할에 대한 이해와 더불어 점차 그 응용 분야와 범위도 확대되고 있다. 이와 같은 메타게놈의 응용 분야 확대의 한 방안으로 본 연구에서는 새로운 제초활성 물질 및 제초활성 물질 생산에 필요한 유전자를 확보하기 위해 메타게놈 라이브러리를 대상으로 오이 떡잎절편 검정, 미세조류 생장저해 검정, 종자발아 저해 검정의 HTS (high throughput screening) 시스템을 구축하였고, 구축된 시스템으로부터 선발된 최종 단일 클론인 9-G1과 9-G12의 바랭이에 대한 in vivo assay를 통해 본 연구에서 개발한 HTS 시스템의 유효성을 확인 하였다. 후속연구로서 활성단일클론이 만들어내는 제초활성물질의 동정 및 제초활성물질을 합성하는 유전자군에 대한 연구를 수행 중에 있다.

• 식물병연구
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• 제19권4호
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• pp.281-287
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• 2013

2006년에서 2007년까지 콩연구센터 육종포장 주변에서 잡초 서식상황을 조사한 결과 31과 74속 96종의 식물이 확인되었다. SYMMV의 자연기주 또는 중간기주를 동정하기 위하여 26과 84종의 식물체가 포함되는 495점의 시료를 RT-PC R로 분석한 결과, 단지 콩과 식물에서(돌콩, 새팥, 토끼풀, 비수리)만 SYMMV가 검출되었다. SYMMV를 가지고 있는 콩과 식물 중에서 분석한 돌콩의 3분의 1이상이 SYMMV를 보독하고 있는 것으로 보아 돌콩은 SYMMV의 감염원으로써 중요한 역할을 담당하는 것으로 생각된다. 돌콩은 SYMMV에 7월 중순경에 감염되는 것으로 추정되었다. 돌콩에서 SYMMV의 빠른 감염시기, 높은 종자감염율 그리고 종자전염과 같은 결과로 볼 때, 돌콩은 SYMMV의 생활사 완성에 큰 역할을 담당하고 있는 것으로 판단된다.

• 식물병연구
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• 제22권1호
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• pp.25-31
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• 2016

2014년도 충남 당진의 고추포장 바이러스 발생 조사 중, 포장 주변에서 바이러스 병징을 보이는 속속이풀을 수집하였다. 수집한 시료에 대해 여러 고추감염바이러스의 감염여부를 조사한 결과, PMMoV와 CMV에 복합감염되어 있음을 확인하였다. 이는 PMMoV의 잡초 기주로서 속속이풀의 최초 동정이며, 속속이풀의 CMV 감염의 국내 첫 보고이다. 따라서 이들 신규 분리주들의 계통발생학적 위치를 파악하고자, 이들의 전체 게놈 염기서열을 분석하였고 이미 보고된 PMMoV 및 CMV 분리주의 유전정보와 비교 분석하였다. 유전적 측면에서 이미 보고된 고추감염바이러스와의 관계를 알아보고자 속속이풀에서 분리된 PMMoV와 CMV의 전체 염기서열을 분석하였고, 이들의 계통발생학적 특성을 구명하였다. 그 결과, 속속이풀에서 분리한 PMMoV 및 CMV의 분리주가 고추에서 분리한 분리주들과 매우 높은 유사성을 보임을 확인하였고, 이는 속속이풀이 PMMoV 및 CMV의 중간 기주로 작용할 수 있음을 시사한다.