• 제목/요약/키워드: threshold values

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Genetic Structure of and Evidence for Admixture between Western and Korean Native Pig Breeds Revealed by Single Nucleotide Polymorphisms

  • Edea, Zewdu;Kim, Sang-Wook;Lee, Kyung-Tai;Kim, Tae Hun;Kim, Kwan-Suk
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제27권9호
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    • pp.1263-1269
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    • 2014
  • Comprehensive information on genetic diversity and introgression is desirable for the design of rational breed improvement and conservation programs. Despite the concerns regarding the genetic introgression of Western pig breeds into the gene pool of the Korean native pig (KNP), the level of this admixture has not yet been quantified. In the present study, we genotyped 93 animals, representing four Western pig breeds and KNP, using the porcine SNP 60K BeadChip to assess their genetic diversity and to estimate the level of admixture among the breeds. Expected heterozygosity was the lowest in Berkshire (0.31) and highest in Landrace (0.42). Population differentiation ($F_{ST}$) estimates were significantly different (p<0.000), accounting for 27% of the variability among the breeds. The evidence of inbreeding observed in KNP (0.029) and Yorkshire (0.031) may result in deficient heterozygosity. Principal components one (PC1) and two (PC2) explained approximately 35.06% and 25.20% of the variation, respectively, and placed KNP somewhat proximal to the Western pig breeds (Berkshire and Landrace). When K = 2, KNP shared a substantial proportion of ancestry with Western breeds. Similarly, when K = 3, over 86% of the KNP individuals were in the same cluster with Berkshire and Landrace. The linkage disquilbrium (LD) values at $r^2_{0.3}$, the physical distance at which LD decays below a threshold of 0.3, ranged from 72.40 kb in Landrace to 85.86 kb in Yorkshire. Based on our structure analysis, a substantial level of admixture between Western and Korean native pig breeds was observed.

영산호 운영을 위한 홍수예보모형의 개발(I) -나주지점의 홍수유출 추정- (River Flow Forecasting Model for the Youngsan Estuary Reservoir Operations(I) -Estimation Runof Hydrographs at Naju Station)

  • 박창언;박승우
    • 한국농공학회지
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    • 제36권4호
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    • pp.95-102
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    • 1994
  • The series of the papers consist of three parts to describe the development, calibration, and applications of the flood forecasting models for the Youngsan Estuarine Dam located at the mouth of the Youngsan river. And this paper discusses the hydrologic model for inflow simulation at Naju station, which constitutes 64 percent of the drainage basin of 3521 .6km$^2$ in area. A simplified TANK model was formulated to simulate hourly runoff from rainfall And the model parameters were optirnized using historical storm data, and validated with the records. The results of this paper were summarized as follows. 1. The simplified TANK model was formulated to conceptualize the hourly rainfall-run-off relationships at a watershed with four tanks in series having five runoff outlets. The runoff from each outlet was assumed to be proportional to the storage exceeding a threshold value. And each tank was linked with a drainage hole from the upper one. 2. Fifteen storm events from four year records from 1984 to 1987 were selected for this study. They varied from 81 to 289rn'm The watershed averaged, hourly rainfall data were determined from those at fifteen raingaging stations using a Thiessen method. Some missing and unrealistic records at a few stations were estimated or replaced with the values determined using a reciprocal distance square method from abjacent ones. 3. An univariate scheme was adopted to calibrate the model parameters using historical records. Some of the calibrated parameters were statistically related to antecedent precipitation. And the model simulated the streamflow close to the observed, with the mean coefficient of determination of 0.94 for all storm events. 4. The simulated streamflow were in good agreement with the historical records for ungaged condition simulation runs. The mean coefficient of determination for the runs was 0.93, nearly the same as calibration runs. This may indicates that the model performs very well in flood forecasting situations for the watershed.

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콘텐츠 기반 움직임 적응형 디인터레이싱 기법 (A Content-Based Motion Adaptive DeInterlacing Technique)

  • 김민환;이창우;이성원
    • 방송공학회논문지
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    • 제15권6호
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    • pp.791-802
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    • 2010
  • 최근 LCD TV와 같은 순차 주사형 디스플레이의 보급에 따라 HDTV등의 전송에 사용된 비월 주사 영상을 순차 주사 영상으로 변환하는 기존의 디인터레이싱 기술에 대한 화질 개선 요구가 커지고 있다. 본 논문에서는 영상 콘텐츠에 따른 움직임 정보의 통계값을 계산하여 영상 콘텐츠의 종류별로 미리 설정된 임계값에 따라 공간적, 시간적 디인터레이싱 방법을 선택적으로 적용하는 움직임 적응형 디인터레이싱 기법을 제안한다. 또한 공간적 디인터레이싱의 화질을 개선하기 위하여 소벨 연산을 이용하여 수직 에지와 수평 에지의 비율에 따라 M-ELA 방법과 DOI 방법을 선택적으로 사용하는 개선된 공간적 디인터레이싱 방법을 제안한다. 다양한 실험 영상에 대한 객관적, 주관적 평가를 통하여 제안한 방법이 기존의 디인터레이싱 방법에 비해 우수한 화질을 보임을 확인하였다.

수평 구동형 MEMS 관성 스위치 설계 및 성능해석 (Design and Performance Analysis of Lateral Type MEMS Inertial Switch)

  • 김학성;장승교
    • 한국항공우주학회지
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    • 제48권7호
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    • pp.523-528
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    • 2020
  • 스프링-메스 시스템의 원리를 이용하여 수평 구동형 MEMS 관성 스위치를 설계하였다. 본 MEMS 스위치는 외부에서 발생하는 가속도를 감지하여 점화안전장치를 장전시키는 역할을 한다. 성능 모델링을 통하여 다양한 가속도 조건에서의 구동 양상을 분석하였다. 시뮬레이션 결과 가속도의 기울기가 10g/msec 이하인 경우에 MEMS 스위치는 10g에서 잘 작동하는 것으로 나타났다. 반면에, 설계 변수들의 공차를 10%로 고려한 시뮬레이션 결과 스프링 폭과 길이에 의해 임계 동작 가속도가 규격(10±2g)을 벗어났다. 제작 공정상 10% 이하의 공차 관리가 어려운 스프링 폭을 두 배로 늘렸을 때 규격을 만족하는 것을 확인하고 설계보완을 제안하였다.

표면 곡률을 이용하여 깊이 가중치 Hausdorff 거리를 적용한 3차원 얼굴 영상 인식 (Surface Curvature Based 3D Pace Image Recognition Using Depth Weighted Hausdorff Distance)

  • 이영학;심재창
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제8권1호
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    • pp.34-45
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    • 2005
  • 본 논문은 3차원 얼굴 영상으로부터 추출된 표면 곡률에 대 하여, 깊이 값을 가중치로 하는 Hausdorff 거리를 이용한 얼굴 인식 알고리즘을 제안한다. Hausdorff 거리 방법은 두 개의 점 집합에 대한 일치성을 측정하는 방법이다. 먼저 객체와 배경을 분리하여 얼굴을 추출한 후 얼굴에서 가장 두드러진 형태인 코끝을 찾고, 회전에 대한 정규화를 실시한다. 3차원 얼굴 영상으로부터 표면 특성의 정보인 주 곡률, 평균 곡률 그리고 가우시안 곡률 값을 추출한다. 입력 영상과 데이터베이스 영상과의 유사도 비교를 위해 두 영상에 대하여 문턱치 값에 의한 이진 영상을 추출하여 각 점에 대한 깊이 값을 가중치로 하는 깊이 가중치 Hausdoff 거리(DWHD)를 이용하여 비교하였다. 제안된 방법으로 수행한 결과, 인식률은 픽셀의 분포가 가장 적은 주 곡률의 최소 곡률이 98%로 가장 높게 나타났다.

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Development of a real-time PCR method for detection and quantification of the parasitic protozoan Perkinsus olseni

  • Gajamange, Dinesh;Yoon, Jong-Man;Park, Kyung-Il
    • 한국패류학회지
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    • 제27권4호
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    • pp.387-393
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    • 2011
  • The objective of this study was to develop a real-time PCR method for the rapid detection and quantification of the protozoan pathogen Perkinsus olseni using a TaqMan probe. For the standard, genomic DNA was extracted from $10^5$ in vitro-cultured P. olseni trophozoites, and then 10-fold serial dilutions to the level of a single cell were prepared. To test the reliability of the technique, triplicates of genomic DNA were extracted from $5{\times}10^4$ cells and 10-fold serial dilutions to the level of 5 cells were prepared. The standards and samples were analyzed in duplicate using an $Exicycler^{TM}$ 96 real-time quantitative thermal block. For quantification, the threshold cycle ($C_T$) values of samples were compared with those obtained from standard dilutions. There was a strong linear relationship between the $C_T$ value and the log concentration of cells in the standard ($r^2$ = 0.996). Detection of DNA at a concentration as low as the equivalent of a single cell showed that the assay was sensitive enough to detect a single cell of P. olseni. The estimated number of P. olseni cells was similar to the original cell concentrations, indicating the reliability of P. olseni quantification by real-time PCR. Accordingly, the designed primers and probe may be used for the rapid detection and quantification of P. olseni from clam tissue, environmental water, and sediment samples.

통영시 연안의 양식굴(Crassostrea gigas)에서 검출된 노로바이러스의 정량분석 (Norovirus Quantification in Oysters Crassostrea gigas Collected from Tongyeoung, Korea)

  • 신순범;오은경;이희정;김연계;이태식;김지회
    • 한국수산과학회지
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    • 제47권5호
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    • pp.501-507
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    • 2014
  • Norovirus (NoV) is a major cause of food poisoning outbreaks in Korea. Most NoV outbreaks originate from environmental contamination, but bivalves such as oysters are also important vectors. Oyster Crassostrea gigas contamination by NoV has been reported in Korea, but no quantitative analyses of NoV have been performed. We investigated the NoV concentration in 21 oyster samples from a Korean commercial oyster-growing area with confirmed fecal contamination from January to December 2012, using real-time reverse transcription-polymerase chain reaction. Additionally, we assessed the NoV concentration after heating to investigate the effects of heat treatment on NoV-infected oysters. In NoV-positive samples, the cycle threshold (Ct) values were 37.43-39.41 and 36.77-39.30, while viral concentrations were $8.97{\times}10^2-2.24{\times}10^2$ and $3.05{\times}10^2-7.47{\times}10^1$ copies/g for genogroups I and II, respectively. After heat treatment, NoV genogroup I decreased by 83.4%, 88.0%, 89.4% and 100% at $60^{\circ}C$, $68^{\circ}C$, $70^{\circ}C$, and $100^{\circ}C$, respectively, for 15 min, while genogroup II respectively decreased by 67.3%, 76.3%, 80.1%, and 89.8% under the same conditions.

낙뢰와 대기전계의 탐지를 기반으로 하는 자동낙뢰경보시스템의 구성과 운용특성 (Construction and Operation Characteristics of the Automated Lightning Warning System Based on Detections of Cloud-to-Ground Discharge and Atmospheric Electric Field)

  • 심해섭;이복희
    • 조명전기설비학회논문지
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    • 제27권11호
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    • pp.82-88
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    • 2013
  • It is important to give lightning warning prior to a cloud-to-ground (CG) discharge within an Area of Concern (AOC) because most of lightning damage and victim are usually occurred by the first lightning in the AOC. The aim of this study is to find the optimal operation conditions of the automated lightning warning systems in order to make the best use of the available data. In this paper, the test-operated results of the automated lightning alert and risk management system (ALARM) based on detections of CG discharge and eletrostatic field and optimized at probability of lightning have been described. It was possible to obtain the following warning performance parameters: probability of detection (POD), false alarm ratio (FAR), probability of lightning (POL) and failure-to-warn rate (FTW). The data obtained from trial operation for 5months were not sufficient but the first analysis of domestic lightning warning was carried out. We have observed that the evaluated statistical results through trial operation depend on the various factors such as analysis methods and criteria, topographical conditions, etc. Also we suggest some methods for improvement of POL and POD including the finding of the optimal electric field threshold level to be used, based on the high values of FAR and FTW found in this work.

AWGN 환경에서 국부 마스크의 표준편차를 이용한 변형된 평균 필터에 관한 연구 (A Study on Modified Average Filter using Standard Deviation of Local Mask in AWGN Environments)

  • 권세익;김남호
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제20권4호
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    • pp.840-846
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    • 2016
  • 최근, 디지털 영상처리 장치에 대한 수요가 급격히 증대되면서 영상의 우수한 화질이 요구되고 있다. 그러나 디지털 영상을 획득, 처리, 전송하는 과정에서 여러 외부 원인에 의해 영상의 열화가 발생되며, 영상 열화의 주된 원인은 잡음에 의한 것으로 알려져 있다. 영상에 첨가되는 잡음에는 다양한 종류가 있으며 AWGN이 대표적이다. 따라서 본 논문에서는 AWGN 환경에서 국부 마스크의 표준편차를 적용한 임계값을 사용하여, 그 값에 따라 서로 다르게 처리하는 평균필터 알고리즘을 제안하였다. 시뮬레이션 결과, 제안한 알고리즘은 AWGN(${\sigma}=15$)인 Baboon 영상에서 24.56[dB]의 높은 PSNR을 보이고 있고, 기존의 MF, CWMF, AWMF에 비해 각각 3.34[dB], 2.57[dB], 3.32[dB] 개선되었다.

홍채 영역 분할을 위한 새로운 원 검출 알고리즘 (A Novel Circle Detection Algorithm for Iris Segmentation)

  • 윤웅배;김태윤;오지은;김광기
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제16권12호
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    • pp.1385-1392
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    • 2013
  • 최근 생체 정보를 이용한 다양한 방식의 인증 시스템에 대한 연구가 많이 이루어지고 있다. 본 연구에서는 홍체 인식을 위한 홍채 영역 검출을 위하여 임계값의 변경 없이 원둘레의 일부 정보를 이용하여 만들어진 원의 연립방정식을 이용하여 전안부 영상에서의 홍채 영역을 효과적으로 검출할 수 있는 새로운 알고리즘을 제안한다. 제안 알고리즘은 외곽정보를 통해 계산된 원의 중점 좌표가 가장 많이 누적된 영역을 검출될 원의 중점으로 인식하여 검출하게 된다. 이를 위하여 50명의 사람의 전안부 이미지에서 테스트를 통해 알고리즘을 circular hough transform, Daugman의 방법과 비교한 결과, 두 방법에 비하여 속도는 각각 5배, 75배가 향상되었으며, 제안한 방법의 중심위치 정확도는 95.36%로 circular hough transform 방법의 92.43%에 비하여 더 우수한 성능을 나타내었다. 본 연구는 홍채인식을 통한 신분 인증 시스템이나, 전안부 영상을 이용한 질병진단 시스템에서의 유용하게 활용이 될 것이라 예상된다.