Surface mineralogy of asteroids are inferred from photometric and spectroscopic observations with the wide range of wavelengths spanning from far-ultraviolet to mid-infrared. We classify mineralogy of those objects based on their spectral absorption features and spectral slopes. Based on overall spectral shapes, mineralogical classes are divided into three broad complexes; silicates (S), carbonaceous (C) and Vestoids (V), and the end-members that do not fit within the S, C and V broad-complexes. Each of them is subdivided into individual classes. Spectral classification of asteroidal objects has been simply represented by a combination of photometric colors. For a decade, photometric data of asteroids have been grouped and classified according to their SDSS colors converted from the spectral taxonomy. However, systematic studies for asteroid taxonomy based on Johnson-Cousins filters is few, and were conducted only with a small number of objects. In this paper, we present our preliminary results for taxonomic classification of Main Belt asteroids based on KMTNet Johnson-Cousins photometric color system.
The classification system of Collybiopsis has been updated to contain some species of Collybiopsis, Gymnopus sect. Vestipedes, and Marasmiellus. Recently, we conducted the taxonomic study of Korean Collybiopsis to reflect the current classification system and confirmed 16 species. We propose their Korean names in this research note.
우리나라 서남해안으로 유입되고 있는 하천 및 각 수계에 서식하는 동자개과 어류를 재검토한 결과 모두 2속 6종 즉 Pseudobagrus fulvidraco, Pseudobagrus koreanus sp. nov., P. brevicorpus, Leiocassis nitidus, L. ussuriensis, L. longirostris 등으로 분류되었다. 이 중에서 P. koreanus sp. nov.와 P. brevicorpus는 한국특산 어종이다. 지금까지 Pseudobagrus sp. 로 기재해온 눈동자개는 독립종으로 하여 Pseudobagrus koreanus Uchida로 명명하였다.
Park, Jongsun;An, Jung-Hyun;Kim, Yongsung;Kim, Donghyun;Yang, Byeong-Gug;Kim, Taeho
Journal of Species Research
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제9권3호
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pp.233-246
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2020
A scientific name is one of changeable terms in biology whenever additional research results of specific taxa is accumulated. The Database of the National Species List of Korea (DBNKo) was developed to manage taxonomic information of Korean species, designed to describe the changeable and complex taxonomical structure and information. A Korean Taxonomical Serial Number (KTSN) was assigned to each taxon, different from the normally used systems that the scientific name was considered as primary key to manage higher rank of taxa systematically. Common names were also treated with the KTSN, reflecting that common name is considered as one type of taxon. Additional taxonomic information (e.g., synonyms, original names, and references) was also added to the database. A web interface with an intuitive dashboard presenting taxonomic hierarchical structure is provided to experts and/or managers of the DBNKo. Currently, several biological databases are available in the National Institute of Biological Resources (NIBR) such as a specimen database, a digital library, a genetic information system, and the shared species data based on the DBNKo. The DBNKo started sharing species information with other institutions such as the Nakdonggang National Institute of Biological Resources. It is an ideal centralized species database to manage standardized information of Korean species.
산림청 국립수목원과 한국식물분류학회가 공동으로 국내 최초로 전산화된 식물목록 데이터베이스를 구축하였다. 그 결과로 재배종을 포함한 약 7,000 분류군을 대상으로 항상 최신의 자료를 갱신할 수 있는 국가표준식물목록을 온라인상에 구현하였다. 국가표준식물목록은 37명의 국내 전문분류학자가 참여한 우리나라 식물목록과 관련된 최대 규모의 프로젝트이다. 본 연구는 국가표준식물목록 생성과정을 분석하고 이를 통해 관계형 데이터베이스 모델을 수립하였다. 개발된 광릉 데이터베이스 모델은 식물목록과 관련된 문헌과 다양한 분류학 자료를 제공할 수 있도록 설계 되었다. 이 모델은 다양한 분류학적 수준의 학명과 잡종명, 재배명, 이명, 기본명, 국명 및 명명법과 관련된 기타 자료를 함께 제공할 수 있다. 따라서, 국가표준식물목록 데이터베이스는 앞으로 개발될 생물정보시스템들의 개발에 있어 식물의 학명과 관련된 정확하고 일관성이 있는 표준 데이터베이스 기반을 제공하게 되었다.
Heterophyidae과에 속하는 Matagenimus yokegawai, Metagonimus Miyata Type, M. takahashii, Heterophyes disbar, H. heterophyes, H. nocens, Heterophyepsis continua, Pygidiopsis summa, Stellanpchasmusfaltatus, Stittodora lari 등 총 21 Operational Taxonomic Unit(OTU)를 사용하여 수리분류학적 연구를 시도하였다. 형질은 절대 측정치가 아닌 상대적 비율을 주로 사용하였으며, 형질수는 26개를 사용하였다. 각 형질간의 유사도를 측정하여 상관계수를 계산한 후 Ward의 방법에 의한 집괴 분석 및 인자 분석을 수행하였다. 분석 결과 Metagonimus 속(genus) 그룹은 Metagonimus yokogawai, Metagonimus Miyata Type, M. takahashii 등 3개의 표현군으로 구분이 되었으며, Metagenimus Miyata Type은 M. takahashii 의 아종 수준으로 분류되었다. Heterophyes 속 그룹은 Heterophyes dispar, H. heterophyes, Jf. nocens 등 명확한 3개의 표현 군으로 구분되며, H. nocens는 H. heterophyes의 아종이 아닌 뚜렷한 종의 수준에서 분류됨을 나타내었다. 그 외의 종들도 역시 뚜렷한 표현 군으로 분류되었으며, 이로부터 흡충류에 있어서도 수리분류학적 방법에 의해 분류가 명화한 분류군의 한계를 규정하는데 많은 도움을 줄 수 있을 것으로 사료된다.
Park, Dong-Suk;Kang, Hee-Wan;Park, Young-Jin;Lee, Mi-Hee;Lee, Byoung-Moo;Hahn, Jang-Ho;Go, Seung-Joo
Mycobiology
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제32권1호
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pp.24-34
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2004
Molecular approaches, internal transcribed spacer(ITS) sequences of ribosomal DNA, and Universal Rice Primer Polymerase Chain Reaction(URP-PCR) were used to investigate the genetic diversity, taxonomic complexity, and relationships of Trichoderma species in mushroom farms. Forty-one isolates of 13 Trichoderma spp. were used in this study and clustered into eight groups. The DNA fingerprint patterns and ITS1 region sequence alignment data showed similar results, but not in some species, such as T. virens, T. atroviride, T. harzianum, and T. aureoviride. Results of this study have proven that the morphology-based taxonomic system has some limitations in terms of classification. The data obtained in this study would be a good index for classifying indistinguishable Trichoderma strains.
Purpose: Culture-based methods for microbiological diagnosis and antibiotic susceptibility tests have limitations in the management of orofacial infections. We aimed to profile pus microbiota and identify antibiotic resistance genes (ARGs) using a culture-independent approach. Materials and Methods: Genomic DNA samples extracted from the pus specimens of two patients with orofacial abscesses were subjected to shotgun sequencing on the NovaSeq system. Taxonomic profiling and prediction of ARGs were performed directly from the metagenomic raw reads. Result: Taxonomic profiling revealed obligate anaerobic polymicrobial communities associated with infections of odontogenic origins: the microbial community of Patient 1 consisted of one predominant species (Prevotella oris 74.6%) with 27 minor species, while the sample from Patient 2 contained 3 abundant species (Porphyromonas endodontalis 33.0%; P. oris 31.6%; and Prevotella koreensis 13.4%) with five minor species. A total of 150 and 136 putative ARGs were predicted in the metagenome of each pus sample. The coverage of most predicted ARGs was less than 10%, and only the CfxA2 gene identified in Patient 1 was covered 100%. ARG analysis of the seven assembled genome/metagenome datasets of P. oris revealed that strain C735 carried the CfxA2 gene. Conclusion: A metagenomics-based approach is useful to profile predominantly anaerobic polymicrobial communities but needs further verification for reliable ARG detection.
한국산 Alsineae (Alsinoideae, 석죽과) 8속 25분류군 종자의 형태학적 형질에 대한 식별형질로서의 가치와 분류학적 의미를 평가하기 위해 해부현미경(SM)과 주사전자현미경(SEM)을 통해 관찰하고 자세히 기재하였다. 종자의 외형은 원형, 쉼표형, 타원형, 난형, 양배형, 신장형, 아원형으로 다양하게 나타났으며, 크기는 길이 0.28-4.10 mm, 너비 0.33-3.10 mm로 개미자리(Sagina japonica)가 가장 작게 나타났고, 갯별꽃(Honkenya peploides var. major)이 가장 크게 나타났다. 점나도나물속(Cerastium), 갯별꽃속(Honkenya), 개벼룩속(Moehringia)에서 제 부위에 부속지가 관찰되었고, 개벼룩속(Moehringia)에서만 strophiole이 관찰되어 구별되었다. 종자표면무늬에 따라 4가지 유형, 구릉상-유두형, 구릉상-기둥형, 구릉상-단순형, 평활상으로 구별하였으며, 종피세포의 형태, 주변부, 수층벽 높이의 정도, 병층세포벽의 형태 등의 형질을 기재하였다. 또한, 이전에 제시된 분류체계와의 비교를 통해 종자 미세형태학적 형질의 분류학적 유용성에 대해 논의하였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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