• 한국미생물·생명공학회지
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• 제44권4호
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• pp.409-419
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• 2016

사상성 진균인 Aspergillus spp.은 환경 속에서 흔히 찾을 수 있는 진균으로 인류에 유익한 역할을 주기도 하지만 병원성을 일으키기도 한다. 대부분의 Aspergillus spp.는 무성 포자를 생성하여 번식을 하며 다양한 이차 대사 산물을 합성한다. 여러 연구에 따르면 Velvet 조절자들은 진균 특이적 전사 인자로 모델 진균인 Aspergillus nidulans의 성장, 분화 및 이차 대사산물 생성 등 다양한 부분에서 중요한 역할을 한다고 보고되었다. 또한 Velvet 단백질들은 다양한 복합체를 형성하며, 이 복합체들은 Aspergillus nidulans에서 다양한 역할을 한다. 다른 Aspergillus spp.에서 Velvet 단백질들은 매우 유사한 구조를 가지며 진균의 무성 생식과 이차 대사를 조절한다. 이번 논문에는 Aspergillus spp.의 Velvet 단백질들의 기능에 대하여 요약하였다.

• 생약학회지
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• 제30권3호
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• pp.314-319
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• 1999

The composition of biochemical components such as lipids, proteins and their amino acid components and inorganic elements in the ashes in unossified antlers from Cervus nippon Temminck var. mantchuricus grown in Korea were analyzed to obtain fundamental data for quality control. As a result, it was found that total lipids were 20.75% which was approximately similar contents with those of proteins (21.8%). Sixteen amino acids were identified from the hydrolysate of the protein fraction. Three gangliosides with very similar TLC patterns of those such as $GM_3$, $GM_1$ and $GM_{1a}$ were identified from the water soluble layer of Folch's partitions. Ash contents were revelaed to be much higher in the sponge layer (40.0%) than in the velvet layer (3.7%).

• 한국균학회지
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• 제43권1호
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• pp.33-39
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• 2015

사상성 진균에서 veA 유전자와 연계되어 있는 velvet 복합체는 진균의 분화와 이차 대사산물의 조절에 매우 중요한 기능을 한다. 모델 사상균인 Aspergillus nidulans의 경우 methyltransferase인 VipB와 VipC를 포함한 여러 단백질들이 VeA 단백질과 상호작용하는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 인간 기회감염 진균인 Aspergillus fumigatus에서 vipB와 vipC 유전자의 상동유전자를 분리하여 각각 AfuvipB와 AfuvipC로 명명하였다. AfuvipB 유전자는 AspGD 데이터베이스에 Afu3g14920으로 등록되어 있으며 1,510 bp 길이에 10개의 인트론을 가지고 있고, 유전자 산물은 336 아미노산 잔기로 구성된 단백질로 methyltransferase 도메인을 가지고 있었다. AfuvipC는 Afu8g01930으로 AfuvipB와 유사하게 10개의 인트론을 가지고 있으며 339개의 아미노산으로 구성된 methyltransferase를 암호화하고 있었다. A. fumigatus에서 각각의 유전자에 대한 기능을 알아보고자 유전자제거 돌연변이 균주들을 제조하고 그들의 표현형을 관찰하였다. AfuvipB 유전자 제거 돌연변이는 점 접종을 하였을 경우 대조군에 비하여 표현형의 차이를 보이지 않았다. 그러나 단일 포자에서 성장한 콜로니를 비교해 보았을 때 대조군에 비하여 그 크기가 작고 분화 속도도 약간 더딘 것을 관찰할 수 있었다. 반면에 AfuvipC 유전자 제거 돌연변이는 대조군과 비교하였을 때 표현형의 차이를 보이지 않았다. 이러한 결과는 두 개의 methyltransferase가 상호 중복적인 역할을 수행하거나 정상적인 실험실 배양조건에서는 중요한 기능을 수행하지 않을 수 있음을 시사한다.

• 한국자원식물학회:학술대회논문집
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• 한국자원식물학회 2019년도 추계학술대회
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• pp.73-73
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• 2019

Angelica gigas Nakai (Korean danggui), a member of the Umbelliferae family, is a Korean traditional medicinal plant whose roots have been used for treating gynecological diseases. Transcriptomics is the study of the transcriptome, which is the complete set of RNA transcripts that are produced by the genome, using high-throughput methods, such as microarray analysis. In this study, transcriptome analysis of A.gigas Nakai was carried out. Transcriptome sequencing and assembly was carried out by using Illumina Hiseq 2500, Velvet and Oases. A total of 109,591,555 clean reads of A. gigas Nakai was obtained after trimming adaptors. The obtained reads were assembled with an average length of 1,154 bp, a maximum length of 13,166 bp, a minimum length of 200 pb, and N50 of 1,635 bp. Functional annotation and classification was performed using NCBI NR, InterprotScan, KOG, KEGG and GO. Candidate genes for phenylpropanoid biosynthesis were obtanied from A.gigas transcriptome and the genes and its proteins were confirmed through the NCBI homology BLAST searches, revealing high identity with other othologous genes and proteins from various plants pecies. In RNA sequencing analysis using an Illumina Next-Seq2500 sequencer, we identified a total 94,930 transcripts and annotated 71,281 transcripts, which provide basic information for further research in A.gigas Nakai. Our transcriptome data reveal that several differentially expressed genes related to flower color in A.gigas Nakai. The results of this research provide comprehensive information on the A.gigas Nakai genome and enhance our understanding of the flower color related gene pathways in this plant.