• 제목/요약/키워드: viral DNA

검색결과 446건 처리시간 0.028초

Development of Two Quantitative Real-Time PCR Diagnostic Kits for HPV Isolates from Korea

  • Jeeva, Subbiah;Kim, Nam-Il;Jang, In-Kwon;Choi, Tae-Jin
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제22권10호
    • /
    • pp.1350-1358
    • /
    • 2012
  • Viral pathogens, alongside other pathogens, have major effects on crustacean aquaculture. Hepatopancreatic parvovirus (HPV) is an emerging virus in the shrimp industry and has been detected in shrimp farms worldwide. The HPV genome has greater diversity than other shrimp viruses owing to its wide host range and geographical distribution. Therefore, developing diagnostic tools is essential to detect even small copy numbers from the target region of native HPV isolates. We have developed two easy to use quantitative real-time PCR kits, called Green Star and Dual Star, which contain all of the necessary components for real-time PCR, including HPV primers, using the primers obtained from the sequences of HPV isolates from Korea, and analyzed their specificity, efficiency, and reproducibility. These two kits could detect from 1 to $1{\times}10^9$ copies of cloned HPV DNA. The minimum detection limits obtained from HPV-infected shrimp were $7.74{\times}10^1$ and $9.06{\times}10^1$ copies in the Green Star and Dual Star assay kits, respectively. These kits can be used for rapid, sensitive, and efficient screening for HPV isolates from Korea before the introduction of postlarval stages into culture ponds, thereby decreasing the incidence of early development of the disease.

Seed Transmission of Tomato yellow leaf curl virus in White Soybean (Glycine max)

  • Kil, Eui-Joon;Park, Jungho;Choi, Hong-Soo;Kim, Chang-Seok;Lee, Sukchan
    • The Plant Pathology Journal
    • /
    • 제33권4호
    • /
    • pp.424-428
    • /
    • 2017
  • Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) infection of the common bean (Phaseolus vulgaris) has been reported, but soybean (Glycine max) has not previously been identified as a TYLCV host. Five cultivars of white soybean were agro-inoculated using an infectious TYLCV clone. At 30 days post-inoculation, they showed infection rates of 25% to 100%. Typical TYLCV symptoms were not observed in any inoculated plants. To examine whether TYLCV was transmitted in soybean seeds, DNA was isolated from bundles of five randomly selected seeds from TYLCV-inoculated soybean plants and amplified with a TYLCV-specific primer set. With the exception of one bundle, all bundles of seeds were verified to be TYLCV-infected. Virus dissemination was also confirmed in three of the 14 bunches. Viral replication was also identified in seeds and seedlings. This is the first report demonstrating that soybean is a TYLCV host, and that TYLCV is a seed-transmissible virus in white soybean.

Attenuated Expression of Interferon-induced Protein Kinase PKR in a Simian Cell Devoid of Type I Interferons

  • Park, Se-Hoon;Choi, Jaydo;Kang, Ju-Il;Choi, Sang-Yun;Hwang, Soon-Bong;Kim, Jungsuh P.;Ahn, Byung-Yoon
    • Molecules and Cells
    • /
    • 제21권1호
    • /
    • pp.21-28
    • /
    • 2006
  • The interferon-induced, double-stranded RNA (dsRNA)-dependent protein kinase PKR plays a key role in interferon-mediated host defense against viral infection, and is implicated in cellular transformation and apoptosis. We have isolated a cDNA of simian PKR encoding a product with 83% amino acid identity to the human homolog and showed that PKR expression is significantly attenuated in the Vero E6 African green monkey kidney cells devoid of type I interferon genes. A variant form of PKR lacking the exon 12 in the kinase domain is produced in these cells, presumably from an alternatively spliced transcript. Unlike wild type PKR, the variant protein named PKR-${\Delta}E12$ is incapable of auto-phosphorylation and phosphorylation of eIF2-${\alpha}$, indicating that the kinase sub-domains III and IV embedded in exon 12 are indispensable for catalytic function. PKR-${\Delta}E12$ had no dominant negative effect but was weakly phosphorylated in trans by wild type PKR.

인유두종바이러스 관련 질환의 예방을 위한 남성 대상 백신의 임상적 유용성 (Clinical Benefit of Vaccinating Male Against HPV-related Disease)

  • 이세영
    • 대한두경부종양학회지
    • /
    • 제38권1호
    • /
    • pp.11-16
    • /
    • 2022
  • HHPV (Human Papillomavirus) is a DNA virus that can cause benign lesions, genitourinary cancer, and oropharyngeal cancer by penetrating the mucous membrane and skin. It is widely known to be transmitted mainly through sexual contact. As with many viral infections, vaccines have been developed to prevent infection with HPV. Currently, in many countries, HPV vaccines are mainly used for national immunization for women to prevent diseases that traditionally occur frequently in women, especially cervical cancer. However, since the vaccination rate is relatively low, many countries are struggling with ways to increase the vaccination rate. Meanwhile, the incidence of oropharyngeal cancer caused by HPV in men has been increasing recently. In the United States, the annual number of oropharyngeal cancers in men already exceeds the number of cervical cancers in women, so HPV infection in men has emerged as a major problem. Accordingly, interest in HPV vaccination in men has also increased, and studies on the effectiveness and necessity of vaccination of both women and men compared to women alone are being actively conducted. In this paper, the evidence of HPV vaccination for men will be reviewed through previous studies, and its validity and cost-effectiveness will be analyzed to bolster the clinical usefulness of HPV vaccination for men.

Surveillance of African swine fever infection in wildlife and environmental samples in Gangwon-do

  • Ahn, Sangjin;Kim, Jong-Taek
    • 한국동물위생학회지
    • /
    • 제45권1호
    • /
    • pp.13-18
    • /
    • 2022
  • African swine fever (ASF) is fatal to domestic pigs and wild boars (Sus scrofa) and affects the domestic pig industry. ASF is transmitted directly through the secretions of infected domestic pigs or wild boars, an essential source of infection in disease transmission. ASFV is also very stable in the environment. Thus, the virus is detected in the surrounding environment where ASF-infected carcasses are found. In this study, ASF infection monitoring was conducted on the swab and whole blood samples from wild animals, various hematopoietic arthropod samples that could access infected wild boar carcasses or habitats to cause maintenance and spread of disease, and soil samples of wild boar habitats. ASF viral DNA detection was confirmed negative in 317 wildlife and environmental samples through a real-time polymerase chain reaction. However, ASF occurs in the wild boars and spreads throughout the Korean peninsula. Therefore, it is necessary to trace the route of ASF virus infection by a continuous vector. Additional monitoring of various samples with potential ASF infection is needed to help the epidemiologic investigation and disease prevention.

소아 만성 B형 간염 환자에서 스테로이드 이탈 요법 후 인터페론 병용 투여의 치료 효과 (Therapeutic Efficacy of Prednisolone Withdrawal Followed by Recombinant ${\alpha}$ Interferon in Children with Chronic Hepatitis B)

  • 류나은;김병주;마재숙;황태주
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
    • /
    • 제2권2호
    • /
    • pp.169-177
    • /
    • 1999
  • 목 적: 소아 만성 B형 간염 환아에서 알파 인터페론의 치료 효과는 보고자마다 차이가 있으나 30~40%로 알려져 있다. 그러나 만성 지속성 B형 간염, 혈청 ALT치가 낮은 경우나 혈청 HBV DNA치가 높은 소아 만성 B형 간염 환자에서 알파 인터페론 단독 투여 시 그 치료 효과는 더 낮다고 보고되고 있다. 이에 저자들은 알파 인터페론 단독 투여 시 치료 효과가 낮다고 알려진 소아 만성 B형간염 환자에 prednisolone 이탈 요법 후 인터페론 병용 투여 시 그 치료 효과를 알아보고자 본 연구를 시행하였다. 대상 및 방법: 1996년 1월부터 1997년 12월까지 전남대학교병원 소아과에 내원하여 만성 B형 간염으로 진단받은 28명을 대상으로 하였다. 대상 환아 중 간 조직 검사 상 만성 활동성 간염을 보이고 혈청 ALT치가 100 IU/L 이상이고 혈청 HBV-DNA치가 100 pg/$300\;{\mu}L$ 미만인 14명(group 1)은 알파 인터페론을 체표면적($m^2$) 당 5백만 단위를 6개월 동안 주 3회 단독 투여하였다. 조직 검사 상 만성 지속성 간염인 경우와 만성 활동성 간염이면서 혈청ALT치가 100 IU/L 미만 또는 혈청 HBV DNA치가 100 pg/$300\;{\mu}L$ 초과한 14명(group 2)은 prednisolone을 60 mg/$m^2$, 40 mg/$m^2$, 20 mg/$m^2$으로 각각 2주씩 6주간 경구 투여하고 2주간 휴약 기간을 가진 후 알파 인터페론을 group 1과 같은 방법으로 투여하였다. 치료에 대한 반응은 인터페론 투여가 종료되는 시점에서 완전반응(항 HBe 항체의 양전화, 혈청 ALT 정상화 및 혈청 HBV-DNA 음성), 부분반응(혈청 ALT 정상화 또는 혈청 HBV-DNA 음성) 및 무반응으로 평가하였다. 결 과: 1) 대상 환아의 평균 연령은 130.6개월(21~192개월)이었고, 남아는 22례, 여아는 6례이었다. 만성 지속성 간염은 11례, 만성 활동성 간염은 17례이었고, 15명의 환아에서 모친이 B형 간염 바이러스 만성 보유자이었다. 2) Group 1에서 평균 연령은 144.1개월(97~169개월), 남아 9명, 여아 5명, 혈청 ALT $299.9{\pm}215.3$ IU/L, HBV-DNA $49.3{\pm}33.1\;pg/300\;{\mu}L$이었고, group 2에서 평균 연령은 112.1개월(21~192개월), 남아 13명, 여아 1명, 만성 지속성 간염 11명, 만성 활동성 간염 3명, 혈청 ALT $85.6{\pm}71.0$ IU/L, HBVDNA $524.3{\pm}1064\;pg/300\;{\mu}L$이었다. 3) Group 1에서 항 HBe 항체 양전은 10례(71.4%) 에서, 혈청 ALT는 9례(64.3%)에서 정상화되었고, HBV-DNA는 11례(78.6%)에서 음성화되었다. Group 2에서 항 HBe 항체 양전은 7례(50.0%)에서, 비정상 수치를 보인 9명의 환아 중 5명(55.6%)이 ALT 의 정상화를 보였고, HBV-DNA는 9례(64.3%)에서 음성화되었다. 두 군간의 항 HBe 항체의 양전율, ALT치의 정상화율, HBV DNA치의 음성화율에 있어서 통계학적으로 유의한 차이는 없었다. 4) Group 1에서 완전반응은 8례(57.1%), 부분반응은 3례(21.4%), 무반응은 3례(21.4%)이었고, group 2 에서는 완전반응 7례(50.0%), 부분반응 2례(14.3%), 무반응 5례(35.7%)으로 두 군간의 통계학적 유의한 차이는 없었다. 결 론: 소아 만성 B형 간염에 대한 치료로 인터페론 단독 요법으로 반응이 좋지 않을 것으로 예측되는 환자군에 스테로이드 이탈 요법 후 인터페론 병합 투여는 안전하고 효과적인 치료법으로 생각된다. 향후 치료 효과의 지속 여부에 대한 지속적인 관찰과 더 많은 환자를 대상으로 한 전향적인 비교 연구가 필요하리라 사료된다.

  • PDF

이산화염소의 활성산소 생성 유도에 의한 항암 및 항바이러스 활성 (Anticancer and Antiviral Activity of Chlorine Dioxide by Its Induction of the Reactive Oxygen Species)

  • 김용균;수닐쿠마르;천원수;어현지;권혁;전용호;정진부;김욱
    • Journal of Applied Biological Chemistry
    • /
    • 제59권1호
    • /
    • pp.31-36
    • /
    • 2016
  • 이산화염소는 높은 항생효과로 살균제로 사용되고 있고, 저곡해충을 대상으로 살충 효과도 보이고 있다. 본 연구는 이 이산화염소의 유용 효과를 넓히기 위해 이 물질이 항암 및 항바이러스 활성을 나타낼 수 있는 지를 검증하였다. 인체에 나타나는 5종의 암 세포주에 대해서 이산화염소의 세포독성을 분석하였다. 유방암 2종 세포주(MCF-7, MDA-MB-231)와 대장암 3종 세포주(LoVo, HCT-116, SW-480) 모두에 대해서 이산화염소는 높은 세포 독성을 나타냈다. 이러한 세포독성은 이산화염소의 활성산소 유발 효과에 기인된다. 이산화염소가 처리된 암세포주는 모두 세포내 높은 활성산소를 형성하였다. 이는 대조구로서 일반 곤충 세포주와 비교하여 훨씬 높은 활성산소를 지녔다. 반면에 항산화제인 비타민 E를 처리하면 이러한 세포독성이 크게 줄어 암 세포에 대해 높은 세포독성은 활성산소에 의해 기인되었다는 것을 입증하였다. 또한 이산화염소는 서로 다른 바이러스에 대해서 항바이러스 활성을 나타냈다. 곤충병원성 바이러스이고 이중 가닥의 DNA 게놈을 지닌 벡큘로바이러스의 일종인 Autographa californica nuclear polyhedrosis virus (AcNPV)는 이산화염소 노출에 따라 활성을 잃어 핵다각체 형성 능력이 크게 둔화되었다. AcNPV에 대한 이산화염소의 항바이러스 효과는 반응 시간에 비례하여 증가했다. 식물병원성 바이러스이고 단일가닥의 RNA 게놈을 지닌 담배모자이크바이러스는 이산화염소 노출에 따라 바이러스 함량이 줄었고, 담배에 대한 병원력도 낮아졌다. 따라서 본 연구는 이산화염소가 항암 및 항바이러스 활성을 지니며, 이는 이 물질에 의한 높은 활성산소 유발에 기인된 것으로 판명되었다.

소아의 B형 만성 활동성 간염에서 저용량 ${\alpha}$-Interferon과 Thymodulin의 병용 치료 효과 (Combined Therapy of Alfa-Interferon and Thymodulin on Children with Chronic Active Hepatitis B)

  • 최병호;고철우
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
    • /
    • 제1권1호
    • /
    • pp.79-89
    • /
    • 1998
  • 목 적: 만성 B형 간염 환자의 치료에 많은 항바이러스제와 면역조절 물질이 시도되었지만 현재까지는 ${\alpha}$-interferon만이 일정한 효과가 있는 것으로 보고되고 있다. 또 면역조절제 중에는 현재thymodulin 등의 면역증강 물질이 시도되어지고 있다. 저자들은 interferon 치료시 thymodulin을 병용하면 소아의 B형 만성 활동성 간염에 interferon 단독 치료보다 효과가 있는지를 조사해 보았다. 대상 및 방법: 1990년 3월부터 1996년 2월까지 경북대학교병원 소아과에 입원하였던 환아 중 6개월 이상 HBsAg과 HBeAg 및 HBV DNA가 양성(1+~4+)이고, 혈청 AST와 ALT치가 상승되어 있으며 간조직 검사상 만성 활동성 간염으로 확진된 환아 23명($9.8{\pm}2.8$세)을 대상으로 recombinant ${\alpha}$-interferon 300 MU($280\;MU/m^2{\pm}68$; 범위: $189{\sim}448\;MU/m^2$)를 주 3회씩 6개월간 피하 주사하였다. 그 중 10명에게는 thymodulin 60 mg을 매일 복용시켰고 13명은 ${\alpha}$-interferon만 투여하였으며 치료 종료 후 최소 12개월 이상 추적 검사를 하였다. 양군간의 모든 변수에서 통계학적 유의차는 없었다. 결 과: 1) 23명 전예에서 interferon 치료 중에 AST, ALT 및 HBV DNA의 감소가 있었고 12개월째 추적 검사상 9명(39%)에서 평균 3.1개월째에 HBeAg과 anti-HBe의 혈청전환 및 HBV DNA의 음전이 생겼으며 18개월째 추적검사에서는 이 중 2명에서 ${\alpha}$-interferon 중단 후 8개월과 9개월에 HBeAg이 다시 나타났고 또 다른 2명에서 추가로 혈청전환이 생겨서 전체적으로는 23명의 환아 중 11명(48%)에서 혈청전환이 생겼고 재발한 2명을 빼면 최종 성적은 9명(39%)이 된다. 2) 수직 감염이 있는 7례 중 2례(29%)에서 혈청 전환이 생긴 반면 수직 감염이 없는 12례 중 6례(50%)에서 혈청전환이 생겨 수직 감염 유무는 혈청전환과의 상관 관계가 밀접하다고 생각한다. 3) ${\alpha}$-interferon 치료 전의 ALT치가 정상치의 2배 이하인 경우 8례 중 3례(38%)에서 혈청전환이 있었는데 비해 2배 이상이었던 경우는 15예 중 8례(53%)에서 혈청전환이 있어서 ${\alpha}$-interferon 치료전의 높은 ALT치가 좋은 치료 효과를 예측하는데 도움이 될 수 있을 것으로 생각한다. 4) ${\alpha}$-interferon 치료 전의 HBV DNA가 3+ 이상이었던 경우는 12례 중 5례(42%)에서 혈청전환이 있었는데 비해 1+ 이었던 경우는 11례 중 6례(55%)에서 혈청전환이 있어서 ${\alpha}$-interferon 치료전의 낮은 HBV DNA가 좋은 치료 효과를 예측하는데 도움이 될 수 있을 것으로 생각한다. 5) B형 만성 활동성 간염 환아 23례 중 10례에게 thymodulin을 병용하여 투여하였으나 10례 중 5례(50%)에서 혈청전환이 있었으며 이는 대조군인 ${\alpha}$-interferon 단독 치료 시의 13례 중 6례(46%)와 비교할 때 통계적인 의의를 찾을 수 없었다. 결 론: 면역조절 물질인 thymodulin의 투여로써 숙주 면역계의 기능을 증강시켜 바이러스의 제거를 촉진하고자 소아의 B형 만성 활동성 간염에 ${\alpha}$-interferon 치료시 thymodulin을 병용하여 치료하였으나 ${\alpha}$-interferon 단독 치료보다 더 효과가 있다고 볼 수는 없었으며 향후 더 많은 환아를 대상으로 한 interferon과 다른 종류의 항바이러스제 및 면역조절제 등과의 병용 치료 연구가 더 좋은 결과를 얻기 위해 필요할 것으로 생각한다.

  • PDF

Protective Immunity Induced by Systemic and Mucosal Delivery of DNA Vaccine Expressing Glycoprotein B of Pseudorabies Virus

  • Yoon, Hyun-A;Han, Young-Woo;Aleyas, Abi George;George, June Abi;Kim, Seon-Ju;Kim, Hye-Kyung;Song, Hee-Jong;Cho, Jeong-Gon;Eo, Seong-Kug
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제18권3호
    • /
    • pp.591-599
    • /
    • 2008
  • A murine model immunized by systemic and mucosal delivery of plasmid DNA vaccine expressing glycoprotein B (pCIgB) of pseudorabies virus (PrV) was used to evaluate both the nature of the induced immunity and protection against a virulent virus. With regard to systemic delivery, the intramuscular (i.m.) immunization with pCIgB induced strong PrV-specific IgG responses in serum but was inefficient in generating a mucosal IgA response. Mucosal delivery through intranasal (i.n.) immunization of pCIgB induced both systemic and mucosal immunity at the distal mucosal site. However, the levels of systemic immunity induced by i.n. immunization were less than those induced by i.m. immunization. Moreover, i.n. genetic transfer of pCIgB appeared to induce Th2-biased immunity compared with systemic delivery, as judged by the ratio of PrV-specific IgG isotypes and Th1- and Th2-type cytokines produced by stimulated T cells. Moreover, the immunity induced by i.n. immunization did not provide effective protection against i.n. challenge of a virulent PrV strain, whereas i.m. immunization produced resistance to viral infection. Therefore, although i.n. immunization was a useful route for inducing mucosal immunity at the virus entry site, i.n. immunization did not provide effective protection against the lethal infection of PrV.

금은화 물추출물의 항산화 효과와 Ultraviolet(UV)B로 유도된 사람 각질형성세포 손상에 대한 보호효과 (The antioxidative and cytoprotective effect of Lonicerae japonicae Flos water extracts on the ultraviolet(UV)B-induced human HaCaT keratinocytes)

  • 서승희;배기상;최선복;조일주;김동구;신준연;송호준;박성주;최미옥
    • 대한본초학회지
    • /
    • 제29권6호
    • /
    • pp.63-71
    • /
    • 2014
  • Objectives : Lonicerae japonicae Flos(LJF) has been reported to exhibit anti-oxidant, anti-inflammatory, anti-viral, anti-rheumatoid properties. However, it is still largely unknown whether LJF inhibits the ultraviolet(UV)B-induced oxidative damage in human HaCaT keratinocytes. Therefore in this paper, we investigated the anti-oxidative capacity and protective effect of LJF against UVB-induced oxidative demage in human HaCaT keratinocytes. Methods : To evaluate the anti-oxidative activity of LJF extracts, we measured total phenolic contents, total flavonoid contents, antioxidant capacity, and superoxide scavenging activity. To give an oxidative stress to HaCaT cells, UVB was irradiated with $200mJ/cm^2$ to HaCaT cells. To detect the protective effect of LJF against UVB, we measured cell viability, DNA fragmentation and reactive oxygen species (ROS) production. In addition, we performed high-performance liquid chromatography (HPLC) analysis to find a major component of LJF. Results : LJF contained phenolic and flavonoid contents, and showed the anti-oxidant and superoxide scavenging activity. The UVB-induced oxidative conditions led to the cell death, DNA fragmentation and reactive oxygen species (ROS) production. However, pretreatment with LJF reduced oxidative conditions, including inhibition of cell death, DNA fragmentation and ROS production. In addition, we found out chlorogenic acid as major component of LJF. Conclusions : These results could suggest that LJF contained anti-oxidative contents and exhibited protective effects against UVB on human HaCaT keratinocytes. And the effective compound of LJF which could show protective activities against UVB is chlorogenic acid. Thus, LJF and chlorogenic acid would be useful for the development of drug or cosmetics treating skin troubles.