소세포폐암은 비교적 초기 항암치료에 대한 반응이 우수하지만 빠르게 진행하는 것으로 알려져 있다. Topotecan은 topoisomerase I inhibitor로 소세포폐암에서 이차치료제로 사용된다. Topotecan의 흔한 부작용으로는 빈혈, 혈소판감소증, 호중구감소증과 같은 혈액학적 부작용이 있으나, topotecan에 의한 폐독성은 잘 알려져 있지 않다. 저자들은 일차치료에 불응하여 이차치료제로 topotecan을 투여 받던 소세포폐암 환자에서 3주기 topotecan 투약중에 발생한 급성호흡곤란증후군을 경험하여 보고한다. 환자는 호흡곤란을 호소하면서 호흡부전에 빠졌으며, 흉부전산화단층촬영에서 약제에 의한 폐손상을 시사하는 미만성 간유리음영을 보였다. 환자는 급성호흡곤란증후군으로 사망하였다.
미꾸라지의 간으로부터 핵을 분리하여, 저농도 염추출 및 제한효소 처리로 핵기질(nuclear matrix)을 분리하였다. 분리된 핵기질을 Proteinase K로 분해한 후, phenol-chloroform 추출로 크기가 약 0.3kb-15kb의 분포를 나타내는 핵기질 부착 DNA (nuclear matrix attachment regions : MARs)를 얻었다. 효모 URA 3 유전자를 가진 2.13 kb Eco47 III 단편을 제한효소 Ssp I 으로 절단된 pUC19 플라즈미드 벡타에 결합시켜, ARS (autonomously replication sequence) 클로닝을 위한 pURY19 플라즈미드 벡타를 만들었다. 이 pURY19 벡타는 Saccharomyces cerevisiae내에서 독립적으로 복제할 수 없기 때문에, 물고기의 효율적인 발현 벡타 개발을 위해, 이 system을 이용하여, S. cerevisiae내에서 독립적으로 복제 가능한 미꾸라지의 ARS를 클로닝하고자 하였다. 분리 된 MARs를 pURY19 벡타에 결합시 킨 다음, E. coli $DH5\alpha$에 형질전환시켜 $pURY19N_{l-62}$를 얻었다. MAR Libraries $(pURY19N_{1-62})$를 각각 $Ura^-\;S.\;cerevisiae$에 형질전환시켜, S. cerevisiae내에서 독립적으로 복제 가능한 M. mizolepis 유래의 복제원점들 (ARSs)을 분리하여, Sanger's dideoxy-chain termination method로 염기서열을 분석하였다. 염기서열 분석결과 모든 clones들은 AT-rich하였으며, 특히 $pURY19N_6$에는 ARS concensus sequence, Topoisomerase II consensus, near A-box, 그리고 T-box들이 존재하였다.
Objective : Ikiyangeumhaedoc-tang(IYHT) has an effect of nourishing Yin(陰) and Jin(津), and has been used to cancer patient effectively. In order to prove the anticancer's and antimetastic effect of IYHT experimentally, studies were done. Methods : We evaluated the cytotoxic activity on HT-1080 cells as well as inhibitory effect on activity of DNA topoisomerase Ⅰ, cell adhesion, cell invasion and proliferation of HUVEC cells induced by bFGF and measured the expression of mRNA(uPA, MMP2, TIMP2), p-ERK protein, recovery effect of gap junctional intercellular communication by $H_{2}O_2$ and survival time of ICR mice bearing sacoma-180. Results : IYHT showed the inhibitory effect on DNA topoisomerase Ⅰ in the concentration of $100{\mu}g/ml,\;500{\mu}g/ml$ and the dosage-dependent inhibitory effect on the adhesion of HT-1080. The concentration of 1mg/ml of IYHT inhibited 15% of adhesion compared with control. IYHT decreased the expression of uPA, but not in MMP2, TIMP2 by RT-PCR and inhibited the expression of p-ERK effectively in the concentration of more than $500{\mu}g/ml.$ IYHT recovered the inhibited gap junctional intercellular communication by $H_{2}O_2$ to the level of 60% of normal control in the concentration of $400{\mu}g/ml$ but, did not extended the mean survival time of sarcoma 180-bearing mouse. Conclusions : It was concluded that IYHT could be applied usefully for prevention and treatment of human cancer, And also experimental study for the evaluation of molecular biological study and antimetastatic research would be recommended in the near future.
생명체에서 비천연 아미노산을 단백질의 특정 위치에 삽입하는 방법으로 orthogonal suppressor tRNA와 여기에 비천연 아미노산을 특이적으로 결합시킬 수 있는 유전자 변형된 aminoacyl-tRNA synthetase (ARS)가 활용되고 있다. 이 기술개발을 위해서는 돌연변이를 유발한 ARS library로부터 비천연 아미노산만을 특이적으로 결합시킬 수 있는 변형된 ARS를 탐색하기 위한 선별시스템이 필요하다. 본 논문에서는 대장균에서 작용하는 2단계로 구성된 새로운 선별시스템을 개발하였다. 먼저 양성선별 시스템은 27번 잔기를 amber 코돈으로 치환한 Chloramphenicol acetyl transferase 유전자로 구성되어 있으며, 이유전자의 amber suppression에 의해 chloramphenicol 배지에서 생존함에 따라 활성을 나타내는 ARS를 최고 $9.0{\times}10^5$배로 농축할 수 있었다. 반면 음성선별 시스템은 대장균의 Topoisomerase II의 기능을 억제하는 단백질을 암호화하는 control of cell death B (ccdB) 유전자의 N-말단 앞에 3개의 amber 코돈을 삽입하여 제작하였다. 이 음성선별 시스템을 가진 대장균에 orthogonal pair인 Saccharomyces cerevisiae tyrosyl-tRNA synthetase (Scc TyrRS)와 amber suppressor tRNA를 형질전환하면 amber suppression으로 CcdB가 발현되어 대장균의 성장이 억제되는 것을 확인하였으며, 천연 아미노산에 대한 특이성을 가진 ARS를 효과적으로 제거하는 것을 관찰하였다. 따라서, 양성선별 및 음성선별 시스템을 순차적으로 거침으로써 무작위적으로 아미노산에 대한 특이성을 변형시킨 ARS 라이브러리로부터 비천연 아미노산을 suppressor tRNA에 특이적으로 결합하는 유전자 변형 ARS를 탐색하는데 유용하게 사용될 수 있을 것이다.
Kim, Myoung-Sug;Jun, Lyu-Jin;Shin, Soon-Bum;Park, Myoung-Ae;Jung, Sung-Hee;Kim, Kwang-Il;Moon, Kyung-Ho;Jeong, Hyun-Do
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제20권12호
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pp.1735-1743
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2010
The full-length genes gyrB (2,415 bp), parC (2,277 bp), and parE (1,896 bp) in Edwardsiella tarda were cloned by PCR with degenerate primers based on the sequence of the respective quinolone resistance-determining region (QRDR), followed by elongation of 5' and 3' ends using cassette ligation-mediated PCR (CLMP). Analysis of the cloned genes revealed open reading frames (ORFs) encoding proteins of 804 (GyrB), 758 (ParC), and 631 (ParE) amino acids with conserved gyrase/topoisomerase features and motifs important for enzymatic function. The ORFs were preceded by putative promoters, ribosome binding sites, and inverted repeats with the potential to form cruciform structures for binding of DNA-binding proteins. When comparing the deduced amino acid sequences of E. tarda GyrB, ParC, and ParE with those of the corresponding proteins in other bacteria, they were found to be most closely related to Escherichia coli GyrB (87.6% identity), Klebsiella pneumoniae ParC (78.8% identity), and Salmonella Typhimurium ParE (89.5% identity), respectively. The two topoisomerase genes, parC and parE, were found to be contiguous on the E. tarda chromosome. All 18 quinolone-resistant isolates obtained from Korea thus far did not contain subunit alternations apart from a substitution in GyrA (Ser83$\rightarrow$Arg). However, an alteration in the QRDR of ParC (Ser84$\rightarrow$Ile) following an amino acid substitution in GyrA (Asp87$\rightarrow$Gly) was detected in E. tarda mutants selected in vitro at $8{\mu}g/ml$ ciprofloxacin (CIP). A mutant with a GyrB (Ser464$\rightarrow$Leu) and GyrA (Asp87$\rightarrow$Gly) substitution did not show a significant increase in the minimum inhibitory concentration (MIC) of CIP. None of the in vitro mutants exhibited mutations in parE. Thus, gyrA and parC should be considered to be the primary and secondary targets, respectively, of quinolones in E. tarda.
본 연구에서는 전이성 암세포와 항암제 다제내성 세포에 있어서 항암제 내성에 영향을 미치는 것으로 알려진 DNA-dependent protein kinase (DNA-PK) 가 Abl protein-tyrosine kinases저해제인 STl571 내성에도 연관되어 있는지에 대하여 조사하였다. 또한 STl571 과 topoisomerase I 저해제인 camptothecin (CPT) 의 단독 및 병용처리에 의한 항암 활성을 전이성 암세포와 항암제 다제내성 세포를 대상으로 조사하였다. 세포의 전이도와 내성정도에 따라 STl571 의 감수성이 다르게 나타났다. 이와 함께 ST1571의 처리후 농도에 따라 전이도가 낮은 KMl2, PC3 세포와 항암제 감수성인 CEM, MCF-7 세포에서는 DNA-PK 의 발현이 감소하는 반면, 전이도가 높은 KML4a, PC-MM2 세포와 다제내성 CEM/MDR 및 MCR/MDR 세포에서는 그 발현이 증가되어 있음을 알 수 있었다. 이는 DNA-PK 의 발현이 STl571 의 내성에 관여한다는 것을 시사한다. 이와 같은 결과에 근거하여 DNA-PK 의 발현을 감소시키는 CPT를 STl571 내성을 나타내는 암세포에 대하여 STl571 과 병용처리 하였다. 그 결과 DNA-PK의 발현이 감소되고 세포증식이 억제됨으로써 ST1571 의 감수성이 CPT에 의해 증가하는 것을 알 수 있었다. 따라서 본 연구에서는 DNA-PK가 STl571 의 내성을 극복하는데 있어서 새로운 표적이 될 수 있으며, STl571 의 치료내성 극복에 CPT 와의 병용처리가 유효함을 알 수 있었다.
Woo, Mi Hee;Zhao, Bing Tian;Tran, Manh Hung;Jeong, Su Yang;Ma, Eun Sook;Min, Byung Sun
Bulletin of the Korean Chemical Society
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제34권9호
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pp.2675-2679
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2013
Activity-directed isolation of the methylene chloride fraction from the stems of Parthenocissus tricuspidata have led to the identification of two new compounds (1-2): 1-(2',3',5'-trihydroxyphenyl)-2-(4"-hydroxyphenyl)-ethane-1,2-(E)-epoxide (1, tricuspidatin A) and erythro-1-(3',5'-dihydroxyphenyl)-2-(4"-hydroxyphenyl)-ethane-1,2-diol (2, tricuspidatin B), together with four known compounds (3-6): ${\beta}$-sitosterol (3), nonacosan-1-ol (4), 3-(4-hydroxy-3-methoxyphenyl)-2-propenoic acid hexacosyl ester (5) and betulinic acid (6). Their chemical structures were elucidated based on spectroscopic (IR, UV, MS, 1D and 2D NMR) and physicochemical analyses. Compounds 1 and 2 showed strong DNA topoisomerase II inhibitory activity at both concentrations of 20 and $100{\mu}M$. In addition, 3 exhibited strong cytotoxic activity against the HT-29 and HepG2 cancer cell lines, and 6 showed strong cytotoxicity against the HT-29 and MCF-7 ones.
Phellinus Iinteus from Cambodia was confirmed to have a homologous DNA sequencec to Phellinus Iinteus. Antitumor and immunomodulatory activities were evaluated with aquous extract of Cambodian Phellinus Iinteus(CPL). CPL didn't show any significant cytotoxicity on HT1080, Sarcoma 180 and B16BL6, whereas it inhibited the relaxation of DNA topoisomerase I from the concentration of 250ug/ml. In the pulmonary colonization assay it inhibited pulmonary metastasis by B16BL6 in C57BL6 mice to 36%, 36.9% and 55.5% at various doses of 2 mg, 20 mg and 50 mg. From FACS analysis with splenocytes pretreated with CPL, it significantly increased lymphoblast and induced production of IL-2. These results indicate Cambodian Phellinus Iinteus has antitumor and immunomodulatory activities still suggesting more study on its mechanism and effective compound in detail.
동시화시킨 CHO세포를 재료로하여 EMS 혹은 BLM에 의해 유발된 염색체 이상에 미치는 APC, ddTTP, 그리고 NOV의 효과를 조사하였다. 세포의 동시화는 thymidine block방법을 사용하였다. APC, ddTTP, 그리고 NOV의 단독처리는 염색체 이상을 유발하지 않았다. EMS에 의해 유발된 염색체 이상은 late G$_1$과 early S기에 높은 감수성을 나타내었고, BLM에 의해 유발된 염색체 이상은 G$_2$기에 가장 높은 감수성을 나타내었다. APC를 후처리할 경우 late G$_1$기와 early S기에서 EMS에 의해 유발된 염색체이상을 증가시켰다. 그러나 ddTTP나 NOV를 복합처리하기전 NOV를 전처리하면 late G$_1$기와 early S기에서의 염색체 이상이 증가되었다. 이런 결과들은 여러 가지 돌연변이원에 따라 각기 다른 세포내 반응이 유발되며 염색체 이상에서의 각 효소들의 활성 또한 다른 것으로 추측된다.
Reverse gyrase is a hyperthermophile specific protein which introduces positive supercoils into DNA molecules. Reverse gyrase consists of an N-terminal helicase-like domain and a C-terminal topoisomerase domain. The helicase-like domain shares the three-dimensional structure with two tandem RecA-folds (H1 and H2), in which the subdomain H2 is interrupted by the latch domain (H3). To understand the physical property of the hyperthermophile-specific protein, two subdomains af_H1 and af_H23 have been cloned into E. coli expression vector, pET28a. The $^{15}N$-labeled af_H1 and af_H23 proteins were expressed and purified for heteronuclear NMR study. The af_H1 protein exhibits the well-dispersion of amide signals in its $^1H/^{15}N$-HSQC spectra and thus further NMR study continues to be progressed.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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