자성 및 웅성스테로이드 호르몬들이 Vg 유전자발현에 영향을 미치는지를 미성숙 무지개송어의 배양간세포 막간을 이용하여 조사하였다. 이미 보고된 송어의 Vg gene의 염기배열을 참고로 Vg cDNA 단편(600 bp)을 증폭시킬 수 있는 primer들을 작성하였다. 이들 primer를 이용하여 증폭된 PCR 산물의 염기배열을 결정하여 송어의 Vg cDNA임을 확인하였고, RT-PCR법을 이용하여 배양간세포 그리고 E$_2$ 및 MT 처리된 송어의 간으로부터 Vg mRNA의 전사량 변화를 조사하였다. 호르몬 처리된 간세포 및 송어의 간에서 추출한 total RNA를 이용하여 RT-PCR법으로 분석한 결과 in vivo, in vitro 실험 모두에서 E$_2$ 또는 MT처리된 간세포 및 송어의 간으로부터 Vg mRNA와 Vg 단백질합성이 유도되었고, 이들의 증가 경향은 처리된 호르몬 농도 및 시간에 의존하고 있음이 밝혀졌다. 또한 progesterone, androsterone 그리고 testosterone 등의 웅성호르몬들도 Vg mRNA의 전사를 유도하고 있다는 것이 시사되었다. 이와 같은 결과로부터E$_2$ 뿐 아니라 웅성스테로이드들도 Vg mRNA의 발현을 유도하고 있음이 송어의 in vivo 또는 in vitro 실험에 의해서 확인되었다.
Kim, Dong Seon;Jung, Ji Young;Wang, Yao;Oh, Hye Ji;Choi, Dongjin;Jeon, Che Ok;Hahn, Yoonsoo
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제24권7호
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pp.979-986
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2014
Plant pathogenic RNA viruses are present in a variety of plant-based foods. When ingested by humans, these viruses can survive the passage through the digestive tract, and are frequently detected in human feces. Kimchi is a traditional fermented Korean food made from cabbage or vegetables, with a variety of other plant-based ingredients, including ground red pepper and garlic paste. We analyzed microbial metatranscriptome data from kimchi at five fermentation stages to identify plant RNA virus-derived sequences. We successfully identified a substantial amount of plant RNA virus sequences, especially during the early stages of fermentation: 23.47% and 16.45% of total clean reads on days 7 and 13, respectively. The most abundant plant RNA virus sequences were from pepper mild mottle virus, a major pathogen of red peppers; this constituted 95% of the total RNA virus sequences identified throughout the fermentation period. We observed distinct sequencing read-depth distributions for plant RNA virus genomes, possibly implying intrinsic and/or technical biases during the metatranscriptome generation procedure. We also identified RNA virus sequences in publicly available microbial metatranscriptome data sets. We propose that metatranscriptome data may serve as a valuable resource for RNA virus detection, and a systematic screening of the ingredients may help prevent the use of virus-infected low-quality materials for food production.
The influence of refeeding with either vitamin, mineral, fibre of water on protein synthesis and mRNA content in the liver and breast muscle of fasted chicks was investigated. At 15 d of age, chicks were fasted for 2 d and then refed either vitamin, mineral, fibre or water. The fractional synthesis rate (FSR) of protein was measured after 30 min of refeeding by using a large dose injection of L - 2, $6[^3H]$ phenylalanine. In the liver, FSR was reduced by fasting and tended to increase but not significantly by refeeding with vitamin or mineral. FSR was not affected by refeeding with fibre or water. There was no influence of fasting and refeeding on ribosomal capacity (the RNA : protein ratio) and ribosomal efficiency (total protein synthesised per total RNA). The absolute synthesis rate (ASR) of liver protein and hepatic mRNA content were reduced by fasting and unchanged by refeeding. In the muscle, FSR, ASR and mRNA content were significantly decreased by fasting and not recovered by refeeding with either vitamin, mineral, fibre or water. It concluded that vitamin, mineral, fibre and water have little capacity to stimulate liver and muscle protein synthesis reduced by fasting.
In order to investigate the effect of Taeumjowetang and Herba Ephedrae on obesity-induced rats, after Taeumjowetang and Herba Ephedrae were administered by mouth, and then body-weight, serum triglyceride, total cholesterol, Obese mRNA and TNF-${\alpha}$/ mRNA were measured. The reselts were as follows ; 1. The body-weight was decresed with the statistical significance in both the Taeumjowetang and the Herba Ephedrae group as compared with the control group. 2. The quantitation of serum triglyceride was decresed with the statistical significance in both the Taeumjowetang and the Herba Ephedrae group as compared with the control group. 3. The total cholesterol was slightly decresed in both the Taeumjowetang and the Herba Ephedrae group as compared with the control group, but there was no statistical significance. 4. The manifestation of Obese mRNA and TNF-${\alpha}$/ mRNA in epidymal, retroperitoneal, mesenteric and skeletal muscle tissues were inhibited in Taeumjowetang and Herba Ephedrae group. According to the above results, Taeumjowerang and Herba Ephedrae were recognized to be helpful for the treatment of obesity.
이 연구에서는 Illumina Hiseq platform을 사용하여 동해 심층 해양수로부터 분리된 Pelagicola sp. DSW4-44 (= KCTC 62762 = KCCM 43261)의 초안 유전체 염기서열 해독을 수행하였다. 그 결과, 유전체는 대략 4.85 Mbp의 길이 및 54.3%의 G + C 함량으로 구성되었고, 전체 4,566개의 단백질 암호 유전자, 3개의 rRNA 유전자, 48개의 tRNA 유전자, 3개의 non-coding RNA 유전자 및 67개의 위유전자(pseudo gene)가 확인되었다. 초안 유전체에서 균주 DSW4-44는 Pelagicola 속의 다른 균주에서 발견되지 않는 이화적 질산염의 암모늄 환원과 탈질화의 질소대사 유전자를 가지고 있었다.
이 연구에서는 Illumina Hiseq platform을 사용하여 동해 심층 해양수로부터 분리된 Zhongshania marina $DSW25-10^T$의 유전체 염기서열 해독을 수행하였다. 그 결과, 유전체는 대략 4.08 Mbp의 길이 및 49.0%의 G + C 함량으로 구성되었고, 전체 3,702개의 단백질 암호 유전자, 3개의 rRNA 유전자, 39개의 tRNA 유전자, 4개의 non-coding RNA 유전자 및 36개의 위 유전자(pseudogenes)가 확인되었다. 또한, 지방족 및 방향족 화합물의 대사 경로가 확인되었다. 이러한 대사 경로들로 비추어 Zhongshania marina $DSW25-10^T$는 유용한 생물 정화 자원으로 사용될 수 있을 것으로 기대된다.
M1 RNA, the catalytic subunit of Escherichia coli RNase P, is an essential ribozyme that processes the 5' leader sequence of tRNA precursors (ptRNAs). Using KS2003, an E. coli strain generating only low levels of M1 RNA, which showed growth defects, we examined whether M1 RNA is involved in polycistronic mRNA processing or degradation. Microarray analysis of total RNA from KS2003 revealed six polycistronic operon mRNAs (acpP-fabF, cysDNC, flgAMN, lepAB, phoPQ, and puuCBE) showing large differences in expression between the adjacent genes in the same mRNA transcript compared with the KS2001 wild type strain. Model substrates spanning an adjacent pair of genes for each polycistronic mRNA were tested for RNase P cleavage in vitro. Five model RNAs (cysNC, flgMN, lepAB, phoPQ, and puuBE) were cleaved by RNase P holoenzyme but not by M1 RNA alone. However, the cleavages occurred at non-ptRNA-like cleavage sites, with much less efficiency than the cleavage of ptRNA. Since cleavage products generated by RNase P from a polycistronic mRNA can have different in vivo stabilities, our results suggest that RNase P cleavage may lead to differential expression of each cistron.
조사포닌을 복강내 투여하면 1) 핵내의 RNA polymerase의 활성도, 2) 핵내의 RNA합성, 3) 세포질의 RNA합성,4) 세포질내의 폴리리보좀 함량, 5) in vitro 상태에서의 쥐간의 polysome과 micro-some으로의 아미노산 유입율, 6) 방사능 표지된 아미노산의 혈청 단백질로의 유입율이 증가하였음을 과거에 보고 한 바 있으며 또한 4주간 조사포닌을 투여한 쥐에서 적출한 간세포를 전자 현미경으로 조사한 결과, 조면 소포체가 상당히 증가하였으며 초원심분리기로서 막에 결합한 ribosome에서의 polysome함량의 증가를 확인하였다. 최근 streptozotocin으로 유도한 단백질 결핍성 당뇨병 쥐에 $Rb_2$를 계속적으로 주사한 결과 blood urea nitrogen과 간내의 urea 농도가 현저히 감소하였으며 혈청내의 총단백질과 알부민의 농도가 대조군의 수치에 비하여 증가한 반면 간내의 RNA와 총 ribosome, 막에 결합된 ribosome의 함량이 증가하였다. 또한 $Rb_2$투여로 혈청내의 총단백질로의 방사능 표지 전구물질의 유입량이 증가하였으며 당뇨쥐에서의 질소균형을 개선시켰다. 이러한 실험적 결과에 근거하여 인삼 사포닌은 대사를 촉진시키고 RNA, 단백질 합성 등을 촉진하는 것으로 생각된다.
난태생 어류인 조피볼락(Sebastes schlegeli)의 성숙과 안정적인 출산을 위한 기초 정보를 얻고자, 간중량지수의 월별 변화와 간세포의 활성이 생식소의 발달과 어떤 관계에 있는지 조사하고, 아울러 생식소 발달에 따른 간 및 근육조직내의 단백질과 총 RNA 함량변화도 조사하였다. 암컷의 HSI는 9월부터 높아지기 시작하여 2월에 최대 값(2.58)에 달한 뒤, 3월(성숙기) 부터 5월(출산기) 사이에는 낮아졌다 수컷에서는 10월(성숙기)부터 높아지기 시작하여 4월(회복기)에 최대 값(3.20)에 달했다. 암컷의 난황형성기에 간세포내 글리코겐과 지방적의 양이 점차 감소되나, 총 RNA의 함량은 증가하였다. 그러나 수컷에서는 다량의 지방적들이 소모되지 않고 성숙기에도 세포질내에 잔존하고 있었다. 생식소의 발달과 함께 간 세포질에는 잘 발달된 조면소포체 가 증가하였는데, 이 들은 단백질 합성과 난황 전구물질의 형성에 중요한 역할을 하는 것으로 간주된다. 암컷의 간과 근육조직의 단백질 및 총 RNA 함량은 1월(성장기)부터 점차 증가되기 시작하여 4월 초순(성숙기)에 최대 값을 나타낸 다음, 4월 하순(임신기)에 감소되는 경향을 보였다. 수컷에서는 초기 성숙기인 10월부터 점차 증가하여 성숙 및 교미기인 12월에 최대 값을 보인 다음, 퇴화기인 1월에 다시 감소하였다.
인삼의 메탄을 추출물을 몇 가지 유기용매를 사용하여 여러 분획으로 나누어서 이 분획들이 아미노아실-tRNA 합성효소의 활동성에 미치는 영향을 조사하였다. 백삼과 홍삼에 모두 아미노아실-합성효소의 활동성에 양성적인 효과를 나타내는 분획을 얻었다. 백삼의 경우에는 전체 메탄을 추출물에 그 성분이 있으며, 홍삼의 경우에는 메탄 올 추출물을 에테르로 추출한 분획에 그 성분이 있었다. 그러므로 이 효소에 양성적인 효과를 미치는 성분은 다소 무극성인 물질일 것으로 추측된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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