• Journal of Species Research
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• 제10권3호
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• pp.217-226
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• 2021

During a project aiming to comprehensively investigate indigenous prokaryotic species in Korea, a total of 20 bacterial strains phylogenetically belonging to the the class Bacilli of the phylum Firmicutes were isolated from various environmental sources such as soil, air, tidal flat, sea water, grain, wetland, breast milk and healthy human urine. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences revealed that 20 bacterial strains showed the high sequence similarities (≥98.7%) to the closest type strains and formed robust phylogenetic clades with closely related species of validly published names in the class Bacilli of the phylum Firmicutes. In the present study, we report 20 species of 13 genera of seven families of two orders of one class in the phylum Firmicutes, which have not been previously reported in Korea. Morphological, biochemical, and physiological characteristics, isolation sources, and NIBR deposit numbers of these unrecorded bacterial species are described in the species descriptions.

• Journal of Nutrition and Health
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• 제32권1호
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• pp.64-64
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• 1999

The relations between micorfloral compositions and environmental factors of 32 Korean infants were sought through statistical analysis after examination of fecal bacterial and questions to their mothers about feeding experiences at three different times for each subjects, about one week after birth, before weaning (2-3 months after birth), and after weaning 95-7 months after birth). The majority of mothers fed their infants cereal foods after the age of 4 months and began weaning with fruit juice and commercial weaning foods. Defection frequencies and fecal pH of infants decreased significantly during the examination period and 37.5% of total infants in fecal samples increased significantly during the examination period, which means that the kinds of bacterial genera increase with aging of infants. Frequencies of streptococci were significantly higher in infants fed delivered by Caesarian section than infants delivered naturally. Frequencies of clostridia were significantly higher in infants fed with cereal food before 4 months of age than after 5 months. The infants fed with probiotics showed significantly higher frequencies of veillonella at about 1 week old. They also showed significantly higher frequencies of clostridia before weaning than the infant fed with no probiotics, but significantly lower frequencies of C. perfringens before weaning. The infants fed with probiotics showed significantly higher number of streptococci at the age of about 1 week and significantly higher numbers of total aerobes before weaning, but significantly lower numbers of bacteroides after weaning than their counter parts. The fecal pH was directly proportional to the number of clostridia, klebsiella, and total aerobes at about 1 week after birth, to the number of E. coli before weaning, and to the number of streptococci and clostridia after weaning. Fecal pH had a negative relationship to the total number of anaerobes in 1-week-old infants. The infants that had diarrhea during lactation showed higher frequencies of bacteroides before weaning than those that didn't.

• Journal of Nutrition and Health
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• 제32권1호
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• pp.67-74
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• 1999

The relations between micorfloral compositions and environmental factors of 32 Korean infants were sought through statistical analysis after examinaton of fecal bacterial and questions to their mothers about feeding experiences at three different times for each subjects, about one week after birth, before weaning (2-3 months after birth), and after weaning 95-7 months after birth). The majority of mothers fed their infants cereal foods after the age of 4 months and began weaning with fruit juice and commercial weaning foods. Defection frequencies and fecal pH of infants decreased significantly during the examination period and 37.5% of total infants in fecal samples increased significantly during the examination period, which means that the kinds of bacterial genera increase with aging of infants. Frequencies of streptococci were significantly higher in infants fed delivered by Caesarian section than infants delived naturally. Frequencies of clostrida were significantly higher in infants fed with cerealfood before 4 months of age than after 5 months. The infants fed with probiotics showed significantly higher frequencies of veillonella at about 1 week old. They also showed significantly higher frequencies of clostridia before weaning than the infant fed with no probiotics, but significantly lower frequencise of C. perfringens before weaning. The infants fed with probiotics showed significantly higher number of streptococci at the age of about 1 week and significantly higher numbers of total aerobes before weaning, but significantly lower numbers of bacteroides after weaning than their counter parts. The fecla pH was directly proportional to the number of clostridia, klebsiella, and total aerobes at about 1 week after birth, to the number of E. coli before weaning, and to the number of streptococci and clostridia after weaning. Fecal pH had a negative relationship to the total number of anaerobes in 1-week-old infants. The infants that had diarrhea during lactation showed higher frequencies of bacteroides before weaning than those that didn't.

• 미생물학회지
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• 제33권4호
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• pp.257-261
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• 1997

겨울철 소양호에서 세균 군집 구조를 파악하고자 총세균수와 EUB338, ALF1b, BET4a, GAM42a와 CF probe 등 fluorescent rRNA targeted oligonucleotide probe 와 반응하는 세균 개체수를 수심별로 측정하였다. 총세균수는 $0.7{\times}10^6{\sim}1.1{\times}10^6cell{\cdot}ml^{-1}$이였으며, 5 m와 10 m 수층에서 높게 나타났다. 총세균수에 대한 Eubacteria의 비율은 34~90%이였으며, 5 m와 10 m에서 낮게 나타났다. Proteobacteria ${\alpha}$-group은 Eubacteria의 10.8-28.7%, ${\beta}$-group은 4.5-53.5%, ${\gamma}$-group은 4.9-35.5%, 그리고 Cytophaga-Flavobacterium group은 6.1-21.1%이였다. 0-5 m 수심에서는 ${\beta}$-group이 28.6-53.5%로 우점하고 있었으며, 10 m에서는 ${\gamma}$-group이 35.5%로 우점하였다. 30, 50 m 수심에서는 ${\alpha}$-group과 Cytophaga-Flavobacterium group이 우점하였다. 세균 군집 구조로 보면 0-2 m, 5-10 m 그리고 30-50 m의 3개층은 각각 독특한 특징을 나타내었다. 이 방법으로 호수 생태계에 대한 새로운 정보를 얻을 수 있었다.

• 동아시아식생활학회지
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• 제22권5호
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• pp.593-603
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• 2012

This study was carried out to investigate the effects of pine needle extract on the color, hardness, springiness, chewiness, pH, thiobarbituric acid reactive substances (TBARS) value, and total bacterial number of seasoned pork meat stored at $4^{\circ}C$ for 9 days. The pH levels of sauce samples were not affected by the mixing rate of the extracts. Acidity, soluble solids, and salinity gradually increased as the amount of added extract increased. Total polyphenolic contents in the sauce ranged from $1.01{\pm}0.02$ mg GAE/mL to $1.41{\pm}0.04$ mg GAE/mL, DPPH radical scavenging activity ranged from $0.06{\pm}0.01$ AEAC to $0.12{\pm}0.01$ AEAC, and ABTS radical scavenging activity ranged from $0.11{\pm}0.01$ AEAC to $0.19{\pm}0.01$ AEAC. The pH levels significantly decreased as the amount of added extract increased. The lightness ($L^*$), redness ($a^*$) and yellowness ($b^*$) values of meat tended to decrease with longer storage period (p<0.05). Hardness and chewiness also increased with longer storage period (p<0.05). The TBARS values decreased as the amount of added extract increased after 6 days (p<0.05). Total bacterial numbers of P5, P10, and P15 decreased compared to the control (p<0.05). In the sensory evaluation, taste and palatability were not significantly different among C, P5, and P10 (p<0.05). Further, flavor, color, tenderness, and juiciness were not different among the seasoned pork meats. These results suggest that pine needle extract can inhibit protein degradation, lipid oxidation, and bacterial growth when used as an additive to seasoned pork meat.

• 생태와환경
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• 제35권3호통권99호
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• pp.152-159
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• 2002

농업용 저수지로 축조된 문천지에서 질소순환에 관여하는 질화세균의 연중변화를 현장그대로의 세균상을 반영하는 FISH법으로 정량분석하였다. 아울러 질화세균군의 계절적인 변화와 이화학적인 환경요인과의 상관성을 규명해보기 위해 수온,pH,용존 유기물(DOC),chi-a등이 측정되었다. 총세균수는 정점 1에서 3월에 급격히 상승한 경우를 제외하고는 정점간의 큰 차이가 없이 $0.8{\sim}1.5{\times}10^6\;cells/ml$ 범위에서 변화하였고 eubacteria의 총세균수에 대한 비율는 $44.9{\sim}79.5%$, 질화세균이 eubacteria에서 차지하는 비율은 $1.0{\sim}7.4%$에 그쳤다. 암모니아산화세균은 큰 계절적인 변동이 없이 $1.1{\sim}3.0{\times}10^4\;cell/ml$범위에서 변화한 반면에 아질산산화세균은　정점에 관계없이 겨울철에 증가하는 양상을 나타냈다($1.3{\sim}5.7{\times}10^4\;cells/ml$).또한 암모니아산화세균보다 아질산산화세균이 대체적으로 더 많은 개체수를 나타냈다. 아울러 이화학적인 환경요인 중,　수온은 총세균수와 양의 상관성 (r=0.355, p<0.05),　그리고 아질산산화세균과는 음의 상관성 (r= -0.416, p<0.05)을 보였다. 마찬가지로 아질산산화세균은 pH와도 음의 상관성 (r= -0.568,p<0.01)을 나타냈다. 아울러 DOC는 총세균수(r = 0.586,p<0.000), 　eubacteria (r = 0.448, p<0.01)와 긴밀한 상관관계에 있는 것으로 나타났다. 따라서 문천지에서는 수온, DOC 그리고 pH가 수계 세균군집구조를 변화시키는　중요한 요인으로 작용함을 알 수 있었다. 또한 FISH법은 느리게 성장하는 질화세균군을 정량 분석할 수 있는　유용한 기법으로 평가된다.기간동안 강우의 빈도 및 강도는 하천의 육수학적 현상 변화와 패턴에 중요한 요소로서 작용하며, 이는 동아시아몬순기후대에 속하는 하천들에서 유사하게 발생하는 하천의 중요한 특성으로 사료된다.다. 정화효율과 수리학적조건간의 상관계수($R^2$)는 수리학적 체류시간과 0.016-0.731,일처리유량과는 0.015-0.868을 나타내었으며, 시간당 정화량과 수리학적 조건간의 상관계수($R^2$)는 수리학적 체류시간과는 0.173-0.763,일처리유량과는 0.209-0.770의 범위를 나타내었다. 정화효율과 수리학적 부하조건간의 상관계수($R^2$)Tt 0.5 이상을 나타내는 각 수생식물 습지별 수질항목은 체류시간과 일처리유량에 대해각각 20%,정화속도와 수리학적 조건간의 상관계수는 체류시간에 대해 53%, 일처리유량에 대해73%가 0.5이상을 보이고 있어 시간당 정화량과 수리학적 조건간의 상관관계가 정화효율과의 상관관계보다 좀더 유의성 있게 나타났다. 이것은 높은 수리학적 부하조건이 영양염류 등의 정화효율에는 크게 영향을 미치지 않음을 보여주고 있으며, 따라서 비교적 낮은 농도의 영양염류를 가지고 있고, 많은 처리수량을 요구하는 부영양화된 저수지의 수질개선을 위해서는 높은 수리학적 부하조건에서 시간당 정화량을 늘리는 관리방법이 경제적이며, 이에 초점을 맞추어 나가야 할 것으로 사료된다.도로 검출되어 이를 고려한정수공정의 관리가 필요하리라 생각된다.$yr^{-1}$)의 71%가 감소되어야 할 필요성이 제기되었다. 또한 여름철 심층 산소 고갈이 야기되었고, 이 시기에 퇴적물로 용출된 인이 식물플랑크톤 성장에 이용될 수 있기때문에 퇴적물에 대한 관리도 수행될 필요가 있다.rsity)지수는 2000년 7월에 2.22로 가장 높았으며, 생물량도 조사기간중 36,640 cells ${\cdot}\;mL^{-1}$로 가장 많았다.

• 미생물학회지
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• 제37권3호
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• pp.209-213
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• 2001

Bacillus spp. 이용하여 B3공법을 사용하는 하수 종말 처리장의 포기조에서 Bacillus sup. 변화를 FSIH방법과 포자염색 방법으로 관찰하였다. DAPI로 측정한 세균수는 $3.2{\times}10^8 ~ 4.4{\times}10^8 $ cells/ml 범위로 큰 변화가 없었으나, Bacillus sp. 균수는 $0.3{\times}10^8 ~ 2.5{\times}10^8 $ cells/ml 범위로 지점별, 조사시기별로 큰 차이가 있었다. 포자수는 $0.3{\times}10^7 ~ 8.4{\times}10^7 $ cells/ml 범위로 3월에는 세 번째 포기조, 5월에는 두 번째 포기조에서 각각 8.5, $5.5{\times}10^7$cells/ml으로 높은 값을 보였다. 총세균수는 DAPH를 측정한 값과 포자수를 합하여 사용하였고, Bacillus속 세균수는 FISH로 계수된 수와 포자수를 합하여 사용하였다. 충세균수에 대한 Bacillus sp.균의 비율은 약 8~60% 범위로 첫 번째 및 세 번째 포기조에서 각각 50%, 35% 이상의 높은 비율을 보였다. B3 공법에서는 Bacillus가 우점하고 있음이 FISH 방법으로 확인되었으며, 반송 슬러지와 하수가 유입되는 첫 번째포기 조에서 그 비율이 높았고, 다음 포기조로 가면서 그 비율이 줄어들고 있었다. Bacillus의 포자수는 뒤의 포기조로 가면서 그 수와 비율이 높아지고 있었다.

• Journal of Microbiology
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• 제45권1호
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• pp.1-5
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• 2007

The bacterial compositions between the dental unit water system and human saliva were characterized and compared by direct sequence analysis of 16S rDNA clone libraries. Based on the species richness estimation, bacterial diversity in the dental unit water system (DUW) was more diverse than that of the human saliva (HS). The Chaol estimates of species richness in HS and DUW samples were 12.0 and 72.4, respectively. The total numbers of OTUs observed in the combined libraries accounted for 83% (HS) and 59% (DUW) of the Chaol diversity estimate as defined at the 80% similarity threshold. Based on the sequence analysis, the phylum Proteobacteria was the major group in both clone libraries at phylum level. DUW clone library contained 80.0% Proteobacteria, 8.0% Bacteroides, 4.0% Nitrospira, 4.0% Firmicutes, 2.0% Planctomycetes and 2.0% Acidobacteria. On the other hand, human saliva (HS) clone library contained 55.5% Proteobacteria, 36.1% Firmicutes and 8.4% Bacteroides. The majority of bacteria identified belonged to phylum Proteobacteria in both samples. In dental unit water system (DUW), Alphaproteobacteria was detected as the major group. There was no evidence of the bacterial contamination due to a dental treatment. Most sequences were related to microorganisms derived from biofilm in oligotrophic environments.

• 미생물학회지
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• 제38권4호
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• pp.287-292
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• 2002

봄철 cyanobarteria가 우점하는 천호지에서 fluorescent in situ hybridization (FISH) 방법을 이용하여 세균군집구조를 조사하였다. 조사기간동안 총세균수는 0.6～$1.3{\times}10^7 \cells{\cdot}ml^-1$ 의 범위로 매우 높게 나타났다. 또, 총세균수에 대한 eubacterial group이 차지하는 비율의 경우 29.8～45.8%로 작은 분포를 차지하였다. 세균군집구조를 분석한 결과, $\alpha$-group은 1.4～l2.5%, $\beta$-group은 0.9～4.9%, $\gamma$-group은 0.6～8.3%, $\circledcirc$Cytophaga-Flavobacteruim group은 1.0～8.3%를 나타내어 본 연구에서 조사된 각 group이 차지하는 비율은 낮고 상대적으로 unknown eubacteria의 비율이 높았다. 이러한 군집구조는 일반적으로 다른 담수호에서 나타나는 세균의 군집구조와는 다른 군집구조 이며 특히, aggregates에 부착한 세균 군집구조와 비슷한 양상이었다. 또, cyanobacteria의 조성 이 Anabaena속에서 Microcystis속으로 천이가 일어난 시기에 Cytophaga-Flavobacteruim group이 크게 증가하는 것으로 나타나 세균군집의 크기는 식물플랑크톤의 영향을 받는 것으로 확인되었다.

• 미생물학회지
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• 제32권3호
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• pp.238-244
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• 1994

부영양화된 낙동강 하구역에서 세균에 의한 용존 유기물의 이용능을 조사하고 이에 미치는 환경요인의 영향을 파악하기 위하여 미생물학적 요인과 물리화학적 환경요인의 연중 변화를 분석하였다. 총세균수는 0.33 ~ $2.09{\times}10^7$ cells/ml의 변화폭을 나타냈으며, 오염부하량이 큰 정점에서 종속영양세균의 개체수와 비례하였다. 세균이 체적과 생물량은 각각 0.064~0.156 ${\mu}m^3$/cell, 0.163~1.036 ${\mu}g$-C/ml을 나타냈다. 세균의 이차생산성은 0.24~60.86 ${\mu}g$-C/l/h의 범위로 측정되었으며, 부영양화 지표로 사용되는 환경인자와 밀접한 관계를 보였다. 담수역에 속하는 정점에서의 세균생산성의 계절별 변화는 동계에 최고치를, 하계에 최저치를 나타내어 갈수기의 오염부하량 증가와 밀접한 상관성을 보였다. 해수역에 속하는 다대의 경우 동계에 낮은 값을, 하계에 높은 값을 나타내고, 환경요인 중 엽록소 a, 수은 등과 밀접한 상관성을 보였다 (r>0.5, p<0.05). 이로 미루어 낙동강 하구의 하구언 상류역에서는 주위에서 유입되는 유기물이, 하구언 하류역에서는 식물성 플랑크톤의 광합성 산무링 세균의 이차생산성에 미치는 주 영양물질임을 암시하고 있다.