• 제목/요약/키워드: total bacterial number

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Single-nucleotide polymorphism-based epidemiological analysis of Korean Mycobacterium bovis isolates

  • Kim, Tae-Woon;Jang, Yun-Ho;Jeong, Min Kyu;Seo, Yoonjeong;Park, Chan Ho;Kang, Sinseok;Lee, Young Ju;Choi, Jeong-Soo;Yoon, Soon-Seek;Kim, Jae Myung
    • Journal of Veterinary Science
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    • 제22권2호
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    • pp.24.1-24.16
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    • 2021
  • Background: Bovine tuberculosis (TB) is caused by Mycobacterium bovis, a well-known cause of zoonotic tuberculosis in cattle and deer, and has been investigated in many physiological and molecular studies. However, detailed genome-level studies of M. bovis have not been performed in Korea. Objectives: To survey whole genome-wide single-nucleotide polymorphism (SNP) variants in Korean M. bovis field isolates and to define M. bovis groups in Korea by comparing SNP typing with spoligotyping and variable number tandem repeat typing. Methods: A total of 46 M. bovis field isolates, isolated from laryngopharyngeal lymph nodes and lungs of Korean cattle, wild boar, and Korean water deer, were used to identify SNPs by performing whole-genome sequencing. SNP sites were confirmed via polymerase chain reaction using 87 primer pairs. Results: We identified 34 SNP sites with different frequencies across M. bovis isolates, and performed SNP typing and epidemiological analysis, which divided the 46 field isolates into 16 subtypes. Conclusions: Through SNP analysis, detailed differences in samples with identical spoligotypes could be detected. SNP analysis is, therefore, a useful epidemiological tracing tool that could enable better management of bovine TB, thus preventing further outbreaks and reducing the impact of this disease.

해산어 양식환경하의 미생물군집에 대한 옥소린산의 영향 (Effects of Oxolinic Acid on Microbial Community under Simulated Marine Fish Farm Environment)

  • 윤덕현;김무찬
    • 해양환경안전학회지
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    • 제12권2호
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    • pp.89-98
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    • 2006
  • 이 연구는 해산어 양식장 환경을 재현한 해양 microcosm을 이용하여, 양식장에서 빈번히 사용하고 있는 옥소린산에 대한 미생물이 나타내는 항생제 내성획득에 관해 알아보고자 하였다. 옥소린산 처리 전과 후의 세균상을 비교한 결과, 비브리오 과 세균은 실험기간 전반에 걸쳐 65-75% 정도로 우점하였으며, 그람양성세균인 Micrococcos sp. 와 Bacillus sp. 는 옥소린산 처리 기간 중에 출현 빈도가 증가하였다. 해산어양식 환경에서 세균의 ETS 활성은옥소린산 처리 기간중 42-67%로 줄어들었지만, 옥소린산의 처리가 종료된 후에 세균은 다시 회복되었다. 해산어 양식장에서 옥소린산의 빈번한 사용은 옥소린산에 대한 세균의 내성을 증가시키는 것으로 관찰되었다.

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파로호 수중생태계에서의 미생물 분포 및 활성도 (Distributions and heterotrophic actibities of bacteria in Lake Paro)

  • 안태석;이동훈
    • 미생물학회지
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    • 제26권3호
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    • pp.230-236
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    • 1988
  • 최근 평화의 댐 건설에 따른 영향으로 다량의 물을 방류하여 미생물 생태계의 큰 변화가 예상되는 파로호에서 미생물 분포 및 활성도에 관하여 1987년 1월부터 11월까지 격월로 조사, 연구하였다. 총 세균수는 $0.3\times 10^{5}-13.1\times10 ^{5}$cells/ml의 비교적 낮은 값을 나타내었으며 3월에 급격한 증가를 보여 $10.7\times 10^{5}-13.1\times10 ^{5}$ cells/ml 의 최고치를 나타애었다. 종속영양세균은 $1.9\times 10^{3}$ - $3.1\times 10^{4}$CFUs/m의 변화를 갖으며 총 세균수의 변화와 유사한 경향을 나타내었다. Alpha-및 beta-glucosidase를 분비하는 세균의 비율은 지역적인 차이보다는 계절적인 변화가 우세하였으며 Phosphatase를 분비하는 세균의 비율은 22.7-63.0%로 최고치를 나타내었다. 전자전달계 활성도는 480-1696${\mu}gO_{2}$/l/day의 변화를 갖으며 지역적으로 유입수에서, 계절적으로 여름에 높았다. 유기연산염의 분해율은 0.4-9.1%/h로 다른 댐보다 낮았으며, 수온이 상승함에 따라 분해율이 커졌으며 Phosphatase를 분비하는 세균의 비율변화와 관계가 있음을 알 수 있였다. 종속영양세균의 생리적 활성도는 여름의 최고치가 8.2%/h로 계절적으로 DOM 증가 에 따른 활성도의 증가가 관찰되었다. 파로호의 급격한 변화는 세균류의 개체수 변화에 큰 영향을 미쳤으냐, 활성도 및 특정호소 분비세균비율에는 영향을 주지 못 하였다. 활성도 및 특정효소 분비비율은 계절적 소장이 뚜렷하여, 식물성플라크톤의 증식과 일차 생산력과의 밀접한 관계를 보였다.

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Effect of Administration of Garlic Extract and PGF2α on Hormonal Changes and Recovery in Endometritis Cows

  • Sarkar, P.;Kumar, H.;Rawat, M.;Varshney, V.P.;Goswami, T.K.;Yadav, M.C.;Srivastava, S.K.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제19권7호
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    • pp.964-969
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    • 2006
  • The efficacy of garlic extract and $PGF_2{\alpha}$ in the treatment of endometritis in cows was evaluated. A total of 26 parous cows affected with endometritis were randomly allocated into three groups. Group I (n = 10) animals were infused (IU) with 10 ml garlic extract mixed with 90 ml normal saline, three times at 12 h interval starting from the day of estrum, whereas the animals of Group II (n = 10) were treated with a single injection of $PGF_2{\alpha}$ (25 mg Lutalyse) on the $10^{th}$ to $12^{th}$ day after estrus, and group III (n = 6) remained as control. Cervico-vaginal mucus (CVM) was collected from each animal at pre- and post-treatment estrus and subjected to white side test, pH determination and total bacterial load. The clinical recovery of cows was assessed by negative white side test reaction, pH value and total bacterial count of CVM at subsequent estrus. The recovered animals were inseminated with frozen-thawed semen twice at 12 h intervals and pregnancy was confirmed at 45-60 days following insemination. A significant decline (p<0.05) in pH of CVM was observed in both the treatment groups at subsequent estrus. After treatment there was a significant (p<0.05) reduction in bacterial load, whereas, it was increased in control group. A total number of 65 isolates were identified in CVM samples comprising mostly of facultative anaerobic bacteria. Plasma $T_4$ and $T_3$ concentrations were increased in all the treated animals, whereas, a decline was observed in cortisol levels following treatment. The overall conception rate was 50% in treated groups as compared to nil pregnancy in the control.

지열시스템의 그라우트 및 수온변화가 미생물에 미치는 영향 실험 (Effects of Grouts and Temperature Change on Microorganisms in Geothermal Heat Pump)

  • 조윤주;이진용;김창균;한지선
    • 한국지하수토양환경학회지:지하수토양환경
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    • 제14권4호
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    • pp.10-14
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    • 2009
  • 본 논문은 지열시스템의 설치 시 사용되는 그라우트와 운영에 따른 수온변동이 유발할 수 있는 미생물학적 영향을 실내실험을 통해 살펴보았다. 시료는 지열히트펌프가 아직 가동되지 않는 관정(한방병원)과 지열 히트펌프가 가동 중인 곳(창업보육센터)에서 채취하였다. 실험에 사용한 그라우트는 볼클레이 벤토나이트로 나트륨(Na)계이며 Real-time PCR을 사용하여 각 시료에서 추출된 총 유전자 DNA 중 세균이 가지고 있는 16S rDNA를 정량함으로써 전체 세균의 양을 평가하였다. 실험 결과 지열히트펌프가 가동 중인 지하수에서 총 세균양이 가장 많았으며 벤토나이트를 주입하면서 세균수가 증가하는 경향을 보였다. 한편 그라우트 및 수온영향을 보다 명확하게 파악하기 위해서는 장기적인 현장모니터링이 요구된다.

도시에서 다양한 토양의 물리화학적 특성과 미생물 활성 (Physicochemical Characteristics and Microbial Activity in the Various Urban Soils)

  • 공학양;조강현
    • The Korean Journal of Ecology
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    • 제23권5호
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    • pp.369-375
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    • 2000
  • 도시에서 토양을 보존하고 합리적으로 이용하기 위하여 도시 토양을 과학적으로 이해하는 것이 필요하지만 아직까지 이처럼 과도하게 관리되고 교란된 토양의 특성에 대하여 집중적으로 연구되지 않았다. 본 연구에서 조사된 인천의 산림, 잔디밭, 가로수, 나지 및 포장 밑 토양에서 답압에 의한 견밀화에 의하여 토양 가밀도가 높았다. 또한 다양한 도시 토양에서 수분함량은 전원지 산림 토양에 비하여 적었고 지온은 높았다. 화학적으로는 도시 토양에서 pH가 중성에 가깝고 유기물 함량이 적었다. 도시 토양의 총세균수는 전원지 산림 토양의 단지 5∼50% 수준이었다. 단계식 다중회귀분석의 결과, 토양 유기물함량이 총세균수에 영향을 미치는 주요한 요인으로서 선정되었다. 대부분의 도시 토양에서 탈수소효소 활성도는 전원지 산림 토양과 유의한 차이가 없었으나, 아스팔트 포장 밑 토양에서는 낮았다 그러므로 견밀한 도시 토양에서 낮은 유기물함량이 물질 순환에 관여하는 미생물 수에 악영향을 미친다고 판단되었다.

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대중음식점 일회용 물티슈의 세균 오염도 조사 (Bacterial Contamination in Disposable Wet Wipes from General Restaurants)

  • 정무상
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제48권3호
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    • pp.237-241
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    • 2016
  • 2016년 4월부터 6월까지 제주특별자치도에 위치한 대중음식점, 커피전문점 및 제과 제빵점 등에서 제공하는 일회용 물티슈를 대상으로 미생물의 오염도를 평가하였다. 사용된 재료는 일회용 물티슈 55종을 사용하였다. 대중음식점 일회용 물티슈 55종의 평균 세균 수는 $4.14{\times}10^3CFU/mL$이었으며, 세균이 자라지 않은 물티슈는 5종이었다. 가장 높게 측정된 세균 수는 2종의 물티슈에서 $16.67{\times}10^3CFU/mL$ 이상으로 나타났다. 순수 분리한 총 균수는 71균주이며, 이 중 황색포도알균(Staphylococcus aureus) 15균주, 녹농균(Pseudomonas aeruginosa) 3균주를 동정하였다. 이는 대중음식점에서 공급하는 물티슈의 세균 오염도가 심각하다는 것을 반영하며 기회감염의 원인이 되는 Staphylococcus aureus와, Pseudomonas aeruginosa가 발견된 것은 주목할 만하다고 볼 수 있다. 본 연구를 통해 한 번 사용 후 버리는 일회용품이며, 수개월 내지는 1~2년 보관하면서 사용하는 제품인 일회용 물티슈의 위생관련 기준 마련에 기초자료를 제공하고 대중음식점 등에 대한 위생관리 감독 강화와 개선방안 및 개인 위생관리 및 국민보건 수준향상에 기여 하고자 한다

다양한 고도폐수처리공정에서의 생물반응조 세균수와 처리효율과의 비교 (Comparison of Bacterial Numbers and Treatment Efficiencies in Bioreactors of Various Advanced Wastewater Treatment Processes)

  • 성기문;조연제;김성균;박은원;유기환;이상현;이동근;박성주
    • 한국물환경학회지
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    • 제25권2호
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    • pp.329-334
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    • 2009
  • Bacterial numbers, such as endospore-formers, and treatment efficiencies were investigated for Rotating Activated Bacillus Contactors (RABC) and other advanced wastewater treatment processes including anaerobic-anoxic-oxic (A2O), sequencing batch reactor (SBR) and biological aerated filter (BAF). Endospore-forming bacterial numbers in the RABC showed 129-fold higher levels than those of the existing advanced systems. RABC process demonstrated the highest bacterial numbers in its bioreactors (paired t-test, p<0.01). RBC biofilms and aeration tanks of the RABC system showed 131- and 476-fold higher than other existing advanced processes, respectively. Mean treatment efficiencies of the existing systems were 83.5% for chemical oxygen demand (COD), 59.1% for total nitrogen (TN) and 76.8% for total phosphorus (TP). However, RABC process removed 96.9% for COD, 96.9% for TN and 91.9% for TP for highly concentrated food wastewater (COD>1,500 mg/L, TN>150 mg/L, TP>50 mg/L). Treatment efficiency was significantly reduced when the numbers of Bacillus genus in the bioreactors decreased below $10^6CFU/mL$. The automated RABC (A-RABC), in which dissolved oxygen concentrations are automatically controlled, showed higher treatment efficiencies compared to the RABC process. The RABC system maintained sufficient bacterial numbers for the effective treatment of highly concentrated food wastewater. Moreover, final effluent was in agreement to water quality standards.

Effect of Casing Layer on Growth Promotion of the Edible Mushroom Pleurotus ostreatus

  • Cho, Young-Sub;Weon, Hang-Yeon;Joh, Jung-Ho;Lim, Jong-Hyun;Kim, Kyung-Yun;Son, Eun-Suk;Lee, Chang-Soo;Cho, Bong-Gum
    • Mycobiology
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    • 제36권1호
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    • pp.40-44
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    • 2008
  • Various bacteria were isolated from the casing layer soil of the culture bed of P. ostreatus and their role in fruiting body induction of the edible mushroom, P. ostreatus, was investigated. Analysis of the bacterial community isolated from the casing layer soil revealed that the composition of genera and number of cultivable bacteria were different for each sterilizing treatment. Bordetella was predominant in the bulk soil whereas Flavobacterium was predominant after sterilization of the casing layer soil. Fluorescent Pseudomonas was predominant in the non-sterilized casing layer soil. Total number of the bacterial genera in the casing layer soil was higher than that in the bulk soil. In particular, an increase in the fluorescent Pseudomonas population was observed in the non-sterilized casing layer accompanied by induction of fruiting body and enhanced mushroom production yield. The results suggested that specific bacterial populations in the casing layer play an important role in the formation of primodia and the development of basidiome in P. ostreatus.

도축공정중 식육의 미생물 오염실태 조사 (Microbiological quality of pork meat in the stage of slaughter process)

  • 김은주;강원명;정경주;김우택;김진회;전창익;임윤규
    • 한국동물위생학회지
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    • 제23권4호
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    • pp.361-366
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    • 2000
  • The growth of bacteria on the surface of the meat was monitored to investigate the relationships between microbiological quality and some environmental factors such as the chilling temperature, alcohol spraying, and transport in slaughter process of pigs. The temperature changes of the surface and inner part of pork carcass were monitored with GreenTrack$\textregistered$ system during the process of chilling and transport Of the 100pigs tested, the prevalence of level on number of standard plate count (SPC) less than $10^4$ CFU/$\textrm{cm}^2$ and Escherichia coli less than $10^2$ CFU/$\textrm{cm}^2$ in pig were 82% and 80%, respectively. Suface bacterial numbers are decreased in the course of chilling process of the carcass. Alcohol spray process before packing meat also could decrease the surface bacterial count. In conclusion, this study could be overemphasized the importance of relationship between microbiological quality and refrigerating temperature in the process of refrigeration and cutting.

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